MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 4026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007762	GCG	2	6	147549	147554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359835
3002	NC_007762	GCA	2	6	147573	147578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359835
3003	NC_007762	ATCA	2	8	147641	147648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_007762	TTTCG	2	10	147674	147683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3005	NC_007762	GCA	2	6	147766	147771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_007762	GTC	2	6	147923	147928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3007	NC_007762	ACA	2	6	147958	147963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359836
3008	NC_007762	GC	3	6	148002	148007	0 %	0 %	50 %	50 %	86359836
3009	NC_007762	T	7	7	148026	148032	0 %	100 %	0 %	0 %	86359836
3010	NC_007762	CCA	2	6	148039	148044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359836
3011	NC_007762	GCTG	2	8	148087	148094	0 %	25 %	50 %	25 %	86359836
3012	NC_007762	ATC	2	6	148123	148128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359836
3013	NC_007762	GTG	2	6	148129	148134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359836
3014	NC_007762	GGC	2	6	148221	148226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359836
3015	NC_007762	GCC	2	6	148232	148237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359836
3016	NC_007762	CGG	2	6	148277	148282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359836
3017	NC_007762	CAG	2	6	148311	148316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3018	NC_007762	GCTG	2	8	148345	148352	0 %	25 %	50 %	25 %	86359836
3019	NC_007762	GA	3	6	148368	148373	50 %	0 %	50 %	0 %	86359836
3020	NC_007762	CGCT	2	8	148378	148385	0 %	25 %	25 %	50 %	86359836
3021	NC_007762	AGC	2	6	148408	148413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3022	NC_007762	GATT	2	8	148436	148443	25 %	50 %	25 %	0 %	86359836
3023	NC_007762	TCC	2	6	148492	148497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359836
3024	NC_007762	CGC	2	6	148682	148687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359836
3025	NC_007762	GCAA	2	8	148696	148703	50 %	0 %	25 %	25 %	86359836
3026	NC_007762	CGA	2	6	148784	148789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3027	NC_007762	CCT	2	6	148850	148855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359836
3028	NC_007762	TGT	2	6	148903	148908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359836
3029	NC_007762	GCT	2	6	148910	148915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3030	NC_007762	CAG	2	6	148926	148931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359836
3031	NC_007762	TCT	2	6	148970	148975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359836
3032	NC_007762	CTC	2	6	149100	149105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_007762	GCG	2	6	149143	149148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_007762	CTC	2	6	149160	149165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_007762	TC	3	6	149190	149195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_007762	CGG	2	6	149295	149300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_007762	TAA	2	6	149332	149337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007762	TGC	2	6	149354	149359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_007762	CAA	2	6	149563	149568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_007762	CGA	2	6	149615	149620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_007762	AAGC	2	8	149667	149674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_007762	CCGCTT	2	12	149760	149771	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_007762	GAG	2	6	149809	149814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_007762	TC	5	10	149868	149877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_007762	TCCT	2	8	149957	149964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_007762	CGA	2	6	149967	149972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_007762	CGA	2	6	149982	149987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_007762	CGC	2	6	150087	150092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_007762	GC	3	6	150123	150128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_007762	GGAA	2	8	150220	150227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_007762	GAAGA	2	10	150232	150241	60 %	0 %	40 %	0 %	86359837
3052	NC_007762	GA	3	6	150240	150245	50 %	0 %	50 %	0 %	86359837
3053	NC_007762	GCG	2	6	150275	150280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3054	NC_007762	CGG	2	6	150326	150331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3055	NC_007762	CCG	2	6	150343	150348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359837
3056	NC_007762	CGG	2	6	150349	150354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3057	NC_007762	ATCGTC	2	12	150359	150370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359837
3058	NC_007762	TCG	2	6	150432	150437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3059	NC_007762	TCG	2	6	150489	150494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3060	NC_007762	GA	3	6	150539	150544	50 %	0 %	50 %	0 %	86359837
3061	NC_007762	CGT	2	6	150581	150586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3062	NC_007762	TGC	2	6	150648	150653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3063	NC_007762	GCG	2	6	150656	150661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3064	NC_007762	GCA	2	6	150696	150701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3065	NC_007762	GCG	2	6	150707	150712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3066	NC_007762	GGA	2	6	150782	150787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359837
3067	NC_007762	TTCGG	2	10	150806	150815	0 %	40 %	40 %	20 %	86359837
3068	NC_007762	CGAT	2	8	150849	150856	25 %	25 %	25 %	25 %	86359837
3069	NC_007762	CGG	2	6	150913	150918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3070	NC_007762	GCG	2	6	150986	150991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3071	NC_007762	CGA	2	6	151045	151050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359837
3072	NC_007762	GCC	2	6	151078	151083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359837
3073	NC_007762	AGG	3	9	151144	151152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359837
3074	NC_007762	GC	3	6	151163	151168	0 %	0 %	50 %	50 %	86359837
3075	NC_007762	CGG	2	6	151194	151199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3076	NC_007762	CGG	2	6	151231	151236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359837
