MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007761	CCG	2	6	152272	152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3502	NC_007761	TCGCCC	2	12	152290	152301	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	86355804
3503	NC_007761	CGG	2	6	152333	152338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355804
3504	NC_007761	TCGA	2	8	152449	152456	25 %	25 %	25 %	25 %	86355804
3505	NC_007761	GAA	2	6	152457	152462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355804
3506	NC_007761	CG	3	6	152472	152477	0 %	0 %	50 %	50 %	86355804
3507	NC_007761	TTC	2	6	152509	152514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355804
3508	NC_007761	ACCCGA	2	12	152535	152546	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	86355804
3509	NC_007761	CCG	2	6	152686	152691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3510	NC_007761	CAT	2	6	152694	152699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355804
3511	NC_007761	AT	3	6	152708	152713	50 %	50 %	0 %	0 %	86355804
3512	NC_007761	GCC	3	9	152733	152741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3513	NC_007761	GCC	3	9	152748	152756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3514	NC_007761	CCG	2	6	152758	152763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3515	NC_007761	GCC	2	6	152769	152774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3516	NC_007761	GCC	2	6	152809	152814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3517	NC_007761	GTC	2	6	152883	152888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355804
3518	NC_007761	GAT	2	6	152903	152908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355804
3519	NC_007761	CCG	2	6	152954	152959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355804
3520	NC_007761	AGC	2	6	153045	153050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_007761	CGC	3	9	153076	153084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_007761	CTT	2	6	153097	153102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3523	NC_007761	GTC	3	9	153106	153114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3524	NC_007761	CGA	2	6	153138	153143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3525	NC_007761	CGC	2	6	153150	153155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3526	NC_007761	GCA	2	6	153173	153178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3527	NC_007761	GCC	2	6	153181	153186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3528	NC_007761	CTG	2	6	153193	153198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3529	NC_007761	GCG	2	6	153308	153313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3530	NC_007761	GCGGT	2	10	153329	153338	0 %	20 %	60 %	20 %	86355805
3531	NC_007761	GTGGA	2	10	153383	153392	20 %	20 %	60 %	0 %	86355805
3532	NC_007761	CTT	2	6	153436	153441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3533	NC_007761	GCA	2	6	153449	153454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3534	NC_007761	GCC	2	6	153502	153507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3535	NC_007761	CTG	2	6	153526	153531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3536	NC_007761	CGC	2	6	153615	153620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3537	NC_007761	CGG	2	6	153628	153633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3538	NC_007761	CGA	2	6	153639	153644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
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3540	NC_007761	TTG	2	6	153665	153670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355805
3541	NC_007761	CTG	2	6	153718	153723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3542	NC_007761	CTT	2	6	153754	153759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3543	NC_007761	TCG	2	6	153768	153773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3544	NC_007761	CGC	2	6	153801	153806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3545	NC_007761	GGC	2	6	153892	153897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3546	NC_007761	GCT	2	6	153954	153959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3547	NC_007761	GAC	2	6	153961	153966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3548	NC_007761	GCC	2	6	153994	153999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3549	NC_007761	TCG	2	6	154013	154018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3550	NC_007761	CAG	2	6	154023	154028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3551	NC_007761	TCG	2	6	154088	154093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3552	NC_007761	GC	3	6	154112	154117	0 %	0 %	50 %	50 %	86355805
3553	NC_007761	TGA	2	6	154161	154166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355805
3554	NC_007761	CTG	2	6	154186	154191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3555	NC_007761	GAC	2	6	154196	154201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3556	NC_007761	TTC	2	6	154259	154264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3557	NC_007761	CTT	2	6	154282	154287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3558	NC_007761	CGA	2	6	154308	154313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3559	NC_007761	CCG	2	6	154334	154339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3560	NC_007761	TGG	2	6	154356	154361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355805
3561	NC_007761	ACTTC	2	10	154362	154371	20 %	40 %	0 %	40 %	86355805
3562	NC_007761	GCC	3	9	154414	154422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355805
3563	NC_007761	CTT	2	6	154453	154458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3564	NC_007761	GCG	3	9	154478	154486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3565	NC_007761	TGA	2	6	154497	154502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355805
3566	NC_007761	CGT	2	6	154560	154565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3567	NC_007761	CGG	2	6	154623	154628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3568	NC_007761	TCT	2	6	154638	154643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355805
3569	NC_007761	CGG	2	6	154778	154783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355805
3570	NC_007761	TCG	2	6	154815	154820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3571	NC_007761	CGA	2	6	154854	154859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3572	NC_007761	CCA	2	6	154884	154889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355805
