MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 145047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_007925	ACC	2	6	455150	455155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90421947
12003	NC_007925	CGC	2	6	455161	455166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12004	NC_007925	ATC	2	6	455190	455195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_007925	GCA	2	6	455284	455289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_007925	GCG	2	6	455310	455315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_007925	CAC	2	6	455316	455321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12008	NC_007925	GCG	2	6	455331	455336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_007925	ATCT	2	8	455380	455387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12010	NC_007925	GCGTG	2	10	455400	455409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12011	NC_007925	GAT	2	6	455541	455546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421948
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12013	NC_007925	GCG	2	6	455579	455584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
12014	NC_007925	GGC	2	6	455609	455614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
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12018	NC_007925	GCG	2	6	455707	455712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
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12021	NC_007925	GC	4	8	455762	455769	0 %	0 %	50 %	50 %	90421948
12022	NC_007925	CGG	2	6	455781	455786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
12023	NC_007925	CGG	2	6	455891	455896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
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12031	NC_007925	TCGGC	2	10	456102	456111	0 %	20 %	40 %	40 %	90421948
12032	NC_007925	GGC	2	6	456124	456129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421948
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12035	NC_007925	GC	3	6	456276	456281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12039	NC_007925	CTCAC	2	10	456467	456476	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12040	NC_007925	AAT	2	6	456511	456516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_007925	CGG	2	6	456578	456583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_007925	GGT	2	6	456587	456592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_007925	CGGC	2	8	456622	456629	0 %	0 %	50 %	50 %	90421949
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12059	NC_007925	GCGCCG	2	12	457227	457238	0 %	0 %	50 %	50 %	90421949
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12065	NC_007925	TGC	2	6	457459	457464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421949
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12083	NC_007925	CGAT	2	8	457975	457982	25 %	25 %	25 %	25 %	90421950
12084	NC_007925	GCC	2	6	457986	457991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421950
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12088	NC_007925	GC	3	6	458080	458085	0 %	0 %	50 %	50 %	90421950
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12105	NC_007925	CAT	2	6	458473	458478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421950
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12108	NC_007925	GCA	2	6	458559	458564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421950
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12110	NC_007925	TCGCG	2	10	458625	458634	0 %	20 %	40 %	40 %	90421950
12111	NC_007925	CCCA	2	8	458833	458840	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12112	NC_007925	CAAC	2	8	458924	458931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12113	NC_007925	AAC	2	6	458941	458946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12124	NC_007925	GCG	2	6	459436	459441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
12125	NC_007925	CACCGT	2	12	459443	459454	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	90421951
12126	NC_007925	GCA	2	6	459502	459507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421951
12127	NC_007925	CGG	2	6	459521	459526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
12128	NC_007925	CGG	2	6	459535	459540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
12129	NC_007925	GCC	2	6	459551	459556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421951
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12143	NC_007925	CGC	3	9	459986	459994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421951
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12145	NC_007925	GCCG	2	8	460034	460041	0 %	0 %	50 %	50 %	90421951
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12152	NC_007925	CGA	2	6	460256	460261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421951
12153	NC_007925	GCG	2	6	460288	460293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
12154	NC_007925	ATCGGC	2	12	460305	460316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421951
12155	NC_007925	GCG	3	9	460317	460325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
12156	NC_007925	T	6	6	460350	460355	0 %	100 %	0 %	0 %	90421951
12157	NC_007925	GCT	2	6	460379	460384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421951
12158	NC_007925	TGT	2	6	460411	460416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90421951
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12164	NC_007925	CGG	2	6	460561	460566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
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12167	NC_007925	GC	3	6	460618	460623	0 %	0 %	50 %	50 %	90421951
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12172	NC_007925	TTC	2	6	460887	460892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421951
12173	NC_007925	CGGCG	2	10	460913	460922	0 %	0 %	60 %	40 %	90421951
12174	NC_007925	CCGGAT	2	12	460937	460948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421951
12175	NC_007925	GCG	2	6	460961	460966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421951
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12177	NC_007925	ATCC	2	8	461025	461032	25 %	25 %	0 %	50 %	90421951
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12179	NC_007925	TGCA	2	8	461067	461074	25 %	25 %	25 %	25 %	90421951
