MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007766	AGG	2	6	630657	630662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361292
14502	NC_007766	GCCC	2	8	630676	630683	0 %	0 %	25 %	75 %	86361292
14503	NC_007766	CAGG	2	8	630769	630776	25 %	0 %	50 %	25 %	86361292
14504	NC_007766	ATC	2	6	630806	630811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361292
14505	NC_007766	TCGA	2	8	630812	630819	25 %	25 %	25 %	25 %	86361292
14506	NC_007766	CGG	2	6	630864	630869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361292
14507	NC_007766	CGTG	2	8	630871	630878	0 %	25 %	50 %	25 %	86361292
14508	NC_007766	CG	3	6	630998	631003	0 %	0 %	50 %	50 %	86361292
14509	NC_007766	CGA	2	6	631047	631052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361292
14510	NC_007766	GC	3	6	631074	631079	0 %	0 %	50 %	50 %	86361292
14511	NC_007766	GCC	2	6	631104	631109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361292
14512	NC_007766	CTC	2	6	631127	631132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361292
14513	NC_007766	GGC	2	6	631146	631151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361292
14514	NC_007766	CCAG	2	8	631155	631162	25 %	0 %	25 %	50 %	86361292
14515	NC_007766	AGA	2	6	631350	631355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361292
14516	NC_007766	CGG	2	6	631365	631370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361292
14517	NC_007766	GTG	2	6	631393	631398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361292
14518	NC_007766	CCT	2	6	631452	631457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361292
14519	NC_007766	GTG	2	6	631463	631468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361292
14520	NC_007766	GAC	2	6	631519	631524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361292
14521	NC_007766	CGC	2	6	631530	631535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361292
14522	NC_007766	CGA	2	6	631536	631541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361292
14523	NC_007766	GCG	2	6	631571	631576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361292
14524	NC_007766	GCC	2	6	631591	631596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361292
14525	NC_007766	TCT	2	6	631620	631625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361292
14526	NC_007766	GATC	2	8	631693	631700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14527	NC_007766	CTT	2	6	631707	631712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_007766	TGGA	2	8	631729	631736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_007766	GCT	2	6	631808	631813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_007766	TCC	2	6	631836	631841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_007766	ATCAA	2	10	631858	631867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14532	NC_007766	TAAT	2	8	631880	631887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_007766	GCA	2	6	631888	631893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_007766	GAG	2	6	631901	631906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_007766	GAG	2	6	631946	631951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_007766	CAT	2	6	631955	631960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361293
14537	NC_007766	CCA	2	6	632038	632043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361293
14538	NC_007766	TCG	2	6	632080	632085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14539	NC_007766	ACGA	2	8	632094	632101	50 %	0 %	25 %	25 %	86361293
14540	NC_007766	TCG	2	6	632152	632157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14541	NC_007766	TCA	2	6	632161	632166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361293
14542	NC_007766	GCC	2	6	632274	632279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361293
14543	NC_007766	GAA	2	6	632352	632357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361293
14544	NC_007766	TGG	3	9	632421	632429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361293
14545	NC_007766	TCG	2	6	632467	632472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14546	NC_007766	GAA	2	6	632501	632506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361293
14547	NC_007766	CCA	2	6	632521	632526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361293
14548	NC_007766	CGG	2	6	632555	632560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361293
14549	NC_007766	ATT	2	6	632596	632601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86361293
14550	NC_007766	CGG	2	6	632609	632614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361293
14551	NC_007766	TCG	2	6	632620	632625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14552	NC_007766	ACT	2	6	632689	632694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361293
14553	NC_007766	TCG	2	6	632704	632709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14554	NC_007766	CAC	2	6	632735	632740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361293
14555	NC_007766	CGC	2	6	632765	632770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361293
14556	NC_007766	ACG	2	6	632784	632789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14557	NC_007766	CGG	2	6	632801	632806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361293
14558	NC_007766	CGA	2	6	632840	632845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361293
14559	NC_007766	CTTC	2	8	632932	632939	0 %	50 %	0 %	50 %	86361293
14560	NC_007766	CAAGGA	2	12	632942	632953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86361293
14561	NC_007766	GC	3	6	632979	632984	0 %	0 %	50 %	50 %	86361293
14562	NC_007766	GCA	3	9	633014	633022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361293
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14564	NC_007766	TCT	2	6	633061	633066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361293
14565	NC_007766	CAA	2	6	633077	633082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361293
14566	NC_007766	TCG	2	6	633100	633105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361293
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14568	NC_007766	CCAGAT	2	12	633152	633163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86361293
14569	NC_007766	ATG	2	6	633165	633170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361293
14570	NC_007766	GAA	2	6	633191	633196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361293
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14572	NC_007766	GCG	2	6	633228	633233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361293
14573	NC_007766	GCC	2	6	633302	633307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14574	NC_007766	CCCTG	2	10	633571	633580	0 %	20 %	20 %	60 %	86361294
14575	NC_007766	TCG	2	6	633595	633600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361294
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14580	NC_007766	CAC	2	6	633848	633853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361294
14581	NC_007766	GAC	2	6	633863	633868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361294
14582	NC_007766	CGG	2	6	633902	633907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361294
14583	NC_007766	CAT	2	6	633908	633913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361294
14584	NC_007766	GC	3	6	633946	633951	0 %	0 %	50 %	50 %	86361294
14585	NC_007766	GTC	2	6	634068	634073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361294
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14587	NC_007766	ATCG	2	8	634091	634098	25 %	25 %	25 %	25 %	86361294
14588	NC_007766	AGC	2	6	634115	634120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361294
14589	NC_007766	GCA	2	6	634145	634150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361294
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14591	NC_007766	GC	3	6	634178	634183	0 %	0 %	50 %	50 %	86361294
14592	NC_007766	GCG	2	6	634258	634263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361294
14593	NC_007766	GC	3	6	634271	634276	0 %	0 %	50 %	50 %	86361294
14594	NC_007766	TC	3	6	634328	634333	0 %	50 %	0 %	50 %	86361294
14595	NC_007766	CGG	2	6	634334	634339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361294
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14600	NC_007766	CTG	2	6	634517	634522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361295
14601	NC_007766	GC	3	6	634565	634570	0 %	0 %	50 %	50 %	86361295
14602	NC_007766	TCA	2	6	634602	634607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361295
14603	NC_007766	CAA	2	6	634615	634620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361295
14604	NC_007766	ATCT	2	8	634634	634641	25 %	50 %	0 %	25 %	86361295
14605	NC_007766	CGC	2	6	634702	634707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361295
14606	NC_007766	GAT	2	6	634750	634755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361295
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14608	NC_007766	CGC	2	6	634782	634787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361295
14609	NC_007766	TCA	2	6	634791	634796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361295
14610	NC_007766	CTG	2	6	634832	634837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361295
14611	NC_007766	AC	3	6	634839	634844	50 %	0 %	0 %	50 %	86361295
14612	NC_007766	CGT	2	6	634852	634857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361295
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.