MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_008044	GC	3	6	2492256	2492261	0 %	0 %	50 %	50 %	99082211
51003	NC_008044	GC	3	6	2492269	2492274	0 %	0 %	50 %	50 %	99082211
51004	NC_008044	TCG	2	6	2492300	2492305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082211
51005	NC_008044	GTG	2	6	2492378	2492383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082211
51006	NC_008044	CG	3	6	2492426	2492431	0 %	0 %	50 %	50 %	99082211
51007	NC_008044	TCC	2	6	2492468	2492473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082211
51008	NC_008044	TCG	2	6	2492522	2492527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082211
51009	NC_008044	AAC	2	6	2492531	2492536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082211
51010	NC_008044	CG	3	6	2492541	2492546	0 %	0 %	50 %	50 %	99082211
51011	NC_008044	GCC	2	6	2492567	2492572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082211
51012	NC_008044	CG	3	6	2492631	2492636	0 %	0 %	50 %	50 %	99082211
51013	NC_008044	ATCA	2	8	2492848	2492855	50 %	25 %	0 %	25 %	99082211
51014	NC_008044	TTG	2	6	2492932	2492937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99082212
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51017	NC_008044	GGC	2	6	2493048	2493053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082212
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51019	NC_008044	C	6	6	2493139	2493144	0 %	0 %	0 %	100 %	99082212
51020	NC_008044	TGCGC	2	10	2493188	2493197	0 %	20 %	40 %	40 %	99082212
51021	NC_008044	GGC	2	6	2493219	2493224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082212
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51025	NC_008044	CAG	2	6	2493437	2493442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082212
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51028	NC_008044	TGC	2	6	2493586	2493591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082213
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51032	NC_008044	GAT	2	6	2493887	2493892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082213
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51037	NC_008044	T	7	7	2494284	2494290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51039	NC_008044	T	6	6	2494490	2494495	0 %	100 %	0 %	0 %	99082214
51040	NC_008044	ATG	2	6	2494528	2494533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082214
51041	NC_008044	GC	3	6	2494558	2494563	0 %	0 %	50 %	50 %	99082214
51042	NC_008044	CGC	2	6	2494630	2494635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082214
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51053	NC_008044	ATT	2	6	2495176	2495181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51057	NC_008044	GC	3	6	2495392	2495397	0 %	0 %	50 %	50 %	99082216
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51109	NC_008044	GC	3	6	2497670	2497675	0 %	0 %	50 %	50 %	99082218
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51121	NC_008044	TCCGC	2	10	2498042	2498051	0 %	20 %	20 %	60 %	99082218
51122	NC_008044	CGCA	2	8	2498052	2498059	25 %	0 %	25 %	50 %	99082218
51123	NC_008044	ATG	2	6	2498155	2498160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082218
51124	NC_008044	GC	3	6	2498201	2498206	0 %	0 %	50 %	50 %	99082218
51125	NC_008044	GC	3	6	2498244	2498249	0 %	0 %	50 %	50 %	99082218
51126	NC_008044	CTT	2	6	2498270	2498275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082218
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51130	NC_008044	CAC	2	6	2498444	2498449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082218
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51133	NC_008044	GCA	2	6	2498612	2498617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082218
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51136	NC_008044	CG	3	6	2498758	2498763	0 %	0 %	50 %	50 %	99082218
51137	NC_008044	CTT	3	9	2498777	2498785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082218
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51153	NC_008044	GC	3	6	2499451	2499456	0 %	0 %	50 %	50 %	99082218
51154	NC_008044	CAT	2	6	2499471	2499476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082218
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51182	NC_008044	TGC	2	6	2501061	2501066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082220
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51218	NC_008044	GC	3	6	2502330	2502335	0 %	0 %	50 %	50 %	99082221
51219	NC_008044	GCCT	2	8	2502539	2502546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51220	NC_008044	TCA	2	6	2502556	2502561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51223	NC_008044	CTGG	2	8	2502861	2502868	0 %	25 %	50 %	25 %	99082222
51224	NC_008044	ATC	2	6	2502875	2502880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082222
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51226	NC_008044	GCT	2	6	2502960	2502965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082222
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51228	NC_008044	CCT	2	6	2503275	2503280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51229	NC_008044	CGCAGT	2	12	2503371	2503382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51230	NC_008044	GA	3	6	2503467	2503472	50 %	0 %	50 %	0 %	99082223
51231	NC_008044	CAAC	2	8	2503488	2503495	50 %	0 %	0 %	50 %	99082223
51232	NC_008044	CTG	2	6	2503505	2503510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082223
51233	NC_008044	CG	4	8	2503557	2503564	0 %	0 %	50 %	50 %	99082223
51234	NC_008044	GCA	2	6	2503674	2503679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082223
51235	NC_008044	GCA	2	6	2503773	2503778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51236	NC_008044	AC	3	6	2503804	2503809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51237	NC_008044	A	6	6	2503898	2503903	100 %	0 %	0 %	0 %	99082224
51238	NC_008044	CA	3	6	2503951	2503956	50 %	0 %	0 %	50 %	99082224
51239	NC_008044	CG	3	6	2503968	2503973	0 %	0 %	50 %	50 %	99082224
51240	NC_008044	GC	5	10	2504079	2504088	0 %	0 %	50 %	50 %	99082224
51241	NC_008044	CGA	2	6	2504181	2504186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082224
51242	NC_008044	GTG	2	6	2504194	2504199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082224
51243	NC_008044	AGC	2	6	2504215	2504220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082224
51244	NC_008044	CGC	2	6	2504241	2504246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082224
51245	NC_008044	GCG	2	6	2504304	2504309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082224
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51253	NC_008044	CCT	2	6	2504698	2504703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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51256	NC_008044	CGCC	2	8	2504797	2504804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51257	NC_008044	TGC	2	6	2504876	2504881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082225
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51363	NC_008044	GAC	2	6	2510138	2510143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082229
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51401	NC_008044	CTG	2	6	2512066	2512071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51481	NC_008044	AGC	2	6	2516124	2516129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082233
51482	NC_008044	GCC	2	6	2516163	2516168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082233
51483	NC_008044	CCA	2	6	2516185	2516190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082233
51484	NC_008044	GCC	2	6	2516343	2516348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082233
51485	NC_008044	CG	3	6	2516349	2516354	0 %	0 %	50 %	50 %	99082233
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51487	NC_008044	CGGG	2	8	2516409	2516416	0 %	0 %	75 %	25 %	99082233
51488	NC_008044	GCCC	2	8	2516450	2516457	0 %	0 %	25 %	75 %	99082233
51489	NC_008044	CAG	2	6	2516514	2516519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082233
51490	NC_008044	CGC	2	6	2516652	2516657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082233
51491	NC_008044	GCC	2	6	2516683	2516688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082233
51492	NC_008044	GC	3	6	2516717	2516722	0 %	0 %	50 %	50 %	99082233
51493	NC_008044	GTC	2	6	2516847	2516852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082233
51494	NC_008044	GCC	2	6	2516859	2516864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082233
51495	NC_008044	CATC	2	8	2516918	2516925	25 %	25 %	0 %	50 %	99082233
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51497	NC_008044	GT	3	6	2517034	2517039	0 %	50 %	50 %	0 %	99082233
51498	NC_008044	GCCT	2	8	2517160	2517167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51499	NC_008044	CGG	2	6	2517305	2517310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51500	NC_008044	CT	3	6	2517326	2517331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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