MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007764	CGC	2	6	44223	44228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_007764	AGAA	2	8	44260	44267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007764	TGA	2	6	44280	44285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_007764	GCG	2	6	44318	44323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_007764	TTGAA	2	10	44360	44369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_007764	CTG	2	6	44426	44431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_007764	CAA	2	6	44448	44453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360091
1008	NC_007764	CAT	2	6	44455	44460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360091
1009	NC_007764	ACCG	2	8	44461	44468	25 %	0 %	25 %	50 %	86360091
1010	NC_007764	TTC	2	6	44484	44489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360091
1011	NC_007764	AAG	2	6	44531	44536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360091
1012	NC_007764	CGTC	2	8	44548	44555	0 %	25 %	25 %	50 %	86360091
1013	NC_007764	CG	3	6	44569	44574	0 %	0 %	50 %	50 %	86360091
1014	NC_007764	CGC	2	6	44673	44678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360091
1015	NC_007764	GTCC	2	8	44698	44705	0 %	25 %	25 %	50 %	86360091
1016	NC_007764	GAT	2	6	44717	44722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360091
1017	NC_007764	CGA	2	6	44743	44748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360091
1018	NC_007764	GTC	2	6	44777	44782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360091
1019	NC_007764	CTGG	2	8	44786	44793	0 %	25 %	50 %	25 %	86360091
1020	NC_007764	CTT	2	6	44833	44838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360091
1021	NC_007764	CGGT	2	8	44848	44855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_007764	ACC	2	6	44885	44890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_007764	GGC	2	6	45010	45015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360092
1024	NC_007764	CCG	2	6	45049	45054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360092
1025	NC_007764	GGC	2	6	45076	45081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360092
1026	NC_007764	CGT	2	6	45084	45089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360092
1027	NC_007764	CGA	2	6	45150	45155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360092
1028	NC_007764	CGG	2	6	45161	45166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360092
1029	NC_007764	CGT	2	6	45209	45214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360092
1030	NC_007764	AAG	2	6	45307	45312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360092
1031	NC_007764	TCT	2	6	45341	45346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360092
1032	NC_007764	GCC	2	6	45361	45366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360092
1033	NC_007764	CCT	2	6	45396	45401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360092
1034	NC_007764	GACA	2	8	45417	45424	50 %	0 %	25 %	25 %	86360092
1035	NC_007764	GGC	2	6	45465	45470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360092
1036	NC_007764	AGC	2	6	45483	45488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360092
1037	NC_007764	CG	3	6	45505	45510	0 %	0 %	50 %	50 %	86360092
1038	NC_007764	GCC	2	6	45523	45528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360092
1039	NC_007764	CT	3	6	45581	45586	0 %	50 %	0 %	50 %	86360093
1040	NC_007764	GCG	2	6	45633	45638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360093
1041	NC_007764	CTGT	2	8	45649	45656	0 %	50 %	25 %	25 %	86360093
1042	NC_007764	TCG	2	6	45710	45715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360093
1043	NC_007764	GCAT	2	8	45745	45752	25 %	25 %	25 %	25 %	86360093
1044	NC_007764	GC	3	6	45776	45781	0 %	0 %	50 %	50 %	86360093
1045	NC_007764	ATC	2	6	45841	45846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360093
1046	NC_007764	CGC	2	6	45871	45876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360093
1047	NC_007764	TGT	2	6	45950	45955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360093
1048	NC_007764	ATG	2	6	45980	45985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360093
1049	NC_007764	GC	3	6	46182	46187	0 %	0 %	50 %	50 %	86360093
1050	NC_007764	GCA	2	6	46264	46269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_007764	CAG	2	6	46272	46277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_007764	ACG	2	6	46335	46340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360094
1053	NC_007764	GCG	2	6	46425	46430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360094
1054	NC_007764	GC	3	6	46433	46438	0 %	0 %	50 %	50 %	86360094
1055	NC_007764	TGC	2	6	46444	46449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360094
1056	NC_007764	CGA	2	6	46460	46465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360094
1057	NC_007764	GCG	2	6	46479	46484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360094
1058	NC_007764	AGA	2	6	46501	46506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360094
1059	NC_007764	GCG	2	6	46562	46567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360094
1060	NC_007764	GGC	2	6	46568	46573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360094
1061	NC_007764	CAA	2	6	46613	46618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360094
1062	NC_007764	TTGCT	2	10	46692	46701	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_007764	TGC	2	6	46715	46720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1064	NC_007764	TCG	2	6	46751	46756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1065	NC_007764	ACA	2	6	46770	46775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360095
1066	NC_007764	GCC	2	6	46843	46848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360095
1067	NC_007764	TCT	2	6	46863	46868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360095
1068	NC_007764	CGG	2	6	46888	46893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1069	NC_007764	GGC	2	6	46899	46904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1070	NC_007764	CGG	2	6	46919	46924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1071	NC_007764	TCG	2	6	46943	46948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1072	NC_007764	TGG	2	6	46972	46977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360095
1073	NC_007764	GGC	2	6	47074	47079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360095
1074	NC_007764	TAC	2	6	47080	47085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360095
1075	NC_007764	GTCC	2	8	47114	47121	0 %	25 %	25 %	50 %	86360095
1076	NC_007764	GAG	2	6	47140	47145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360095
1077	NC_007764	GCT	2	6	47157	47162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360095
1078	NC_007764	CAT	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360096
1079	NC_007764	CAT	2	6	47367	47372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360096
1080	NC_007764	ACC	2	6	47378	47383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360096
1081	NC_007764	TCC	2	6	47447	47452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360096
