MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 4026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007762	CAA	2	6	169542	169547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359854
3502	NC_007762	CGC	3	9	169579	169587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
3503	NC_007762	GCCG	2	8	169636	169643	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
3504	NC_007762	GGC	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359854
3505	NC_007762	TCG	2	6	169701	169706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
3506	NC_007762	CCG	2	6	169712	169717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854
3507	NC_007762	GGC	2	6	169789	169794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359854
3508	NC_007762	CGATCA	2	12	169902	169913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86359854
3509	NC_007762	TCG	2	6	170007	170012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359855
3510	NC_007762	CAG	2	6	170048	170053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359855
3511	NC_007762	TCT	2	6	170110	170115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359855
3512	NC_007762	GT	3	6	170119	170124	0 %	50 %	50 %	0 %	86359855
3513	NC_007762	CTT	2	6	170126	170131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359855
3514	NC_007762	CGTG	2	8	170150	170157	0 %	25 %	50 %	25 %	86359855
3515	NC_007762	CAG	2	6	170174	170179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3516	NC_007762	GCT	2	6	170223	170228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3517	NC_007762	GCT	2	6	170238	170243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3518	NC_007762	TCC	2	6	170274	170279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359856
3519	NC_007762	TCG	2	6	170326	170331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3520	NC_007762	ATCTCG	2	12	170332	170343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359856
3521	NC_007762	CGG	2	6	170396	170401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359856
3522	NC_007762	GCT	2	6	170408	170413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3523	NC_007762	TCG	2	6	170431	170436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359856
3524	NC_007762	GAG	2	6	170446	170451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359856
3525	NC_007762	TTC	2	6	170455	170460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359856
3526	NC_007762	T	6	6	170509	170514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_007762	GCAC	2	8	170529	170536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_007762	CGG	2	6	170657	170662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_007762	CGA	2	6	170676	170681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_007762	TTCG	2	8	170692	170699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_007762	GA	3	6	170707	170712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_007762	CCG	2	6	170716	170721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3533	NC_007762	CGT	2	6	170747	170752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3534	NC_007762	CGG	2	6	170785	170790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359857
3535	NC_007762	CCG	2	6	170887	170892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3536	NC_007762	GAT	2	6	170915	170920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359857
3537	NC_007762	CCG	2	6	171040	171045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3538	NC_007762	TCG	2	6	171073	171078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3539	NC_007762	AGC	2	6	171079	171084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3540	NC_007762	ACG	2	6	171124	171129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3541	NC_007762	TGA	2	6	171154	171159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359857
3542	NC_007762	CGGA	2	8	171181	171188	25 %	0 %	50 %	25 %	86359857
3543	NC_007762	AAG	2	6	171198	171203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359857
3544	NC_007762	ATCCG	2	10	171229	171238	20 %	20 %	20 %	40 %	86359857
3545	NC_007762	ACG	2	6	171241	171246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3546	NC_007762	GAT	2	6	171285	171290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359857
3547	NC_007762	GATC	2	8	171392	171399	25 %	25 %	25 %	25 %	86359857
3548	NC_007762	CCAT	2	8	171409	171416	25 %	25 %	0 %	50 %	86359857
3549	NC_007762	TGA	2	6	171584	171589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359857
3550	NC_007762	CGA	2	6	171623	171628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3551	NC_007762	TCG	2	6	171807	171812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3552	NC_007762	GCGT	2	8	171817	171824	0 %	25 %	50 %	25 %	86359857
3553	NC_007762	CGCCGG	2	12	171935	171946	0 %	0 %	50 %	50 %	86359857
3554	NC_007762	ACG	2	6	171951	171956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3555	NC_007762	ATG	2	6	171957	171962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359857
3556	NC_007762	GGC	2	6	171965	171970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359857
3557	NC_007762	CGGC	2	8	171988	171995	0 %	0 %	50 %	50 %	86359857
3558	NC_007762	GTC	2	6	172002	172007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3559	NC_007762	GCA	2	6	172011	172016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3560	NC_007762	GGC	2	6	172028	172033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359857
3561	NC_007762	GAAG	2	8	172046	172053	50 %	0 %	50 %	0 %	86359857
3562	NC_007762	CAT	2	6	172058	172063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359857
3563	NC_007762	CGT	2	6	172078	172083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3564	NC_007762	GTTC	2	8	172133	172140	0 %	50 %	25 %	25 %	86359857
