MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008043	TGCCC	2	10	48141	48150	0 %	20 %	20 %	60 %	99078057
1002	NC_008043	TACA	2	8	48164	48171	50 %	25 %	0 %	25 %	99078057
1003	NC_008043	CTG	3	9	48341	48349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078058
1004	NC_008043	CTG	2	6	48352	48357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078058
1005	NC_008043	GAT	2	6	48376	48381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078058
1006	NC_008043	GC	3	6	48395	48400	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
1007	NC_008043	GGA	2	6	48403	48408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078058
1008	NC_008043	GC	3	6	48429	48434	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
1009	NC_008043	GCGCG	2	10	48451	48460	0 %	0 %	60 %	40 %	99078058
1010	NC_008043	CTG	2	6	48605	48610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078058
1011	NC_008043	TGG	2	6	48692	48697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078058
1012	NC_008043	GTGG	2	8	48745	48752	0 %	25 %	75 %	0 %	99078058
1013	NC_008043	GGT	2	6	48781	48786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078058
1014	NC_008043	GAT	2	6	48854	48859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078058
1015	NC_008043	ACGGC	2	10	48881	48890	20 %	0 %	40 %	40 %	99078058
1016	NC_008043	TTG	2	6	48930	48935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078058
1017	NC_008043	ATC	2	6	48962	48967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078058
1018	NC_008043	GC	3	6	49057	49062	0 %	0 %	50 %	50 %	99078058
1019	NC_008043	ACA	2	6	49074	49079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078058
1020	NC_008043	CCT	2	6	49087	49092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078058
1021	NC_008043	GAC	2	6	49217	49222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008043	CCG	2	6	49275	49280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1023	NC_008043	TGG	2	6	49308	49313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078059
1024	NC_008043	GTG	2	6	49358	49363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078059
1025	NC_008043	CGC	2	6	49364	49369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1026	NC_008043	GCG	2	6	49406	49411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078059
1027	NC_008043	GCC	2	6	49466	49471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1028	NC_008043	GTG	2	6	49490	49495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078059
1029	NC_008043	GCG	2	6	49499	49504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078059
1030	NC_008043	ATC	2	6	49508	49513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078059
1031	NC_008043	CGCCC	2	10	49546	49555	0 %	0 %	20 %	80 %	99078059
1032	NC_008043	GAA	2	6	49642	49647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078059
1033	NC_008043	G	6	6	49662	49667	0 %	0 %	100 %	0 %	99078059
1034	NC_008043	CGC	2	6	49668	49673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1035	NC_008043	CTG	2	6	49760	49765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1036	NC_008043	AGGC	2	8	49788	49795	25 %	0 %	50 %	25 %	99078059
1037	NC_008043	TGC	2	6	49866	49871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1038	NC_008043	TGC	2	6	49900	49905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1039	NC_008043	GGGC	2	8	49957	49964	0 %	0 %	75 %	25 %	99078059
1040	NC_008043	GAA	2	6	49991	49996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078059
1041	NC_008043	CG	4	8	50091	50098	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
1042	NC_008043	TGC	2	6	50253	50258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1043	NC_008043	TGC	2	6	50265	50270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1044	NC_008043	GAG	2	6	50279	50284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078059
1045	NC_008043	CCG	2	6	50289	50294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1046	NC_008043	CAT	2	6	50296	50301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078059
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1049	NC_008043	GC	3	6	50722	50727	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
1050	NC_008043	GCC	2	6	50765	50770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078059
1051	NC_008043	GC	3	6	50777	50782	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
1052	NC_008043	GCA	2	6	50809	50814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078059
1053	NC_008043	GC	5	10	50923	50932	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
1054	NC_008043	GC	3	6	50957	50962	0 %	0 %	50 %	50 %	99078059
1055	NC_008043	C	6	6	51161	51166	0 %	0 %	0 %	100 %	99078059
1056	NC_008043	CAC	2	6	51228	51233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078060
1057	NC_008043	ATC	2	6	51238	51243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078060
1058	NC_008043	GGT	2	6	51266	51271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078060
1059	NC_008043	CAG	2	6	51394	51399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078060
1060	NC_008043	ACCA	2	8	51415	51422	50 %	0 %	0 %	50 %	99078060
1061	NC_008043	GC	3	6	51447	51452	0 %	0 %	50 %	50 %	99078060
1062	NC_008043	CTC	2	6	51557	51562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078061
1063	NC_008043	GAA	2	6	51581	51586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078061
1064	NC_008043	GC	4	8	51752	51759	0 %	0 %	50 %	50 %	99078061
1065	NC_008043	ATGT	2	8	51833	51840	25 %	50 %	25 %	0 %	99078061
1066	NC_008043	GGC	2	6	51866	51871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078061
1067	NC_008043	GCT	2	6	51899	51904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078061
1068	NC_008043	GC	3	6	51925	51930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_008043	GC	3	6	51995	52000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_008043	GCA	2	6	52068	52073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_008043	GCA	2	6	52089	52094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008043	GCC	2	6	52095	52100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_008043	CAAAG	2	10	52110	52119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_008043	ACT	2	6	52123	52128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008043	TCA	2	6	52148	52153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078062
