MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 145047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_007925	GC	4	8	640632	640639	0 %	0 %	50 %	50 %	90422111
17002	NC_007925	GCC	4	12	640641	640652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422111
17003	NC_007925	CG	3	6	640668	640673	0 %	0 %	50 %	50 %	90422111
17004	NC_007925	AGG	2	6	640684	640689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90422111
17005	NC_007925	CGT	2	6	640699	640704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422111
17006	NC_007925	CGGC	2	8	640746	640753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17007	NC_007925	GTCGC	2	10	640765	640774	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17008	NC_007925	CGC	2	6	640779	640784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_007925	TGT	2	6	640787	640792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_007925	TGCT	2	8	640799	640806	0 %	50 %	25 %	25 %	90422112
17011	NC_007925	ACAA	2	8	640881	640888	75 %	0 %	0 %	25 %	90422112
17012	NC_007925	CGT	2	6	640924	640929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422112
17013	NC_007925	CG	3	6	641038	641043	0 %	0 %	50 %	50 %	90422112
17014	NC_007925	GC	3	6	641074	641079	0 %	0 %	50 %	50 %	90422112
17015	NC_007925	GAG	2	6	641129	641134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90422112
17016	NC_007925	GC	3	6	641147	641152	0 %	0 %	50 %	50 %	90422112
17017	NC_007925	TTG	2	6	641176	641181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90422112
17018	NC_007925	CG	3	6	641211	641216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17019	NC_007925	GCG	2	6	641242	641247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_007925	AGCGA	2	10	641278	641287	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17021	NC_007925	TCGCT	2	10	641325	641334	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17022	NC_007925	CTT	2	6	641346	641351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_007925	GCG	2	6	641362	641367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422113
17024	NC_007925	ACA	2	6	641372	641377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422113
17025	NC_007925	CGG	2	6	641381	641386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422113
17026	NC_007925	CGA	2	6	641420	641425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422113
17027	NC_007925	CGT	2	6	641438	641443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422113
17028	NC_007925	GGC	2	6	641511	641516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422113
17029	NC_007925	TCGA	2	8	641570	641577	25 %	25 %	25 %	25 %	90422114
17030	NC_007925	GAA	2	6	641629	641634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422114
17031	NC_007925	GCC	2	6	641639	641644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422114
17032	NC_007925	CG	3	6	641657	641662	0 %	0 %	50 %	50 %	90422114
17033	NC_007925	TCT	2	6	641725	641730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422114
17034	NC_007925	TCCAG	2	10	641734	641743	20 %	20 %	20 %	40 %	90422114
17035	NC_007925	GC	3	6	641801	641806	0 %	0 %	50 %	50 %	90422114
17036	NC_007925	GCG	2	6	641870	641875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_007925	TCGCT	2	10	641895	641904	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17038	NC_007925	GCG	2	6	641946	641951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17039	NC_007925	CCT	2	6	641959	641964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90422115
17040	NC_007925	TCT	3	9	641995	642003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422115
17041	NC_007925	CCTT	2	8	642006	642013	0 %	50 %	0 %	50 %	90422115
17042	NC_007925	CGC	2	6	642049	642054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
17043	NC_007925	GAT	2	6	642107	642112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422115
17044	NC_007925	GCC	2	6	642116	642121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
17045	NC_007925	CGC	2	6	642125	642130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
17046	NC_007925	GCG	2	6	642154	642159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17047	NC_007925	TCT	2	6	642175	642180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422115
17048	NC_007925	GCGGCC	2	12	642191	642202	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17049	NC_007925	CCG	2	6	642283	642288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
17050	NC_007925	GGTGA	2	10	642299	642308	20 %	20 %	60 %	0 %	90422115
17051	NC_007925	ACC	2	6	642366	642371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422115
17052	NC_007925	CGG	2	6	642441	642446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17053	NC_007925	CCGAG	2	10	642466	642475	20 %	0 %	40 %	40 %	90422115
17054	NC_007925	TCG	2	6	642480	642485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17055	NC_007925	TGG	2	6	642496	642501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422115
17056	NC_007925	CAC	2	6	642536	642541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422115
17057	NC_007925	CG	3	6	642646	642651	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17058	NC_007925	GAT	2	6	642665	642670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422115
17059	NC_007925	GCA	2	6	642679	642684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17060	NC_007925	AAG	2	6	642690	642695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422115
17061	NC_007925	GAAGCC	2	12	642704	642715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17062	NC_007925	GCG	2	6	642720	642725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17063	NC_007925	GC	3	6	642783	642788	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17064	NC_007925	GTC	2	6	642800	642805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17065	NC_007925	ACC	2	6	642834	642839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422115
17066	NC_007925	CGGC	2	8	642844	642851	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17067	NC_007925	GCA	2	6	642862	642867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17068	NC_007925	CTT	2	6	642881	642886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422115
17069	NC_007925	GTC	2	6	642887	642892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17070	NC_007925	CGG	2	6	642937	642942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17071	NC_007925	TGA	2	6	642943	642948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422115
17072	NC_007925	TCG	2	6	642972	642977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
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17074	NC_007925	GGC	2	6	643025	643030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17075	NC_007925	CAT	2	6	643040	643045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422115
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17077	NC_007925	CGA	2	6	643078	643083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17078	NC_007925	CAC	3	9	643094	643102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422115
