MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 16259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008043	TGC	2	6	249978	249983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078224
5002	NC_008043	GCGG	2	8	250044	250051	0 %	0 %	75 %	25 %	99078225
5003	NC_008043	CCG	2	6	250068	250073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078225
5004	NC_008043	CCG	2	6	250122	250127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078225
5005	NC_008043	GA	3	6	250160	250165	50 %	0 %	50 %	0 %	99078225
5006	NC_008043	CG	3	6	250175	250180	0 %	0 %	50 %	50 %	99078225
5007	NC_008043	TGC	3	9	250208	250216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078225
5008	NC_008043	AAG	2	6	250243	250248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078225
5009	NC_008043	AGG	2	6	250337	250342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078225
5010	NC_008043	GTC	2	6	250423	250428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078225
5011	NC_008043	GGA	2	6	250482	250487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078225
5012	NC_008043	CCA	2	6	250535	250540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078225
5013	NC_008043	ACG	2	6	250601	250606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078225
5014	NC_008043	GAA	2	6	250762	250767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078225
5015	NC_008043	TGA	2	6	250808	250813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078225
5016	NC_008043	AAC	2	6	250864	250869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008043	G	6	6	250935	250940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008043	CTG	2	6	250970	250975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078226
5019	NC_008043	GAA	3	9	250976	250984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078226
5020	NC_008043	CGG	2	6	250988	250993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078226
5021	NC_008043	AGC	2	6	251044	251049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078226
5022	NC_008043	TGG	2	6	251092	251097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078226
5023	NC_008043	ATG	2	6	251190	251195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078227
5024	NC_008043	CGC	2	6	251222	251227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078227
5025	NC_008043	CAG	2	6	251311	251316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078227
5026	NC_008043	TGA	2	6	251373	251378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078227
5027	NC_008043	GCC	2	6	251517	251522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_008043	GCC	2	6	251563	251568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_008043	C	8	8	251567	251574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5030	NC_008043	CAC	2	6	251593	251598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_008043	GAC	2	6	251649	251654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008043	GCT	2	6	251682	251687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_008043	CG	3	6	251704	251709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_008043	TGC	2	6	251721	251726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_008043	GC	3	6	251725	251730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_008043	CAA	2	6	251766	251771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078228
5037	NC_008043	CAC	2	6	251824	251829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078228
5038	NC_008043	ATC	2	6	251843	251848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078228
5039	NC_008043	CGA	2	6	251850	251855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078228
5040	NC_008043	GCT	2	6	251856	251861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078228
5041	NC_008043	TCA	2	6	251901	251906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078228
5042	NC_008043	GCA	2	6	251910	251915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078228
5043	NC_008043	ACC	2	6	251921	251926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078228
5044	NC_008043	TGA	2	6	251946	251951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078228
5045	NC_008043	CG	3	6	251955	251960	0 %	0 %	50 %	50 %	99078228
5046	NC_008043	GA	3	6	252035	252040	50 %	0 %	50 %	0 %	99078228
5047	NC_008043	GC	3	6	252078	252083	0 %	0 %	50 %	50 %	99078228
5048	NC_008043	CTTG	2	8	252160	252167	0 %	50 %	25 %	25 %	99078228
5049	NC_008043	GCA	2	6	252194	252199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078228
5050	NC_008043	GCT	2	6	252223	252228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078228
5051	NC_008043	CT	3	6	252294	252299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_008043	GCTATC	2	12	252428	252439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99078229
5053	NC_008043	CGC	2	6	252495	252500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078229
5054	NC_008043	CTGC	2	8	252504	252511	0 %	25 %	25 %	50 %	99078229
5055	NC_008043	GC	3	6	252574	252579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_008043	ATC	2	6	252617	252622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078230
5057	NC_008043	GC	3	6	252663	252668	0 %	0 %	50 %	50 %	99078230
5058	NC_008043	GAA	2	6	252736	252741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078230
5059	NC_008043	GCC	2	6	252775	252780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5060	NC_008043	GGC	2	6	252808	252813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078230
5061	NC_008043	CCG	2	6	252836	252841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5062	NC_008043	CGC	2	6	252852	252857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5063	NC_008043	CG	4	8	252864	252871	0 %	0 %	50 %	50 %	99078230
