MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007764	GCCG	2	8	149655	149662	0 %	0 %	50 %	50 %	86360183
3502	NC_007764	GCC	2	6	149707	149712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3503	NC_007764	CCCCT	2	10	149718	149727	0 %	20 %	0 %	80 %	86360183
3504	NC_007764	CCG	2	6	149731	149736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3505	NC_007764	CAGCTC	2	12	149752	149763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360183
3506	NC_007764	CCG	2	6	149843	149848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3507	NC_007764	CCG	2	6	149877	149882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3508	NC_007764	CCG	2	6	149891	149896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3509	NC_007764	GAT	2	6	149934	149939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360183
3510	NC_007764	ATT	2	6	149942	149947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360183
3511	NC_007764	CGC	2	6	150086	150091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3512	NC_007764	GCT	2	6	150153	150158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360183
3513	NC_007764	GCT	2	6	150174	150179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360183
3514	NC_007764	CAA	2	6	150183	150188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360183
3515	NC_007764	GAC	2	6	150199	150204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360183
3516	NC_007764	CGG	2	6	150321	150326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360183
3517	NC_007764	CGG	2	6	150341	150346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360183
3518	NC_007764	GACG	2	8	150405	150412	25 %	0 %	50 %	25 %	86360183
3519	NC_007764	TCGA	2	8	150433	150440	25 %	25 %	25 %	25 %	86360183
3520	NC_007764	CAT	2	6	150456	150461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360183
3521	NC_007764	GAG	2	6	150463	150468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360183
3522	NC_007764	GCC	2	6	150568	150573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3523	NC_007764	AGA	2	6	150599	150604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360183
3524	NC_007764	GAA	2	6	150613	150618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360183
3525	NC_007764	CG	3	6	150716	150721	0 %	0 %	50 %	50 %	86360183
3526	NC_007764	CAA	2	6	150741	150746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360183
3527	NC_007764	GAT	2	6	150828	150833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360183
3528	NC_007764	GCC	2	6	150856	150861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3529	NC_007764	CGGT	2	8	150971	150978	0 %	25 %	50 %	25 %	86360183
3530	NC_007764	CCA	2	6	150995	151000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360183
3531	NC_007764	CGC	2	6	151005	151010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3532	NC_007764	CGC	2	6	151041	151046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360183
3533	NC_007764	G	6	6	151127	151132	0 %	0 %	100 %	0 %	86360183
3534	NC_007764	TCGT	2	8	151169	151176	0 %	50 %	25 %	25 %	86360183
3535	NC_007764	CAGC	2	8	151191	151198	25 %	0 %	25 %	50 %	86360183
3536	NC_007764	GAA	2	6	151205	151210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_007764	AGGC	2	8	151231	151238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_007764	GGC	2	6	151246	151251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_007764	AAAT	2	8	151341	151348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_007764	ATT	2	6	151365	151370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_007764	GGA	2	6	151405	151410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_007764	CAA	2	6	151419	151424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_007764	GGC	2	6	151442	151447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_007764	TGA	2	6	151514	151519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360184
3545	NC_007764	TC	3	6	151535	151540	0 %	50 %	0 %	50 %	86360184
3546	NC_007764	CCTTC	2	10	151644	151653	0 %	40 %	0 %	60 %	86360184
3547	NC_007764	CCG	2	6	151780	151785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360184
3548	NC_007764	CGT	2	6	151803	151808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360184
3549	NC_007764	CCG	2	6	151906	151911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360184
3550	NC_007764	TCC	2	6	151915	151920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360184
3551	NC_007764	GGA	2	6	151946	151951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360184
3552	NC_007764	CGT	2	6	152003	152008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360184
3553	NC_007764	GCG	2	6	152085	152090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360184
3554	NC_007764	GCC	2	6	152114	152119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360184
3555	NC_007764	GTT	2	6	152148	152153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360184
3556	NC_007764	CAT	2	6	152202	152207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360184
3557	NC_007764	TTG	2	6	152212	152217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360184
3558	NC_007764	CGG	2	6	152246	152251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360184
3559	NC_007764	CCAG	2	8	152270	152277	25 %	0 %	25 %	50 %	86360184
3560	NC_007764	GCC	2	6	152280	152285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360184
3561	NC_007764	CGA	2	6	152315	152320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360184
3562	NC_007764	ATG	2	6	152380	152385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360184
3563	NC_007764	CCT	3	9	152386	152394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_007764	ATC	2	6	152412	152417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_007764	AAT	2	6	152478	152483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_007764	GAT	2	6	152495	152500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_007764	GAG	2	6	152602	152607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_007764	CG	3	6	152671	152676	0 %	0 %	50 %	50 %	86360185
3569	NC_007764	CAT	2	6	152720	152725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360185
3570	NC_007764	CGGC	2	8	152764	152771	0 %	0 %	50 %	50 %	86360185
3571	NC_007764	TCG	2	6	152778	152783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3572	NC_007764	CGC	2	6	152801	152806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360185
3573	NC_007764	CAA	2	6	152822	152827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360185
