MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008043	CAT	2	6	684080	684085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078596
13502	NC_008043	AG	3	6	684093	684098	50 %	0 %	50 %	0 %	99078596
13503	NC_008043	ATG	2	6	684176	684181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078596
13504	NC_008043	ATG	2	6	684233	684238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_008043	T	6	6	684279	684284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_008043	GCC	3	9	684364	684372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078597
13507	NC_008043	AGA	2	6	684392	684397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078597
13508	NC_008043	ATC	2	6	684449	684454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078597
13509	NC_008043	GGCT	2	8	684462	684469	0 %	25 %	50 %	25 %	99078597
13510	NC_008043	GTC	2	6	684561	684566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078597
13511	NC_008043	TGC	2	6	684636	684641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078597
13512	NC_008043	CAC	2	6	684712	684717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078597
13513	NC_008043	ATG	2	6	684786	684791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078597
13514	NC_008043	GTT	2	6	684821	684826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078597
13515	NC_008043	GCGCC	2	10	684866	684875	0 %	0 %	40 %	60 %	99078597
13516	NC_008043	ATC	2	6	685022	685027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078598
13517	NC_008043	AGT	2	6	685044	685049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078598
13518	NC_008043	GAT	2	6	685168	685173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078598
13519	NC_008043	GTC	2	6	685192	685197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078598
13520	NC_008043	GGC	2	6	685227	685232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078598
13521	NC_008043	AGT	2	6	685248	685253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078598
13522	NC_008043	GCC	2	6	685363	685368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078598
13523	NC_008043	CGA	2	6	685374	685379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078598
13524	NC_008043	CAA	2	6	685491	685496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078598
13525	NC_008043	TGG	2	6	685500	685505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078598
13526	NC_008043	ACG	2	6	685565	685570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078598
13527	NC_008043	TTG	2	6	685613	685618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078598
13528	NC_008043	CCAA	2	8	685660	685667	50 %	0 %	0 %	50 %	99078598
13529	NC_008043	GCACCA	2	12	685668	685679	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99078598
13530	NC_008043	GAC	2	6	685699	685704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078598
13531	NC_008043	GCAT	2	8	685830	685837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13532	NC_008043	G	7	7	685890	685896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_008043	CAG	2	6	686093	686098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078599
13534	NC_008043	AAG	2	6	686151	686156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078599
13535	NC_008043	GC	3	6	686192	686197	0 %	0 %	50 %	50 %	99078599
13536	NC_008043	ATG	2	6	686232	686237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078599
13537	NC_008043	GC	3	6	686274	686279	0 %	0 %	50 %	50 %	99078599
13538	NC_008043	AGC	2	6	686290	686295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078599
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13540	NC_008043	CG	4	8	686354	686361	0 %	0 %	50 %	50 %	99078599
13541	NC_008043	GCCG	2	8	686444	686451	0 %	0 %	50 %	50 %	99078599
13542	NC_008043	GCC	2	6	686474	686479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078599
13543	NC_008043	CAT	2	6	686485	686490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078599
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13546	NC_008043	ACC	3	9	686595	686603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078599
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13551	NC_008043	GTC	2	6	686744	686749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078599
13552	NC_008043	CAG	2	6	686789	686794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078599
13553	NC_008043	AGGT	2	8	686829	686836	25 %	25 %	50 %	0 %	99078599
13554	NC_008043	CAG	2	6	686840	686845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078599
13555	NC_008043	TCCC	2	8	686849	686856	0 %	25 %	0 %	75 %	99078599
13556	NC_008043	GCA	2	6	686857	686862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078599
13557	NC_008043	CGC	2	6	686954	686959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078599
13558	NC_008043	ATC	2	6	687009	687014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078599
13559	NC_008043	CG	4	8	687040	687047	0 %	0 %	50 %	50 %	99078599
13560	NC_008043	TCC	2	6	687119	687124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13561	NC_008043	TGC	2	6	687166	687171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_008043	TTC	2	6	687207	687212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_008043	TCG	2	6	687271	687276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078600
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13569	NC_008043	CGC	2	6	687842	687847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13570	NC_008043	AGC	2	6	687922	687927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078601
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13592	NC_008043	CT	3	6	689384	689389	0 %	50 %	0 %	50 %	99078602
13593	NC_008043	ACG	2	6	689418	689423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078602
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13598	NC_008043	ATG	2	6	689518	689523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078602
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13619	NC_008043	T	6	6	690800	690805	0 %	100 %	0 %	0 %	99078605
13620	NC_008043	CCAGA	2	10	690858	690867	40 %	0 %	20 %	40 %	99078605
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13989	NC_008043	CGA	2	6	708931	708936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078625
13990	NC_008043	TTTCG	2	10	708939	708948	0 %	60 %	20 %	20 %	99078625
13991	NC_008043	GAT	2	6	709008	709013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078625
13992	NC_008043	CAT	2	6	709016	709021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078625
13993	NC_008043	GC	3	6	709028	709033	0 %	0 %	50 %	50 %	99078625
13994	NC_008043	GTGCT	2	10	709119	709128	0 %	40 %	40 %	20 %	99078625
13995	NC_008043	AGAA	2	8	709160	709167	75 %	0 %	25 %	0 %	99078625
13996	NC_008043	TCG	2	6	709198	709203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078625
13997	NC_008043	AGGA	2	8	709225	709232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13998	NC_008043	GCC	2	6	709274	709279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078626
13999	NC_008043	ATT	2	6	709352	709357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078626
14000	NC_008043	TCGAGG	2	12	709392	709403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99078626

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