MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 127993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007958	GCC	2	6	418377	418382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974833
11002	NC_007958	GC	3	6	418509	418514	0 %	0 %	50 %	50 %	91974833
11003	NC_007958	CGC	2	6	418546	418551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974833
11004	NC_007958	CGG	2	6	418706	418711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974834
11005	NC_007958	AGCGAG	2	12	418732	418743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91974834
11006	NC_007958	TGG	2	6	418847	418852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974834
11007	NC_007958	CAA	2	6	418860	418865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974834
11008	NC_007958	CGA	2	6	418877	418882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974834
11009	NC_007958	TCA	2	6	418937	418942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974834
11010	NC_007958	CAC	2	6	418986	418991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974834
11011	NC_007958	TCG	2	6	419039	419044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974834
11012	NC_007958	GAT	2	6	419061	419066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974834
11013	NC_007958	GAT	2	6	419124	419129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974834
11014	NC_007958	ATG	2	6	419158	419163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974834
11015	NC_007958	CGC	2	6	419164	419169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974834
11016	NC_007958	CGCCGG	2	12	419249	419260	0 %	0 %	50 %	50 %	91974834
11017	NC_007958	GC	3	6	419272	419277	0 %	0 %	50 %	50 %	91974834
11018	NC_007958	TCG	2	6	419284	419289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974834
11019	NC_007958	CG	4	8	419288	419295	0 %	0 %	50 %	50 %	91974834
11020	NC_007958	GCTTC	2	10	419351	419360	0 %	40 %	20 %	40 %	91974834
11021	NC_007958	CGAT	2	8	419451	419458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11022	NC_007958	ACG	2	6	419473	419478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974835
11023	NC_007958	CCG	2	6	419487	419492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974835
11024	NC_007958	CGG	2	6	419503	419508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974835
11025	NC_007958	AGG	2	6	419521	419526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974835
11026	NC_007958	CAGCG	2	10	419552	419561	20 %	0 %	40 %	40 %	91974835
11027	NC_007958	GGC	2	6	419572	419577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974835
11028	NC_007958	TCG	2	6	419582	419587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974835
11029	NC_007958	CG	3	6	419586	419591	0 %	0 %	50 %	50 %	91974835
11030	NC_007958	CGGTT	2	10	419593	419602	0 %	40 %	40 %	20 %	91974835
11031	NC_007958	T	6	6	419605	419610	0 %	100 %	0 %	0 %	91974835
11032	NC_007958	GCG	2	6	419644	419649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974835
11033	NC_007958	GACA	2	8	419665	419672	50 %	0 %	25 %	25 %	91974835
11034	NC_007958	CGC	3	9	419744	419752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974835
11035	NC_007958	CCGC	2	8	419763	419770	0 %	0 %	25 %	75 %	91974835
11036	NC_007958	TGA	2	6	419884	419889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974835
11037	NC_007958	CCGA	2	8	419972	419979	25 %	0 %	25 %	50 %	91974835
11038	NC_007958	CGA	2	6	419998	420003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974835
11039	NC_007958	CGTTG	2	10	420034	420043	0 %	40 %	40 %	20 %	91974835
11040	NC_007958	AGCG	2	8	420046	420053	25 %	0 %	50 %	25 %	91974835
11041	NC_007958	GCC	2	6	420092	420097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974835
11042	NC_007958	TCG	2	6	420102	420107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974835
11043	NC_007958	GC	3	6	420137	420142	0 %	0 %	50 %	50 %	91974835
11044	NC_007958	CCG	2	6	420180	420185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974835
11045	NC_007958	CG	4	8	420199	420206	0 %	0 %	50 %	50 %	91974835
11046	NC_007958	CGC	2	6	420242	420247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974835
11047	NC_007958	TGA	2	6	420265	420270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974836
11048	NC_007958	CGGC	2	8	420356	420363	0 %	0 %	50 %	50 %	91974836
11049	NC_007958	CATT	2	8	420368	420375	25 %	50 %	0 %	25 %	91974836
11050	NC_007958	TGG	2	6	420423	420428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974836
11051	NC_007958	CGG	2	6	420453	420458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974836
11052	NC_007958	GCA	2	6	420486	420491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11053	NC_007958	CG	3	6	420509	420514	0 %	0 %	50 %	50 %	91974836
11054	NC_007958	CG	3	6	420621	420626	0 %	0 %	50 %	50 %	91974836
11055	NC_007958	CAGG	2	8	420646	420653	25 %	0 %	50 %	25 %	91974836
11056	NC_007958	ATG	2	6	420659	420664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974836
11057	NC_007958	AATCC	2	10	420699	420708	40 %	20 %	0 %	40 %	91974836
11058	NC_007958	AATG	2	8	420865	420872	50 %	25 %	25 %	0 %	91974836
11059	NC_007958	GGTC	2	8	420900	420907	0 %	25 %	50 %	25 %	91974836
11060	NC_007958	GAC	2	6	420916	420921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11061	NC_007958	TGC	2	6	420981	420986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11062	NC_007958	ACG	2	6	421016	421021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11063	NC_007958	CGCC	2	8	421032	421039	0 %	0 %	25 %	75 %	91974836
