MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_008044	TGC	2	6	2643411	2643416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082341
54002	NC_008044	GGC	2	6	2643423	2643428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082341
54003	NC_008044	GCA	2	6	2643488	2643493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082341
54004	NC_008044	GA	4	8	2643498	2643505	50 %	0 %	50 %	0 %	99082341
54005	NC_008044	CGCC	2	8	2643536	2643543	0 %	0 %	25 %	75 %	99082341
54006	NC_008044	GCC	2	6	2643588	2643593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082341
54007	NC_008044	CGC	2	6	2643608	2643613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082341
54008	NC_008044	AGA	2	6	2643637	2643642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082341
54009	NC_008044	TGG	2	6	2643689	2643694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082341
54010	NC_008044	GCC	2	6	2643702	2643707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082341
54011	NC_008044	GC	3	6	2643716	2643721	0 %	0 %	50 %	50 %	99082341
54012	NC_008044	GCC	2	6	2643781	2643786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082341
54013	NC_008044	ACC	2	6	2643826	2643831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082341
54014	NC_008044	GC	3	6	2643839	2643844	0 %	0 %	50 %	50 %	99082341
54015	NC_008044	CGT	2	6	2643879	2643884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082341
54016	NC_008044	GACA	2	8	2643900	2643907	50 %	0 %	25 %	25 %	99082341
54017	NC_008044	ATG	2	6	2643958	2643963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082341
54018	NC_008044	TCA	2	6	2643992	2643997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082341
54019	NC_008044	GCA	2	6	2644193	2644198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082342
54020	NC_008044	C	6	6	2644245	2644250	0 %	0 %	0 %	100 %	99082342
54021	NC_008044	TTG	2	6	2644315	2644320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99082342
54022	NC_008044	GGCAG	2	10	2644429	2644438	20 %	0 %	60 %	20 %	99082342
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54024	NC_008044	CG	3	6	2644576	2644581	0 %	0 %	50 %	50 %	99082342
54025	NC_008044	TGA	2	6	2644589	2644594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082342
54026	NC_008044	CTTCGA	2	12	2644628	2644639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99082342
54027	NC_008044	TGA	2	6	2644748	2644753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082342
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54029	NC_008044	GAG	2	6	2644893	2644898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082342
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54031	NC_008044	CAT	2	6	2644953	2644958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082342
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54036	NC_008044	C	6	6	2645233	2645238	0 %	0 %	0 %	100 %	99082342
54037	NC_008044	CGG	2	6	2645346	2645351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082342
54038	NC_008044	CG	3	6	2645385	2645390	0 %	0 %	50 %	50 %	99082342
54039	NC_008044	GGC	2	6	2645475	2645480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082342
54040	NC_008044	G	6	6	2645484	2645489	0 %	0 %	100 %	0 %	99082342
54041	NC_008044	CTC	2	6	2645509	2645514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54042	NC_008044	ATA	2	6	2645524	2645529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54043	NC_008044	GCCTG	2	10	2645632	2645641	0 %	20 %	40 %	40 %	99082343
54044	NC_008044	GCTGG	2	10	2645648	2645657	0 %	20 %	60 %	20 %	99082343
54045	NC_008044	TGGC	2	8	2645666	2645673	0 %	25 %	50 %	25 %	99082343
54046	NC_008044	CGTC	2	8	2645701	2645708	0 %	25 %	25 %	50 %	99082343
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54050	NC_008044	GGGGC	2	10	2645847	2645856	0 %	0 %	80 %	20 %	99082343
54051	NC_008044	ATC	2	6	2645946	2645951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082343
54052	NC_008044	TC	3	6	2645981	2645986	0 %	50 %	0 %	50 %	99082343
54053	NC_008044	GCC	2	6	2646033	2646038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082343
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54055	NC_008044	CG	3	6	2646110	2646115	0 %	0 %	50 %	50 %	99082343
54056	NC_008044	GC	3	6	2646134	2646139	0 %	0 %	50 %	50 %	99082343
54057	NC_008044	TCA	2	6	2646205	2646210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082343
54058	NC_008044	GGCC	2	8	2646376	2646383	0 %	0 %	50 %	50 %	99082344
54059	NC_008044	TGC	2	6	2646388	2646393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082344
54060	NC_008044	TGC	2	6	2646397	2646402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082344
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54064	NC_008044	CAGC	2	8	2646762	2646769	25 %	0 %	25 %	50 %	99082345
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54086	NC_008044	TCAA	2	8	2647796	2647803	50 %	25 %	0 %	25 %	99082347
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54088	NC_008044	CG	3	6	2647832	2647837	0 %	0 %	50 %	50 %	99082347
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54115	NC_008044	AT	3	6	2649337	2649342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54116	NC_008044	CG	4	8	2649392	2649399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54117	NC_008044	GCC	2	6	2649422	2649427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54118	NC_008044	GC	3	6	2649440	2649445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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54121	NC_008044	GGA	2	6	2649744	2649749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082348
54122	NC_008044	GCC	2	6	2649766	2649771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082348
54123	NC_008044	CG	3	6	2649783	2649788	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54124	NC_008044	TCG	2	6	2649845	2649850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082348
