MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 39896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204816
2	NC_007940	CTT	2	6	86	91	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204816
3	NC_007940	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204816
4	NC_007940	AAG	2	6	143	148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204816
5	NC_007940	GTATT	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	91204816
6	NC_007940	TAA	2	6	263	268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204816
7	NC_007940	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204816
8	NC_007940	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	91204816
9	NC_007940	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	91204816
10	NC_007940	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204816
11	NC_007940	GCT	2	6	405	410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204816
12	NC_007940	ATATT	2	10	431	440	40 %	60 %	0 %	0 %	91204816
13	NC_007940	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204816
14	NC_007940	TAAT	2	8	587	594	50 %	50 %	0 %	0 %	91204816
15	NC_007940	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204816
16	NC_007940	GCT	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204816
17	NC_007940	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204816
18	NC_007940	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	91204816
19	NC_007940	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204816
20	NC_007940	A	8	8	799	806	100 %	0 %	0 %	0 %	91204816
21	NC_007940	A	6	6	814	819	100 %	0 %	0 %	0 %	91204816
22	NC_007940	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007940	A	6	6	873	878	100 %	0 %	0 %	0 %	91204817
24	NC_007940	TAG	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204817
25	NC_007940	GTG	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204817
26	NC_007940	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204817
27	NC_007940	AGA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204817
28	NC_007940	AAAGT	2	10	1033	1042	60 %	20 %	20 %	0 %	91204817
29	NC_007940	TGA	2	6	1064	1069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204817
30	NC_007940	GTA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204817
31	NC_007940	AAT	2	6	1197	1202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204817
32	NC_007940	AT	3	6	1201	1206	50 %	50 %	0 %	0 %	91204817
33	NC_007940	A	6	6	1255	1260	100 %	0 %	0 %	0 %	91204818
34	NC_007940	TTTC	2	8	1312	1319	0 %	75 %	0 %	25 %	91204818
35	NC_007940	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204818
36	NC_007940	A	8	8	1360	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	91204818
37	NC_007940	GTAG	2	8	1406	1413	25 %	25 %	50 %	0 %	91204818
38	NC_007940	AAT	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204818
39	NC_007940	GAACAA	2	12	1532	1543	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91204818
40	NC_007940	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204818
41	NC_007940	AACAG	2	10	1609	1618	60 %	0 %	20 %	20 %	91204818
42	NC_007940	A	7	7	1646	1652	100 %	0 %	0 %	0 %	91204818
43	NC_007940	A	6	6	1666	1671	100 %	0 %	0 %	0 %	91204818
44	NC_007940	TGA	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204818
45	NC_007940	ATT	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204818
46	NC_007940	AC	3	6	1818	1823	50 %	0 %	0 %	50 %	91204818
47	NC_007940	AAT	2	6	1831	1836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204818
48	NC_007940	TCA	2	6	1843	1848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204818
49	NC_007940	GA	3	6	1891	1896	50 %	0 %	50 %	0 %	91204818
50	NC_007940	TTG	2	6	1905	1910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204818
51	NC_007940	GAA	2	6	1950	1955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204818
52	NC_007940	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	91204819
53	NC_007940	A	6	6	1984	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	91204819
54	NC_007940	ATT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204819
55	NC_007940	TAA	2	6	2027	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204819
56	NC_007940	T	6	6	2049	2054	0 %	100 %	0 %	0 %	91204819
57	NC_007940	AT	3	6	2090	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
58	NC_007940	T	7	7	2109	2115	0 %	100 %	0 %	0 %	91204819
59	NC_007940	T	6	6	2118	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	91204819
60	NC_007940	GGA	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91204819
61	NC_007940	AGTA	2	8	2190	2197	50 %	25 %	25 %	0 %	91204819
62	NC_007940	TTC	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204819
63	NC_007940	TAA	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204819
64	NC_007940	A	7	7	2244	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	91204819
65	NC_007940	T	6	6	2268	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	91204819
66	NC_007940	TA	3	6	2300	2305	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
67	NC_007940	TTGTT	2	10	2308	2317	0 %	80 %	20 %	0 %	91204819
68	NC_007940	ATA	2	6	2377	2382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204819
69	NC_007940	TGT	2	6	2487	2492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204819
70	NC_007940	TTATAA	2	12	2585	2596	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
71	NC_007940	TAAT	2	8	2615	2622	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
