MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008043	TGC	2	6	657715	657720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078578
13002	NC_008043	GC	3	6	657724	657729	0 %	0 %	50 %	50 %	99078578
13003	NC_008043	GCC	2	6	657786	657791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078578
13004	NC_008043	C	6	6	657790	657795	0 %	0 %	0 %	100 %	99078578
13005	NC_008043	GGC	2	6	657800	657805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078578
13006	NC_008043	GCG	2	6	657852	657857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078578
13007	NC_008043	GAAT	2	8	657868	657875	50 %	25 %	25 %	0 %	99078578
13008	NC_008043	CCT	2	6	657877	657882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078578
13009	NC_008043	GGC	2	6	658032	658037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078578
13010	NC_008043	GCG	2	6	658056	658061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078578
13011	NC_008043	GGC	2	6	658115	658120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078578
13012	NC_008043	GCT	2	6	658130	658135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078578
13013	NC_008043	TCT	2	6	658236	658241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_008043	CCCG	2	8	658282	658289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13015	NC_008043	TTC	2	6	658336	658341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078579
13016	NC_008043	GACCT	2	10	658354	658363	20 %	20 %	20 %	40 %	99078579
13017	NC_008043	TCA	2	6	658406	658411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078579
13018	NC_008043	CG	4	8	658500	658507	0 %	0 %	50 %	50 %	99078579
13019	NC_008043	G	6	6	658528	658533	0 %	0 %	100 %	0 %	99078579
13020	NC_008043	TGG	2	6	658643	658648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078579
13021	NC_008043	GC	3	6	658674	658679	0 %	0 %	50 %	50 %	99078579
13022	NC_008043	CGG	2	6	658704	658709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078579
13023	NC_008043	CCTC	2	8	658847	658854	0 %	25 %	0 %	75 %	99078579
13024	NC_008043	GATC	2	8	658857	658864	25 %	25 %	25 %	25 %	99078579
13025	NC_008043	TGG	2	6	658914	658919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078579
13026	NC_008043	TCT	2	6	658977	658982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078579
13027	NC_008043	GCA	2	6	659036	659041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078579
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13029	NC_008043	ATC	3	9	659236	659244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078579
13030	NC_008043	CTG	2	6	659269	659274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078579
13031	NC_008043	ACT	2	6	659417	659422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078579
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13033	NC_008043	GCT	2	6	659475	659480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078579
13034	NC_008043	TGG	2	6	659486	659491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078579
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13037	NC_008043	TGA	2	6	659597	659602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078579
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13039	NC_008043	TGC	2	6	659675	659680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078579
13040	NC_008043	GGC	2	6	659775	659780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_008043	CGC	2	6	659832	659837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078580
13042	NC_008043	GCC	2	6	659887	659892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078580
13043	NC_008043	AAG	2	6	659923	659928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078580
13044	NC_008043	ATG	2	6	659956	659961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078580
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13046	NC_008043	CG	3	6	660073	660078	0 %	0 %	50 %	50 %	99078580
13047	NC_008043	TAA	2	6	660224	660229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99078580
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13051	NC_008043	CAGC	2	8	660399	660406	25 %	0 %	25 %	50 %	99078580
13052	NC_008043	CGC	2	6	660607	660612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078580
13053	NC_008043	TGAGG	2	10	660725	660734	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_008043	GCT	2	6	660784	660789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078581
13055	NC_008043	CCGTGA	2	12	660819	660830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99078581
13056	NC_008043	GA	3	6	660843	660848	50 %	0 %	50 %	0 %	99078581
13057	NC_008043	AGCC	2	8	660920	660927	25 %	0 %	25 %	50 %	99078581
13058	NC_008043	ACA	2	6	660932	660937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078581
13059	NC_008043	CTG	2	6	660955	660960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078581
13060	NC_008043	GAT	2	6	661000	661005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078581
13061	NC_008043	TCG	2	6	661124	661129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078581
13062	NC_008043	GCT	2	6	661155	661160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078581
13063	NC_008043	ATG	2	6	661219	661224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078581
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13067	NC_008043	CTCA	2	8	661360	661367	25 %	25 %	0 %	50 %	99078581
13068	NC_008043	GCGATT	2	12	661415	661426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	99078581
13069	NC_008043	TGA	2	6	661487	661492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078581
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13092	NC_008043	AGCGC	2	10	662913	662922	20 %	0 %	40 %	40 %	99078581
13093	NC_008043	TTG	2	6	662924	662929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078581
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13105	NC_008043	CG	4	8	663385	663392	0 %	0 %	50 %	50 %	99078581
13106	NC_008043	TGATC	2	10	663462	663471	20 %	40 %	20 %	20 %	99078581
13107	NC_008043	GCA	2	6	663495	663500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078581
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13111	NC_008043	AGC	2	6	663574	663579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078581
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13118	NC_008043	CGCC	2	8	663921	663928	0 %	0 %	25 %	75 %	99078581
13119	NC_008043	GC	3	6	663989	663994	0 %	0 %	50 %	50 %	99078581
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13249	NC_008043	TGGC	2	8	671028	671035	0 %	25 %	50 %	25 %	99078587
13250	NC_008043	GATC	2	8	671060	671067	25 %	25 %	25 %	25 %	99078587
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13362	NC_008043	TC	3	6	677109	677114	0 %	50 %	0 %	50 %	99078591
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13492	NC_008043	TGA	2	6	683600	683605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078595
13493	NC_008043	CGT	2	6	683699	683704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078596
13494	NC_008043	GGT	2	6	683755	683760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078596
13495	NC_008043	TGA	2	6	683811	683816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078596
13496	NC_008043	GGGT	2	8	683957	683964	0 %	25 %	75 %	0 %	99078596
13497	NC_008043	CGC	2	6	683970	683975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078596
13498	NC_008043	CATC	2	8	684016	684023	25 %	25 %	0 %	50 %	99078596
13499	NC_008043	CCGAGA	2	12	684030	684041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078596
13500	NC_008043	CTG	2	6	684058	684063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078596

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