MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 145047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007925	GGCGC	2	10	567110	567119	0 %	0 %	60 %	40 %	90422050
15002	NC_007925	ACC	2	6	567162	567167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422050
15003	NC_007925	CGA	2	6	567188	567193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15004	NC_007925	CAG	2	6	567195	567200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15005	NC_007925	GCC	2	6	567207	567212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15006	NC_007925	CAA	2	6	567239	567244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422050
15007	NC_007925	ACA	2	6	567271	567276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422050
15008	NC_007925	GGA	2	6	567290	567295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90422050
15009	NC_007925	ACT	2	6	567313	567318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15010	NC_007925	TCG	2	6	567325	567330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15011	NC_007925	CGA	2	6	567353	567358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15012	NC_007925	ATC	2	6	567375	567380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15013	NC_007925	CGA	2	6	567392	567397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15014	NC_007925	ACA	2	6	567412	567417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422050
15015	NC_007925	CGAC	2	8	567451	567458	25 %	0 %	25 %	50 %	90422050
15016	NC_007925	CGA	2	6	567467	567472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15017	NC_007925	AGC	2	6	567475	567480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15018	NC_007925	TGC	3	9	567523	567531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15019	NC_007925	ACG	2	6	567565	567570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15020	NC_007925	GGT	2	6	567584	567589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422050
15021	NC_007925	CAC	2	6	567591	567596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422050
15022	NC_007925	GC	3	6	567611	567616	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15023	NC_007925	CGA	3	9	567656	567664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15024	NC_007925	TCA	2	6	567670	567675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15025	NC_007925	CGA	2	6	567677	567682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15026	NC_007925	CCGG	2	8	567688	567695	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15027	NC_007925	ATG	2	6	567696	567701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422050
15028	NC_007925	GTCCAG	2	12	567756	567767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15029	NC_007925	ACT	2	6	567805	567810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15030	NC_007925	CGA	2	6	567863	567868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15031	NC_007925	CGA	2	6	567932	567937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15032	NC_007925	GAC	2	6	567939	567944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15033	NC_007925	CGC	2	6	567974	567979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15034	NC_007925	GC	3	6	567998	568003	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15035	NC_007925	TCGA	2	8	568041	568048	25 %	25 %	25 %	25 %	90422050
15036	NC_007925	GAA	2	6	568076	568081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422050
15037	NC_007925	GCG	2	6	568137	568142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422050
15038	NC_007925	CG	3	6	568146	568151	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15039	NC_007925	TCG	2	6	568213	568218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15040	NC_007925	CCA	2	6	568252	568257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422050
15041	NC_007925	GGCC	2	8	568262	568269	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15042	NC_007925	CGG	2	6	568289	568294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422050
15043	NC_007925	CGA	2	6	568337	568342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15044	NC_007925	GCC	2	6	568353	568358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15045	NC_007925	TCA	2	6	568369	568374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15046	NC_007925	GAG	2	6	568416	568421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90422050
15047	NC_007925	GTC	2	6	568422	568427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15048	NC_007925	CAA	2	6	568448	568453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422050
15049	NC_007925	CGGG	2	8	568477	568484	0 %	0 %	75 %	25 %	90422050
15050	NC_007925	CAT	2	6	568490	568495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15051	NC_007925	CGC	2	6	568518	568523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15052	NC_007925	TTC	2	6	568581	568586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422050
15053	NC_007925	ATC	2	6	568677	568682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15054	NC_007925	CAA	2	6	568694	568699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422050
15055	NC_007925	GCA	2	6	568715	568720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15056	NC_007925	GC	3	6	568731	568736	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15057	NC_007925	TGA	2	6	568822	568827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422050
15058	NC_007925	GAC	2	6	568830	568835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15059	NC_007925	CGA	2	6	568877	568882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15060	NC_007925	TCG	2	6	568885	568890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15061	NC_007925	GAAG	2	8	568943	568950	50 %	0 %	50 %	0 %	90422050
15062	NC_007925	CGA	2	6	568985	568990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15063	NC_007925	GAA	2	6	569001	569006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422050
15064	NC_007925	CGA	2	6	569015	569020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15065	NC_007925	CTG	2	6	569025	569030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15066	NC_007925	AGC	2	6	569041	569046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
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15068	NC_007925	GGC	2	6	569063	569068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422050
15069	NC_007925	ATC	2	6	569137	569142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422050
15070	NC_007925	GAT	2	6	569261	569266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90422050
15071	NC_007925	GCC	2	6	569318	569323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15072	NC_007925	AGC	2	6	569326	569331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422050
15073	NC_007925	GCC	2	6	569342	569347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422050
15074	NC_007925	GCCG	2	8	569417	569424	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15075	NC_007925	CG	3	6	569441	569446	0 %	0 %	50 %	50 %	90422050
15076	NC_007925	AAG	2	6	569514	569519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422050
