MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008043	CAA	2	6	149275	149280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078146
3002	NC_008043	CCCG	2	8	149313	149320	0 %	0 %	25 %	75 %	99078146
3003	NC_008043	TCC	2	6	149334	149339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078146
3004	NC_008043	GAA	2	6	149375	149380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078146
3005	NC_008043	CGA	2	6	149416	149421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078146
3006	NC_008043	GCG	2	6	149429	149434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078146
3007	NC_008043	ACC	2	6	149447	149452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078146
3008	NC_008043	GGC	2	6	149569	149574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078146
3009	NC_008043	TG	3	6	149575	149580	0 %	50 %	50 %	0 %	99078146
3010	NC_008043	CA	3	6	149585	149590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_008043	TTC	2	6	149604	149609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008043	CCGAA	2	10	149650	149659	40 %	0 %	20 %	40 %	99078147
3013	NC_008043	CCG	2	6	149677	149682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078147
3014	NC_008043	GGT	2	6	149759	149764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078147
3015	NC_008043	CTT	2	6	149765	149770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078147
3016	NC_008043	CG	3	6	149783	149788	0 %	0 %	50 %	50 %	99078147
3017	NC_008043	TCA	2	6	149810	149815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078147
3018	NC_008043	GCGG	2	8	149826	149833	0 %	0 %	75 %	25 %	99078147
3019	NC_008043	GC	3	6	149908	149913	0 %	0 %	50 %	50 %	99078147
3020	NC_008043	GAT	2	6	149940	149945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078147
3021	NC_008043	TCG	2	6	149956	149961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078147
3022	NC_008043	GCG	2	6	149966	149971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078147
3023	NC_008043	GC	3	6	149977	149982	0 %	0 %	50 %	50 %	99078147
3024	NC_008043	GCC	2	6	149998	150003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078147
3025	NC_008043	CTGC	2	8	150128	150135	0 %	25 %	25 %	50 %	99078147
3026	NC_008043	GCC	2	6	150157	150162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078147
3027	NC_008043	GC	3	6	150170	150175	0 %	0 %	50 %	50 %	99078147
3028	NC_008043	GCG	2	6	150181	150186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078147
3029	NC_008043	G	6	6	150207	150212	0 %	0 %	100 %	0 %	99078147
3030	NC_008043	GGC	2	6	150238	150243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078147
3031	NC_008043	ATC	2	6	150292	150297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078147
3032	NC_008043	GA	3	6	150342	150347	50 %	0 %	50 %	0 %	99078147
3033	NC_008043	GA	3	6	150410	150415	50 %	0 %	50 %	0 %	99078147
3034	NC_008043	GCGG	2	8	150492	150499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_008043	GCC	2	6	150543	150548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_008043	C	7	7	150547	150553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3037	NC_008043	CAA	2	6	150559	150564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008043	A	6	6	150563	150568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008043	CG	3	6	150605	150610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_008043	GTC	2	6	150718	150723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078148
3041	NC_008043	CG	3	6	150747	150752	0 %	0 %	50 %	50 %	99078148
3042	NC_008043	TCA	2	6	150840	150845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078148
3043	NC_008043	GGC	2	6	150894	150899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078148
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3045	NC_008043	TCTGGG	2	12	150924	150935	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	99078148
3046	NC_008043	CGC	2	6	151112	151117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_008043	GA	3	6	151132	151137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008043	CTT	2	6	151159	151164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078149
3049	NC_008043	CTG	2	6	151180	151185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078149
3050	NC_008043	TGG	2	6	151187	151192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078149
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3052	NC_008043	CGT	2	6	151356	151361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078149
3053	NC_008043	TGT	2	6	151409	151414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078149
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3055	NC_008043	GTG	2	6	151456	151461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078149
3056	NC_008043	TGC	2	6	151463	151468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078149
3057	NC_008043	GCGCT	2	10	151526	151535	0 %	20 %	40 %	40 %	99078149
3058	NC_008043	ATT	2	6	151537	151542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078149
3059	NC_008043	GCGGGC	2	12	151670	151681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078149
3060	NC_008043	CG	3	6	151767	151772	0 %	0 %	50 %	50 %	99078149
3061	NC_008043	ACA	2	6	151916	151921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078149
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3064	NC_008043	TGA	2	6	152000	152005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078149
3065	NC_008043	CCG	2	6	152015	152020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078149
3066	NC_008043	CTG	2	6	152077	152082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078149
3067	NC_008043	GAT	2	6	152106	152111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078149
3068	NC_008043	CGC	2	6	152128	152133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_008043	CGC	2	6	152296	152301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078150
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3072	NC_008043	GCA	3	9	152410	152418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078150
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3082	NC_008043	CCTCGG	2	12	152812	152823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	99078150
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3084	NC_008043	ATGCCC	2	12	152907	152918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99078150
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3092	NC_008043	C	6	6	153315	153320	0 %	0 %	0 %	100 %	99078150
3093	NC_008043	GCA	2	6	153328	153333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078150
3094	NC_008043	GC	3	6	153457	153462	0 %	0 %	50 %	50 %	99078150
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3109	NC_008043	TGG	2	6	154034	154039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078151
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3114	NC_008043	GA	3	6	154459	154464	50 %	0 %	50 %	0 %	99078151
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3117	NC_008043	GC	3	6	154520	154525	0 %	0 %	50 %	50 %	99078151
3118	NC_008043	TGGC	2	8	154570	154577	0 %	25 %	50 %	25 %	99078151
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3121	NC_008043	CGCGC	3	15	154651	154665	0 %	0 %	40 %	60 %	99078151
3122	NC_008043	GC	3	6	154695	154700	0 %	0 %	50 %	50 %	99078151
3123	NC_008043	CGG	2	6	154754	154759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078151
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3126	NC_008043	GCT	2	6	154878	154883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078151
3127	NC_008043	CTC	2	6	154918	154923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078151
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3129	NC_008043	CGC	2	6	154968	154973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078151
3130	NC_008043	TC	3	6	154979	154984	0 %	50 %	0 %	50 %	99078151
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3134	NC_008043	TGC	2	6	155140	155145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078152
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3155	NC_008043	C	6	6	156168	156173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3249	NC_008043	CCG	2	6	159980	159985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078155
3250	NC_008043	GGC	2	6	160036	160041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078155
3251	NC_008043	GGT	2	6	160056	160061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078155
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3254	NC_008043	GC	4	8	160174	160181	0 %	0 %	50 %	50 %	99078155
3255	NC_008043	TCT	2	6	160243	160248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078155
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3266	NC_008043	CCTC	2	8	160792	160799	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3271	NC_008043	TAA	2	6	160960	160965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_008043	CAAAGG	2	12	161009	161020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3274	NC_008043	CT	3	6	161099	161104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3275	NC_008043	TGC	2	6	161109	161114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3277	NC_008043	GAAA	2	8	161321	161328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3278	NC_008043	GCT	2	6	161468	161473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078156
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