MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 4375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007763	CAA	2	6	168024	168029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360030
4002	NC_007763	CCG	2	6	168069	168074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
4003	NC_007763	GAC	2	6	168090	168095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360030
4004	NC_007763	CCG	2	6	168101	168106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
4005	NC_007763	GAC	2	6	168163	168168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360031
4006	NC_007763	CCG	2	6	168344	168349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
4007	NC_007763	CGC	2	6	168375	168380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
4008	NC_007763	GCCG	2	8	168384	168391	0 %	0 %	50 %	50 %	86360031
4009	NC_007763	CGA	2	6	168395	168400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360031
4010	NC_007763	GCC	2	6	168411	168416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
4011	NC_007763	GCAGGC	2	12	168470	168481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360031
4012	NC_007763	CTT	2	6	168566	168571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360031
4013	NC_007763	CGG	2	6	168596	168601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360031
4014	NC_007763	TTGC	2	8	168654	168661	0 %	50 %	25 %	25 %	86360031
4015	NC_007763	TC	3	6	168662	168667	0 %	50 %	0 %	50 %	86360031
4016	NC_007763	CGC	2	6	168675	168680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
4017	NC_007763	CCG	2	6	168737	168742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360032
4018	NC_007763	GGA	2	6	168747	168752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360032
4019	NC_007763	CTG	2	6	168763	168768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360032
4020	NC_007763	CGG	2	6	168786	168791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360032
4021	NC_007763	AAC	2	6	168792	168797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360032
4022	NC_007763	CGC	2	6	168809	168814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360032
4023	NC_007763	CCG	2	6	168931	168936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360032
4024	NC_007763	GCA	2	6	169021	169026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360032
4025	NC_007763	TCA	2	6	169049	169054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360032
4026	NC_007763	CGG	2	6	169080	169085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360032
4027	NC_007763	TCT	2	6	169213	169218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360032
4028	NC_007763	CGA	2	6	169231	169236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_007763	TCG	2	6	169239	169244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_007763	ATG	2	6	169247	169252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_007763	TCT	2	6	169282	169287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_007763	CG	3	6	169303	169308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_007763	CGG	2	6	169347	169352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
4034	NC_007763	GGC	2	6	169396	169401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
4035	NC_007763	GAT	2	6	169462	169467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360033
4036	NC_007763	GGC	2	6	169522	169527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
4037	NC_007763	TCG	2	6	169535	169540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4038	NC_007763	GCC	2	6	169727	169732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360033
4039	NC_007763	CCTCGA	2	12	169737	169748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360033
4040	NC_007763	CCG	3	9	169847	169855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360033
4041	NC_007763	GCTC	2	8	169857	169864	0 %	25 %	25 %	50 %	86360033
4042	NC_007763	CACGG	2	10	169880	169889	20 %	0 %	40 %	40 %	86360033
4043	NC_007763	TAA	2	6	169892	169897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360033
4044	NC_007763	CCA	2	6	169909	169914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360033
4045	NC_007763	TCG	2	6	169926	169931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4046	NC_007763	CAG	2	6	169966	169971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4047	NC_007763	CGAG	2	8	170039	170046	25 %	0 %	50 %	25 %	86360033
4048	NC_007763	TCG	2	6	170060	170065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4049	NC_007763	CGG	2	6	170155	170160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
4050	NC_007763	TCG	2	6	170186	170191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4051	NC_007763	TCA	2	6	170267	170272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360033
4052	NC_007763	GCA	2	6	170336	170341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360033
4053	NC_007763	TCC	2	6	170387	170392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_007763	GC	3	6	170408	170413	0 %	0 %	50 %	50 %	86360034
4055	NC_007763	GGC	2	6	170440	170445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
4056	NC_007763	TGCG	2	8	170481	170488	0 %	25 %	50 %	25 %	86360034
4057	NC_007763	CGG	2	6	170500	170505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
4058	NC_007763	AAT	2	6	170518	170523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360034
4059	NC_007763	CGGC	3	12	170594	170605	0 %	0 %	50 %	50 %	86360034
4060	NC_007763	AT	3	6	170613	170618	50 %	50 %	0 %	0 %	86360034
4061	NC_007763	TA	3	6	170630	170635	50 %	50 %	0 %	0 %	86360034
4062	NC_007763	CGTC	2	8	170661	170668	0 %	25 %	25 %	50 %	86360034
4063	NC_007763	CTG	2	6	170719	170724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4064	NC_007763	GCA	3	9	170737	170745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4065	NC_007763	CGA	2	6	170872	170877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4066	NC_007763	GCC	2	6	170882	170887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360034
4067	NC_007763	GAA	2	6	170903	170908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360034
4068	NC_007763	CCTT	2	8	170982	170989	0 %	50 %	0 %	50 %	86360034
4069	NC_007763	CGG	2	6	171010	171015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
4070	NC_007763	GTC	2	6	171105	171110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4071	NC_007763	TCA	2	6	171127	171132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360034
4072	NC_007763	CG	3	6	171152	171157	0 %	0 %	50 %	50 %	86360034
4073	NC_007763	ATCG	2	8	171206	171213	25 %	25 %	25 %	25 %	86360034
4074	NC_007763	TCG	2	6	171219	171224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4075	NC_007763	GCG	2	6	171247	171252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
