MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007766	ACGA	2	8	563766	563773	50 %	0 %	25 %	25 %	86361228
13002	NC_007766	GAT	2	6	563792	563797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
13003	NC_007766	GGC	2	6	563834	563839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
13004	NC_007766	ATCG	2	8	563913	563920	25 %	25 %	25 %	25 %	86361228
13005	NC_007766	TTC	2	6	563951	563956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361229
13006	NC_007766	GGC	2	6	563989	563994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361229
13007	NC_007766	GTC	2	6	564004	564009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361229
13008	NC_007766	AGG	2	6	564044	564049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361229
13009	NC_007766	AGC	2	6	564065	564070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361229
13010	NC_007766	AGAT	2	8	564083	564090	50 %	25 %	25 %	0 %	86361229
13011	NC_007766	GCC	2	6	564123	564128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13012	NC_007766	GC	4	8	564130	564137	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13013	NC_007766	ACG	2	6	564193	564198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13014	NC_007766	CGA	2	6	564204	564209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13015	NC_007766	CCG	2	6	564224	564229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13016	NC_007766	GCG	2	6	564236	564241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13017	NC_007766	CG	3	6	564331	564336	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13018	NC_007766	CGGCA	2	10	564351	564360	20 %	0 %	40 %	40 %	86361230
13019	NC_007766	CGG	2	6	564389	564394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13020	NC_007766	CCTG	2	8	564395	564402	0 %	25 %	25 %	50 %	86361230
13021	NC_007766	GGCG	2	8	564420	564427	0 %	0 %	75 %	25 %	86361230
13022	NC_007766	GCG	2	6	564442	564447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13023	NC_007766	GGGC	2	8	564452	564459	0 %	0 %	75 %	25 %	86361230
13024	NC_007766	CGA	2	6	564593	564598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13025	NC_007766	ATC	2	6	564619	564624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361230
13026	NC_007766	GCG	2	6	564643	564648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13027	NC_007766	GTC	2	6	564687	564692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13028	NC_007766	TTC	2	6	564721	564726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361230
13029	NC_007766	ACC	2	6	564733	564738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361230
13030	NC_007766	GCC	2	6	564757	564762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13031	NC_007766	CCG	2	6	564841	564846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13032	NC_007766	CGAAGG	2	12	564866	564877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86361230
13033	NC_007766	GGC	2	6	564998	565003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13034	NC_007766	CGA	2	6	565034	565039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13035	NC_007766	ATG	2	6	565084	565089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
13036	NC_007766	CGG	2	6	565093	565098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
13037	NC_007766	ACC	2	6	565126	565131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361230
13038	NC_007766	ACCGCG	2	12	565174	565185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86361230
13039	NC_007766	CGC	2	6	565208	565213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13040	NC_007766	AGG	2	6	565235	565240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361230
13041	NC_007766	ACG	2	6	565258	565263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13042	NC_007766	TGC	2	6	565275	565280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13043	NC_007766	GCC	2	6	565314	565319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13044	NC_007766	GCC	2	6	565324	565329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13045	NC_007766	GAT	2	6	565341	565346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
13046	NC_007766	AAG	2	6	565353	565358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361230
13047	NC_007766	TCG	2	6	565376	565381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13048	NC_007766	CTGC	2	8	565432	565439	0 %	25 %	25 %	50 %	86361230
13049	NC_007766	GCT	2	6	565455	565460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13050	NC_007766	CGC	2	6	565496	565501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13051	NC_007766	GCCG	2	8	565533	565540	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13052	NC_007766	TCAGCA	2	12	565604	565615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86361230
13053	NC_007766	CG	3	6	565622	565627	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13054	NC_007766	CGC	2	6	565653	565658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13055	NC_007766	CAG	2	6	565701	565706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13056	NC_007766	CAG	2	6	565713	565718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13057	NC_007766	GC	3	6	565841	565846	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13058	NC_007766	GAA	3	9	565860	565868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361230
13059	NC_007766	GCGCCG	2	12	565886	565897	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13060	NC_007766	ATC	2	6	565900	565905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361230