1082	NC_007764	CGG	2	6	47468	47473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1083	NC_007764	CTC	2	6	47497	47502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360096
1084	NC_007764	GCCCG	2	10	47539	47548	0 %	0 %	40 %	60 %	86360096
1085	NC_007764	GC	4	8	47557	47564	0 %	0 %	50 %	50 %	86360096
1086	NC_007764	GCAG	2	8	47613	47620	25 %	0 %	50 %	25 %	86360096
1087	NC_007764	GCG	2	6	47638	47643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1088	NC_007764	ACA	2	6	47658	47663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360096
1089	NC_007764	CGC	2	6	47742	47747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360096
1090	NC_007764	AGC	2	6	47798	47803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360096
1091	NC_007764	CGAT	2	8	47830	47837	25 %	25 %	25 %	25 %	86360096
1092	NC_007764	GGC	2	6	47838	47843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1093	NC_007764	CGG	2	6	47893	47898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360096
1094	NC_007764	TCTG	2	8	47950	47957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_007764	CAA	2	6	47960	47965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_007764	TCA	2	6	48008	48013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360097
1097	NC_007764	CTG	2	6	48026	48031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1098	NC_007764	CCG	2	6	48043	48048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360097
1099	NC_007764	GTG	2	6	48069	48074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360097
1100	NC_007764	CGG	2	6	48106	48111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1101	NC_007764	TTG	2	6	48222	48227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360097
1102	NC_007764	GGT	2	6	48284	48289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360097
1103	NC_007764	CGA	2	6	48316	48321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1104	NC_007764	GCG	2	6	48347	48352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1105	NC_007764	GGGCA	2	10	48513	48522	20 %	0 %	60 %	20 %	86360097
1106	NC_007764	GGC	2	6	48598	48603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1107	NC_007764	GC	3	6	48602	48607	0 %	0 %	50 %	50 %	86360097
1108	NC_007764	TCGCCA	2	12	48618	48629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360097
1109	NC_007764	TGC	2	6	48714	48719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360097
1110	NC_007764	AGCGA	2	10	48785	48794	40 %	0 %	40 %	20 %	86360097
1111	NC_007764	GCG	2	6	48830	48835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1112	NC_007764	GCG	3	9	48855	48863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360097
1113	NC_007764	GCC	2	6	48878	48883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360097
1114	NC_007764	GAT	3	9	48884	48892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360097
1115	NC_007764	TGGA	2	8	48924	48931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_007764	GGA	3	9	48929	48937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_007764	GGC	2	6	48991	48996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_007764	C	7	7	49031	49037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_007764	AAT	2	6	49079	49084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360098
1120	NC_007764	GAAC	2	8	49115	49122	50 %	0 %	25 %	25 %	86360098
1121	NC_007764	CGGC	2	8	49139	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1122	NC_007764	CCA	2	6	49147	49152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360098
1123	NC_007764	CGA	2	6	49219	49224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360098
1124	NC_007764	GC	3	6	49244	49249	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
1125	NC_007764	AGG	2	6	49291	49296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360098
1126	NC_007764	GGC	2	6	49316	49321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360098
1127	NC_007764	CAC	2	6	49339	49344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360098
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1129	NC_007764	CCGGC	2	10	49507	49516	0 %	0 %	40 %	60 %	86360098
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1383	NC_007764	GAGC	3	12	59583	59594	25 %	0 %	50 %	25 %	86360105
1384	NC_007764	GGC	2	6	59605	59610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360105
1385	NC_007764	GC	3	6	59631	59636	0 %	0 %	50 %	50 %	86360105
1386	NC_007764	CGGC	2	8	59654	59661	0 %	0 %	50 %	50 %	86360105
1387	NC_007764	GCG	2	6	59776	59781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360105
1388	NC_007764	GCG	2	6	59809	59814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360105
1389	NC_007764	GCA	2	6	59828	59833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360105
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1391	NC_007764	CGG	2	6	59982	59987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360105
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1399	NC_007764	GAC	2	6	60374	60379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360106
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1432	NC_007764	CGG	2	6	62092	62097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360107
1433	NC_007764	GAAA	2	8	62156	62163	75 %	0 %	25 %	0 %	86360107
1434	NC_007764	GGAT	2	8	62174	62181	25 %	25 %	50 %	0 %	86360107
1435	NC_007764	GCT	2	6	62204	62209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360107
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1437	NC_007764	CGG	3	9	62248	62256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360107
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1443	NC_007764	GAT	2	6	62518	62523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360108
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1450	NC_007764	CG	3	6	62634	62639	0 %	0 %	50 %	50 %	86360108
1451	NC_007764	CGG	2	6	62654	62659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360108
1452	NC_007764	TGG	2	6	62661	62666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360108
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1476	NC_007764	CGA	2	6	63711	63716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360108
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1482	NC_007764	TCG	2	6	63947	63952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360108
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1487	NC_007764	GCG	2	6	64059	64064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360109
1488	NC_007764	GCC	2	6	64149	64154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360109
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1492	NC_007764	GCA	2	6	64382	64387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360109
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1495	NC_007764	GCC	2	6	64422	64427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360109
1496	NC_007764	GC	3	6	64438	64443	0 %	0 %	50 %	50 %	86360109
1497	NC_007764	CTCC	2	8	64481	64488	0 %	25 %	0 %	75 %	86360109
1498	NC_007764	CGGC	2	8	64505	64512	0 %	0 %	50 %	50 %	86360109
1499	NC_007764	CTT	2	6	64575	64580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360109
1500	NC_007764	GAT	2	6	64611	64616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360109

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