MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 4375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	CTT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007763	TTC	2	6	86	91	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007763	CGA	2	6	149	154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007763	CGGC	2	8	156	163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007763	GAA	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007763	GTC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
7	NC_007763	GCA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359882
8	NC_007763	CGA	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359882
9	NC_007763	TCG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
10	NC_007763	CAAT	2	8	621	628	50 %	25 %	0 %	25 %	86359882
11	NC_007763	TGATC	2	10	630	639	20 %	40 %	20 %	20 %	86359882
12	NC_007763	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
13	NC_007763	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359882
14	NC_007763	ATT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007763	ACA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007763	GGT	2	6	929	934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007763	TGAT	2	8	939	946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007763	TCG	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007763	CTG	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007763	TGC	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
21	NC_007763	TGG	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359883
22	NC_007763	CTGG	2	8	1116	1123	0 %	25 %	50 %	25 %	86359883
23	NC_007763	CTG	3	9	1378	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
24	NC_007763	GGC	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
25	NC_007763	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
26	NC_007763	GAT	3	9	1561	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359883
27	NC_007763	CAT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359883
28	NC_007763	CTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359883
29	NC_007763	GCT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
30	NC_007763	CAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359883
31	NC_007763	GGT	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359883
32	NC_007763	CGG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
33	NC_007763	CGG	2	6	1914	1919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
34	NC_007763	GCC	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359883
35	NC_007763	CCTCAT	2	12	1959	1970	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	86359883
36	NC_007763	TCCG	2	8	2071	2078	0 %	25 %	25 %	50 %	86359883
37	NC_007763	GGC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
38	NC_007763	CGC	3	9	2136	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359883
39	NC_007763	TCG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
40	NC_007763	AAAT	2	8	2232	2239	75 %	25 %	0 %	0 %	86359883
41	NC_007763	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359883
42	NC_007763	TGC	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
43	NC_007763	TCC	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359883
44	NC_007763	CGT	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
45	NC_007763	GCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359883
46	NC_007763	AAGG	2	8	2452	2459	50 %	0 %	50 %	0 %	86359883
47	NC_007763	GGCG	2	8	2538	2545	0 %	0 %	75 %	25 %	86359883
48	NC_007763	GCG	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
49	NC_007763	GAA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359883
50	NC_007763	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
51	NC_007763	GC	3	6	2776	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
52	NC_007763	GAA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359883
53	NC_007763	CGT	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
54	NC_007763	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
55	NC_007763	GCT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359884
56	NC_007763	AG	3	6	3137	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	86359884
57	NC_007763	GGCCAG	2	12	3164	3175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86359884
58	NC_007763	AGC	3	9	3211	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
59	NC_007763	CAG	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
60	NC_007763	CAG	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
61	NC_007763	CCAG	2	8	3626	3633	25 %	0 %	25 %	50 %	86359884
62	NC_007763	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
63	NC_007763	CGG	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359884
64	NC_007763	CGC	2	6	3740	3745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359884
65	NC_007763	CAG	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
66	NC_007763	CGC	2	6	3774	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359884
67	NC_007763	GAAAA	2	10	3834	3843	80 %	0 %	20 %	0 %	86359884
68	NC_007763	GGC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359884
69	NC_007763	ATCCA	2	10	3961	3970	40 %	20 %	0 %	40 %	86359884
70	NC_007763	TTC	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359884
71	NC_007763	ATC	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359884
72	NC_007763	ACC	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359884
73	NC_007763	ACC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359884
74	NC_007763	GAG	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359884
75	NC_007763	GATC	2	8	4195	4202	25 %	25 %	25 %	25 %	86359884
76	NC_007763	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
77	NC_007763	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359884
78	NC_007763	AGG	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007763	T	6	6	4355	4360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007763	CAG	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007763	ACG	2	6	4410	4415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007763	GCG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007763	TC	3	6	4516	4521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007763	GGCC	2	8	4537	4544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007763	CGC	2	6	4612	4617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007763	GC	3	6	4616	4621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007763	GAG	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007763	GGT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007763	GGC	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007763	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007763	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	86359885
92	NC_007763	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359885
93	NC_007763	TGCC	2	8	5069	5076	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
94	NC_007763	GCCT	2	8	5082	5089	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
95	NC_007763	TCC	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359885
96	NC_007763	CCG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359885
97	NC_007763	AG	3	6	5201	5206	50 %	0 %	50 %	0 %	86359885
98	NC_007763	GTC	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359885
99	NC_007763	CGT	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359885
100	NC_007763	TTC	2	6	5264	5269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359885
101	NC_007763	CCT	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007763	AAC	2	6	5352	5357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007763	CAC	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359886
104	NC_007763	GCC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
105	NC_007763	GCT	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
106	NC_007763	GGT	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359886
107	NC_007763	CCG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
108	NC_007763	GCC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
109	NC_007763	ATC	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359886
110	NC_007763	CGG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359886
111	NC_007763	GTC	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
112	NC_007763	CGC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
113	NC_007763	TGC	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
114	NC_007763	GC	3	6	6090	6095	0 %	0 %	50 %	50 %	86359886
115	NC_007763	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359886
116	NC_007763	CGA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359886
117	NC_007763	ATT	2	6	6163	6168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359886
118	NC_007763	CTG	2	6	6170	6175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
119	NC_007763	GGAA	2	8	6209	6216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007763	GAT	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359887
121	NC_007763	CCA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359887
122	NC_007763	TCGTC	2	10	6301	6310	0 %	40 %	20 %	40 %	86359887
123	NC_007763	GAC	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359887
124	NC_007763	GCCG	2	8	6386	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
125	NC_007763	TCGC	2	8	6395	6402	0 %	25 %	25 %	50 %	86359887
126	NC_007763	CTGGT	2	10	6405	6414	0 %	40 %	40 %	20 %	86359887
127	NC_007763	GTC	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
128	NC_007763	CGC	2	6	6512	6517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
129	NC_007763	CGT	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
130	NC_007763	GCG	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359887
131	NC_007763	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
132	NC_007763	GTC	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
133	NC_007763	GGA	3	9	6734	6742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359887
134	NC_007763	CAT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359887
135	NC_007763	CGG	2	6	6901	6906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359887
136	NC_007763	CGA	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359887
137	NC_007763	CCG	2	6	6948	6953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
138	NC_007763	GAT	2	6	6993	6998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359887
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141	NC_007763	CCG	2	6	7241	7246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
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241	NC_007763	GAAA	2	8	11076	11083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
242	NC_007763	CCT	2	6	11086	11091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
243	NC_007763	AGG	2	6	11102	11107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_007763	CTGA	2	8	11977	11984	25 %	25 %	25 %	25 %	86359891
262	NC_007763	ATTTC	2	10	12042	12051	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_007763	GAG	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_007763	GCG	2	6	12064	12069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_007763	CG	3	6	12075	12080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
266	NC_007763	CG	3	6	12103	12108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359892
267	NC_007763	GTT	2	6	12150	12155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359892
268	NC_007763	GAA	2	6	12183	12188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359892
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402	NC_007763	ATC	2	6	17576	17581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_007763	GCAT	2	8	17600	17607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
404	NC_007763	GCAC	2	8	17628	17635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
405	NC_007763	GGC	2	6	17658	17663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359898
406	NC_007763	GGC	2	6	17692	17697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359898
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408	NC_007763	CTTC	2	8	17750	17757	0 %	50 %	0 %	50 %	86359898
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444	NC_007763	ACATTC	2	12	19467	19478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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