MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_007766	GCT	2	6	584549	584554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361247
13502	NC_007766	GACG	2	8	584564	584571	25 %	0 %	50 %	25 %	86361247
13503	NC_007766	GGA	2	6	584615	584620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361247
13504	NC_007766	GGGC	2	8	584722	584729	0 %	0 %	75 %	25 %	86361247
13505	NC_007766	CA	3	6	584920	584925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13506	NC_007766	TGCG	2	8	584957	584964	0 %	25 %	50 %	25 %	86361248
13507	NC_007766	CGC	3	9	584992	585000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
13508	NC_007766	GC	3	6	585019	585024	0 %	0 %	50 %	50 %	86361248
13509	NC_007766	CGC	2	6	585048	585053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
13510	NC_007766	ACG	2	6	585062	585067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13511	NC_007766	ACCCG	2	10	585127	585136	20 %	0 %	20 %	60 %	86361248
13512	NC_007766	GAT	2	6	585184	585189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361248
13513	NC_007766	AGA	2	6	585218	585223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361248
13514	NC_007766	GCA	2	6	585240	585245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13515	NC_007766	GCC	2	6	585312	585317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
13516	NC_007766	ATC	2	6	585355	585360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361248
13517	NC_007766	GC	3	6	585400	585405	0 %	0 %	50 %	50 %	86361248
13518	NC_007766	CTC	2	6	585478	585483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361248
13519	NC_007766	TCG	2	6	585536	585541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13520	NC_007766	CTT	2	6	585556	585561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361248
13521	NC_007766	CAGC	2	8	585618	585625	25 %	0 %	25 %	50 %	86361248
13522	NC_007766	TGC	2	6	585690	585695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13523	NC_007766	CGA	2	6	585717	585722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13524	NC_007766	CCG	2	6	585723	585728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
13525	NC_007766	CTGC	2	8	585765	585772	0 %	25 %	25 %	50 %	86361248
13526	NC_007766	GATC	2	8	585864	585871	25 %	25 %	25 %	25 %	86361248
13527	NC_007766	TCG	2	6	585957	585962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13528	NC_007766	GCC	3	9	585967	585975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
13529	NC_007766	CGT	2	6	585999	586004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
13530	NC_007766	TCA	2	6	586041	586046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361248
13531	NC_007766	AAACCG	2	12	586143	586154	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	86361248
13532	NC_007766	ATTC	2	8	586191	586198	25 %	50 %	0 %	25 %	86361248
13533	NC_007766	CG	3	6	586338	586343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13534	NC_007766	ATG	2	6	586364	586369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_007766	ATC	2	6	586385	586390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_007766	CTG	3	9	586773	586781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361249
13537	NC_007766	GAT	2	6	586809	586814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361250
13538	NC_007766	CGGCG	2	10	586857	586866	0 %	0 %	60 %	40 %	86361250
13539	NC_007766	CTT	2	6	586869	586874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361250
13540	NC_007766	TCA	2	6	586949	586954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361250
13541	NC_007766	GGCT	2	8	586975	586982	0 %	25 %	50 %	25 %	86361250
13542	NC_007766	CTG	2	6	586987	586992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13543	NC_007766	GC	3	6	587000	587005	0 %	0 %	50 %	50 %	86361250
13544	NC_007766	TGC	2	6	587006	587011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13545	NC_007766	CCGG	2	8	587048	587055	0 %	0 %	50 %	50 %	86361250
13546	NC_007766	CGGGCT	2	12	587088	587099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86361250
13547	NC_007766	CGGCCG	2	12	587135	587146	0 %	0 %	50 %	50 %	86361250
13548	NC_007766	CGG	2	6	587168	587173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361250
13549	NC_007766	CTG	2	6	587176	587181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13550	NC_007766	GGC	2	6	587235	587240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361250
13551	NC_007766	GCC	2	6	587245	587250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
13552	NC_007766	CGC	2	6	587252	587257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
13553	NC_007766	TGCCC	2	10	587370	587379	0 %	20 %	20 %	60 %	86361250
13554	NC_007766	GGAT	2	8	587404	587411	25 %	25 %	50 %	0 %	86361250
13555	NC_007766	GCT	2	6	587442	587447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13556	NC_007766	CGA	2	6	587543	587548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13557	NC_007766	CTCG	2	8	587559	587566	0 %	25 %	25 %	50 %	86361250
13558	NC_007766	TTC	2	6	587596	587601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361250
13559	NC_007766	CTG	2	6	587707	587712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13560	NC_007766	TTCCG	2	10	587718	587727	0 %	40 %	20 %	40 %	86361250
13561	NC_007766	CGC	2	6	587754	587759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
13562	NC_007766	GGCT	2	8	587800	587807	0 %	25 %	50 %	25 %	86361250
13563	NC_007766	TTCCT	2	10	587843	587852	0 %	60 %	0 %	40 %	86361250
13564	NC_007766	CTC	2	6	587878	587883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361250
13565	NC_007766	CGC	2	6	587897	587902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
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13567	NC_007766	GCC	2	6	587935	587940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