3573	NC_007761	GC	3	6	154903	154908	0 %	0 %	50 %	50 %	86355805
3574	NC_007761	TCG	2	6	154968	154973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355805
3575	NC_007761	TC	3	6	155010	155015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_007761	AAGC	2	8	155020	155027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_007761	GCG	2	6	155112	155117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_007761	TA	3	6	155118	155123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_007761	GCA	2	6	155199	155204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_007761	GCA	2	6	155269	155274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_007761	GTC	2	6	155337	155342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
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3583	NC_007761	CGT	2	6	155377	155382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3584	NC_007761	CCG	2	6	155391	155396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3585	NC_007761	AGG	2	6	155414	155419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355806
3586	NC_007761	GCT	2	6	155446	155451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3587	NC_007761	CGC	3	9	155488	155496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3588	NC_007761	ATG	2	6	155511	155516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355806
3589	NC_007761	CCG	2	6	155517	155522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3590	NC_007761	TCG	3	9	155524	155532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3591	NC_007761	GGC	2	6	155535	155540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3592	NC_007761	CCG	2	6	155562	155567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3593	NC_007761	CTGC	2	8	155575	155582	0 %	25 %	25 %	50 %	86355806
3594	NC_007761	ATC	2	6	155613	155618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355806
3595	NC_007761	GCG	2	6	155635	155640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3596	NC_007761	GCG	2	6	155661	155666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3597	NC_007761	TTCC	2	8	155675	155682	0 %	50 %	0 %	50 %	86355806
3598	NC_007761	CCG	3	9	155700	155708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3599	NC_007761	CTT	2	6	155714	155719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355806
3600	NC_007761	CGT	2	6	155731	155736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3601	NC_007761	CGA	2	6	155779	155784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3602	NC_007761	CG	3	6	155794	155799	0 %	0 %	50 %	50 %	86355806
3603	NC_007761	CGT	2	6	155807	155812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355806
3604	NC_007761	CGC	2	6	155825	155830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3605	NC_007761	CAT	3	9	155882	155890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355806
3606	NC_007761	GCG	2	6	155904	155909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3607	NC_007761	CG	3	6	155926	155931	0 %	0 %	50 %	50 %	86355806
3608	NC_007761	CGG	2	6	155971	155976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3609	NC_007761	CGG	2	6	155985	155990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3610	NC_007761	GCG	2	6	155998	156003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3611	NC_007761	GCC	2	6	156014	156019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3612	NC_007761	GGC	2	6	156029	156034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355806
3613	NC_007761	AGG	2	6	156037	156042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355806
3614	NC_007761	TCT	2	6	156235	156240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355806
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3617	NC_007761	TCGA	2	8	156444	156451	25 %	25 %	25 %	25 %	86355806
3618	NC_007761	GCC	2	6	156459	156464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3619	NC_007761	GCC	2	6	156482	156487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355806
3620	NC_007761	TCT	2	6	156526	156531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355806
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3748	NC_007761	TCGATC	2	12	161992	162003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86355809
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3822	NC_007761	ATCG	2	8	165716	165723	25 %	25 %	25 %	25 %	86355811
3823	NC_007761	GCC	2	6	165737	165742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355811
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3853	NC_007761	GGAA	2	8	167144	167151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3854	NC_007761	TTA	2	6	167153	167158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3855	NC_007761	CCTT	2	8	167160	167167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3856	NC_007761	TGAG	2	8	167201	167208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3857	NC_007761	GGA	2	6	167287	167292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355812
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3860	NC_007761	GCC	4	12	167388	167399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355812
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3863	NC_007761	CCG	2	6	167550	167555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355812
3864	NC_007761	CGG	2	6	167556	167561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355812
3865	NC_007761	GAG	2	6	167636	167641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355812
3866	NC_007761	CG	3	6	167654	167659	0 %	0 %	50 %	50 %	86355812
3867	NC_007761	TTC	2	6	167670	167675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355812
3868	NC_007761	AATC	2	8	167697	167704	50 %	25 %	0 %	25 %	86355812
3869	NC_007761	GC	3	6	167739	167744	0 %	0 %	50 %	50 %	86355812
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3995	NC_007761	GGC	2	6	172597	172602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355816
3996	NC_007761	ATG	3	9	172645	172653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_007761	GCC	2	6	172662	172667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3998	NC_007761	GAC	2	6	172749	172754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355817
3999	NC_007761	GATCAG	2	12	172755	172766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86355817
4000	NC_007761	GAT	2	6	172857	172862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355817

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