MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_008043	GCCT	2	8	709509	709516	0 %	25 %	25 %	50 %	99078626
14003	NC_008043	TCT	2	6	709558	709563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078626
14004	NC_008043	TGC	2	6	709650	709655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078626
14005	NC_008043	GAC	2	6	709688	709693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078626
14006	NC_008043	GAT	2	6	709699	709704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078626
14007	NC_008043	CT	3	6	709729	709734	0 %	50 %	0 %	50 %	99078626
14008	NC_008043	CTT	2	6	709848	709853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078626
14009	NC_008043	ATG	2	6	709854	709859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078626
14010	NC_008043	CG	3	6	709906	709911	0 %	0 %	50 %	50 %	99078626
14011	NC_008043	GCA	2	6	709919	709924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078626
14012	NC_008043	AAC	2	6	709952	709957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078626
14013	NC_008043	TGCGC	2	10	710050	710059	0 %	20 %	40 %	40 %	99078626
14014	NC_008043	CCGG	2	8	710060	710067	0 %	0 %	50 %	50 %	99078626
14015	NC_008043	AC	3	6	710085	710090	50 %	0 %	0 %	50 %	99078626
14016	NC_008043	GC	3	6	710208	710213	0 %	0 %	50 %	50 %	99078627
14017	NC_008043	GGCG	2	8	710231	710238	0 %	0 %	75 %	25 %	99078627
14018	NC_008043	ATT	2	6	710303	710308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078627
14019	NC_008043	GCA	2	6	710310	710315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078627
14020	NC_008043	GTC	2	6	710362	710367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078627
14021	NC_008043	GGC	2	6	710394	710399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078627
14022	NC_008043	GAG	2	6	710428	710433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078627
14023	NC_008043	GCG	2	6	710575	710580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078627
14024	NC_008043	CCG	2	6	710627	710632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078627
14025	NC_008043	GAC	2	6	710680	710685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078627
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14027	NC_008043	GAC	2	6	710722	710727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078627
14028	NC_008043	TCG	2	6	710761	710766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078627
14029	NC_008043	ACGGC	2	10	710893	710902	20 %	0 %	40 %	40 %	99078628
14030	NC_008043	GAC	2	6	711090	711095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078628
14031	NC_008043	TGC	2	6	711100	711105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078628
14032	NC_008043	CAA	2	6	711112	711117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078628
14033	NC_008043	GC	3	6	711141	711146	0 %	0 %	50 %	50 %	99078628
14034	NC_008043	CG	3	6	711150	711155	0 %	0 %	50 %	50 %	99078628
14035	NC_008043	CCA	2	6	711217	711222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078628
14036	NC_008043	CGG	2	6	711242	711247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078628
14037	NC_008043	CAGCGG	2	12	711249	711260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99078628
14038	NC_008043	GC	3	6	711270	711275	0 %	0 %	50 %	50 %	99078628
14039	NC_008043	AGA	2	6	711284	711289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078628
14040	NC_008043	TGC	2	6	711373	711378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078628
14041	NC_008043	CAT	2	6	711446	711451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078628
14042	NC_008043	TGA	2	6	711466	711471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078628
14043	NC_008043	CGC	2	6	711478	711483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078628
14044	NC_008043	TGA	2	6	711544	711549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078628
14045	NC_008043	TGC	2	6	711592	711597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078629
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14048	NC_008043	CGC	2	6	711990	711995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078629
14049	NC_008043	GC	3	6	712013	712018	0 %	0 %	50 %	50 %	99078629
14050	NC_008043	CGC	2	6	712102	712107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078629
14051	NC_008043	GC	3	6	712406	712411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_008043	TGA	2	6	712476	712481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078630
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14061	NC_008043	GCA	2	6	712904	712909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078630
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14070	NC_008043	TGC	2	6	713615	713620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078632
14071	NC_008043	CGT	2	6	713629	713634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078632
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14075	NC_008043	TCG	2	6	713787	713792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078632