72	NC_007940	TAG	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204819
73	NC_007940	TA	3	6	2699	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
74	NC_007940	TTAT	2	8	2723	2730	25 %	75 %	0 %	0 %	91204819
75	NC_007940	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
76	NC_007940	A	6	6	2787	2792	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
77	NC_007940	CAA	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204820
78	NC_007940	TAT	3	9	2851	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
79	NC_007940	TATTC	2	10	2874	2883	20 %	60 %	0 %	20 %	91204820
80	NC_007940	TC	4	8	2882	2889	0 %	50 %	0 %	50 %	91204820
81	NC_007940	ATT	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
82	NC_007940	AT	3	6	2914	2919	50 %	50 %	0 %	0 %	91204820
83	NC_007940	GAT	2	6	2931	2936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204820
84	NC_007940	ATT	2	6	2948	2953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
85	NC_007940	ATT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
86	NC_007940	A	6	6	3067	3072	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
87	NC_007940	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	91204820
88	NC_007940	CAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204820
89	NC_007940	AGA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204820
90	NC_007940	TGC	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91204820
91	NC_007940	A	6	6	3291	3296	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
92	NC_007940	GAT	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204820
93	NC_007940	A	7	7	3381	3387	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
94	NC_007940	A	7	7	3400	3406	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
95	NC_007940	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
96	NC_007940	TATT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	91204820
97	NC_007940	AAGATA	2	12	3496	3507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204820
98	NC_007940	GTT	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204820
99	NC_007940	TAA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204820
100	NC_007940	A	6	6	3600	3605	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
101	NC_007940	TC	3	6	3628	3633	0 %	50 %	0 %	50 %	91204820
102	NC_007940	ACA	2	6	3695	3700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204820
103	NC_007940	A	6	6	3742	3747	100 %	0 %	0 %	0 %	91204820
104	NC_007940	TTTAA	2	10	3780	3789	40 %	60 %	0 %	0 %	91204820
105	NC_007940	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
106	NC_007940	AGA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204820
107	NC_007940	AT	3	6	3960	3965	50 %	50 %	0 %	0 %	91204820
108	NC_007940	CTA	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204820
109	NC_007940	TTA	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
110	NC_007940	TTA	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
111	NC_007940	AAAT	2	8	4184	4191	75 %	25 %	0 %	0 %	91204820
112	NC_007940	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204820
113	NC_007940	AAC	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204820
114	NC_007940	AT	3	6	4270	4275	50 %	50 %	0 %	0 %	91204820
115	NC_007940	GA	3	6	4290	4295	50 %	0 %	50 %	0 %	91204820
116	NC_007940	ATG	2	6	4315	4320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204820
117	NC_007940	CTAATA	2	12	4507	4518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204820
118	NC_007940	TTA	2	6	4522	4527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
119	NC_007940	TGG	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91204820
120	NC_007940	CT	3	6	4562	4567	0 %	50 %	0 %	50 %	91204820
121	NC_007940	GCA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91204820
122	NC_007940	TAT	3	9	4590	4598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
123	NC_007940	TGT	2	6	4637	4642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91204820
124	NC_007940	GAA	2	6	4668	4673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204820
125	NC_007940	ATT	2	6	4712	4717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
126	NC_007940	AAT	2	6	4731	4736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204820
127	NC_007940	CTA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204820
128	NC_007940	TAT	2	6	4782	4787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204820
129	NC_007940	TAAAT	2	10	4817	4826	60 %	40 %	0 %	0 %	91204820
130	NC_007940	GAG	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91204820
131	NC_007940	AT	3	6	4839	4844	50 %	50 %	0 %	0 %	91204820
132	NC_007940	GCATTA	2	12	4845	4856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91204820
133	NC_007940	GAA	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91204820
134	NC_007940	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204820
135	NC_007940	CAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91204820
136	NC_007940	CAT	2	6	5048	5053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204820
137	NC_007940	TGA	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204820
138	NC_007940	GTAGT	2	10	5158	5167	20 %	40 %	40 %	0 %	91204820
139	NC_007940	TAA	2	6	5207	5212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204820
140	NC_007940	ATA	2	6	5224	5229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204820
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