54125	NC_008044	GC	3	6	2649929	2649934	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54126	NC_008044	AGA	2	6	2649995	2650000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082348
54127	NC_008044	CAT	2	6	2650074	2650079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082348
54128	NC_008044	GGC	2	6	2650099	2650104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082348
54129	NC_008044	GCG	2	6	2650193	2650198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082348
54130	NC_008044	CGA	2	6	2650221	2650226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082348
54131	NC_008044	ACC	2	6	2650228	2650233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082348
54132	NC_008044	GCC	2	6	2650250	2650255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082348
54133	NC_008044	GC	3	6	2650271	2650276	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54134	NC_008044	GCC	2	6	2650285	2650290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082348
54135	NC_008044	TGG	2	6	2650297	2650302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082348
54136	NC_008044	GAC	3	9	2650318	2650326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082348
54137	NC_008044	TGG	2	6	2650449	2650454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082348
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54139	NC_008044	CG	3	6	2650474	2650479	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54140	NC_008044	GC	3	6	2650578	2650583	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54141	NC_008044	AAG	2	6	2650606	2650611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082348
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54143	NC_008044	TGG	2	6	2650634	2650639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082348
54144	NC_008044	GC	3	6	2650659	2650664	0 %	0 %	50 %	50 %	99082348
54145	NC_008044	AGA	3	9	2650671	2650679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082348
54146	NC_008044	GCT	2	6	2650730	2650735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082348
54147	NC_008044	CCTCCA	2	12	2650787	2650798	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	99082348
54148	NC_008044	ACGC	2	8	2650833	2650840	25 %	0 %	25 %	50 %	99082348
54149	NC_008044	GCCA	2	8	2650851	2650858	25 %	0 %	25 %	50 %	99082348
54150	NC_008044	GCC	2	6	2650861	2650866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082348
54151	NC_008044	GCT	2	6	2650867	2650872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082348
54152	NC_008044	ACA	2	6	2650915	2650920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54153	NC_008044	GCG	2	6	2650954	2650959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082349
54154	NC_008044	ATC	2	6	2650993	2650998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082349
54155	NC_008044	TGG	2	6	2651135	2651140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082349
54156	NC_008044	CG	3	6	2651168	2651173	0 %	0 %	50 %	50 %	99082349
54157	NC_008044	GTG	2	6	2651212	2651217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082349
54158	NC_008044	TCT	2	6	2651240	2651245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082349
54159	NC_008044	CAA	2	6	2651247	2651252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082349
54160	NC_008044	TGC	2	6	2651270	2651275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082349
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54162	NC_008044	ACC	2	6	2651374	2651379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082349
54163	NC_008044	GTGAT	2	10	2651387	2651396	20 %	40 %	40 %	0 %	99082349
54164	NC_008044	CGA	2	6	2651445	2651450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082349
54165	NC_008044	GC	3	6	2651499	2651504	0 %	0 %	50 %	50 %	99082349
54166	NC_008044	GCC	2	6	2651558	2651563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54167	NC_008044	GGC	2	6	2651572	2651577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54168	NC_008044	TTTG	2	8	2651580	2651587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54169	NC_008044	AGC	2	6	2651650	2651655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082350
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54171	NC_008044	ACCG	2	8	2651742	2651749	25 %	0 %	25 %	50 %	99082350
54172	NC_008044	ATGA	2	8	2651821	2651828	50 %	25 %	25 %	0 %	99082350
54173	NC_008044	GCC	2	6	2651940	2651945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082351
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54177	NC_008044	CG	3	6	2652252	2652257	0 %	0 %	50 %	50 %	99082351
54178	NC_008044	AAG	2	6	2652286	2652291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082351
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54181	NC_008044	GC	3	6	2652440	2652445	0 %	0 %	50 %	50 %	99082351
54182	NC_008044	TG	3	6	2652480	2652485	0 %	50 %	50 %	0 %	99082351
54183	NC_008044	GCG	2	6	2652500	2652505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082351
54184	NC_008044	ATC	2	6	2652510	2652515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082351
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54186	NC_008044	GGC	2	6	2652704	2652709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082351
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54188	NC_008044	GCC	2	6	2652793	2652798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082351
54189	NC_008044	GCCGG	2	10	2652835	2652844	0 %	0 %	60 %	40 %	99082351
54190	NC_008044	CTT	2	6	2652906	2652911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082351
54191	NC_008044	AGCA	2	8	2653054	2653061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54192	NC_008044	CGA	2	6	2653077	2653082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54193	NC_008044	GCTGT	2	10	2653137	2653146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54194	NC_008044	GCG	3	9	2653173	2653181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54195	NC_008044	GCG	2	6	2653286	2653291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082352
54196	NC_008044	GC	3	6	2653334	2653339	0 %	0 %	50 %	50 %	99082352