3574	NC_007764	CTT	3	9	152889	152897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360185
3575	NC_007764	CAT	2	6	152969	152974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360185
3576	NC_007764	GC	4	8	152999	153006	0 %	0 %	50 %	50 %	86360185
3577	NC_007764	GGT	2	6	153035	153040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360185
3578	NC_007764	GAA	2	6	153060	153065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360185
3579	NC_007764	ATCA	2	8	153069	153076	50 %	25 %	0 %	25 %	86360185
3580	NC_007764	GCT	2	6	153110	153115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3581	NC_007764	GCCA	2	8	153129	153136	25 %	0 %	25 %	50 %	86360185
3582	NC_007764	GGT	2	6	153162	153167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360185
3583	NC_007764	ACG	2	6	153168	153173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3584	NC_007764	GC	3	6	153174	153179	0 %	0 %	50 %	50 %	86360185
3585	NC_007764	CG	3	6	153184	153189	0 %	0 %	50 %	50 %	86360185
3586	NC_007764	CAGC	2	8	153191	153198	25 %	0 %	25 %	50 %	86360185
3587	NC_007764	GAA	2	6	153225	153230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360185
3588	NC_007764	CCGGG	2	10	153243	153252	0 %	0 %	60 %	40 %	86360185
3589	NC_007764	GCC	2	6	153269	153274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360185
3590	NC_007764	GGC	2	6	153291	153296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360185
3591	NC_007764	CTG	2	6	153312	153317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3592	NC_007764	TCG	2	6	153453	153458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3593	NC_007764	ACG	2	6	153477	153482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3594	NC_007764	GCC	2	6	153508	153513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360185
3595	NC_007764	GCC	2	6	153516	153521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360185
3596	NC_007764	CTG	2	6	153528	153533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3597	NC_007764	GCGAG	2	10	153553	153562	20 %	0 %	60 %	20 %	86360185
3598	NC_007764	CGA	2	6	153566	153571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3599	NC_007764	GTC	2	6	153594	153599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360185
3600	NC_007764	TGC	2	6	153673	153678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3601	NC_007764	TCGC	2	8	153681	153688	0 %	25 %	25 %	50 %	86360186
3602	NC_007764	GGC	2	6	153698	153703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360186
3603	NC_007764	AGC	2	6	153735	153740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3604	NC_007764	GC	3	6	153758	153763	0 %	0 %	50 %	50 %	86360186
3605	NC_007764	CGA	2	6	153835	153840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3606	NC_007764	CGC	2	6	153865	153870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360186
3607	NC_007764	GC	3	6	153921	153926	0 %	0 %	50 %	50 %	86360186
3608	NC_007764	CCGC	2	8	153928	153935	0 %	0 %	25 %	75 %	86360186
3609	NC_007764	ATG	2	6	153957	153962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360186
3610	NC_007764	GGC	2	6	153989	153994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360186
3611	NC_007764	CGG	2	6	154000	154005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360186
3612	NC_007764	CGC	2	6	154036	154041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360186
3613	NC_007764	CG	3	6	154108	154113	0 %	0 %	50 %	50 %	86360186
3614	NC_007764	AGC	2	6	154173	154178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3615	NC_007764	CCA	2	6	154285	154290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360186
3616	NC_007764	GCC	2	6	154304	154309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360186
3617	NC_007764	CGGCAT	2	12	154319	154330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3618	NC_007764	CTG	2	6	154367	154372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360186
3619	NC_007764	CGGC	2	8	154403	154410	0 %	0 %	50 %	50 %	86360186
3620	NC_007764	ATC	2	6	154500	154505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360186
3621	NC_007764	GCC	2	6	154532	154537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360186
3622	NC_007764	TAA	2	6	154545	154550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360186
3623	NC_007764	CCG	2	6	154572	154577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360186
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3625	NC_007764	ATGA	2	8	154655	154662	50 %	25 %	25 %	0 %	86360186
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3749	NC_007764	TCGC	2	8	159817	159824	0 %	25 %	25 %	50 %	86360192
3750	NC_007764	GAT	2	6	159828	159833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360192
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3752	NC_007764	CTG	2	6	159991	159996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360192
3753	NC_007764	GCTC	2	8	160059	160066	0 %	25 %	25 %	50 %	86360192
3754	NC_007764	CGG	2	6	160077	160082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360192
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3764	NC_007764	CTG	2	6	160561	160566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360192
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3810	NC_007764	ATA	2	6	162392	162397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3843	NC_007764	CGC	2	6	163653	163658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3852	NC_007764	ACG	2	6	164106	164111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360197
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3864	NC_007764	TCG	2	6	164695	164700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360197
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3992	NC_007764	CGA	2	6	169355	169360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360201
3993	NC_007764	CCG	2	6	169371	169376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360201
3994	NC_007764	GC	3	6	169384	169389	0 %	0 %	50 %	50 %	86360201
3995	NC_007764	GGC	2	6	169401	169406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360201
3996	NC_007764	TCG	2	6	169426	169431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360201
3997	NC_007764	GAC	2	6	169476	169481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360201
3998	NC_007764	AG	3	6	169485	169490	50 %	0 %	50 %	0 %	86360201
3999	NC_007764	GCC	3	9	169542	169550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360201
4000	NC_007764	GATC	2	8	169607	169614	25 %	25 %	25 %	25 %	86360201

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