MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008043	CT	3	6	630247	630252	0 %	50 %	0 %	50 %	99078553
12502	NC_008043	TCT	2	6	630285	630290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078553
12503	NC_008043	GC	3	6	630335	630340	0 %	0 %	50 %	50 %	99078553
12504	NC_008043	GGA	2	6	630354	630359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078553
12505	NC_008043	T	8	8	630491	630498	0 %	100 %	0 %	0 %	99078553
12506	NC_008043	GTA	2	6	630528	630533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078553
12507	NC_008043	TG	3	6	630565	630570	0 %	50 %	50 %	0 %	99078553
12508	NC_008043	ATG	2	6	630594	630599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078553
12509	NC_008043	TCGA	2	8	630608	630615	25 %	25 %	25 %	25 %	99078553
12510	NC_008043	AGA	2	6	630675	630680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078553
12511	NC_008043	ACT	2	6	630738	630743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078553
12512	NC_008043	A	6	6	630784	630789	100 %	0 %	0 %	0 %	99078553
12513	NC_008043	TTC	2	6	630809	630814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078553
12514	NC_008043	TCT	2	6	630864	630869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_008043	TCC	2	6	630908	630913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_008043	ATCA	2	8	630939	630946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12517	NC_008043	GGA	2	6	631033	631038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_008043	ACG	2	6	631075	631080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_008043	TG	3	6	631082	631087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_008043	TAT	2	6	631091	631096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_008043	AGC	2	6	631117	631122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_008043	TGC	2	6	631146	631151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_008043	GTG	2	6	631245	631250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078554
12524	NC_008043	TTC	2	6	631258	631263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078554
12525	NC_008043	GCT	2	6	631334	631339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078554
12526	NC_008043	GGT	2	6	631519	631524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078554
12527	NC_008043	CGT	2	6	631716	631721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078554
12528	NC_008043	AGCC	2	8	631733	631740	25 %	0 %	25 %	50 %	99078554
12529	NC_008043	GC	3	6	631811	631816	0 %	0 %	50 %	50 %	99078554
12530	NC_008043	CG	3	6	631827	631832	0 %	0 %	50 %	50 %	99078554
12531	NC_008043	TCA	2	6	631856	631861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078554
12532	NC_008043	GT	3	6	631868	631873	0 %	50 %	50 %	0 %	99078554
12533	NC_008043	CAC	2	6	631897	631902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078554
12534	NC_008043	GAT	2	6	631977	631982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078554
12535	NC_008043	GCG	2	6	632033	632038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078554
12536	NC_008043	GAAG	2	8	632058	632065	50 %	0 %	50 %	0 %	99078554
12537	NC_008043	GA	3	6	632189	632194	50 %	0 %	50 %	0 %	99078554
12538	NC_008043	CGGG	2	8	632277	632284	0 %	0 %	75 %	25 %	99078554
12539	NC_008043	G	6	6	632378	632383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_008043	C	6	6	632394	632399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12541	NC_008043	CG	3	6	632403	632408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12542	NC_008043	GCC	2	6	632418	632423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_008043	CGG	2	6	632480	632485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_008043	GCA	2	6	632487	632492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_008043	TGG	2	6	632603	632608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078555
12546	NC_008043	CGT	2	6	632679	632684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078555
12547	NC_008043	GCTG	2	8	632729	632736	0 %	25 %	50 %	25 %	99078555
12548	NC_008043	TGAA	2	8	632764	632771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_008043	CG	3	6	632830	632835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12550	NC_008043	GCT	2	6	632879	632884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078556
12551	NC_008043	TGC	2	6	632887	632892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078556
12552	NC_008043	GA	3	6	632919	632924	50 %	0 %	50 %	0 %	99078556
12553	NC_008043	CGA	2	6	632931	632936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078556
12554	NC_008043	GAACG	2	10	632941	632950	40 %	0 %	40 %	20 %	99078556
12555	NC_008043	CTG	2	6	633028	633033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078556
12556	NC_008043	TG	3	6	633101	633106	0 %	50 %	50 %	0 %	99078556
12557	NC_008043	GAA	2	6	633194	633199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_008043	AGCA	2	8	633267	633274	50 %	0 %	25 %	25 %	99078557
12559	NC_008043	TGG	2	6	633295	633300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078557
12560	NC_008043	GCA	2	6	633334	633339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078557
12561	NC_008043	AGGG	2	8	633381	633388	25 %	0 %	75 %	0 %	99078557
