MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 65177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_008044	TGAAG	2	10	2443528	2443537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50002	NC_008044	GGC	2	6	2443538	2443543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50003	NC_008044	TCC	2	6	2443548	2443553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50004	NC_008044	ACA	2	6	2443559	2443564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50005	NC_008044	CGG	2	6	2443585	2443590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50006	NC_008044	CGG	2	6	2443600	2443605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50007	NC_008044	AC	3	6	2443635	2443640	50 %	0 %	0 %	50 %	99082163
50008	NC_008044	CGG	2	6	2443681	2443686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082163
50009	NC_008044	TCG	2	6	2443755	2443760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082163
50010	NC_008044	CCG	2	6	2443778	2443783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082163
50011	NC_008044	GC	3	6	2443788	2443793	0 %	0 %	50 %	50 %	99082163
50012	NC_008044	TTC	2	6	2443892	2443897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082163
50013	NC_008044	AAG	2	6	2443995	2444000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082163
50014	NC_008044	TC	3	6	2444103	2444108	0 %	50 %	0 %	50 %	99082163
50015	NC_008044	TGC	2	6	2444109	2444114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082163
50016	NC_008044	CGCAG	2	10	2444136	2444145	20 %	0 %	40 %	40 %	99082163
50017	NC_008044	CTG	2	6	2444162	2444167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082163
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50019	NC_008044	CGC	2	6	2444293	2444298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082163
50020	NC_008044	TCG	2	6	2444385	2444390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082163
50021	NC_008044	TGG	2	6	2444453	2444458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082163
50022	NC_008044	CAC	2	6	2444473	2444478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082163
50023	NC_008044	GCT	2	6	2444507	2444512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082163
50024	NC_008044	CCG	2	6	2444567	2444572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50025	NC_008044	A	6	6	2444619	2444624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50026	NC_008044	AGG	2	6	2444632	2444637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50027	NC_008044	ATTG	2	8	2444656	2444663	25 %	50 %	25 %	0 %	99082164
50028	NC_008044	CGG	2	6	2444671	2444676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082164
50029	NC_008044	ACC	2	6	2444720	2444725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082164
50030	NC_008044	GGC	2	6	2444769	2444774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082164
50031	NC_008044	CTGC	2	8	2444904	2444911	0 %	25 %	25 %	50 %	99082164
50032	NC_008044	GC	4	8	2444981	2444988	0 %	0 %	50 %	50 %	99082164
50033	NC_008044	CTT	2	6	2444995	2445000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082164
50034	NC_008044	TGGCGC	2	12	2445024	2445035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	99082164
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50037	NC_008044	GGC	2	6	2445107	2445112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082164
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50039	NC_008044	GC	3	6	2445355	2445360	0 %	0 %	50 %	50 %	99082164
50040	NC_008044	GC	4	8	2445397	2445404	0 %	0 %	50 %	50 %	99082164
50041	NC_008044	CG	3	6	2445425	2445430	0 %	0 %	50 %	50 %	99082164
50042	NC_008044	CAT	2	6	2445442	2445447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082164
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50044	NC_008044	TCG	2	6	2445674	2445679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082165
50045	NC_008044	CG	3	6	2445734	2445739	0 %	0 %	50 %	50 %	99082165
50046	NC_008044	TGC	2	6	2445764	2445769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082165
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50052	NC_008044	CGG	2	6	2446056	2446061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082165
50053	NC_008044	ATC	2	6	2446066	2446071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082165
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50055	NC_008044	GGCG	2	8	2446105	2446112	0 %	0 %	75 %	25 %	99082165
50056	NC_008044	T	8	8	2446177	2446184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50057	NC_008044	ACG	2	6	2446199	2446204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50059	NC_008044	T	6	6	2446264	2446269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50060	NC_008044	GCT	2	6	2446318	2446323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50063	NC_008044	CTG	3	9	2446524	2446532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082166
50064	NC_008044	TGG	2	6	2446536	2446541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082166
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50078	NC_008044	CCGGC	2	10	2447200	2447209	0 %	0 %	40 %	60 %	99082167
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50093	NC_008044	GCCC	2	8	2448153	2448160	0 %	0 %	25 %	75 %	99082167
50094	NC_008044	GCC	2	6	2448172	2448177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082167
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50101	NC_008044	CCGG	2	8	2448315	2448322	0 %	0 %	50 %	50 %	99082167
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50103	NC_008044	AG	3	6	2448349	2448354	50 %	0 %	50 %	0 %	99082167
50104	NC_008044	AAGGC	2	10	2448422	2448431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50105	NC_008044	CGG	2	6	2448472	2448477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082168
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50108	NC_008044	GGCA	2	8	2448621	2448628	25 %	0 %	50 %	25 %	99082168
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50110	NC_008044	ATG	2	6	2448668	2448673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082168
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50120	NC_008044	GGCGC	2	10	2449083	2449092	0 %	0 %	60 %	40 %	99082169
50121	NC_008044	CGC	2	6	2449147	2449152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082169
50122	NC_008044	GC	3	6	2449157	2449162	0 %	0 %	50 %	50 %	99082169
50123	NC_008044	GGT	2	6	2449171	2449176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082169
50124	NC_008044	GC	3	6	2449240	2449245	0 %	0 %	50 %	50 %	99082169
50125	NC_008044	GC	3	6	2449305	2449310	0 %	0 %	50 %	50 %	99082169
50126	NC_008044	TCA	2	6	2449361	2449366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082169
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50128	NC_008044	TCA	2	6	2449422	2449427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082169
50129	NC_008044	CTGC	2	8	2449449	2449456	0 %	25 %	25 %	50 %	99082169
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50134	NC_008044	CCG	2	6	2449640	2449645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082169
