MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007761	TTG	2	6	172996	173001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355817
4003	NC_007761	CGC	2	6	173066	173071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355817
4004	NC_007761	AGG	2	6	173176	173181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355817
4005	NC_007761	GCG	2	6	173186	173191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355817
4006	NC_007761	GC	3	6	173199	173204	0 %	0 %	50 %	50 %	86355817
4007	NC_007761	GGC	2	6	173226	173231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355817
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4012	NC_007761	TGGTC	2	10	173351	173360	0 %	40 %	40 %	20 %	86355817
4013	NC_007761	GAA	2	6	173418	173423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355817
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4015	NC_007761	TGC	2	6	173693	173698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355817
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4019	NC_007761	TCGA	2	8	173770	173777	25 %	25 %	25 %	25 %	86355817
4020	NC_007761	CGT	2	6	173780	173785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355817
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4027	NC_007761	GGC	2	6	174030	174035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_007761	CG	3	6	175104	175109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4107	NC_007761	GCA	2	6	176875	176880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355820
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4111	NC_007761	CAT	2	6	177005	177010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355820
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4122	NC_007761	ATG	2	6	177497	177502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355821
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4124	NC_007761	TGGT	2	8	177525	177532	0 %	50 %	50 %	0 %	86355821
4125	NC_007761	CGG	2	6	177547	177552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355821
4126	NC_007761	TCG	2	6	177577	177582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355821
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4129	NC_007761	GCG	2	6	177743	177748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355822
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4156	NC_007761	TTC	2	6	178450	178455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_007761	GAG	2	6	178490	178495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355823
4158	NC_007761	AGC	2	6	178499	178504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355823
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4163	NC_007761	GCGA	2	8	178603	178610	25 %	0 %	50 %	25 %	86355823
4164	NC_007761	GAT	2	6	178630	178635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355823
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4176	NC_007761	GCCC	2	8	179339	179346	0 %	0 %	25 %	75 %	86355824
4177	NC_007761	GTC	2	6	179349	179354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355824
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4183	NC_007761	TCGGCG	2	12	179555	179566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86355824
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4185	NC_007761	GCAT	2	8	179686	179693	25 %	25 %	25 %	25 %	86355824
4186	NC_007761	CGTCTC	2	12	179700	179711	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86355824
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4188	NC_007761	CGT	2	6	179835	179840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355824
4189	NC_007761	A	6	6	179866	179871	100 %	0 %	0 %	0 %	86355824
4190	NC_007761	TCG	2	6	179899	179904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355824
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4200	NC_007761	CGC	2	6	180145	180150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355825
4201	NC_007761	TGC	2	6	180151	180156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355825
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4204	NC_007761	CGA	2	6	180241	180246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355825
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4224	NC_007761	GTG	3	9	181252	181260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355826
4225	NC_007761	CAGA	2	8	181266	181273	50 %	0 %	25 %	25 %	86355826
4226	NC_007761	CG	3	6	181310	181315	0 %	0 %	50 %	50 %	86355826
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4229	NC_007761	GC	3	6	181545	181550	0 %	0 %	50 %	50 %	86355826
4230	NC_007761	CGG	2	6	181607	181612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355826
4231	NC_007761	CGG	2	6	181679	181684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355826
4232	NC_007761	GCG	3	9	181694	181702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355826
4233	NC_007761	GGGC	2	8	181741	181748	0 %	0 %	75 %	25 %	86355826
4234	NC_007761	TCGGC	2	10	181793	181802	0 %	20 %	40 %	40 %	86355826
4235	NC_007761	GCC	2	6	181806	181811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355826
4236	NC_007761	GAA	2	6	181862	181867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355827
4237	NC_007761	CGC	2	6	181880	181885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355827
4238	NC_007761	GGT	2	6	181903	181908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355827
4239	NC_007761	CGG	3	9	181909	181917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355827
4240	NC_007761	TGCG	2	8	181921	181928	0 %	25 %	50 %	25 %	86355827
4241	NC_007761	GTC	2	6	181968	181973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355827
4242	NC_007761	TCC	2	6	181974	181979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355827
4243	NC_007761	CGC	2	6	182000	182005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355827
4244	NC_007761	GC	3	6	182009	182014	0 %	0 %	50 %	50 %	86355827
4245	NC_007761	CGGT	2	8	182022	182029	0 %	25 %	50 %	25 %	86355827
4246	NC_007761	CG	3	6	182078	182083	0 %	0 %	50 %	50 %	86355827
4247	NC_007761	GTCACC	2	12	182085	182096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86355827
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4371	NC_007761	CTT	2	6	186785	186790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355832
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4473	NC_007761	GGCA	2	8	191380	191387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4474	NC_007761	AAG	2	6	191394	191399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_007761	ACG	3	9	192132	192140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355836
4494	NC_007761	GAG	2	6	192165	192170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355836
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4496	NC_007761	GTC	2	6	192186	192191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355836
4497	NC_007761	CCGC	2	8	192193	192200	0 %	0 %	25 %	75 %	86355836
4498	NC_007761	ATC	3	9	192261	192269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355836
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