MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_008044	TCA	2	6	2541949	2541954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082245
52003	NC_008044	TGA	3	9	2541961	2541969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082245
52004	NC_008044	TGC	2	6	2542006	2542011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082245
52005	NC_008044	CTT	2	6	2542017	2542022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082245
52006	NC_008044	ATC	2	6	2542062	2542067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082245
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52010	NC_008044	TGA	2	6	2542331	2542336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082245
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52121	NC_008044	TGG	2	6	2547901	2547906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082248
52122	NC_008044	GCG	2	6	2547915	2547920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082248
52123	NC_008044	GCTG	2	8	2547926	2547933	0 %	25 %	50 %	25 %	99082248
52124	NC_008044	AC	3	6	2547962	2547967	50 %	0 %	0 %	50 %	99082248
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52132	NC_008044	TGA	2	6	2548444	2548449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082249
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52152	NC_008044	GCT	2	6	2549254	2549259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082249
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52213	NC_008044	A	6	6	2553020	2553025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52214	NC_008044	CCTTG	2	10	2553114	2553123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52215	NC_008044	CCAAA	2	10	2553206	2553215	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
52216	NC_008044	GAT	2	6	2553252	2553257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52220	NC_008044	CTGC	2	8	2553607	2553614	0 %	25 %	25 %	50 %	99082253
52221	NC_008044	CAA	2	6	2553641	2553646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082253
52222	NC_008044	TCA	2	6	2553700	2553705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082253
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52224	NC_008044	ACCTC	2	10	2553741	2553750	20 %	20 %	0 %	60 %	99082253
52225	NC_008044	TGG	2	6	2553751	2553756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082253
52226	NC_008044	CT	3	6	2553762	2553767	0 %	50 %	0 %	50 %	99082253
52227	NC_008044	GATC	2	8	2553788	2553795	25 %	25 %	25 %	25 %	99082253
52228	NC_008044	ATGTC	2	10	2553823	2553832	20 %	40 %	20 %	20 %	99082253
52229	NC_008044	AG	3	6	2553863	2553868	50 %	0 %	50 %	0 %	99082253
52230	NC_008044	ATG	2	6	2553898	2553903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082253
52231	NC_008044	GC	3	6	2553907	2553912	0 %	0 %	50 %	50 %	99082253
52232	NC_008044	GCCA	2	8	2554035	2554042	25 %	0 %	25 %	50 %	99082253
52233	NC_008044	CGA	2	6	2554064	2554069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082253
52234	NC_008044	CGC	2	6	2554106	2554111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082253
52235	NC_008044	GCA	2	6	2554145	2554150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52236	NC_008044	TGG	2	6	2554209	2554214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082254
52237	NC_008044	CTG	2	6	2554233	2554238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082254
52238	NC_008044	CGA	2	6	2554304	2554309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082254
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52357	NC_008044	TC	4	8	2560352	2560359	0 %	50 %	0 %	50 %	99082258
52358	NC_008044	GGC	2	6	2560404	2560409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082258
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52360	NC_008044	AGACC	2	10	2560513	2560522	40 %	0 %	20 %	40 %	99082258
52361	NC_008044	TGGC	2	8	2560537	2560544	0 %	25 %	50 %	25 %	99082258
52362	NC_008044	TGC	2	6	2560604	2560609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082259
52363	NC_008044	CTG	3	9	2560615	2560623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082259
52364	NC_008044	GAT	2	6	2560647	2560652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082259
52365	NC_008044	CGT	2	6	2560656	2560661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082259
52366	NC_008044	ACT	2	6	2560664	2560669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082259
52367	NC_008044	CAG	2	6	2560726	2560731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082259
52368	NC_008044	TGGT	2	8	2560910	2560917	0 %	50 %	50 %	0 %	99082259
52369	NC_008044	TAT	2	6	2561113	2561118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99082259
52370	NC_008044	CGG	2	6	2561262	2561267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082259
52371	NC_008044	CCA	2	6	2561282	2561287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082259
52372	NC_008044	TCGA	2	8	2561296	2561303	25 %	25 %	25 %	25 %	99082259
52373	NC_008044	CGC	3	9	2561343	2561351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082259
52374	NC_008044	GCTG	2	8	2561390	2561397	0 %	25 %	50 %	25 %	99082259
52375	NC_008044	TGA	2	6	2561408	2561413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082259
52376	NC_008044	GAC	2	6	2561419	2561424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082259
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52380	NC_008044	CTGC	2	8	2561685	2561692	0 %	25 %	25 %	50 %	99082260
52381	NC_008044	AGC	2	6	2561731	2561736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082260
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52385	NC_008044	TTCC	2	8	2561951	2561958	0 %	50 %	0 %	50 %	99082260
52386	NC_008044	CTT	2	6	2561963	2561968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082260
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52389	NC_008044	GCG	2	6	2562012	2562017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082260
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52391	NC_008044	CCA	2	6	2562097	2562102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082260
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52399	NC_008044	CCTGG	2	10	2562432	2562441	0 %	20 %	40 %	40 %	99082261
52400	NC_008044	TCT	2	6	2562500	2562505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082261
52401	NC_008044	CCGC	2	8	2562523	2562530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52402	NC_008044	ACC	2	6	2562576	2562581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52403	NC_008044	CAA	2	6	2562589	2562594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52404	NC_008044	TCT	2	6	2562640	2562645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52405	NC_008044	GC	3	6	2562658	2562663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52406	NC_008044	TCT	2	6	2562706	2562711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52407	NC_008044	A	6	6	2562712	2562717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52408	NC_008044	CTGAA	2	10	2562920	2562929	40 %	20 %	20 %	20 %	99082262
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52410	NC_008044	AGCG	2	8	2563003	2563010	25 %	0 %	50 %	25 %	99082262
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52422	NC_008044	GC	3	6	2564009	2564014	0 %	0 %	50 %	50 %	99082263
52423	NC_008044	CGC	2	6	2564099	2564104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082263
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52427	NC_008044	AGT	2	6	2564254	2564259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082263
52428	NC_008044	GCGCA	2	10	2564276	2564285	20 %	0 %	40 %	40 %	99082263
52429	NC_008044	CCTGCC	2	12	2564414	2564425	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52430	NC_008044	GGGAAC	2	12	2564436	2564447	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	99082264
52431	NC_008044	CAGC	2	8	2564490	2564497	25 %	0 %	25 %	50 %	99082264
52432	NC_008044	CAG	2	6	2564517	2564522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082264
52433	NC_008044	ACGC	2	8	2564667	2564674	25 %	0 %	25 %	50 %	99082264
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52444	NC_008044	CCAG	2	8	2565226	2565233	25 %	0 %	25 %	50 %	99082264
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52448	NC_008044	GCGG	2	8	2565338	2565345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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52453	NC_008044	TG	3	6	2565681	2565686	0 %	50 %	50 %	0 %	99082265
52454	NC_008044	ATG	2	6	2565712	2565717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082265
52455	NC_008044	GC	3	6	2565833	2565838	0 %	0 %	50 %	50 %	99082265
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52462	NC_008044	GCCCC	2	10	2566066	2566075	0 %	0 %	20 %	80 %	99082265
52463	NC_008044	TGG	2	6	2566081	2566086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082265
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52465	NC_008044	CAGGC	2	10	2566153	2566162	20 %	0 %	40 %	40 %	99082265
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52467	NC_008044	TGA	2	6	2566216	2566221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082265
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52470	NC_008044	A	6	6	2566315	2566320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52471	NC_008044	CTT	2	6	2566449	2566454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082266
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