MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_008043	ATC	2	6	550946	550951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078490
11003	NC_008043	GAT	2	6	550982	550987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078490
11004	NC_008043	CTT	2	6	551050	551055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11005	NC_008043	ATG	2	6	551097	551102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078490
11006	NC_008043	TGA	2	6	551149	551154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078490
11007	NC_008043	TGG	2	6	551182	551187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078490
11008	NC_008043	CGC	3	9	551188	551196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078490
11009	NC_008043	TGA	2	6	551236	551241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078490
11010	NC_008043	TGG	2	6	551248	551253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078490
11011	NC_008043	TCT	2	6	551349	551354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11012	NC_008043	TCG	2	6	551361	551366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078490
11013	NC_008043	GCG	2	6	551373	551378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078490
11014	NC_008043	CGA	2	6	551455	551460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078490
11015	NC_008043	GC	3	6	551548	551553	0 %	0 %	50 %	50 %	99078490
11016	NC_008043	CGAG	2	8	551563	551570	25 %	0 %	50 %	25 %	99078490
11017	NC_008043	GCG	2	6	551652	551657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078490
11018	NC_008043	CTT	2	6	551659	551664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11019	NC_008043	GCC	2	6	551675	551680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078490
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11021	NC_008043	GCCGG	2	10	551799	551808	0 %	0 %	60 %	40 %	99078490
11022	NC_008043	TGG	2	6	551811	551816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078490
11023	NC_008043	TCT	2	6	551839	551844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11024	NC_008043	CTT	2	6	551848	551853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11025	NC_008043	CGG	2	6	551854	551859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078490
11026	NC_008043	CTT	2	6	551860	551865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078490
11027	NC_008043	CGC	2	6	551887	551892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078490
11028	NC_008043	ACC	2	6	551936	551941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078490
11029	NC_008043	CTG	2	6	551989	551994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078490
11030	NC_008043	TCA	2	6	552016	552021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078490
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11032	NC_008043	ATG	2	6	552186	552191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_008043	GC	3	6	552273	552278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_008043	TGC	2	6	552296	552301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078491
11035	NC_008043	ATTTC	2	10	552357	552366	20 %	60 %	0 %	20 %	99078491
11036	NC_008043	AAG	2	6	552451	552456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078491
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11040	NC_008043	CTTT	2	8	552707	552714	0 %	75 %	0 %	25 %	99078491
11041	NC_008043	GC	3	6	552738	552743	0 %	0 %	50 %	50 %	99078491
11042	NC_008043	TTG	2	6	552926	552931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078492
11043	NC_008043	CT	3	6	552939	552944	0 %	50 %	0 %	50 %	99078492
11044	NC_008043	GC	3	6	552946	552951	0 %	0 %	50 %	50 %	99078492
11045	NC_008043	AGG	2	6	552952	552957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078492
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11050	NC_008043	G	6	6	553178	553183	0 %	0 %	100 %	0 %	99078492
11051	NC_008043	GC	3	6	553220	553225	0 %	0 %	50 %	50 %	99078492
11052	NC_008043	GCG	2	6	553409	553414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078492
11053	NC_008043	T	6	6	553491	553496	0 %	100 %	0 %	0 %	99078492
11054	NC_008043	CGA	2	6	553504	553509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078492
11055	NC_008043	AAG	2	6	553510	553515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078492
11056	NC_008043	GGGGC	2	10	553528	553537	0 %	0 %	80 %	20 %	99078492
11057	NC_008043	GATC	2	8	553602	553609	25 %	25 %	25 %	25 %	99078492
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11059	NC_008043	CGG	2	6	553649	553654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078492
11060	NC_008043	GTG	2	6	553679	553684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078492
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11062	NC_008043	AAAT	2	8	553745	553752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_008043	G	6	6	553776	553781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_008043	TTC	2	6	553879	553884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_008043	ACAT	2	8	554055	554062	50 %	25 %	0 %	25 %	99078493
11066	NC_008043	GCAGG	2	10	554099	554108	20 %	0 %	60 %	20 %	99078493
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11073	NC_008043	ACG	2	6	554775	554780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078493
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11075	NC_008043	CTGCG	2	10	554938	554947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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11077	NC_008043	AGCG	2	8	555010	555017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11079	NC_008043	CG	3	6	555176	555181	0 %	0 %	50 %	50 %	99078494
11080	NC_008043	CGT	2	6	555264	555269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078494
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11083	NC_008043	GC	3	6	555342	555347	0 %	0 %	50 %	50 %	99078494
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11095	NC_008043	GCG	2	6	555980	555985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078495
11096	NC_008043	GCG	2	6	556019	556024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078495
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11099	NC_008043	ATAGC	2	10	556277	556286	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11100	NC_008043	CGC	2	6	556303	556308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_008043	CTG	2	6	556351	556356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_008043	GC	3	6	556422	556427	0 %	0 %	50 %	50 %	99078496
11103	NC_008043	ATC	2	6	556506	556511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078496
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11107	NC_008043	GGC	3	9	556661	556669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078496
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11111	NC_008043	TGA	2	6	556900	556905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078496
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11114	NC_008043	GGC	2	6	556997	557002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078496
11115	NC_008043	GC	3	6	557008	557013	0 %	0 %	50 %	50 %	99078496
11116	NC_008043	CATC	2	8	557048	557055	25 %	25 %	0 %	50 %	99078496
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11121	NC_008043	TGG	2	6	557270	557275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_008043	GCG	2	6	557278	557283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11248	NC_008043	CG	3	6	563932	563937	0 %	0 %	50 %	50 %	99078505
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11250	NC_008043	CG	4	8	564067	564074	0 %	0 %	50 %	50 %	99078505
11251	NC_008043	GCT	2	6	564075	564080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078505
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11286	NC_008043	GGC	2	6	566163	566168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11295	NC_008043	GGTGA	2	10	566406	566415	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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11366	NC_008043	CGA	2	6	570194	570199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078509
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11369	NC_008043	AGT	2	6	570332	570337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11371	NC_008043	CCT	2	6	570368	570373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11497	NC_008043	TCC	2	6	577951	577956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078513
11498	NC_008043	GCG	2	6	578021	578026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078513
11499	NC_008043	TGA	2	6	578033	578038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078513
11500	NC_008043	AGG	2	6	578044	578049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078513

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