MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 145047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_007925	TGC	2	6	679953	679958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18002	NC_007925	TCGC	2	8	679964	679971	0 %	25 %	25 %	50 %	90422151
18003	NC_007925	GGCT	2	8	679991	679998	0 %	25 %	50 %	25 %	90422151
18004	NC_007925	GCA	2	6	680002	680007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18005	NC_007925	GC	3	6	680068	680073	0 %	0 %	50 %	50 %	90422151
18006	NC_007925	GAC	2	6	680087	680092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18007	NC_007925	GC	3	6	680150	680155	0 %	0 %	50 %	50 %	90422151
18008	NC_007925	GAG	2	6	680234	680239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90422151
18009	NC_007925	TCG	2	6	680272	680277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18010	NC_007925	TGC	2	6	680310	680315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18011	NC_007925	AGA	2	6	680343	680348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422151
18012	NC_007925	AGCT	2	8	680382	680389	25 %	25 %	25 %	25 %	90422151
18013	NC_007925	GAGC	2	8	680437	680444	25 %	0 %	50 %	25 %	90422151
18014	NC_007925	TCG	2	6	680498	680503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18015	NC_007925	GCA	2	6	680511	680516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18016	NC_007925	GA	3	6	680589	680594	50 %	0 %	50 %	0 %	90422151
18017	NC_007925	CTT	2	6	680626	680631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422151
18018	NC_007925	CAG	2	6	680653	680658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422151
18019	NC_007925	CTT	2	6	680893	680898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422151
18020	NC_007925	GCC	2	6	680912	680917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422151
18021	NC_007925	GGC	2	6	680950	680955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422151
18022	NC_007925	ACC	2	6	680966	680971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18023	NC_007925	CGT	2	6	681120	681125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_007925	CGT	3	9	681134	681142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_007925	TTG	2	6	681299	681304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_007925	CGC	2	6	681312	681317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18027	NC_007925	TCC	2	6	681323	681328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_007925	TGC	2	6	681385	681390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_007925	GCGT	2	8	681402	681409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18030	NC_007925	TAG	2	6	681427	681432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_007925	ATTT	2	8	681462	681469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_007925	TCAC	3	12	681477	681488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18033	NC_007925	CCGA	2	8	681522	681529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18034	NC_007925	CGG	3	9	681530	681538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_007925	GCA	2	6	681552	681557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_007925	GAT	2	6	681599	681604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_007925	CTA	3	9	681620	681628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_007925	GC	3	6	681668	681673	0 %	0 %	50 %	50 %	90422152
18039	NC_007925	ATC	2	6	681772	681777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422152
18040	NC_007925	ACG	2	6	681794	681799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422152
18041	NC_007925	CCT	2	6	681930	681935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90422152
18042	NC_007925	TCGG	2	8	681946	681953	0 %	25 %	50 %	25 %	90422152
18043	NC_007925	GCC	2	6	681962	681967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422152
18044	NC_007925	GTC	2	6	681985	681990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422152
18045	NC_007925	CCA	2	6	682011	682016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422152
18046	NC_007925	TCC	2	6	682040	682045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90422152
18047	NC_007925	CGA	2	6	682109	682114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422152
18048	NC_007925	CTGG	2	8	682149	682156	0 %	25 %	50 %	25 %	90422152
18049	NC_007925	CCA	2	6	682179	682184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422152
18050	NC_007925	GCC	2	6	682318	682323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422152
18051	NC_007925	ACG	2	6	682370	682375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422152
18052	NC_007925	CG	3	6	682430	682435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18053	NC_007925	GGT	2	6	682445	682450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_007925	GGC	6	18	682480	682497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_007925	GAGG	2	8	682510	682517	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_007925	TCG	2	6	682555	682560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_007925	CGC	2	6	682625	682630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18058	NC_007925	GCG	2	6	682639	682644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_007925	TTCTA	2	10	682665	682674	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18060	NC_007925	TCC	2	6	682697	682702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90422153
18061	NC_007925	GCC	2	6	682708	682713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422153
18062	NC_007925	CTT	2	6	682741	682746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422153
18063	NC_007925	GC	4	8	682779	682786	0 %	0 %	50 %	50 %	90422153
18064	NC_007925	GCG	2	6	682806	682811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422153
18065	NC_007925	TCC	2	6	682874	682879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90422153
18066	NC_007925	GCA	2	6	682893	682898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422153
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18069	NC_007925	CGT	2	6	682918	682923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422153
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18071	NC_007925	GC	4	8	682964	682971	0 %	0 %	50 %	50 %	90422153
18072	NC_007925	GGC	2	6	682975	682980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422153
18073	NC_007925	TGA	2	6	683037	683042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422153
18074	NC_007925	TCG	2	6	683235	683240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422153
18075	NC_007925	GTA	2	6	683287	683292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422153
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18078	NC_007925	TCCCG	2	10	683438	683447	0 %	20 %	20 %	60 %	90422153
18079	NC_007925	GAA	2	6	683455	683460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422153
18080	NC_007925	ATG	2	6	683620	683625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422153