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14080	NC_008043	CGA	2	6	713986	713991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078632
14081	NC_008043	GCT	2	6	714137	714142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078632
14082	NC_008043	ATC	2	6	714221	714226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078632
14083	NC_008043	AT	3	6	714339	714344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_008043	TGG	2	6	714362	714367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_008043	CG	3	6	714541	714546	0 %	0 %	50 %	50 %	99078633
14086	NC_008043	TGC	2	6	714725	714730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078633
14087	NC_008043	TG	3	6	714824	714829	0 %	50 %	50 %	0 %	99078633
14088	NC_008043	AAC	3	9	714847	714855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078633
14089	NC_008043	TCA	2	6	714968	714973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078633
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14091	NC_008043	GC	4	8	715023	715030	0 %	0 %	50 %	50 %	99078633
14092	NC_008043	GC	3	6	715089	715094	0 %	0 %	50 %	50 %	99078633
14093	NC_008043	CGATC	2	10	715113	715122	20 %	20 %	20 %	40 %	99078633
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14096	NC_008043	GGGC	2	8	715242	715249	0 %	0 %	75 %	25 %	99078633
14097	NC_008043	C	6	6	715257	715262	0 %	0 %	0 %	100 %	99078633
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14102	NC_008043	GAT	2	6	715539	715544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078634
14103	NC_008043	CGC	2	6	715557	715562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078634
14104	NC_008043	TC	3	6	715619	715624	0 %	50 %	0 %	50 %	99078634
14105	NC_008043	TTG	2	6	715649	715654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078634
14106	NC_008043	GC	3	6	715822	715827	0 %	0 %	50 %	50 %	99078634
14107	NC_008043	CAG	2	6	715830	715835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078634
14108	NC_008043	AGC	4	12	715942	715953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078634
14109	NC_008043	CAC	2	6	715965	715970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078634
14110	NC_008043	CGG	2	6	715971	715976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078634
14111	NC_008043	TGCCC	2	10	716150	716159	0 %	20 %	20 %	60 %	99078634
14112	NC_008043	CTG	2	6	716266	716271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078635
14113	NC_008043	GAC	2	6	716318	716323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078635
14114	NC_008043	CG	3	6	716331	716336	0 %	0 %	50 %	50 %	99078635
14115	NC_008043	CGG	2	6	716338	716343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078635
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14119	NC_008043	G	6	6	716569	716574	0 %	0 %	100 %	0 %	99078635
14120	NC_008043	GGC	2	6	716585	716590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078635
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14247	NC_008043	GCTG	2	8	721974	721981	0 %	25 %	50 %	25 %	99078640
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14349	NC_008043	C	7	7	727206	727212	0 %	0 %	0 %	100 %	99078644
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14356	NC_008043	GATC	2	8	727539	727546	25 %	25 %	25 %	25 %	99078644
14357	NC_008043	GAG	2	6	727553	727558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078644
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14359	NC_008043	CGA	2	6	727639	727644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078644
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14362	NC_008043	ATG	2	6	727968	727973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078645
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14365	NC_008043	GTC	2	6	728289	728294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078646
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14490	NC_008043	CCAA	2	8	734257	734264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14491	NC_008043	GCG	2	6	734428	734433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078651
14492	NC_008043	CGC	2	6	734474	734479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078651
14493	NC_008043	GCG	2	6	734483	734488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078651
14494	NC_008043	GC	3	6	734505	734510	0 %	0 %	50 %	50 %	99078651
14495	NC_008043	GGA	2	6	734523	734528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078651
14496	NC_008043	TGCC	2	8	734546	734553	0 %	25 %	25 %	50 %	99078651
14497	NC_008043	CGG	2	6	734576	734581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078651
14498	NC_008043	GC	3	6	734588	734593	0 %	0 %	50 %	50 %	99078651
14499	NC_008043	CTC	2	6	734709	734714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078651
14500	NC_008043	GCG	2	6	734723	734728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078651

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