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50143	NC_008044	GCC	2	6	2450092	2450097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082169
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50157	NC_008044	TCCA	2	8	2451126	2451133	25 %	25 %	0 %	50 %	99082170
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50162	NC_008044	GCG	2	6	2451442	2451447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082170
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50179	NC_008044	GA	3	6	2452102	2452107	50 %	0 %	50 %	0 %	99082171
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50183	NC_008044	CTG	2	6	2452243	2452248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082171
50184	NC_008044	TGG	2	6	2452264	2452269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082171
50185	NC_008044	ACC	2	6	2452350	2452355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082171
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50187	NC_008044	GC	3	6	2452444	2452449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50188	NC_008044	CG	3	6	2452461	2452466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50189	NC_008044	CGG	2	6	2452544	2452549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082172
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50192	NC_008044	CG	3	6	2452665	2452670	0 %	0 %	50 %	50 %	99082172
50193	NC_008044	AC	3	6	2452677	2452682	50 %	0 %	0 %	50 %	99082172
50194	NC_008044	GAA	2	6	2452737	2452742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082172
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50196	NC_008044	GCA	2	6	2452784	2452789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082172
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50201	NC_008044	TGA	2	6	2452946	2452951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082172
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50229	NC_008044	CGAC	2	8	2454545	2454552	25 %	0 %	25 %	50 %	99082175
50230	NC_008044	TGC	2	6	2454554	2454559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082175
50231	NC_008044	GCG	2	6	2454626	2454631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082175
50232	NC_008044	CAC	2	6	2454660	2454665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082175
50233	NC_008044	AGA	2	6	2454671	2454676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082175
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50237	NC_008044	GC	3	6	2454860	2454865	0 %	0 %	50 %	50 %	99082175
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50360	NC_008044	GAT	2	6	2460455	2460460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082179
50361	NC_008044	ACGC	2	8	2460490	2460497	25 %	0 %	25 %	50 %	99082179
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50447	NC_008044	CGT	2	6	2463914	2463919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082182
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50454	NC_008044	GCGG	2	8	2464566	2464573	0 %	0 %	75 %	25 %	99082182
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50457	NC_008044	GA	3	6	2464972	2464977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50458	NC_008044	CCG	2	6	2464997	2465002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50459	NC_008044	AGG	2	6	2465026	2465031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50460	NC_008044	TCA	2	6	2465050	2465055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082183
50461	NC_008044	GCA	2	6	2465158	2465163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082183
50462	NC_008044	CTA	2	6	2465219	2465224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082183
50463	NC_008044	GGA	2	6	2465321	2465326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50464	NC_008044	GGT	2	6	2465388	2465393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082184
50465	NC_008044	GGC	2	6	2465397	2465402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082184
50466	NC_008044	GC	3	6	2465504	2465509	0 %	0 %	50 %	50 %	99082184
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50468	NC_008044	CTGG	2	8	2465702	2465709	0 %	25 %	50 %	25 %	99082185
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50470	NC_008044	CAA	2	6	2465818	2465823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99082185
50471	NC_008044	GAG	2	6	2465912	2465917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082185
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50473	NC_008044	TGC	2	6	2465961	2465966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082185
50474	NC_008044	GAA	2	6	2465977	2465982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082185
50475	NC_008044	GC	3	6	2466058	2466063	0 %	0 %	50 %	50 %	99082185
50476	NC_008044	GCG	2	6	2466090	2466095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082185
50477	NC_008044	C	6	6	2466149	2466154	0 %	0 %	0 %	100 %	99082185
50478	NC_008044	CGG	2	6	2466175	2466180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082185
50479	NC_008044	GCG	2	6	2466240	2466245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082185
50480	NC_008044	CAG	2	6	2466250	2466255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082185
50481	NC_008044	ATC	2	6	2466260	2466265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082185
50482	NC_008044	GC	3	6	2466266	2466271	0 %	0 %	50 %	50 %	99082185
50483	NC_008044	ACCGTC	2	12	2466272	2466283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99082185
50484	NC_008044	GAA	2	6	2466296	2466301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082185
50485	NC_008044	GCACAA	2	12	2466314	2466325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	99082185
50486	NC_008044	GC	3	6	2466357	2466362	0 %	0 %	50 %	50 %	99082185
50487	NC_008044	TCG	2	6	2466384	2466389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082185
50488	NC_008044	GCG	2	6	2466431	2466436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082185
50489	NC_008044	AGA	2	6	2466448	2466453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082185
50490	NC_008044	GGT	2	6	2466490	2466495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082185
50491	NC_008044	TAAA	2	8	2466532	2466539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50492	NC_008044	CCT	2	6	2466583	2466588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50493	NC_008044	TAA	2	6	2466621	2466626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50494	NC_008044	GCG	2	6	2466758	2466763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082186
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50497	NC_008044	GAC	2	6	2466997	2467002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082186
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50499	NC_008044	GCA	2	6	2467090	2467095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082186
50500	NC_008044	ATG	2	6	2467134	2467139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082186

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