12180	NC_007925	CGA	2	6	461093	461098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421951
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12190	NC_007925	TAC	2	6	461500	461505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421952
12191	NC_007925	TTC	2	6	461509	461514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90421952
12192	NC_007925	TCG	2	6	461543	461548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421952
12193	NC_007925	GCT	2	6	461652	461657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421952
12194	NC_007925	CGG	2	6	461688	461693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421952
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12207	NC_007925	CGA	2	6	462387	462392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421952
12208	NC_007925	CG	3	6	462404	462409	0 %	0 %	50 %	50 %	90421952
12209	NC_007925	CGT	2	6	462411	462416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421952
12210	NC_007925	GCTCGG	2	12	462432	462443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	90421952
12211	NC_007925	GC	3	6	462537	462542	0 %	0 %	50 %	50 %	90421952
12212	NC_007925	ATC	2	6	462568	462573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421952
12213	NC_007925	ACG	2	6	462761	462766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421952
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12215	NC_007925	CGATCT	2	12	462824	462835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	90421952
12216	NC_007925	CCGAT	2	10	462845	462854	20 %	20 %	20 %	40 %	90421952
12217	NC_007925	CGA	2	6	463032	463037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421952
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12219	NC_007925	GAC	2	6	463229	463234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421952
12220	NC_007925	CGG	2	6	463237	463242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12221	NC_007925	GCG	2	6	463288	463293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12222	NC_007925	CGC	2	6	463301	463306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12223	NC_007925	CAC	2	6	463367	463372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12224	NC_007925	GCG	2	6	463382	463387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_007925	CGC	4	12	463514	463525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421953
12226	NC_007925	CG	3	6	463590	463595	0 %	0 %	50 %	50 %	90421953
12227	NC_007925	CGGC	2	8	463621	463628	0 %	0 %	50 %	50 %	90421953
12228	NC_007925	CG	3	6	463652	463657	0 %	0 %	50 %	50 %	90421953
12229	NC_007925	GC	3	6	463826	463831	0 %	0 %	50 %	50 %	90421953
12230	NC_007925	CG	3	6	463897	463902	0 %	0 %	50 %	50 %	90421953
12231	NC_007925	TCACCA	2	12	464032	464043	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	90421953
12232	NC_007925	TCA	2	6	464059	464064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421953
12233	NC_007925	CAT	2	6	464165	464170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421953
12234	NC_007925	CGCGAC	2	12	464211	464222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	90421953
12235	NC_007925	CGC	2	6	464252	464257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421953
12236	NC_007925	GCG	2	6	464278	464283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421953
12237	NC_007925	GCTC	2	8	464284	464291	0 %	25 %	25 %	50 %	90421953
12238	NC_007925	CGA	3	9	464324	464332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421953
12239	NC_007925	TGC	2	6	464341	464346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421953
12240	NC_007925	TCG	2	6	464373	464378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421953
12241	NC_007925	CAA	2	6	464423	464428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90421953
12242	NC_007925	CGGCAT	2	12	464456	464467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421953
12243	NC_007925	GCAACC	2	12	464521	464532	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	90421953
12244	NC_007925	GGC	2	6	464574	464579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421953
12245	NC_007925	CGACGG	2	12	464618	464629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	90421953
12246	NC_007925	CGG	2	6	464716	464721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421953
12247	NC_007925	TGC	2	6	464728	464733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421953
12248	NC_007925	CGG	2	6	464768	464773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421953
12249	NC_007925	CGC	3	9	464800	464808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421953
12250	NC_007925	GCCA	2	8	464830	464837	25 %	0 %	25 %	50 %	90421953
12251	NC_007925	ACCGTC	2	12	464846	464857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	90421954
12252	NC_007925	CG	3	6	464879	464884	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12253	NC_007925	TGC	2	6	464916	464921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12254	NC_007925	GC	3	6	464934	464939	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12255	NC_007925	CGA	2	6	465028	465033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421954
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12257	NC_007925	GCCG	2	8	465056	465063	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12258	NC_007925	GCT	2	6	465067	465072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12259	NC_007925	GCG	2	6	465104	465109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421954
12260	NC_007925	CG	3	6	465139	465144	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12261	NC_007925	CGCC	2	8	465159	465166	0 %	0 %	25 %	75 %	90421954
12262	NC_007925	CGC	2	6	465205	465210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421954
12263	NC_007925	GCT	2	6	465271	465276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12264	NC_007925	CGGC	2	8	465277	465284	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12265	NC_007925	CG	3	6	465285	465290	0 %	0 %	50 %	50 %	90421954
12266	NC_007925	TGC	2	6	465291	465296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
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12268	NC_007925	CGA	2	6	465370	465375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421954
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12270	NC_007925	GGC	2	6	465463	465468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421954