15077	NC_007925	GGCGG	2	10	569550	569559	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15078	NC_007925	CGC	2	6	569616	569621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_007925	CGG	2	6	569670	569675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_007925	ATC	2	6	569676	569681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_007925	CGT	2	6	569712	569717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_007925	ACCCCC	2	12	569726	569737	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15083	NC_007925	GGGGA	2	10	569754	569763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_007925	A	6	6	569823	569828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_007925	GCG	2	6	569837	569842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_007925	TTGAA	2	10	569927	569936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_007925	CG	3	6	569950	569955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15088	NC_007925	CTCCC	2	10	569966	569975	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15089	NC_007925	GGGGT	2	10	569994	570003	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_007925	TGC	2	6	570100	570105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_007925	GCCT	2	8	570110	570117	0 %	25 %	25 %	50 %	90422051
15092	NC_007925	ACC	2	6	570160	570165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422051
15093	NC_007925	GC	3	6	570170	570175	0 %	0 %	50 %	50 %	90422051
15094	NC_007925	GCC	2	6	570186	570191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422051
15095	NC_007925	CGA	2	6	570195	570200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15096	NC_007925	CGA	2	6	570225	570230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15097	NC_007925	GCG	2	6	570245	570250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15098	NC_007925	GCT	2	6	570279	570284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15099	NC_007925	GGC	2	6	570291	570296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15100	NC_007925	CGG	2	6	570297	570302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15101	NC_007925	GCG	3	9	570329	570337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15102	NC_007925	TGG	2	6	570350	570355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422051
15103	NC_007925	GGT	2	6	570393	570398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90422051
15104	NC_007925	GCC	2	6	570405	570410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422051
15105	NC_007925	TTG	2	6	570424	570429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90422051
15106	NC_007925	GGC	2	6	570450	570455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15107	NC_007925	GCT	2	6	570470	570475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15108	NC_007925	CGG	2	6	570510	570515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15109	NC_007925	GCGA	2	8	570546	570553	25 %	0 %	50 %	25 %	90422051
15110	NC_007925	GCC	2	6	570636	570641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422051
15111	NC_007925	CGG	2	6	570692	570697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422051
15112	NC_007925	CGT	2	6	570704	570709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15113	NC_007925	GCT	2	6	570716	570721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422051
15114	NC_007925	CAC	2	6	570753	570758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422051
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15116	NC_007925	CTT	2	6	570896	570901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90422051
15117	NC_007925	ATC	2	6	570904	570909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422051
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15119	NC_007925	CG	3	6	570993	570998	0 %	0 %	50 %	50 %	90422051
15120	NC_007925	GCC	2	6	571002	571007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422051
15121	NC_007925	GAA	2	6	571008	571013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90422051
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15141	NC_007925	GCC	2	6	571890	571895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422052
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15228	NC_007925	CAGC	2	8	575105	575112	25 %	0 %	25 %	50 %	90422056
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15242	NC_007925	CG	3	6	575600	575605	0 %	0 %	50 %	50 %	90422056
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15245	NC_007925	TCA	2	6	575698	575703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90422056
15246	NC_007925	CGC	2	6	575710	575715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422057
15247	NC_007925	TGC	2	6	575791	575796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422057
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15250	NC_007925	CTG	2	6	575873	575878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422057
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15335	NC_007925	CGTTG	2	10	578615	578624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15336	NC_007925	CGAT	2	8	578641	578648	25 %	25 %	25 %	25 %	90422060
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15354	NC_007925	GCG	2	6	579332	579337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15355	NC_007925	GAG	2	6	579345	579350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_007925	CGA	2	6	579353	579358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15357	NC_007925	CG	3	6	579413	579418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15358	NC_007925	GAC	2	6	579471	579476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15359	NC_007925	CGC	2	6	579477	579482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15360	NC_007925	CGT	2	6	579502	579507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422061
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15363	NC_007925	CCA	2	6	579568	579573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90422061
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15485	NC_007925	TCG	2	6	583841	583846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90422064
15486	NC_007925	CGG	2	6	583860	583865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422064
15487	NC_007925	CGC	2	6	583910	583915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422064
15488	NC_007925	GCC	4	12	583928	583939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422064
15489	NC_007925	GGC	2	6	583940	583945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90422064
15490	NC_007925	TCG	2	6	583964	583969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_007925	ACCTC	2	10	583999	584008	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15492	NC_007925	CGC	2	6	584071	584076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15493	NC_007925	CGCC	2	8	584086	584093	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15494	NC_007925	GC	3	6	584148	584153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15495	NC_007925	GGC	2	6	584182	584187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15496	NC_007925	TCA	2	6	584220	584225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15497	NC_007925	TCGC	2	8	584264	584271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15498	NC_007925	CGA	2	6	584280	584285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90422065
15499	NC_007925	CAA	2	6	584304	584309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90422065
15500	NC_007925	GCC	2	6	584345	584350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90422065

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