12562	NC_008043	CGC	2	6	633408	633413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078557
12563	NC_008043	T	6	6	633461	633466	0 %	100 %	0 %	0 %	99078557
12564	NC_008043	GGC	2	6	633495	633500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078557
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12567	NC_008043	TGC	2	6	633691	633696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078557
12568	NC_008043	TGA	2	6	633723	633728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078557
12569	NC_008043	GGTT	2	8	633737	633744	0 %	50 %	50 %	0 %	99078557
12570	NC_008043	TGC	2	6	633795	633800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078557
12571	NC_008043	GCG	2	6	633842	633847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078557
12572	NC_008043	TAATG	2	10	633942	633951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_008043	GC	3	6	633972	633977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12574	NC_008043	GTAAC	2	10	633995	634004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12575	NC_008043	TACGTA	2	12	634027	634038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12576	NC_008043	ACGTA	2	10	634049	634058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12577	NC_008043	CGTA	2	8	634083	634090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12578	NC_008043	CG	3	6	634156	634161	0 %	0 %	50 %	50 %	99078558
12579	NC_008043	TCT	2	6	634168	634173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078558
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12582	NC_008043	GCCC	2	8	634335	634342	0 %	0 %	25 %	75 %	99078558
12583	NC_008043	GCC	2	6	634355	634360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078558
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12585	NC_008043	GCGCC	2	10	634479	634488	0 %	0 %	40 %	60 %	99078558
12586	NC_008043	CAG	2	6	634581	634586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078558
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12591	NC_008043	TGC	2	6	635011	635016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078558
12592	NC_008043	CGG	2	6	635027	635032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078558
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12594	NC_008043	GCC	2	6	635108	635113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078558
12595	NC_008043	C	6	6	635137	635142	0 %	0 %	0 %	100 %	99078558
12596	NC_008043	TTCGT	2	10	635261	635270	0 %	60 %	20 %	20 %	99078558
12597	NC_008043	CT	3	6	635292	635297	0 %	50 %	0 %	50 %	99078558
12598	NC_008043	CAAAT	2	10	635502	635511	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12599	NC_008043	ACA	2	6	635520	635525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_008043	AAC	2	6	635573	635578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_008043	C	6	6	635656	635661	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12602	NC_008043	GAT	2	6	635754	635759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12604	NC_008043	GGC	2	6	635851	635856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_008043	CTG	2	6	635920	635925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_008043	CGT	2	6	635946	635951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_008043	CTG	2	6	635962	635967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_008043	GCC	2	6	635977	635982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_008043	GAC	2	6	636017	636022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_008043	GCG	2	6	636032	636037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_008043	GCG	2	6	636042	636047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_008043	TGC	2	6	636176	636181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_008043	ACG	3	9	636341	636349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_008043	CG	3	6	636400	636405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_008043	GAT	2	6	636473	636478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12617	NC_008043	CAG	2	6	636683	636688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_008043	CGA	2	6	636724	636729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_008043	GAG	2	6	636740	636745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_008043	CG	3	6	636766	636771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_008043	CGC	2	6	636840	636845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12622	NC_008043	GC	3	6	636851	636856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_008043	G	6	6	636966	636971	0 %	0 %	100 %	0 %	99078559
12624	NC_008043	ACT	2	6	636978	636983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078559
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12996	NC_008043	AC	3	6	657529	657534	50 %	0 %	0 %	50 %	99078578
12997	NC_008043	GCT	2	6	657549	657554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078578
12998	NC_008043	TGC	2	6	657607	657612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078578
12999	NC_008043	GAG	2	6	657621	657626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078578
13000	NC_008043	CG	3	6	657663	657668	0 %	0 %	50 %	50 %	99078578

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