13061	NC_007766	CG	3	6	565928	565933	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
13062	NC_007766	CGC	2	6	565935	565940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13063	NC_007766	AGC	2	6	565969	565974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13064	NC_007766	ATG	2	6	565975	565980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
13065	NC_007766	CAG	3	9	566013	566021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
13066	NC_007766	CGGT	2	8	566035	566042	0 %	25 %	50 %	25 %	86361230
13067	NC_007766	CGC	2	6	566094	566099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
13068	NC_007766	CGGA	2	8	566108	566115	25 %	0 %	50 %	25 %	86361230
13069	NC_007766	CGCC	2	8	566121	566128	0 %	0 %	25 %	75 %	86361230
13070	NC_007766	TCC	2	6	566137	566142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361230
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13072	NC_007766	TGGC	2	8	566299	566306	0 %	25 %	50 %	25 %	86361230
13073	NC_007766	CTT	2	6	566315	566320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361230
13074	NC_007766	GGA	2	6	566328	566333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361230
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13077	NC_007766	CGA	2	6	566458	566463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361231
13078	NC_007766	CGC	2	6	566470	566475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361231
13079	NC_007766	TCG	2	6	566580	566585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361231
13080	NC_007766	C	6	6	566601	566606	0 %	0 %	0 %	100 %	86361231
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13087	NC_007766	AGC	2	6	566823	566828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361231
13088	NC_007766	CGT	2	6	566992	566997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13089	NC_007766	CGC	2	6	566998	567003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361232
13090	NC_007766	TGC	2	6	567038	567043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13091	NC_007766	CCTC	2	8	567071	567078	0 %	25 %	0 %	75 %	86361232
13092	NC_007766	GAC	2	6	567199	567204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13093	NC_007766	CGAT	2	8	567255	567262	25 %	25 %	25 %	25 %	86361232
13094	NC_007766	CGG	2	6	567270	567275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361232
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13096	NC_007766	CGGA	2	8	567292	567299	25 %	0 %	50 %	25 %	86361232
13097	NC_007766	GAT	2	6	567301	567306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361232
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13099	NC_007766	CGT	3	9	567345	567353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13100	NC_007766	TCCG	2	8	567388	567395	0 %	25 %	25 %	50 %	86361232
13101	NC_007766	CG	3	6	567450	567455	0 %	0 %	50 %	50 %	86361232
13102	NC_007766	GC	3	6	567501	567506	0 %	0 %	50 %	50 %	86361232
13103	NC_007766	CTG	2	6	567523	567528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13104	NC_007766	TGGGCC	2	12	567608	567619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86361232
13105	NC_007766	TTC	2	6	567620	567625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361232
13106	NC_007766	GCT	2	6	567639	567644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13107	NC_007766	GAC	2	6	567667	567672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13108	NC_007766	TCG	2	6	567683	567688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13109	NC_007766	GCC	2	6	567751	567756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361232
13110	NC_007766	GGC	3	9	567799	567807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361232
13111	NC_007766	AGA	2	6	567861	567866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361232
13112	NC_007766	CCG	2	6	567875	567880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361232
13113	NC_007766	CAG	2	6	567895	567900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361232
13114	NC_007766	CG	3	6	567971	567976	0 %	0 %	50 %	50 %	86361232
13115	NC_007766	CGA	3	9	568002	568010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361232
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13118	NC_007766	GAA	2	6	568153	568158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361232
13119	NC_007766	AGA	2	6	568161	568166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361232
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13121	NC_007766	GAG	2	6	568175	568180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361232
13122	NC_007766	CGA	2	6	568185	568190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361232
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13355	NC_007766	CTG	2	6	578249	578254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13358	NC_007766	CCGG	2	8	578271	578278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13359	NC_007766	GGT	2	6	578326	578331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_007766	GGGC	2	8	578366	578373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13361	NC_007766	CAT	2	6	578394	578399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13362	NC_007766	GCC	2	6	578460	578465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13364	NC_007766	AAACCG	2	12	578551	578562	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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