3565	NC_007762	CGA	2	6	172142	172147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3566	NC_007762	GTC	2	6	172160	172165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3567	NC_007762	TCG	2	6	172183	172188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3568	NC_007762	CTCGTC	2	12	172215	172226	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86359857
3569	NC_007762	GCC	2	6	172263	172268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3570	NC_007762	CGCCAG	2	12	172320	172331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86359857
3571	NC_007762	GC	3	6	172362	172367	0 %	0 %	50 %	50 %	86359857
3572	NC_007762	CGAT	2	8	172384	172391	25 %	25 %	25 %	25 %	86359857
3573	NC_007762	CGA	2	6	172483	172488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3574	NC_007762	GC	3	6	172545	172550	0 %	0 %	50 %	50 %	86359857
3575	NC_007762	GAA	2	6	172649	172654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359857
3576	NC_007762	GTC	2	6	172695	172700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3577	NC_007762	CGGGAC	2	12	172705	172716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86359857
3578	NC_007762	ATC	2	6	172719	172724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359857
3579	NC_007762	TTA	2	6	172925	172930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359857
3580	NC_007762	ACG	2	6	172998	173003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3581	NC_007762	GTC	2	6	173115	173120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3582	NC_007762	CAA	2	6	173222	173227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359857
3583	NC_007762	CGC	2	6	173300	173305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3584	NC_007762	GAA	2	6	173318	173323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359857
3585	NC_007762	GAG	2	6	173331	173336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359857
3586	NC_007762	GAA	2	6	173411	173416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359857
3587	NC_007762	GC	3	6	173473	173478	0 %	0 %	50 %	50 %	86359857
3588	NC_007762	GCGG	2	8	173588	173595	0 %	0 %	75 %	25 %	86359857
3589	NC_007762	GAA	2	6	173619	173624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359857
3590	NC_007762	TCGA	2	8	173646	173653	25 %	25 %	25 %	25 %	86359857
3591	NC_007762	CCG	2	6	173728	173733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3592	NC_007762	ACGG	2	8	173930	173937	25 %	0 %	50 %	25 %	86359857
3593	NC_007762	GCA	2	6	173939	173944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359857
3594	NC_007762	CGC	2	6	173948	173953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359857
3595	NC_007762	AAGC	2	8	173979	173986	50 %	0 %	25 %	25 %	86359857
3596	NC_007762	GACGC	2	10	174055	174064	20 %	0 %	40 %	40 %	86359858
3597	NC_007762	GGC	2	6	174100	174105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359858
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3599	NC_007762	TGC	2	6	174127	174132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359858
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3601	NC_007762	TCG	2	6	174195	174200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359858
3602	NC_007762	CGG	2	6	174213	174218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359858
3603	NC_007762	C	6	6	174244	174249	0 %	0 %	0 %	100 %	86359858
3604	NC_007762	GA	3	6	174274	174279	50 %	0 %	50 %	0 %	86359858
3605	NC_007762	GGC	2	6	174311	174316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359858
3606	NC_007762	CGC	2	6	174321	174326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359858
3607	NC_007762	TCA	2	6	174327	174332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359858
3608	NC_007762	GCA	2	6	174355	174360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359858
3609	NC_007762	CGAT	2	8	174384	174391	25 %	25 %	25 %	25 %	86359858
3610	NC_007762	GCCG	2	8	174438	174445	0 %	0 %	50 %	50 %	86359858
3611	NC_007762	CGG	2	6	174460	174465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359858
3612	NC_007762	CGT	2	6	174466	174471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359858
3613	NC_007762	TGA	2	6	174475	174480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359858
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3618	NC_007762	GGATGG	2	12	174999	175010	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	86359859
3619	NC_007762	CCG	2	6	175105	175110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359859
3620	NC_007762	CGAAC	2	10	175121	175130	40 %	0 %	20 %	40 %	86359859
3621	NC_007762	TTC	2	6	175261	175266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359859
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3623	NC_007762	GCGG	2	8	175371	175378	0 %	0 %	75 %	25 %	86359859
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3992	NC_007762	GGC	2	6	192203	192208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359879
3993	NC_007762	GCC	2	6	192220	192225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359879
3994	NC_007762	GAC	2	6	192348	192353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359879
3995	NC_007762	CGA	2	6	192367	192372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359879
3996	NC_007762	GCG	2	6	192378	192383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359879
3997	NC_007762	GGA	2	6	192440	192445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359879
3998	NC_007762	ATTG	2	8	192455	192462	25 %	50 %	25 %	0 %	86359879
3999	NC_007762	CG	4	8	192483	192490	0 %	0 %	50 %	50 %	86359879
4000	NC_007762	CTC	2	6	192515	192520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359879

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