MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_008044	GCC	2	6	3140791	3140796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082816
64003	NC_008044	GT	3	6	3140847	3140852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64004	NC_008044	TTC	2	6	3140857	3140862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64005	NC_008044	TGAT	2	8	3140955	3140962	25 %	50 %	25 %	0 %	99082817
64006	NC_008044	GTC	2	6	3141004	3141009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64007	NC_008044	CG	3	6	3141025	3141030	0 %	0 %	50 %	50 %	99082817
64008	NC_008044	ATTC	2	8	3141042	3141049	25 %	50 %	0 %	25 %	99082817
64009	NC_008044	GAC	2	6	3141134	3141139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64010	NC_008044	TGC	3	9	3141397	3141405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64011	NC_008044	CA	3	6	3141412	3141417	50 %	0 %	0 %	50 %	99082817
64012	NC_008044	GC	3	6	3141463	3141468	0 %	0 %	50 %	50 %	99082817
64013	NC_008044	TGC	2	6	3141529	3141534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64014	NC_008044	GGC	2	6	3141571	3141576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082817
64015	NC_008044	TGC	2	6	3141688	3141693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64016	NC_008044	GCC	2	6	3141709	3141714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082817
64017	NC_008044	TCC	2	6	3141772	3141777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082817
64018	NC_008044	GC	3	6	3141800	3141805	0 %	0 %	50 %	50 %	99082817
64019	NC_008044	GC	5	10	3141863	3141872	0 %	0 %	50 %	50 %	99082817
64020	NC_008044	GTG	2	6	3141882	3141887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082817
64021	NC_008044	CG	3	6	3141940	3141945	0 %	0 %	50 %	50 %	99082817
64022	NC_008044	TCAAG	2	10	3141969	3141978	40 %	20 %	20 %	20 %	99082817
64023	NC_008044	CCG	2	6	3141981	3141986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082817
64024	NC_008044	ATG	2	6	3142011	3142016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082817
64025	NC_008044	CAA	2	6	3142148	3142153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082817
64026	NC_008044	GGC	2	6	3142175	3142180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082817
64027	NC_008044	TGA	2	6	3142239	3142244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082817
64028	NC_008044	CGT	2	6	3142307	3142312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64029	NC_008044	GTCA	2	8	3142395	3142402	25 %	25 %	25 %	25 %	99082817
64030	NC_008044	GA	3	6	3142410	3142415	50 %	0 %	50 %	0 %	99082817
64031	NC_008044	AGC	2	6	3142440	3142445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082817
64032	NC_008044	CAG	2	6	3142552	3142557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082818
64033	NC_008044	AAC	2	6	3142580	3142585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082818
64034	NC_008044	TGG	2	6	3142592	3142597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082818
64035	NC_008044	GC	3	6	3142624	3142629	0 %	0 %	50 %	50 %	99082818
64036	NC_008044	TGA	2	6	3142660	3142665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082818
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64039	NC_008044	AGC	2	6	3142856	3142861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082818
64040	NC_008044	CTG	3	9	3142906	3142914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082818
64041	NC_008044	GAT	2	6	3142931	3142936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082818
64042	NC_008044	GAC	2	6	3142944	3142949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082818
64043	NC_008044	CTC	2	6	3143069	3143074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082818
64044	NC_008044	GGTGA	2	10	3143079	3143088	20 %	20 %	60 %	0 %	99082818
64045	NC_008044	GAT	2	6	3143335	3143340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082819
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64048	NC_008044	GC	3	6	3143433	3143438	0 %	0 %	50 %	50 %	99082819
64049	NC_008044	T	6	6	3143556	3143561	0 %	100 %	0 %	0 %	99082819
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64052	NC_008044	CAG	2	6	3143728	3143733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082819
64053	NC_008044	CGT	2	6	3143796	3143801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082819
64054	NC_008044	GCC	2	6	3143802	3143807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082819
64055	NC_008044	TCAT	2	8	3143825	3143832	25 %	50 %	0 %	25 %	99082819
64056	NC_008044	TTGA	2	8	3143881	3143888	25 %	50 %	25 %	0 %	99082819
64057	NC_008044	CT	3	6	3143977	3143982	0 %	50 %	0 %	50 %	99082819
64058	NC_008044	AGG	2	6	3143990	3143995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082819
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64062	NC_008044	GCGTG	2	10	3144088	3144097	0 %	20 %	60 %	20 %	99082819
64063	NC_008044	GACG	2	8	3144102	3144109	25 %	0 %	50 %	25 %	99082819
64064	NC_008044	CG	3	6	3144108	3144113	0 %	0 %	50 %	50 %	99082819
64065	NC_008044	CG	3	6	3144186	3144191	0 %	0 %	50 %	50 %	99082820
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64076	NC_008044	GGCG	2	8	3145067	3145074	0 %	0 %	75 %	25 %	99082820
64077	NC_008044	CTT	2	6	3145103	3145108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082820
64078	NC_008044	CG	4	8	3145158	3145165	0 %	0 %	50 %	50 %	99082820
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64089	NC_008044	ACG	2	6	3145469	3145474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082821
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64091	NC_008044	GTG	2	6	3145632	3145637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082821
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64232	NC_008044	GC	4	8	3152419	3152426	0 %	0 %	50 %	50 %	99082827
64233	NC_008044	GGC	2	6	3152453	3152458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082827
64234	NC_008044	GGT	2	6	3152480	3152485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082827
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64474	NC_008044	CAC	2	6	3164206	3164211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082836
64475	NC_008044	CGTC	2	8	3164319	3164326	0 %	25 %	25 %	50 %	99082836
64476	NC_008044	CAC	2	6	3164352	3164357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082836
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64478	NC_008044	TCC	2	6	3164434	3164439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64479	NC_008044	ATC	2	6	3164444	3164449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64480	NC_008044	TGA	2	6	3164452	3164457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64481	NC_008044	GAA	2	6	3164580	3164585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64482	NC_008044	TAA	2	6	3164588	3164593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64483	NC_008044	CGA	2	6	3164641	3164646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64484	NC_008044	ATCA	2	8	3164660	3164667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64485	NC_008044	CG	3	6	3164731	3164736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64486	NC_008044	GACTGA	2	12	3164760	3164771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64487	NC_008044	CGC	2	6	3164805	3164810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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64490	NC_008044	CGC	2	6	3164940	3164945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082837
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