MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007766	GGC	2	6	542658	542663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361211
12502	NC_007766	TCG	2	6	542698	542703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361211
12503	NC_007766	CGGC	2	8	542716	542723	0 %	0 %	50 %	50 %	86361211
12504	NC_007766	GGT	2	6	542759	542764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361211
12505	NC_007766	TCG	2	6	542842	542847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361211
12506	NC_007766	GTG	2	6	542850	542855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361211
12507	NC_007766	CGC	2	6	542894	542899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361211
12508	NC_007766	GACC	2	8	542900	542907	25 %	0 %	25 %	50 %	86361211
12509	NC_007766	ATC	3	9	542919	542927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361211
12510	NC_007766	GTG	2	6	542954	542959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361211
12511	NC_007766	CAG	2	6	543045	543050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361211
12512	NC_007766	AAG	2	6	543072	543077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361211
12513	NC_007766	GTG	2	6	543084	543089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361211
12514	NC_007766	CGG	2	6	543146	543151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361211
12515	NC_007766	CG	3	6	543229	543234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_007766	CG	3	6	543247	543252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_007766	GCA	2	6	543280	543285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12518	NC_007766	TCA	2	6	543442	543447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12519	NC_007766	GGC	2	6	543450	543455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12520	NC_007766	GAAG	2	8	543468	543475	50 %	0 %	50 %	0 %	86361212
12521	NC_007766	GCGA	2	8	543480	543487	25 %	0 %	50 %	25 %	86361212
12522	NC_007766	TCG	2	6	543583	543588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12523	NC_007766	CAT	2	6	543599	543604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12524	NC_007766	CGG	2	6	543617	543622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12525	NC_007766	GC	3	6	543638	543643	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12526	NC_007766	ATC	2	6	543651	543656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12527	NC_007766	CGA	2	6	543800	543805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12528	NC_007766	TCG	2	6	543813	543818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12529	NC_007766	CGCC	2	8	543833	543840	0 %	0 %	25 %	75 %	86361212
12530	NC_007766	CCG	2	6	543857	543862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361212
12531	NC_007766	TCG	2	6	543865	543870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12532	NC_007766	CGGC	2	8	543871	543878	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12533	NC_007766	TCATCT	2	12	543886	543897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	86361212
12534	NC_007766	TCG	2	6	543937	543942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12535	NC_007766	CGT	2	6	543959	543964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12536	NC_007766	ATC	3	9	543991	543999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12537	NC_007766	AGG	2	6	544030	544035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361212
12538	NC_007766	GC	3	6	544053	544058	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12539	NC_007766	TC	3	6	544082	544087	0 %	50 %	0 %	50 %	86361212
12540	NC_007766	CGG	2	6	544096	544101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12541	NC_007766	GC	3	6	544116	544121	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12542	NC_007766	ATC	2	6	544131	544136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12543	NC_007766	GCT	3	9	544172	544180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12544	NC_007766	GCC	2	6	544191	544196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361212
12545	NC_007766	TCG	2	6	544240	544245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12546	NC_007766	CCG	2	6	544253	544258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361212
12547	NC_007766	CTCG	2	8	544310	544317	0 %	25 %	25 %	50 %	86361212
12548	NC_007766	CGCGG	2	10	544327	544336	0 %	0 %	60 %	40 %	86361212
12549	NC_007766	GCG	2	6	544382	544387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12550	NC_007766	CGG	2	6	544436	544441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12551	NC_007766	CAG	2	6	544446	544451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12552	NC_007766	CG	4	8	544463	544470	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12553	NC_007766	CG	4	8	544480	544487	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12554	NC_007766	CGT	2	6	544490	544495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12555	NC_007766	GCG	2	6	544516	544521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361212
12556	NC_007766	AGG	2	6	544540	544545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361212
12557	NC_007766	CAT	2	6	544553	544558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12558	NC_007766	CGA	2	6	544562	544567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361212
12559	NC_007766	CG	3	6	544573	544578	0 %	0 %	50 %	50 %	86361212
12560	NC_007766	ATC	2	6	544701	544706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361212
12561	NC_007766	GCC	2	6	544707	544712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361212
12562	NC_007766	CGC	2	6	544727	544732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361212
12563	NC_007766	CTG	2	6	544793	544798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12564	NC_007766	CGC	2	6	544801	544806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361213
12565	NC_007766	CG	3	6	544824	544829	0 %	0 %	50 %	50 %	86361213
12566	NC_007766	CTG	2	6	544853	544858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12567	NC_007766	CGA	2	6	544887	544892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12568	NC_007766	CGATCT	2	12	544921	544932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86361213
12569	NC_007766	TCG	2	6	544956	544961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12570	NC_007766	TCA	2	6	545052	545057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361213
12571	NC_007766	TCG	2	6	545082	545087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12572	NC_007766	GGC	2	6	545114	545119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361213
12573	NC_007766	TTG	2	6	545132	545137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86361213
12574	NC_007766	CGGG	2	8	545145	545152	0 %	0 %	75 %	25 %	86361213
12575	NC_007766	TGA	2	6	545178	545183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361213
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12580	NC_007766	TCT	2	6	545248	545253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361213
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12584	NC_007766	CTT	2	6	545371	545376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361213
12585	NC_007766	TCG	2	6	545400	545405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12586	NC_007766	GCT	2	6	545449	545454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
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12589	NC_007766	GC	3	6	545529	545534	0 %	0 %	50 %	50 %	86361213
12590	NC_007766	TGACGC	2	12	545535	545546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86361213
12591	NC_007766	TCCT	2	8	545564	545571	0 %	50 %	0 %	50 %	86361213
12592	NC_007766	ATC	2	6	545618	545623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361213
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12599	NC_007766	TGA	2	6	545933	545938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361214
12600	NC_007766	CTT	2	6	545968	545973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361214
12601	NC_007766	CGT	3	9	545991	545999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361214
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12603	NC_007766	ATC	2	6	546046	546051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361214
12604	NC_007766	GCC	2	6	546120	546125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361214
12605	NC_007766	CAC	2	6	546144	546149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361214
12606	NC_007766	TCG	2	6	546182	546187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361214
12607	NC_007766	CTC	2	6	546190	546195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361214
12608	NC_007766	ACCT	2	8	546319	546326	25 %	25 %	0 %	50 %	86361214
12609	NC_007766	CGG	2	6	546378	546383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361214
12610	NC_007766	GCA	2	6	546385	546390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361214
12611	NC_007766	CTG	2	6	546412	546417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361214
12612	NC_007766	CGT	3	9	546429	546437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361214
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12615	NC_007766	CGG	2	6	546459	546464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361214
12616	NC_007766	GTC	2	6	546514	546519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361214
12617	NC_007766	TCA	2	6	546560	546565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361214
12618	NC_007766	TCA	4	12	546575	546586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361214
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12620	NC_007766	CAT	2	6	546641	546646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361215
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12743	NC_007766	GGA	2	6	552620	552625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12992	NC_007766	TGA	2	6	563440	563445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
12993	NC_007766	GCG	2	6	563466	563471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
12994	NC_007766	ATG	2	6	563526	563531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
12995	NC_007766	TCGG	2	8	563561	563568	0 %	25 %	50 %	25 %	86361228
12996	NC_007766	GTAGGC	2	12	563633	563644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86361228
12997	NC_007766	GTC	2	6	563678	563683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361228
12998	NC_007766	GCAGAT	2	12	563690	563701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86361228
12999	NC_007766	CGG	2	6	563716	563721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
13000	NC_007766	TCA	2	6	563752	563757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361228

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