54197	NC_008044	CGG	2	6	2653369	2653374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082352
54198	NC_008044	CAG	2	6	2653457	2653462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082352
54199	NC_008044	GCC	2	6	2653469	2653474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082352
54200	NC_008044	GCCA	2	8	2653745	2653752	25 %	0 %	25 %	50 %	99082352
54201	NC_008044	GCA	2	6	2653758	2653763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082352
54202	NC_008044	GC	3	6	2653764	2653769	0 %	0 %	50 %	50 %	99082352
54203	NC_008044	AGA	2	6	2653846	2653851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082352
54204	NC_008044	GCC	3	9	2653884	2653892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082352
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54207	NC_008044	GCT	2	6	2653990	2653995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082352
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54209	NC_008044	TC	3	6	2654171	2654176	0 %	50 %	0 %	50 %	99082352
54210	NC_008044	GAA	2	6	2654241	2654246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54211	NC_008044	CCG	2	6	2654272	2654277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54212	NC_008044	CGG	2	6	2654286	2654291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54213	NC_008044	CAGC	2	8	2654325	2654332	25 %	0 %	25 %	50 %	99082353
54214	NC_008044	TGA	2	6	2654439	2654444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082353
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54216	NC_008044	TTC	2	6	2654531	2654536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082353
54217	NC_008044	GTA	2	6	2654611	2654616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082353
54218	NC_008044	TGA	2	6	2654631	2654636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082353
54219	NC_008044	CTT	2	6	2654638	2654643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082353
54220	NC_008044	GTGA	2	8	2654653	2654660	25 %	25 %	50 %	0 %	99082353
54221	NC_008044	ACC	2	6	2654665	2654670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082353
54222	NC_008044	GTG	2	6	2654756	2654761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082354
54223	NC_008044	AC	3	6	2654929	2654934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54224	NC_008044	CG	3	6	2654962	2654967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54225	NC_008044	A	6	6	2655042	2655047	100 %	0 %	0 %	0 %	99082355
54226	NC_008044	ACCC	2	8	2655074	2655081	25 %	0 %	0 %	75 %	99082355
54227	NC_008044	GGT	2	6	2655083	2655088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082355
54228	NC_008044	CGC	2	6	2655132	2655137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082355
54229	NC_008044	GCG	2	6	2655153	2655158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082355
54230	NC_008044	AGGC	2	8	2655179	2655186	25 %	0 %	50 %	25 %	99082355
54231	NC_008044	ATAC	2	8	2655255	2655262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54232	NC_008044	TAT	2	6	2655274	2655279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99082356
54233	NC_008044	TCA	2	6	2655307	2655312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082356
54234	NC_008044	TGG	2	6	2655335	2655340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082356
54235	NC_008044	GAC	2	6	2655372	2655377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082356
54236	NC_008044	CG	3	6	2655412	2655417	0 %	0 %	50 %	50 %	99082356
54237	NC_008044	GCA	2	6	2655424	2655429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082356
54238	NC_008044	CA	3	6	2655471	2655476	50 %	0 %	0 %	50 %	99082356
54239	NC_008044	GGC	2	6	2655500	2655505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082356
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54241	NC_008044	GGT	2	6	2655576	2655581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082356
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54361	NC_008044	G	7	7	2661205	2661211	0 %	0 %	100 %	0 %	99082360
54362	NC_008044	TGC	2	6	2661279	2661284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54363	NC_008044	TGA	2	6	2661311	2661316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54364	NC_008044	CCA	2	6	2661319	2661324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54365	NC_008044	AATC	2	8	2661411	2661418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54366	NC_008044	T	7	7	2661433	2661439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54367	NC_008044	CCCA	2	8	2661448	2661455	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54368	NC_008044	CTT	2	6	2661541	2661546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54433	NC_008044	CGGG	2	8	2664500	2664507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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54468	NC_008044	TCC	2	6	2666447	2666452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082366
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54476	NC_008044	C	6	6	2666639	2666644	0 %	0 %	0 %	100 %	99082366
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54479	NC_008044	GC	3	6	2666883	2666888	0 %	0 %	50 %	50 %	99082366
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54481	NC_008044	CGG	2	6	2666949	2666954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082366
54482	NC_008044	GCCCC	2	10	2667015	2667024	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54483	NC_008044	CT	3	6	2667045	2667050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54486	NC_008044	ATG	2	6	2667244	2667249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082367
54487	NC_008044	CATC	2	8	2667305	2667312	25 %	25 %	0 %	50 %	99082367
54488	NC_008044	TAA	2	6	2667486	2667491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99082367
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54491	NC_008044	GCC	2	6	2667627	2667632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082367
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