MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 14807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007766	GCG	2	6	27	32	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007766	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007766	TGT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007766	ATA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007766	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007766	CGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007766	GAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007766	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007766	CGC	2	6	422	427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007766	TCC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007766	CGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007766	CGGC	2	8	596	603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007766	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007766	CTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007766	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007766	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	86360735
18	NC_007766	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
19	NC_007766	TCG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
20	NC_007766	CG	4	8	831	838	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
21	NC_007766	TCG	3	9	857	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
22	NC_007766	CGGCC	2	10	894	903	0 %	0 %	40 %	60 %	86360735
23	NC_007766	CG	3	6	923	928	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
24	NC_007766	GCC	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360735
25	NC_007766	CGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
26	NC_007766	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
27	NC_007766	GA	3	6	1148	1153	50 %	0 %	50 %	0 %	86360735
28	NC_007766	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
29	NC_007766	GTC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
30	NC_007766	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360735
31	NC_007766	GTC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
32	NC_007766	GGA	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360735
33	NC_007766	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
34	NC_007766	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	86360735
35	NC_007766	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
36	NC_007766	GTC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
37	NC_007766	ACG	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
38	NC_007766	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
39	NC_007766	GTCG	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	86360735
40	NC_007766	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360735
41	NC_007766	CGG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
42	NC_007766	CGC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
43	NC_007766	GGC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
44	NC_007766	CGA	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
45	NC_007766	CTG	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
46	NC_007766	GAC	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
47	NC_007766	ATG	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360736
48	NC_007766	GCG	2	6	1831	1836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
49	NC_007766	CGT	3	9	1850	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
50	NC_007766	GGC	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
51	NC_007766	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360736
52	NC_007766	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
53	NC_007766	CGG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
54	NC_007766	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
55	NC_007766	CGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
56	NC_007766	CG	4	8	2177	2184	0 %	0 %	50 %	50 %	86360736
57	NC_007766	CATCGG	2	12	2213	2224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360736
58	NC_007766	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
59	NC_007766	ACG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
60	NC_007766	CGC	2	6	2348	2353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
61	NC_007766	CGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
62	NC_007766	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
63	NC_007766	CCG	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
64	NC_007766	CCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360737
65	NC_007766	GCG	2	6	2625	2630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
66	NC_007766	CGGG	2	8	2767	2774	0 %	0 %	75 %	25 %	86360737
67	NC_007766	AGC	4	12	2831	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
68	NC_007766	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
69	NC_007766	GCA	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
70	NC_007766	TCG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
71	NC_007766	GAT	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360737
72	NC_007766	CG	3	6	3147	3152	0 %	0 %	50 %	50 %	86360737
73	NC_007766	TCG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
74	NC_007766	GC	3	6	3185	3190	0 %	0 %	50 %	50 %	86360737
75	NC_007766	GCGCT	2	10	3251	3260	0 %	20 %	40 %	40 %	86360737
76	NC_007766	CGG	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
77	NC_007766	GCA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007766	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007766	GA	3	6	3489	3494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007766	CAGA	2	8	3529	3536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007766	CAA	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360738
82	NC_007766	CG	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
83	NC_007766	TGG	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
84	NC_007766	TTC	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360738
85	NC_007766	AAG	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
86	NC_007766	TGA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360738
87	NC_007766	TGG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
88	NC_007766	GGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
89	NC_007766	GCG	3	9	3881	3889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
90	NC_007766	CAG	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
91	NC_007766	CCG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
92	NC_007766	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
93	NC_007766	CGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
94	NC_007766	GCG	2	6	4157	4162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
95	NC_007766	GC	3	6	4258	4263	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
96	NC_007766	ACG	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
97	NC_007766	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
98	NC_007766	GGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
99	NC_007766	CCG	2	6	4466	4471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
100	NC_007766	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360738
101	NC_007766	CCGG	2	8	4564	4571	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
102	NC_007766	GGCG	2	8	4583	4590	0 %	0 %	75 %	25 %	86360738
103	NC_007766	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
104	NC_007766	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
105	NC_007766	CGATC	2	10	4680	4689	20 %	20 %	20 %	40 %	86360738
106	NC_007766	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	86360738
107	NC_007766	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
108	NC_007766	CCG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
109	NC_007766	TCG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
110	NC_007766	GCCTCG	2	12	4954	4965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86360738
111	NC_007766	GCG	3	9	4988	4996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
112	NC_007766	GC	4	8	5003	5010	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
113	NC_007766	CGC	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
114	NC_007766	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
115	NC_007766	TCGC	2	8	5134	5141	0 %	25 %	25 %	50 %	86360738
116	NC_007766	GCC	2	6	5164	5169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
117	NC_007766	GGC	3	9	5181	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
118	NC_007766	CGG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
119	NC_007766	CATT	2	8	5263	5270	25 %	50 %	0 %	25 %	86360738
120	NC_007766	CGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
121	NC_007766	GAA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
122	NC_007766	TCG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
123	NC_007766	TCG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
124	NC_007766	ACGA	2	8	5479	5486	50 %	0 %	25 %	25 %	86360738
125	NC_007766	T	6	6	5488	5493	0 %	100 %	0 %	0 %	86360738
126	NC_007766	AAGG	2	8	5539	5546	50 %	0 %	50 %	0 %	86360738
127	NC_007766	GCC	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
128	NC_007766	CTCGCA	2	12	5619	5630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360738
129	NC_007766	GC	3	6	5634	5639	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
130	NC_007766	TCG	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
131	NC_007766	CTC	2	6	5802	5807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007766	CGA	2	6	5815	5820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007766	TCC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007766	GCG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007766	CAC	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007766	GAG	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007766	TC	3	6	5928	5933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007766	GCA	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007766	CGAC	2	8	6006	6013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007766	GGA	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007766	ATTGG	2	10	6106	6115	20 %	40 %	40 %	0 %	86360739
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271	NC_007766	CGGC	2	8	11623	11630	0 %	0 %	50 %	50 %	86360745
272	NC_007766	TTGCAT	2	12	11657	11668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	86360745
273	NC_007766	CA	3	6	11673	11678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
274	NC_007766	GAC	2	6	11725	11730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360746
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