1076	NC_008043	CTG	2	6	52219	52224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078062
1077	NC_008043	CTA	2	6	52269	52274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078062
1078	NC_008043	TTC	2	6	52276	52281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078062
1079	NC_008043	CG	3	6	52305	52310	0 %	0 %	50 %	50 %	99078062
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1081	NC_008043	C	6	6	52369	52374	0 %	0 %	0 %	100 %	99078062
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1084	NC_008043	TTC	2	6	52501	52506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078062
1085	NC_008043	CT	3	6	52512	52517	0 %	50 %	0 %	50 %	99078062
1086	NC_008043	GGT	2	6	52587	52592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078062
1087	NC_008043	GCG	2	6	52614	52619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078062
1088	NC_008043	TCGG	2	8	52652	52659	0 %	25 %	50 %	25 %	99078062
1089	NC_008043	CCTG	2	8	52707	52714	0 %	25 %	25 %	50 %	99078062
1090	NC_008043	CGC	2	6	52724	52729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078062
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1092	NC_008043	GAA	2	6	52835	52840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078063
1093	NC_008043	CGC	2	6	52897	52902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078063
1094	NC_008043	GCAGT	2	10	52958	52967	20 %	20 %	40 %	20 %	99078063
1095	NC_008043	AT	3	6	53156	53161	50 %	50 %	0 %	0 %	99078063
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1097	NC_008043	TCCCC	2	10	53259	53268	0 %	20 %	0 %	80 %	99078063
1098	NC_008043	TGC	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078063
1099	NC_008043	TGC	2	6	53331	53336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078063
1100	NC_008043	TGT	2	6	53341	53346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078063
1101	NC_008043	CTGC	2	8	53350	53357	0 %	25 %	25 %	50 %	99078063
1102	NC_008043	TGGGC	2	10	53370	53379	0 %	20 %	60 %	20 %	99078063
1103	NC_008043	GAT	2	6	53380	53385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078063
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1105	NC_008043	CAA	2	6	53431	53436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078063
1106	NC_008043	TTCT	2	8	53444	53451	0 %	75 %	0 %	25 %	99078063
1107	NC_008043	CGG	2	6	53475	53480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078063
1108	NC_008043	TTAT	2	8	53484	53491	25 %	75 %	0 %	0 %	99078063
1109	NC_008043	TCTG	2	8	53514	53521	0 %	50 %	25 %	25 %	99078063
1110	NC_008043	TC	4	8	53551	53558	0 %	50 %	0 %	50 %	99078063
1111	NC_008043	GTC	2	6	53612	53617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078064
1112	NC_008043	CG	4	8	53876	53883	0 %	0 %	50 %	50 %	99078064
1113	NC_008043	CGC	2	6	53918	53923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1114	NC_008043	CATG	2	8	53924	53931	25 %	25 %	25 %	25 %	99078064
1115	NC_008043	CGG	2	6	53993	53998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078064
1116	NC_008043	GGT	2	6	54002	54007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078064
1117	NC_008043	ACCA	2	8	54012	54019	50 %	0 %	0 %	50 %	99078064
1118	NC_008043	CGC	2	6	54062	54067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1119	NC_008043	CCT	2	6	54130	54135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078064
1120	NC_008043	GCC	2	6	54161	54166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078064
1121	NC_008043	GAT	2	6	54173	54178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078064
1122	NC_008043	ATCGC	2	10	54237	54246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_008043	T	6	6	54277	54282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008043	ATG	2	6	54319	54324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008043	GCT	2	6	54378	54383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008043	GCG	2	6	54481	54486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008043	AGTG	2	8	54514	54521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008043	CG	3	6	54619	54624	0 %	0 %	50 %	50 %	99078065
1129	NC_008043	ACC	2	6	54672	54677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078065
1130	NC_008043	CTG	2	6	54712	54717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078065
1131	NC_008043	CTCGC	2	10	54789	54798	0 %	20 %	20 %	60 %	99078065
1132	NC_008043	GATC	2	8	54803	54810	25 %	25 %	25 %	25 %	99078065
1133	NC_008043	CTCCA	2	10	54872	54881	20 %	20 %	0 %	60 %	99078065
1134	NC_008043	AAG	2	6	54889	54894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078065
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1165	NC_008043	CG	3	6	56432	56437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1166	NC_008043	GC	3	6	56439	56444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1243	NC_008043	GC	4	8	60049	60056	0 %	0 %	50 %	50 %	99078068
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1247	NC_008043	TCAT	2	8	60204	60211	25 %	50 %	0 %	25 %	99078068
1248	NC_008043	CAA	2	6	60241	60246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078068
1249	NC_008043	CG	3	6	60251	60256	0 %	0 %	50 %	50 %	99078068
1250	NC_008043	GAA	2	6	60344	60349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078068
1251	NC_008043	TGC	2	6	60358	60363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078068
1252	NC_008043	G	6	6	60369	60374	0 %	0 %	100 %	0 %	99078068
1253	NC_008043	GCA	2	6	60424	60429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078068
1254	NC_008043	GCG	2	6	60482	60487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078068
1255	NC_008043	GC	3	6	60522	60527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_008043	CG	3	6	60557	60562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1257	NC_008043	CCG	2	6	60761	60766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078069
1258	NC_008043	GCG	2	6	60827	60832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078069
1259	NC_008043	GAC	2	6	60877	60882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078069
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