4076	NC_007763	TCT	2	6	171265	171270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360034
4077	NC_007763	CGA	2	6	171316	171321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4078	NC_007763	CGC	2	6	171325	171330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360034
4079	NC_007763	GCG	2	6	171333	171338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
4080	NC_007763	CGA	2	6	171382	171387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360034
4081	NC_007763	TCC	2	6	171414	171419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_007763	ATT	2	6	171554	171559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_007763	GCC	3	9	171682	171690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_007763	GGC	2	6	171700	171705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007763	CGC	2	6	171735	171740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_007763	GGA	2	6	171752	171757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_007763	GCC	2	6	171784	171789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360035
4088	NC_007763	GGT	2	6	171796	171801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360035
4089	NC_007763	GCC	2	6	171832	171837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360035
4090	NC_007763	CG	3	6	171887	171892	0 %	0 %	50 %	50 %	86360035
4091	NC_007763	CGGC	2	8	171932	171939	0 %	0 %	50 %	50 %	86360035
4092	NC_007763	GCCG	2	8	172038	172045	0 %	0 %	50 %	50 %	86360035
4093	NC_007763	GCG	2	6	172067	172072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360035
4094	NC_007763	GAT	2	6	172089	172094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360035
4095	NC_007763	GAG	2	6	172108	172113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360035
4096	NC_007763	GGC	2	6	172116	172121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360035
4097	NC_007763	GCC	2	6	172138	172143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360035
4098	NC_007763	CGG	2	6	172173	172178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360035
4099	NC_007763	CGA	2	6	172239	172244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360035
4100	NC_007763	CT	3	6	172315	172320	0 %	50 %	0 %	50 %	86360035
4101	NC_007763	GGCAA	2	10	172486	172495	40 %	0 %	40 %	20 %	86360035
4102	NC_007763	ACA	2	6	172499	172504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360035
4103	NC_007763	CCT	2	6	172508	172513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360035
4104	NC_007763	TGC	2	6	172616	172621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360035
4105	NC_007763	CGACC	2	10	172653	172662	20 %	0 %	20 %	60 %	86360035
4106	NC_007763	TCA	3	9	172689	172697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360035
4107	NC_007763	CA	4	8	172776	172783	50 %	0 %	0 %	50 %	86360035
4108	NC_007763	CGT	2	6	172794	172799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360035
4109	NC_007763	TCG	2	6	172807	172812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360035
4110	NC_007763	CCG	2	6	172861	172866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360035
4111	NC_007763	GCA	2	6	173052	173057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360036
4112	NC_007763	CGC	3	9	173101	173109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360036
4113	NC_007763	GAC	2	6	173111	173116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360036
4114	NC_007763	ATA	2	6	173118	173123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360036
4115	NC_007763	GCA	2	6	173164	173169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360036
4116	NC_007763	CGA	2	6	173203	173208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360036
4117	NC_007763	AAC	2	6	173259	173264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360036
4118	NC_007763	TGA	2	6	173461	173466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360036
4119	NC_007763	GGC	2	6	173477	173482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360036
4120	NC_007763	GC	4	8	173532	173539	0 %	0 %	50 %	50 %	86360036
4121	NC_007763	GCC	2	6	173544	173549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360036
4122	NC_007763	GCT	2	6	173556	173561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360036
4123	NC_007763	GC	3	6	173585	173590	0 %	0 %	50 %	50 %	86360036
4124	NC_007763	GGC	2	6	173603	173608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360036
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4236	NC_007763	ATC	2	6	178175	178180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_007763	CTG	2	6	178626	178631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360040
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4279	NC_007763	CCG	2	6	180271	180276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4343	NC_007763	GAA	2	6	183039	183044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_007763	GAC	2	6	183063	183068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360044
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4347	NC_007763	AGGCC	2	10	183182	183191	20 %	0 %	40 %	40 %	86360044
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4352	NC_007763	GGC	2	6	183357	183362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
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4354	NC_007763	GC	4	8	183481	183488	0 %	0 %	50 %	50 %	86360044
4355	NC_007763	GGC	2	6	183507	183512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
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4361	NC_007763	CACTA	2	10	183829	183838	40 %	20 %	0 %	40 %	86360044
4362	NC_007763	GAC	2	6	183883	183888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360044
4363	NC_007763	GCCGA	2	10	183904	183913	20 %	0 %	40 %	40 %	86360044
4364	NC_007763	AGG	2	6	183932	183937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360044
4365	NC_007763	CGG	3	9	183981	183989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
4366	NC_007763	TGC	2	6	184016	184021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
4367	NC_007763	CGC	2	6	184038	184043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
4368	NC_007763	GGC	3	9	184086	184094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
4369	NC_007763	GTC	2	6	184096	184101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
4370	NC_007763	GCGT	2	8	184186	184193	0 %	25 %	50 %	25 %	86360044
4371	NC_007763	AGGGC	2	10	184201	184210	20 %	0 %	60 %	20 %	86360044
4372	NC_007763	CCG	2	6	184220	184225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
4373	NC_007763	TGACC	2	10	184239	184248	20 %	20 %	20 %	40 %	86360044
4374	NC_007763	CGC	2	6	184249	184254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
4375	NC_007763	GA	3	6	184258	184263	50 %	0 %	50 %	0 %	86360044

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