11064	NC_007958	GCT	2	6	421095	421100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11065	NC_007958	GTTCC	2	10	421112	421121	0 %	40 %	20 %	40 %	91974836
11066	NC_007958	CGG	2	6	421173	421178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974836
11067	NC_007958	TTC	2	6	421195	421200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974836
11068	NC_007958	GAT	2	6	421207	421212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974836
11069	NC_007958	ACC	2	6	421237	421242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974836
11070	NC_007958	TCG	2	6	421250	421255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974836
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11072	NC_007958	GCA	2	6	421383	421388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11073	NC_007958	TCG	2	6	421400	421405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974836
11074	NC_007958	TCAAAA	2	12	421409	421420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91974836
11075	NC_007958	ATC	2	6	421433	421438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974836
11076	NC_007958	CG	3	6	421480	421485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_007958	GTC	2	6	421522	421527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_007958	GGC	2	6	421547	421552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_007958	GAT	2	6	421556	421561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_007958	TCG	3	9	421565	421573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_007958	GCC	3	9	421576	421584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_007958	TCG	2	6	421592	421597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_007958	ACT	2	6	421619	421624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974837
11084	NC_007958	CAT	2	6	421667	421672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974837
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11086	NC_007958	TCA	2	6	421835	421840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974837
11087	NC_007958	TCG	2	6	421922	421927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11088	NC_007958	GAA	2	6	421947	421952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974837
11089	NC_007958	TTG	2	6	421954	421959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974837
11090	NC_007958	CG	3	6	421967	421972	0 %	0 %	50 %	50 %	91974837
11091	NC_007958	TCG	2	6	421978	421983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11092	NC_007958	CAG	2	6	422064	422069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11093	NC_007958	CCG	2	6	422086	422091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974837
11094	NC_007958	CCCAA	2	10	422092	422101	40 %	0 %	0 %	60 %	91974837
11095	NC_007958	CGA	2	6	422156	422161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11096	NC_007958	CAG	2	6	422187	422192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11097	NC_007958	ACG	2	6	422195	422200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
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11100	NC_007958	CGC	2	6	422246	422251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974837
11101	NC_007958	TGA	2	6	422315	422320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974837
11102	NC_007958	GGC	2	6	422358	422363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974837
11103	NC_007958	GTG	2	6	422437	422442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974837
11104	NC_007958	TCT	2	6	422462	422467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974837
11105	NC_007958	CGA	2	6	422522	422527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11106	NC_007958	CG	6	12	422558	422569	0 %	0 %	50 %	50 %	91974837
11107	NC_007958	ACG	2	6	422674	422679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974837
11108	NC_007958	CCCGG	2	10	422680	422689	0 %	0 %	40 %	60 %	91974837
11109	NC_007958	GAA	2	6	422695	422700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974837
11110	NC_007958	GCC	2	6	422749	422754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974837
11111	NC_007958	A	6	6	422793	422798	100 %	0 %	0 %	0 %	91974837
11112	NC_007958	TCC	3	9	422850	422858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_007958	T	7	7	422895	422901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_007958	TCGA	2	8	422913	422920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11115	NC_007958	TTG	2	6	423003	423008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_007958	TCA	2	6	423023	423028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_007958	A	6	6	423056	423061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_007958	GGA	2	6	423102	423107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_007958	CAG	2	6	423155	423160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_007958	CCT	2	6	423214	423219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_007958	AAT	3	9	423225	423233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11123	NC_007958	GGC	2	6	423262	423267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11489	NC_007958	CAG	2	6	436764	436769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974852
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11492	NC_007958	TGC	2	6	436829	436834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974852
11493	NC_007958	CGA	2	6	436856	436861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974852
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