5064	NC_008043	TCA	3	9	252921	252929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078230
5065	NC_008043	GCC	2	6	252962	252967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5066	NC_008043	GCC	2	6	252976	252981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5067	NC_008043	CGAG	2	8	253002	253009	25 %	0 %	50 %	25 %	99078230
5068	NC_008043	C	6	6	253074	253079	0 %	0 %	0 %	100 %	99078230
5069	NC_008043	GGC	2	6	253083	253088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078230
5070	NC_008043	GCAAAG	2	12	253106	253117	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	99078230
5071	NC_008043	CCG	2	6	253139	253144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5072	NC_008043	CAG	3	9	253147	253155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078230
5073	NC_008043	C	6	6	253163	253168	0 %	0 %	0 %	100 %	99078230
5074	NC_008043	GCGA	2	8	253169	253176	25 %	0 %	50 %	25 %	99078230
5075	NC_008043	ATG	2	6	253193	253198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078230
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5078	NC_008043	GA	3	6	253382	253387	50 %	0 %	50 %	0 %	99078230
5079	NC_008043	GCC	2	6	253393	253398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078230
5080	NC_008043	CAG	2	6	253498	253503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078230
5081	NC_008043	ACC	2	6	253511	253516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078230
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5083	NC_008043	GGT	2	6	253603	253608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078230
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5089	NC_008043	TGC	2	6	253937	253942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078231
5090	NC_008043	GATC	2	8	253979	253986	25 %	25 %	25 %	25 %	99078231
5091	NC_008043	C	6	6	254000	254005	0 %	0 %	0 %	100 %	99078231
5092	NC_008043	CG	4	8	254069	254076	0 %	0 %	50 %	50 %	99078231
5093	NC_008043	GA	4	8	254114	254121	50 %	0 %	50 %	0 %	99078231
5094	NC_008043	CG	3	6	254132	254137	0 %	0 %	50 %	50 %	99078231
5095	NC_008043	TGC	2	6	254189	254194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078231
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5102	NC_008043	TCA	2	6	254614	254619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078231
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5104	NC_008043	GC	3	6	254680	254685	0 %	0 %	50 %	50 %	99078231
5105	NC_008043	CGA	2	6	254696	254701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078231
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5107	NC_008043	CG	5	10	254744	254753	0 %	0 %	50 %	50 %	99078231
5108	NC_008043	CG	3	6	254763	254768	0 %	0 %	50 %	50 %	99078231
5109	NC_008043	TCCCA	2	10	254797	254806	20 %	20 %	0 %	60 %	99078231
5110	NC_008043	CAG	3	9	254922	254930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078231
5111	NC_008043	CCCCG	2	10	254985	254994	0 %	0 %	20 %	80 %	99078231
5112	NC_008043	AAATCA	2	12	255031	255042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	99078231
5113	NC_008043	T	6	6	255072	255077	0 %	100 %	0 %	0 %	99078231
5114	NC_008043	A	6	6	255124	255129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008043	GA	3	6	255195	255200	50 %	0 %	50 %	0 %	99078232
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5117	NC_008043	CG	3	6	255225	255230	0 %	0 %	50 %	50 %	99078232
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5119	NC_008043	GCA	2	6	255528	255533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078232
5120	NC_008043	CGA	2	6	255540	255545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078232
5121	NC_008043	GGC	2	6	255637	255642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078232
5122	NC_008043	ACCC	2	8	255647	255654	25 %	0 %	0 %	75 %	99078232
5123	NC_008043	GGC	2	6	255772	255777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078232
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5125	NC_008043	TGA	2	6	255801	255806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078232
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5246	NC_008043	TTA	2	6	262388	262393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_008043	CA	4	8	262409	262416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5374	NC_008043	AGCGA	2	10	268182	268191	40 %	0 %	40 %	20 %	99078244
5375	NC_008043	CAT	2	6	268222	268227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078244
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5377	NC_008043	CGA	2	6	268363	268368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078244
5378	NC_008043	GGGCG	2	10	268417	268426	0 %	0 %	80 %	20 %	99078244
5379	NC_008043	TAT	2	6	268460	268465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078244
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5382	NC_008043	TGC	2	6	268590	268595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078244
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5390	NC_008043	ACC	2	6	268954	268959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_008043	TGC	2	6	269060	269065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5497	NC_008043	TCG	2	6	273877	273882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078249
5498	NC_008043	TGCG	2	8	273988	273995	0 %	25 %	50 %	25 %	99078249
5499	NC_008043	TCG	2	6	274006	274011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078249
5500	NC_008043	AG	3	6	274031	274036	50 %	0 %	50 %	0 %	99078249

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