12271	NC_007925	GAGC	2	8	465481	465488	25 %	0 %	50 %	25 %	90421954
12272	NC_007925	CGA	2	6	465535	465540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12273	NC_007925	CGC	2	6	465577	465582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421954
12274	NC_007925	TGC	2	6	465597	465602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12275	NC_007925	GAC	2	6	465611	465616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421954
12276	NC_007925	AGA	2	6	465621	465626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90421954
12277	NC_007925	GCT	2	6	465631	465636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421954
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12280	NC_007925	CAT	2	6	465753	465758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421955
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12282	NC_007925	GC	3	6	465857	465862	0 %	0 %	50 %	50 %	90421955
12283	NC_007925	CGGCGC	2	12	465876	465887	0 %	0 %	50 %	50 %	90421955
12284	NC_007925	CGT	3	9	465894	465902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421955
12285	NC_007925	ACG	2	6	465962	465967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421955
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12287	NC_007925	CTG	2	6	466003	466008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421955
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12295	NC_007925	GCA	2	6	466463	466468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421955
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12299	NC_007925	ATC	2	6	466725	466730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421956
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12303	NC_007925	CG	3	6	466845	466850	0 %	0 %	50 %	50 %	90421956
12304	NC_007925	CGG	2	6	466913	466918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421956
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12311	NC_007925	CCG	2	6	467032	467037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421956
12312	NC_007925	GCC	2	6	467057	467062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421956
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12314	NC_007925	GAG	2	6	467115	467120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12315	NC_007925	CCG	2	6	467176	467181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421957
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12320	NC_007925	GCG	2	6	467339	467344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421957
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12322	NC_007925	GCT	2	6	467441	467446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421957
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12331	NC_007925	GCCCG	2	10	467775	467784	0 %	0 %	40 %	60 %	90421957
12332	NC_007925	TCG	2	6	467854	467859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421957
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12337	NC_007925	CAGCGT	2	12	467966	467977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90421957
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12340	NC_007925	GAT	2	6	468086	468091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421957
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12343	NC_007925	GCG	2	6	468173	468178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12344	NC_007925	GCA	2	6	468195	468200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12345	NC_007925	CAG	2	6	468352	468357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421958
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12347	NC_007925	CT	4	8	468412	468419	0 %	50 %	0 %	50 %	90421958
12348	NC_007925	GCG	2	6	468458	468463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421958
12349	NC_007925	CGA	2	6	468468	468473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421958
12350	NC_007925	CGA	2	6	468490	468495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421958
12351	NC_007925	GATCT	2	10	468518	468527	20 %	40 %	20 %	20 %	90421958
12352	NC_007925	GGCT	2	8	468542	468549	0 %	25 %	50 %	25 %	90421958
12353	NC_007925	GC	3	6	468576	468581	0 %	0 %	50 %	50 %	90421958
12354	NC_007925	ATG	2	6	468703	468708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421958
12355	NC_007925	GCAAC	2	10	468735	468744	40 %	0 %	20 %	40 %	90421958
12356	NC_007925	GAT	2	6	468805	468810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421959
12357	NC_007925	TGA	2	6	468840	468845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90421959
12358	NC_007925	GCG	2	6	468879	468884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421959
12359	NC_007925	GCC	2	6	469063	469068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421959
12360	NC_007925	TCA	2	6	469095	469100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90421959
12361	NC_007925	CTG	2	6	469101	469106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421959
12362	NC_007925	CCTGT	2	10	469123	469132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12363	NC_007925	T	6	6	469148	469153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12364	NC_007925	CGG	3	9	469159	469167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12365	NC_007925	CGT	2	6	469186	469191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12367	NC_007925	CGC	2	6	469286	469291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12491	NC_007925	CGG	2	6	474698	474703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421964
12492	NC_007925	TCG	2	6	474718	474723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90421964
12493	NC_007925	CG	3	6	474802	474807	0 %	0 %	50 %	50 %	90421964
12494	NC_007925	CG	3	6	474859	474864	0 %	0 %	50 %	50 %	90421964
12495	NC_007925	GACC	2	8	474875	474882	25 %	0 %	25 %	50 %	90421964
12496	NC_007925	CGAC	2	8	474919	474926	25 %	0 %	25 %	50 %	90421964
12497	NC_007925	GCG	2	6	474956	474961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90421964
12498	NC_007925	CG	3	6	475003	475008	0 %	0 %	50 %	50 %	90421964
12499	NC_007925	CCG	2	6	475013	475018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90421964
12500	NC_007925	CGA	2	6	475046	475051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90421964

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