MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 12139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007765	AGCC	2	8	167009	167016	25 %	0 %	25 %	50 %	86360416
4002	NC_007765	TGG	2	6	167033	167038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360416
4003	NC_007765	CGG	2	6	167095	167100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360416
4004	NC_007765	CGG	2	6	167125	167130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360416
4005	NC_007765	GGT	2	6	167167	167172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360416
4006	NC_007765	ACG	2	6	167199	167204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360416
4007	NC_007765	CAC	2	6	167224	167229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360416
4008	NC_007765	AGG	2	6	167292	167297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360416
4009	NC_007765	AGC	2	6	167349	167354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360416
4010	NC_007765	CGA	2	6	167356	167361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360416
4011	NC_007765	GCC	2	6	167410	167415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_007765	CGC	2	6	167509	167514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360417
4013	NC_007765	TGA	2	6	167578	167583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360417
4014	NC_007765	GGGTG	2	10	167725	167734	0 %	20 %	80 %	0 %	86360417
4015	NC_007765	GCC	2	6	167818	167823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360417
4016	NC_007765	GGC	2	6	167926	167931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360418
4017	NC_007765	TGT	2	6	167943	167948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360418
4018	NC_007765	CGG	2	6	167955	167960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360418
4019	NC_007765	GC	3	6	167979	167984	0 %	0 %	50 %	50 %	86360418
4020	NC_007765	TCT	2	6	167989	167994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360418
4021	NC_007765	GAT	2	6	168064	168069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360418
4022	NC_007765	TGC	2	6	168209	168214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360418
4023	NC_007765	TGC	2	6	168228	168233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360418
4024	NC_007765	TGC	2	6	168369	168374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360418
4025	NC_007765	GCG	2	6	168489	168494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360418
4026	NC_007765	TGAGAT	2	12	168531	168542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360418
4027	NC_007765	GCA	2	6	168576	168581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360418
4028	NC_007765	TGA	2	6	168648	168653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360418
4029	NC_007765	TGGA	2	8	168673	168680	25 %	25 %	50 %	0 %	86360418
4030	NC_007765	CGT	2	6	168716	168721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360418
4031	NC_007765	GCC	2	6	168758	168763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_007765	GAC	2	6	168779	168784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_007765	AAC	2	6	168809	168814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_007765	CTGC	2	8	168846	168853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_007765	CG	3	6	168857	168862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_007765	CCA	2	6	168932	168937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_007765	TCA	2	6	169031	169036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360419
4038	NC_007765	CGC	2	6	169102	169107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360419
4039	NC_007765	TC	3	6	169204	169209	0 %	50 %	0 %	50 %	86360419
4040	NC_007765	GCG	2	6	169273	169278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360419
4041	NC_007765	CGA	2	6	169303	169308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360419
4042	NC_007765	TCC	2	6	169326	169331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360419
4043	NC_007765	GCA	2	6	169333	169338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360419
4044	NC_007765	CGC	2	6	169420	169425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360419
4045	NC_007765	GGC	2	6	169472	169477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360419
4046	NC_007765	GC	3	6	169476	169481	0 %	0 %	50 %	50 %	86360419
4047	NC_007765	CAG	2	6	169541	169546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360419
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4049	NC_007765	TCG	2	6	169573	169578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360419
4050	NC_007765	GAT	2	6	169634	169639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360419
4051	NC_007765	GGC	2	6	169680	169685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360419
4052	NC_007765	CGTC	2	8	169738	169745	0 %	25 %	25 %	50 %	86360419
4053	NC_007765	ATGA	2	8	169932	169939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_007765	GACG	2	8	170022	170029	25 %	0 %	50 %	25 %	86360420
4055	NC_007765	GCC	2	6	170055	170060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360420
4056	NC_007765	GAC	2	6	170177	170182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360420
4057	NC_007765	CGG	2	6	170243	170248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360420
4058	NC_007765	GAA	2	6	170253	170258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360420
4059	NC_007765	GAC	2	6	170279	170284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360420
4060	NC_007765	GGT	2	6	170396	170401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360420
4061	NC_007765	GAA	2	6	170474	170479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360420
4062	NC_007765	GCACG	3	15	170544	170558	20 %	0 %	40 %	40 %	86360420
4063	NC_007765	CTGA	2	8	170577	170584	25 %	25 %	25 %	25 %	86360420
4064	NC_007765	GCG	2	6	170642	170647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360420
4065	NC_007765	GGT	2	6	170657	170662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360420
4066	NC_007765	ATG	2	6	170695	170700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360420
4067	NC_007765	TCT	2	6	170749	170754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360420
4068	NC_007765	CAT	2	6	170856	170861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360420
4069	NC_007765	CGG	2	6	170963	170968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007765	CGA	2	6	171013	171018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007765	CCA	2	6	171048	171053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360421
4072	NC_007765	CCA	2	6	171055	171060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360421
4073	NC_007765	GAC	2	6	171107	171112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360421
4074	NC_007765	CAC	2	6	171119	171124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360421
4075	NC_007765	GTGCC	2	10	171202	171211	0 %	20 %	40 %	40 %	86360421
4076	NC_007765	TGAT	2	8	171294	171301	25 %	50 %	25 %	0 %	86360421
4077	NC_007765	GCC	2	6	171303	171308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360421
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4080	NC_007765	GCTGAT	2	12	171362	171373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86360421
