MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007766	TGC	2	6	477333	477338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11002	NC_007766	GGC	2	6	477340	477345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361153
11003	NC_007766	ACG	2	6	477347	477352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11004	NC_007766	TGCC	2	8	477394	477401	0 %	25 %	25 %	50 %	86361153
11005	NC_007766	CAA	2	6	477442	477447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361153
11006	NC_007766	AGA	2	6	477468	477473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361153
11007	NC_007766	GC	3	6	477481	477486	0 %	0 %	50 %	50 %	86361153
11008	NC_007766	CCGT	2	8	477504	477511	0 %	25 %	25 %	50 %	86361153
11009	NC_007766	CGA	2	6	477529	477534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11010	NC_007766	CGA	2	6	477538	477543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11011	NC_007766	GC	3	6	477629	477634	0 %	0 %	50 %	50 %	86361153
11012	NC_007766	GCC	2	6	477683	477688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361153
11013	NC_007766	GGGAC	2	10	477741	477750	20 %	0 %	60 %	20 %	86361153
11014	NC_007766	CTG	2	6	477782	477787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11015	NC_007766	ACGG	2	8	477788	477795	25 %	0 %	50 %	25 %	86361153
11016	NC_007766	AGT	2	6	477829	477834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361153
11017	NC_007766	AATC	2	8	477917	477924	50 %	25 %	0 %	25 %	86361153
11018	NC_007766	GGC	2	6	478034	478039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361153
11019	NC_007766	GCG	2	6	478050	478055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361153
11020	NC_007766	TCG	2	6	478112	478117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11021	NC_007766	TCG	3	9	478139	478147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11022	NC_007766	CAG	2	6	478158	478163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361153
11023	NC_007766	TC	3	6	478189	478194	0 %	50 %	0 %	50 %	86361153
11024	NC_007766	TCCG	2	8	478196	478203	0 %	25 %	25 %	50 %	86361153
11025	NC_007766	CGC	2	6	478243	478248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11026	NC_007766	TCA	2	6	478310	478315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361154
11027	NC_007766	CAT	2	6	478326	478331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361154
11028	NC_007766	TTC	2	6	478348	478353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361154
11029	NC_007766	CTC	2	6	478359	478364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361154
11030	NC_007766	GAT	2	6	478395	478400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361154
11031	NC_007766	CGA	2	6	478461	478466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361154
11032	NC_007766	TCG	2	6	478499	478504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361154
11033	NC_007766	GTC	2	6	478530	478535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361154
11034	NC_007766	CCGAT	2	10	478547	478556	20 %	20 %	20 %	40 %	86361154
11035	NC_007766	CGA	2	6	478557	478562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361154
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11040	NC_007766	TCACGG	2	12	479049	479060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86361155
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11043	NC_007766	TCGC	2	8	479123	479130	0 %	25 %	25 %	50 %	86361155
11044	NC_007766	CGA	2	6	479160	479165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361155
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11050	NC_007766	CGG	2	6	479346	479351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_007766	CCGTC	2	10	479374	479383	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11052	NC_007766	ATG	2	6	479388	479393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_007766	AATG	2	8	479436	479443	50 %	25 %	25 %	0 %	86361156
11054	NC_007766	GCG	2	6	479457	479462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361156
11055	NC_007766	GCG	2	6	479560	479565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361156
11056	NC_007766	GGAC	2	8	479571	479578	25 %	0 %	50 %	25 %	86361156
11057	NC_007766	GACC	2	8	479639	479646	25 %	0 %	25 %	50 %	86361156
11058	NC_007766	TGC	2	6	479693	479698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361156
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11060	NC_007766	CTT	2	6	479730	479735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361156
11061	NC_007766	ATC	2	6	479770	479775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361156
11062	NC_007766	GGGC	2	8	479795	479802	0 %	0 %	75 %	25 %	86361156
11063	NC_007766	CGG	2	6	479823	479828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361156
11064	NC_007766	CCGATC	2	12	479834	479845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86361156
11065	NC_007766	CAGGA	2	10	479848	479857	40 %	0 %	40 %	20 %	86361156
11066	NC_007766	GAA	2	6	479919	479924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361156
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11068	NC_007766	GAG	2	6	479947	479952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361156
11069	NC_007766	CAG	2	6	479971	479976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361156
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11074	NC_007766	CGAC	2	8	480340	480347	25 %	0 %	25 %	50 %	86361157
11075	NC_007766	GCT	2	6	480350	480355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361157
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11088	NC_007766	GTT	2	6	480817	480822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_007766	AAG	2	6	480845	480850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_007766	GC	3	6	480887	480892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11091	NC_007766	CGAAA	2	10	480967	480976	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11092	NC_007766	ATC	2	6	480982	480987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11094	NC_007766	GA	3	6	481132	481137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_007766	GC	3	6	481206	481211	0 %	0 %	50 %	50 %	86361158
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11103	NC_007766	TGG	2	6	481595	481600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361158
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11105	NC_007766	CCG	2	6	481619	481624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361158
11106	NC_007766	CTC	2	6	481681	481686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361158
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11111	NC_007766	CGG	2	6	481832	481837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361158
11112	NC_007766	TGG	2	6	481864	481869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_007766	CGGC	2	8	481879	481886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11114	NC_007766	ATG	2	6	481971	481976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_007766	CG	4	8	482007	482014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11116	NC_007766	GACT	2	8	482147	482154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_007766	AGC	2	6	482187	482192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_007766	TGAC	2	8	482202	482209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_007766	AAATT	2	10	482250	482259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_007766	CGA	2	6	482324	482329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11122	NC_007766	GCA	2	6	482353	482358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361159
11123	NC_007766	TCG	2	6	482362	482367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361159
11124	NC_007766	ATC	2	6	482475	482480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361159
11125	NC_007766	CAA	2	6	482546	482551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361159
11126	NC_007766	A	6	6	482582	482587	100 %	0 %	0 %	0 %	86361159
11127	NC_007766	TGC	2	6	482638	482643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361159
11128	NC_007766	CTG	2	6	482685	482690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361159
11129	NC_007766	CGA	2	6	482693	482698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361159
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11166	NC_007766	AAT	2	6	484132	484137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11167	NC_007766	GAA	2	6	484139	484144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11168	NC_007766	ACT	2	6	484176	484181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11170	NC_007766	CGG	3	9	484213	484221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11171	NC_007766	CCGATC	2	12	484255	484266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11172	NC_007766	GCG	2	6	484328	484333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11173	NC_007766	CA	3	6	484369	484374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11174	NC_007766	TGA	2	6	484411	484416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361162
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11202	NC_007766	ATC	2	6	485620	485625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11218	NC_007766	AGG	2	6	486340	486345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11219	NC_007766	GCCGC	2	10	486429	486438	0 %	0 %	40 %	60 %	86361164
11220	NC_007766	CTG	2	6	486441	486446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361164
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11222	NC_007766	TGC	2	6	486519	486524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361164
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11229	NC_007766	ATC	2	6	486783	486788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361164
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11232	NC_007766	CGG	2	6	486855	486860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361164
11233	NC_007766	CGA	2	6	486959	486964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361164
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11239	NC_007766	CCG	2	6	487087	487092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361164
11240	NC_007766	CTG	2	6	487107	487112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361164
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11242	NC_007766	GTC	2	6	487141	487146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361164
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11244	NC_007766	CAC	2	6	487196	487201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361164
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