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13569	NC_007766	TCT	2	6	587951	587956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361250
13570	NC_007766	CGT	2	6	587964	587969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
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13572	NC_007766	CGC	2	6	588076	588081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361250
13573	NC_007766	TCG	2	6	588137	588142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361250
13574	NC_007766	CGG	2	6	588212	588217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361251
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13579	NC_007766	CGC	2	6	588484	588489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361251
13580	NC_007766	GCT	2	6	588554	588559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361251
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13582	NC_007766	GAC	4	12	588828	588839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361252
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13586	NC_007766	GCG	2	6	589011	589016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_007766	CGA	2	6	589041	589046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361253
13588	NC_007766	CAA	2	6	589129	589134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361253
13589	NC_007766	GTG	2	6	589142	589147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361253
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13591	NC_007766	GCA	2	6	589190	589195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361253
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13593	NC_007766	CAT	3	9	589282	589290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361253
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13596	NC_007766	GCA	2	6	589398	589403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361253
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13598	NC_007766	GA	3	6	589531	589536	50 %	0 %	50 %	0 %	86361253
13599	NC_007766	GAT	2	6	589549	589554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361253
13600	NC_007766	TGAT	2	8	589607	589614	25 %	50 %	25 %	0 %	86361253
13601	NC_007766	CGA	2	6	589650	589655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361253
13602	NC_007766	TGA	2	6	589659	589664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361253
13603	NC_007766	CGAC	2	8	589749	589756	25 %	0 %	25 %	50 %	86361253
13604	NC_007766	CGA	2	6	589773	589778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361253
13605	NC_007766	CCA	2	6	589806	589811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361253
13606	NC_007766	CG	3	6	589817	589822	0 %	0 %	50 %	50 %	86361253
13607	NC_007766	TGGCGG	2	12	589860	589871	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	86361253
13608	NC_007766	TCGC	2	8	589889	589896	0 %	25 %	25 %	50 %	86361253
13609	NC_007766	CCGG	2	8	589909	589916	0 %	0 %	50 %	50 %	86361253
13610	NC_007766	GCG	2	6	589937	589942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361253
13611	NC_007766	GGC	2	6	589965	589970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361253
13612	NC_007766	TGC	2	6	590101	590106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361253
13613	NC_007766	GCC	3	9	590138	590146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361253
13614	NC_007766	AGAA	2	8	590147	590154	75 %	0 %	25 %	0 %	86361253
13615	NC_007766	AAGAG	2	10	590169	590178	60 %	0 %	40 %	0 %	86361253
13616	NC_007766	CA	3	6	590263	590268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13617	NC_007766	CAG	2	6	590288	590293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_007766	TCT	2	6	590381	590386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_007766	GCG	2	6	590405	590410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_007766	TGC	2	6	590487	590492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361254
13621	NC_007766	ATC	2	6	590515	590520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361254
13622	NC_007766	GCG	2	6	590530	590535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361254
13623	NC_007766	GCC	2	6	590628	590633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361254
13624	NC_007766	TCA	2	6	590646	590651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361254
13625	NC_007766	AGA	2	6	590708	590713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361254
13626	NC_007766	TGG	2	6	590783	590788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361254
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13988	NC_007766	CGCC	2	8	607384	607391	0 %	0 %	25 %	75 %	86361271
13989	NC_007766	TCC	2	6	607415	607420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361271
13990	NC_007766	TCG	2	6	607501	607506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361271
13991	NC_007766	T	6	6	607530	607535	0 %	100 %	0 %	0 %	86361271
13992	NC_007766	CGC	2	6	607558	607563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361271
13993	NC_007766	GACG	2	8	607591	607598	25 %	0 %	50 %	25 %	86361271
13994	NC_007766	GTT	2	6	607647	607652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86361271
13995	NC_007766	CG	3	6	607674	607679	0 %	0 %	50 %	50 %	86361271
13996	NC_007766	CTTGCG	2	12	607698	607709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361271
13997	NC_007766	CAG	2	6	607727	607732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361271
13998	NC_007766	GCG	2	6	607783	607788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361271
13999	NC_007766	CGA	2	6	607853	607858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361271
14000	NC_007766	GAC	3	9	607908	607916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361271

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