4081	NC_007765	GCC	2	6	171380	171385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360421
4082	NC_007765	ATC	2	6	171396	171401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360421
4083	NC_007765	TCA	2	6	171421	171426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360421
4084	NC_007765	TCG	2	6	171459	171464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360421
4085	NC_007765	CGA	2	6	171478	171483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360421
4086	NC_007765	GTT	2	6	171515	171520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360421
4087	NC_007765	CGATC	2	10	171532	171541	20 %	20 %	20 %	40 %	86360421
4088	NC_007765	GTC	2	6	171546	171551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360421
4089	NC_007765	TTG	2	6	171585	171590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360421
4090	NC_007765	CCG	2	6	171652	171657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360421
4091	NC_007765	GC	3	6	171715	171720	0 %	0 %	50 %	50 %	86360421
4092	NC_007765	GTG	2	6	171804	171809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_007765	GAG	2	6	171874	171879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_007765	GCTG	2	8	171922	171929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_007765	TG	3	6	171928	171933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_007765	GCG	2	6	171940	171945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_007765	GAT	2	6	171996	172001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007765	GCT	2	6	172026	172031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_007765	CGG	2	6	172043	172048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_007765	GGC	2	6	172100	172105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_007765	GC	3	6	172184	172189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_007765	TCG	2	6	172190	172195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_007765	GTC	2	6	172207	172212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_007765	GGC	2	6	172251	172256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_007765	GC	3	6	172255	172260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_007765	TGG	2	6	172328	172333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_007765	ATGGGG	2	12	172346	172357	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007765	CGC	2	6	172365	172370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_007765	GGC	2	6	172396	172401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_007765	ATC	2	6	172427	172432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007765	AGC	2	6	172472	172477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_007765	GCC	2	6	172493	172498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_007765	GCG	3	9	172585	172593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_007765	CGTTG	2	10	172596	172605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_007765	GGC	2	6	172615	172620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007765	GCC	2	6	172624	172629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_007765	TGG	2	6	172630	172635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_007765	TTC	2	6	172636	172641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_007765	TGC	2	6	172679	172684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_007765	GGC	2	6	172699	172704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_007765	TCA	2	6	172748	172753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_007765	CG	3	6	172761	172766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_007765	GGT	2	6	172782	172787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007765	CACAG	2	10	172911	172920	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4126	NC_007765	CGG	3	9	173031	173039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4252	NC_007765	CGA	2	6	177722	177727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360426
4253	NC_007765	CGA	2	6	177743	177748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360426
4254	NC_007765	TGA	2	6	177749	177754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360426
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4256	NC_007765	ACG	2	6	177835	177840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360426
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4258	NC_007765	CGA	2	6	177854	177859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360426
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4281	NC_007765	TCA	2	6	178520	178525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360426
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4289	NC_007765	GCCA	2	8	178939	178946	25 %	0 %	25 %	50 %	86360426
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4332	NC_007765	GTT	2	6	180457	180462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4342	NC_007765	TCA	2	6	180833	180838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360428
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4357	NC_007765	GC	3	6	181276	181281	0 %	0 %	50 %	50 %	86360428
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4365	NC_007765	CGT	2	6	181674	181679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360429
4366	NC_007765	GCGT	2	8	181725	181732	0 %	25 %	50 %	25 %	86360429
4367	NC_007765	TCC	2	6	181750	181755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360429
4368	NC_007765	GGGC	2	8	181761	181768	0 %	0 %	75 %	25 %	86360429
4369	NC_007765	CTT	2	6	181867	181872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360429
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4371	NC_007765	CAG	2	6	181912	181917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360429
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4463	NC_007765	TTG	2	6	185386	185391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4471	NC_007765	GGCG	3	12	185652	185663	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4472	NC_007765	TTGC	2	8	185681	185688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4473	NC_007765	AGC	2	6	185764	185769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360433
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4484	NC_007765	GAT	2	6	186188	186193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360433
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4490	NC_007765	TGC	2	6	186310	186315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360433
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4495	NC_007765	CGT	2	6	186470	186475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360433
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4497	NC_007765	CAT	2	6	186569	186574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360433
4498	NC_007765	CGG	2	6	186590	186595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360433
4499	NC_007765	CCG	2	6	186757	186762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360433
4500	NC_007765	CGT	3	9	186767	186775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360433

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