MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_007761	GCCA	2	8	823613	823620	25 %	0 %	25 %	50 %	86356433
19503	NC_007761	GCA	2	6	823661	823666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356433
19504	NC_007761	GC	3	6	823745	823750	0 %	0 %	50 %	50 %	86356433
19505	NC_007761	CGC	2	6	823815	823820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356433
19506	NC_007761	GAA	2	6	823909	823914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356433
19507	NC_007761	TCA	2	6	823932	823937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356433
19508	NC_007761	GAT	2	6	823958	823963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356433
19509	NC_007761	TCAT	2	8	823986	823993	25 %	50 %	0 %	25 %	86356433
19510	NC_007761	GAC	2	6	824063	824068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356433
19511	NC_007761	GTC	2	6	824090	824095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356433
19512	NC_007761	ATG	3	9	824106	824114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356433
19513	NC_007761	GAC	2	6	824146	824151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356433
19514	NC_007761	GGCAAT	2	12	824153	824164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86356433
19515	NC_007761	GCG	2	6	824267	824272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356433
19516	NC_007761	GGC	2	6	824308	824313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356433
19517	NC_007761	GGCG	2	8	824317	824324	0 %	0 %	75 %	25 %	86356433
19518	NC_007761	GAA	2	6	824422	824427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356433
19519	NC_007761	TCC	2	6	824531	824536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19520	NC_007761	CG	3	6	824572	824577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19521	NC_007761	CAG	2	6	824618	824623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19522	NC_007761	TGC	2	6	824634	824639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_007761	CGGC	2	8	824682	824689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19524	NC_007761	GCC	2	6	824735	824740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19525	NC_007761	AAG	2	6	824872	824877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_007761	GGC	2	6	824890	824895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19527	NC_007761	CGC	2	6	824900	824905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19528	NC_007761	CCG	2	6	824915	824920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19529	NC_007761	CTA	2	6	824921	824926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19530	NC_007761	GGTT	2	8	824981	824988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_007761	TGA	2	6	825097	825102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_007761	CG	3	6	825103	825108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19533	NC_007761	CCA	2	6	825110	825115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19534	NC_007761	T	6	6	825127	825132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_007761	CAG	2	6	825219	825224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19536	NC_007761	CGG	2	6	825231	825236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19537	NC_007761	GCG	2	6	825253	825258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19538	NC_007761	A	7	7	825299	825305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_007761	TG	3	6	825314	825319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_007761	A	6	6	825353	825358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_007761	CGG	2	6	825373	825378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_007761	CTG	2	6	825420	825425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19543	NC_007761	GCGCG	2	10	825442	825451	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19544	NC_007761	AACG	2	8	825458	825465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19545	NC_007761	GGC	2	6	825480	825485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19546	NC_007761	CGG	2	6	825511	825516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_007761	AAG	2	6	825534	825539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19548	NC_007761	GC	3	6	825630	825635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19549	NC_007761	GCC	2	6	825679	825684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19550	NC_007761	TGC	2	6	825701	825706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19551	NC_007761	TTCAC	2	10	825716	825725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19552	NC_007761	CCATG	2	10	825728	825737	20 %	20 %	20 %	40 %	86356434
19553	NC_007761	GGC	2	6	825743	825748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356434
19554	NC_007761	CCGG	2	8	825763	825770	0 %	0 %	50 %	50 %	86356434
19555	NC_007761	CCG	2	6	825803	825808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356434
19556	NC_007761	GCCG	2	8	825838	825845	0 %	0 %	50 %	50 %	86356434
19557	NC_007761	GAC	2	6	825893	825898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19558	NC_007761	CG	3	6	825913	825918	0 %	0 %	50 %	50 %	86356434
19559	NC_007761	GGCGCG	2	12	825930	825941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356434
19560	NC_007761	CGC	2	6	826031	826036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356434
19561	NC_007761	CCCG	2	8	826084	826091	0 %	0 %	25 %	75 %	86356434
19562	NC_007761	CGT	2	6	826103	826108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19563	NC_007761	CGTC	2	8	826127	826134	0 %	25 %	25 %	50 %	86356434
19564	NC_007761	GCG	2	6	826149	826154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356434
19565	NC_007761	GCC	2	6	826159	826164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356434
19566	NC_007761	GAC	2	6	826170	826175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19567	NC_007761	CCG	2	6	826301	826306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356434
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19571	NC_007761	TCG	2	6	826390	826395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19572	NC_007761	CGT	2	6	826412	826417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
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19574	NC_007761	TCG	2	6	826440	826445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19575	NC_007761	ATCAC	2	10	826495	826504	40 %	20 %	0 %	40 %	86356434
19576	NC_007761	CGT	2	6	826529	826534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
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19580	NC_007761	GCCGC	2	10	826816	826825	0 %	0 %	40 %	60 %	86356434
19581	NC_007761	CCG	2	6	826892	826897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356434
19582	NC_007761	CTG	2	6	826950	826955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356434
19583	NC_007761	ATG	2	6	826962	826967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356434
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19588	NC_007761	GC	3	6	827158	827163	0 %	0 %	50 %	50 %	86356435
19589	NC_007761	GCC	2	6	827189	827194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356435
19590	NC_007761	GCT	2	6	827200	827205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356435
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19596	NC_007761	GT	3	6	827370	827375	0 %	50 %	50 %	0 %	86356435
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19602	NC_007761	GGC	2	6	827594	827599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356435
19603	NC_007761	GTC	2	6	827645	827650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356435
19604	NC_007761	CTG	2	6	827696	827701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356435
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19607	NC_007761	CTG	2	6	827863	827868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19608	NC_007761	ATT	2	6	827975	827980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19609	NC_007761	CCG	2	6	828047	828052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19610	NC_007761	GCA	2	6	828085	828090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19611	NC_007761	ATT	2	6	828120	828125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19612	NC_007761	CTTTGC	2	12	828205	828216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19614	NC_007761	GCC	2	6	828278	828283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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