3077	NC_007762	GAC	2	6	151431	151436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359838
3078	NC_007762	GCC	2	6	151508	151513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359838
3079	NC_007762	TTC	2	6	151578	151583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359838
3080	NC_007762	CGA	2	6	151595	151600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359838
3081	NC_007762	CGTC	2	8	151645	151652	0 %	25 %	25 %	50 %	86359838
3082	NC_007762	C	6	6	151688	151693	0 %	0 %	0 %	100 %	86359838
3083	NC_007762	CG	4	8	151708	151715	0 %	0 %	50 %	50 %	86359838
3084	NC_007762	CGG	2	6	151744	151749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359838
3085	NC_007762	CG	3	6	151792	151797	0 %	0 %	50 %	50 %	86359838
3086	NC_007762	TGA	2	6	151810	151815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359838
3087	NC_007762	CGG	2	6	151820	151825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359838
3088	NC_007762	GGC	2	6	151830	151835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359838
3089	NC_007762	GCT	2	6	151847	151852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359838
3090	NC_007762	CGA	3	9	151865	151873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359838
3091	NC_007762	CGC	2	6	151877	151882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359838
3092	NC_007762	CGG	2	6	151998	152003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_007762	C	7	7	152010	152016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3094	NC_007762	CGCT	2	8	152055	152062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_007762	AGC	2	6	152114	152119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3096	NC_007762	TCA	2	6	152126	152131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359839
3097	NC_007762	CGG	2	6	152158	152163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359839
3098	NC_007762	CGC	2	6	152167	152172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359839
3099	NC_007762	ACG	3	9	152175	152183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3100	NC_007762	CCGG	2	8	152239	152246	0 %	0 %	50 %	50 %	86359839
3101	NC_007762	CGA	2	6	152284	152289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3102	NC_007762	CGC	2	6	152305	152310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359839
3103	NC_007762	CGG	2	6	152462	152467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359839
3104	NC_007762	TCGC	2	8	152549	152556	0 %	25 %	25 %	50 %	86359839
3105	NC_007762	GCG	2	6	152637	152642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359839
3106	NC_007762	GC	3	6	152780	152785	0 %	0 %	50 %	50 %	86359839
3107	NC_007762	ATC	2	6	152786	152791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359839
3108	NC_007762	CG	3	6	152803	152808	0 %	0 %	50 %	50 %	86359839
3109	NC_007762	GACCG	2	10	152861	152870	20 %	0 %	40 %	40 %	86359839
3110	NC_007762	TCGA	2	8	152933	152940	25 %	25 %	25 %	25 %	86359839
3111	NC_007762	CCT	2	6	152964	152969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359839
3112	NC_007762	CCG	2	6	153033	153038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359839
3113	NC_007762	CGC	2	6	153046	153051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359839
3114	NC_007762	CGT	2	6	153097	153102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3115	NC_007762	CTT	2	6	153115	153120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359839
3116	NC_007762	GGA	2	6	153172	153177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359839
3117	NC_007762	GGT	2	6	153222	153227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359839
3118	NC_007762	GCA	2	6	153232	153237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3119	NC_007762	CGA	2	6	153313	153318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3120	NC_007762	ACTG	2	8	153334	153341	25 %	25 %	25 %	25 %	86359839
3121	NC_007762	CTT	2	6	153353	153358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359839
3122	NC_007762	CATCGA	2	12	153391	153402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86359839
3123	NC_007762	GGA	2	6	153406	153411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359839
3124	NC_007762	TCG	2	6	153426	153431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3125	NC_007762	GTC	2	6	153503	153508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3126	NC_007762	GCG	2	6	153549	153554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359839
3127	NC_007762	ACCAC	2	10	153720	153729	40 %	0 %	0 %	60 %	86359839
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3131	NC_007762	TCA	2	6	153921	153926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359839
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3133	NC_007762	CGT	2	6	153949	153954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359839
3134	NC_007762	CTCGAT	2	12	153974	153985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359839
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3154	NC_007762	ATC	3	9	154982	154990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359839
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3201	NC_007762	GCA	2	6	157226	157231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3233	NC_007762	TGG	2	6	158311	158316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359841
3234	NC_007762	CGA	2	6	158373	158378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359841
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3239	NC_007762	TCG	2	6	158522	158527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359841
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3241	NC_007762	AAG	2	6	158560	158565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359841
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3243	NC_007762	CGA	3	9	158718	158726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359841
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3245	NC_007762	CG	3	6	158949	158954	0 %	0 %	50 %	50 %	86359841
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3247	NC_007762	CGC	2	6	159006	159011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359841
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3492	NC_007762	TCCAG	2	10	169080	169089	20 %	20 %	20 %	40 %	86359854
3493	NC_007762	CGT	2	6	169246	169251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359854
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3499	NC_007762	CG	4	8	169369	169376	0 %	0 %	50 %	50 %	86359854
3500	NC_007762	GCC	2	6	169423	169428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359854

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