18081	NC_007925	ACT	2	6	683772	683777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_007925	CGG	2	6	683900	683905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_007925	CG	3	6	683908	683913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18084	NC_007925	GC	4	8	683925	683932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18085	NC_007925	CG	3	6	683959	683964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18086	NC_007925	CCT	2	6	683968	683973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18087	NC_007925	ATA	2	6	684002	684007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_007925	ACG	2	6	684063	684068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_007925	ATC	2	6	684108	684113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_007925	CGG	2	6	684125	684130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18091	NC_007925	AGC	2	6	684150	684155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_007925	AG	3	6	684184	684189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_007925	AG	3	6	684205	684210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_007925	GCA	2	6	684227	684232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_007925	GAAC	2	8	684253	684260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18096	NC_007925	AAC	2	6	684267	684272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18097	NC_007925	GAC	2	6	684285	684290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_007925	GTTT	2	8	684291	684298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_007925	TCG	2	6	684299	684304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18100	NC_007925	CCG	2	6	684389	684394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18101	NC_007925	CGC	2	6	684409	684414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18102	NC_007925	GC	4	8	684422	684429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18103	NC_007925	CAG	2	6	684496	684501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422154
18104	NC_007925	GCC	2	6	684542	684547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18105	NC_007925	CGC	2	6	684579	684584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18106	NC_007925	CGA	2	6	684597	684602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422154
18107	NC_007925	GCC	3	9	684625	684633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18108	NC_007925	GCC	2	6	684737	684742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18109	NC_007925	CGC	2	6	684757	684762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18110	NC_007925	CGC	2	6	684862	684867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18111	NC_007925	CGC	2	6	684880	684885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422154
18112	NC_007925	TCG	2	6	684891	684896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422154
18113	NC_007925	CGT	2	6	684901	684906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422154
18114	NC_007925	ATC	2	6	684914	684919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422154
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18118	NC_007925	ATT	2	6	685053	685058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90422154
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18123	NC_007925	GCA	2	6	685246	685251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422154
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18125	NC_007925	GT	3	6	685275	685280	0 %	50 %	50 %	0 %	90422154
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18249	NC_007925	CGG	3	9	691178	691186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422161
18250	NC_007925	GCT	2	6	691199	691204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422161
18251	NC_007925	GCA	2	6	691216	691221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422161
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18253	NC_007925	TTC	2	6	691257	691262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422161
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18268	NC_007925	CG	3	6	691969	691974	0 %	0 %	50 %	50 %	90422161
18269	NC_007925	GCT	2	6	692026	692031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422161
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18273	NC_007925	CG	3	6	692180	692185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18274	NC_007925	CGC	2	6	692209	692214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18275	NC_007925	CCAA	2	8	692216	692223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18276	NC_007925	CGCC	2	8	692285	692292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18277	NC_007925	GGTC	2	8	692399	692406	0 %	25 %	50 %	25 %	90422162
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18315	NC_007925	CAA	2	6	693645	693650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18318	NC_007925	CGT	2	6	693751	693756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422163
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18355	NC_007925	CG	3	6	695158	695163	0 %	0 %	50 %	50 %	90422164
18356	NC_007925	CTGC	2	8	695196	695203	0 %	25 %	25 %	50 %	90422164
18357	NC_007925	CGC	2	6	695214	695219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422164
18358	NC_007925	CGT	2	6	695232	695237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422164
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18361	NC_007925	GC	3	6	695380	695385	0 %	0 %	50 %	50 %	90422164
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18363	NC_007925	GCCG	2	8	695427	695434	0 %	0 %	50 %	50 %	90422164
18364	NC_007925	CCG	2	6	695463	695468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422164
18365	NC_007925	TCG	2	6	695570	695575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422164
18366	NC_007925	GCCG	2	8	695652	695659	0 %	0 %	50 %	50 %	90422164
18367	NC_007925	GCG	2	6	695684	695689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422164
18368	NC_007925	ACGTCG	2	12	695690	695701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90422164
18369	NC_007925	TGC	2	6	695708	695713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422164
18370	NC_007925	CTCGAC	2	12	695734	695745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	90422164
18371	NC_007925	ACGAG	2	10	695765	695774	40 %	0 %	40 %	20 %	90422164
18372	NC_007925	GGC	2	6	695826	695831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422164
18373	NC_007925	CGG	2	6	695898	695903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422164
18374	NC_007925	GGC	2	6	695947	695952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422164
18375	NC_007925	CCGCG	2	10	695976	695985	0 %	0 %	40 %	60 %	90422164
18376	NC_007925	CGA	2	6	696021	696026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422164
18377	NC_007925	GCC	2	6	696028	696033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422164
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18380	NC_007925	CGA	2	6	696108	696113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422164
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18388	NC_007925	ATC	2	6	696565	696570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422165
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18474	NC_007925	GCGCG	2	10	699594	699603	0 %	0 %	60 %	40 %	90422167
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18486	NC_007925	CCG	2	6	700051	700056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18487	NC_007925	GC	4	8	700149	700156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18488	NC_007925	AGA	2	6	700218	700223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422168
18489	NC_007925	CG	3	6	700228	700233	0 %	0 %	50 %	50 %	90422168
18490	NC_007925	TTC	2	6	700273	700278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422168
18491	NC_007925	CGG	2	6	700281	700286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422168
18492	NC_007925	GTC	2	6	700331	700336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422168
18493	NC_007925	ACG	2	6	700341	700346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422168
18494	NC_007925	CGT	2	6	700360	700365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422168
18495	NC_007925	GGC	2	6	700456	700461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422168
18496	NC_007925	GAC	2	6	700540	700545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422168
18497	NC_007925	CG	3	6	700561	700566	0 %	0 %	50 %	50 %	90422168
18498	NC_007925	GTG	2	6	700608	700613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422168
18499	NC_007925	CGCGT	2	10	700692	700701	0 %	20 %	40 %	40 %	90422168
18500	NC_007925	TCT	2	6	700718	700723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422168

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