17079	NC_007925	CGT	2	6	643114	643119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17080	NC_007925	GCG	2	6	643147	643152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17081	NC_007925	GCG	3	9	643168	643176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422115
17082	NC_007925	ATC	2	6	643236	643241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422115
17083	NC_007925	CTG	2	6	643280	643285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422115
17084	NC_007925	CGGC	2	8	643306	643313	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17085	NC_007925	TTG	2	6	643323	643328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90422115
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17088	NC_007925	GCC	2	6	643437	643442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
17089	NC_007925	AGCG	2	8	643443	643450	25 %	0 %	50 %	25 %	90422115
17090	NC_007925	ATCGA	2	10	643587	643596	40 %	20 %	20 %	20 %	90422115
17091	NC_007925	CG	3	6	643615	643620	0 %	0 %	50 %	50 %	90422115
17092	NC_007925	C	6	6	643628	643633	0 %	0 %	0 %	100 %	90422115
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17095	NC_007925	GCC	2	6	643779	643784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422115
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17097	NC_007925	CGG	2	6	643844	643849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_007925	GCT	2	6	643932	643937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422116
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17100	NC_007925	CG	3	6	643957	643962	0 %	0 %	50 %	50 %	90422116
17101	NC_007925	GGC	2	6	643977	643982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17102	NC_007925	GCG	2	6	643987	643992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17103	NC_007925	CG	3	6	644027	644032	0 %	0 %	50 %	50 %	90422116
17104	NC_007925	CG	3	6	644069	644074	0 %	0 %	50 %	50 %	90422116
17105	NC_007925	CCG	2	6	644101	644106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422116
17106	NC_007925	GCG	2	6	644223	644228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17107	NC_007925	CGG	2	6	644237	644242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17108	NC_007925	GCT	2	6	644265	644270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422116
17109	NC_007925	TTC	2	6	644284	644289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422116
17110	NC_007925	CAACGC	2	12	644310	644321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	90422116
17111	NC_007925	TGC	3	9	644324	644332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422116
17112	NC_007925	CCAT	2	8	644348	644355	25 %	25 %	0 %	50 %	90422116
17113	NC_007925	GC	3	6	644364	644369	0 %	0 %	50 %	50 %	90422116
17114	NC_007925	GCG	2	6	644376	644381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17115	NC_007925	GCG	2	6	644395	644400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17116	NC_007925	GGC	2	6	644475	644480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
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17118	NC_007925	GTG	2	6	644551	644556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422116
17119	NC_007925	CTGGC	2	10	644569	644578	0 %	20 %	40 %	40 %	90422116
17120	NC_007925	GCA	2	6	644583	644588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422116
17121	NC_007925	CGC	2	6	644610	644615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422116
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17123	NC_007925	GGC	2	6	644649	644654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422116
17124	NC_007925	CCG	2	6	644657	644662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422116
17125	NC_007925	CTG	3	9	644716	644724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422116
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17127	NC_007925	TGA	2	6	644834	644839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422116
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17129	NC_007925	GCTGGC	2	12	644982	644993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	90422116
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17228	NC_007925	CGGCG	2	10	648842	648851	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17229	NC_007925	TCGG	2	8	648855	648862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17230	NC_007925	TGCG	2	8	648879	648886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17231	NC_007925	GTT	2	6	648912	648917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17232	NC_007925	GGCGC	2	10	648961	648970	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17233	NC_007925	GTCA	2	8	648974	648981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17234	NC_007925	GC	3	6	648986	648991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17235	NC_007925	GCA	2	6	648994	648999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17237	NC_007925	TCG	3	9	649073	649081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422121
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17239	NC_007925	TCG	2	6	649133	649138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422121
17240	NC_007925	GGC	2	6	649159	649164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422121
17241	NC_007925	CAC	2	6	649189	649194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422121
17242	NC_007925	TTC	2	6	649259	649264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422121
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17368	NC_007925	GCG	2	6	654604	654609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422126
17369	NC_007925	GCT	2	6	654850	654855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422126
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17487	NC_007925	TCG	2	6	659917	659922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17490	NC_007925	GCG	3	9	660064	660072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422130
17491	NC_007925	GCA	2	6	660088	660093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422130
17492	NC_007925	GCA	2	6	660127	660132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422130
17493	NC_007925	CGCT	2	8	660141	660148	0 %	25 %	25 %	50 %	90422130
17494	NC_007925	CAG	2	6	660158	660163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422130
17495	NC_007925	GCG	2	6	660174	660179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422130
17496	NC_007925	GCA	2	6	660184	660189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422130
17497	NC_007925	GTC	2	6	660246	660251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422130
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17499	NC_007925	CG	3	6	660294	660299	0 %	0 %	50 %	50 %	90422130
17500	NC_007925	GAA	3	9	660314	660322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422130

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