MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6503	NC_008043	GT	3	6	325271	325276	0 %	50 %	50 %	0 %	99078292
6504	NC_008043	ACC	2	6	325313	325318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078292
6505	NC_008043	CAT	2	6	325346	325351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078292
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6507	NC_008043	TCT	2	6	325420	325425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078292
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6509	NC_008043	TCG	2	6	325488	325493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078292
6510	NC_008043	TGC	2	6	325500	325505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078292
6511	NC_008043	GC	3	6	325549	325554	0 %	0 %	50 %	50 %	99078292
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6515	NC_008043	GGC	2	6	325819	325824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078293
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6875	NC_008043	GTG	2	6	344399	344404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078310
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6891	NC_008043	GCA	2	6	345160	345165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078310
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6893	NC_008043	GCT	2	6	345238	345243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078310
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6900	NC_008043	TTG	2	6	345623	345628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078311
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6903	NC_008043	GGAC	2	8	345783	345790	25 %	0 %	50 %	25 %	99078311
6904	NC_008043	GAT	2	6	345895	345900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078311
6905	NC_008043	GCA	2	6	345962	345967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078311
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6911	NC_008043	TGTGC	2	10	346352	346361	0 %	40 %	40 %	20 %	99078312
6912	NC_008043	GAA	2	6	346422	346427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078312
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6915	NC_008043	TCAA	2	8	346551	346558	50 %	25 %	0 %	25 %	99078312
6916	NC_008043	CT	3	6	346644	346649	0 %	50 %	0 %	50 %	99078312
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6927	NC_008043	CACTG	2	10	347252	347261	20 %	20 %	20 %	40 %	99078312
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6943	NC_008043	CGA	2	6	347965	347970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078313
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6953	NC_008043	GC	3	6	348440	348445	0 %	0 %	50 %	50 %	99078313
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6966	NC_008043	CAT	2	6	348821	348826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078313
6967	NC_008043	GTCC	2	8	348851	348858	0 %	25 %	25 %	50 %	99078313
6968	NC_008043	GC	3	6	348904	348909	0 %	0 %	50 %	50 %	99078313
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6970	NC_008043	TGA	2	6	348982	348987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6973	NC_008043	GGCG	2	8	349121	349128	0 %	0 %	75 %	25 %	99078314
6974	NC_008043	GC	3	6	349191	349196	0 %	0 %	50 %	50 %	99078314
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6976	NC_008043	GC	3	6	349347	349352	0 %	0 %	50 %	50 %	99078314
6977	NC_008043	TCGA	2	8	349421	349428	25 %	25 %	25 %	25 %	99078314
6978	NC_008043	CAG	2	6	349507	349512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078314
6979	NC_008043	TCA	2	6	349515	349520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078314
6980	NC_008043	ATG	2	6	349722	349727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078314
6981	NC_008043	TGATC	2	10	349729	349738	20 %	40 %	20 %	20 %	99078314
6982	NC_008043	GCA	2	6	349792	349797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078314
6983	NC_008043	GGC	2	6	349812	349817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078314
6984	NC_008043	GGT	2	6	349864	349869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078314
6985	NC_008043	CGG	2	6	349875	349880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078314
6986	NC_008043	GC	3	6	349903	349908	0 %	0 %	50 %	50 %	99078314
6987	NC_008043	CTTG	2	8	349909	349916	0 %	50 %	25 %	25 %	99078314
6988	NC_008043	CTCG	2	8	349944	349951	0 %	25 %	25 %	50 %	99078314
6989	NC_008043	CTT	2	6	350030	350035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078315
6990	NC_008043	CTT	2	6	350055	350060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078315
6991	NC_008043	CAG	2	6	350068	350073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078315
6992	NC_008043	GTC	2	6	350149	350154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078315
6993	NC_008043	GCCT	2	8	350233	350240	0 %	25 %	25 %	50 %	99078315
6994	NC_008043	ACG	2	6	350305	350310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078315
6995	NC_008043	TGC	2	6	350340	350345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078315
6996	NC_008043	ATG	2	6	350401	350406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078315
6997	NC_008043	ATG	2	6	350413	350418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078315
6998	NC_008043	GGAA	2	8	350422	350429	50 %	0 %	50 %	0 %	99078315
6999	NC_008043	GAT	2	6	350536	350541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078315
7000	NC_008043	A	6	6	350594	350599	100 %	0 %	0 %	0 %	99078315

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