MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008043	TGC	2	6	401803	401808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078360
8002	NC_008043	CA	3	6	401834	401839	50 %	0 %	0 %	50 %	99078360
8003	NC_008043	GAG	2	6	401961	401966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078360
8004	NC_008043	GCA	2	6	401970	401975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078360
8005	NC_008043	TGAA	2	8	401988	401995	50 %	25 %	25 %	0 %	99078361
8006	NC_008043	GTCT	2	8	402033	402040	0 %	50 %	25 %	25 %	99078361
8007	NC_008043	GAA	2	6	402053	402058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078361
8008	NC_008043	GCA	2	6	402059	402064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078361
8009	NC_008043	CTC	2	6	402082	402087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078361
8010	NC_008043	GCC	2	6	402179	402184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078361
8011	NC_008043	GCT	2	6	402301	402306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078361
8012	NC_008043	GCG	2	6	402324	402329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078361
8013	NC_008043	GC	3	6	402372	402377	0 %	0 %	50 %	50 %	99078361
8014	NC_008043	CTG	2	6	402449	402454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078361
8015	NC_008043	CGG	2	6	402468	402473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078361
8016	NC_008043	GAA	2	6	402575	402580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078361
8017	NC_008043	GCC	2	6	402582	402587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078361
8018	NC_008043	ACA	2	6	402615	402620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078361
8019	NC_008043	GC	3	6	402640	402645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_008043	GACA	2	8	402665	402672	50 %	0 %	25 %	25 %	99078362
8021	NC_008043	AGAA	2	8	402673	402680	75 %	0 %	25 %	0 %	99078362
8022	NC_008043	GCCTT	2	10	402726	402735	0 %	40 %	20 %	40 %	99078362
8023	NC_008043	CGCC	2	8	402772	402779	0 %	0 %	25 %	75 %	99078362
8024	NC_008043	AAC	2	6	403031	403036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078362
8025	NC_008043	GGCTG	2	10	403084	403093	0 %	20 %	60 %	20 %	99078362
8026	NC_008043	TGG	2	6	403155	403160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078362
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8029	NC_008043	CGG	2	6	403366	403371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078362
8030	NC_008043	GCGG	2	8	403469	403476	0 %	0 %	75 %	25 %	99078362
8031	NC_008043	G	6	6	403529	403534	0 %	0 %	100 %	0 %	99078362
8032	NC_008043	GATTT	2	10	403556	403565	20 %	60 %	20 %	0 %	99078362
8033	NC_008043	GCC	2	6	403631	403636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078362
8034	NC_008043	CGC	2	6	403657	403662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078362
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8036	NC_008043	GCCC	2	8	403738	403745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8037	NC_008043	TTG	2	6	403783	403788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_008043	AAC	2	6	403803	403808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_008043	AGG	2	6	403866	403871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_008043	AGATG	2	10	403915	403924	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_008043	CCT	2	6	403953	403958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_008043	CATGC	2	10	403960	403969	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8043	NC_008043	GCT	2	6	404025	404030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_008043	GAG	2	6	404048	404053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_008043	T	6	6	404092	404097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_008043	CGC	2	6	404105	404110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_008043	CGC	2	6	404236	404241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8049	NC_008043	GGA	2	6	404364	404369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_008043	AGC	2	6	404399	404404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078363
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8054	NC_008043	TGC	2	6	404624	404629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078363
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8056	NC_008043	GCC	2	6	404704	404709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078363
8057	NC_008043	GC	3	6	404843	404848	0 %	0 %	50 %	50 %	99078363
8058	NC_008043	GC	4	8	404867	404874	0 %	0 %	50 %	50 %	99078363
8059	NC_008043	GCA	2	6	404940	404945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078363
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8075	NC_008043	AGATC	2	10	405564	405573	40 %	20 %	20 %	20 %	99078363
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8081	NC_008043	GTC	2	6	405733	405738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078363
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8107	NC_008043	TCCGG	2	10	407436	407445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8108	NC_008043	TGC	2	6	407518	407523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078364
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8111	NC_008043	CCTG	2	8	407961	407968	0 %	25 %	25 %	50 %	99078364
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8124	NC_008043	GCTC	2	8	408907	408914	0 %	25 %	25 %	50 %	99078365
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