MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_007761	ATG	2	6	670363	670368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356299
16003	NC_007761	CTCG	2	8	670377	670384	0 %	25 %	25 %	50 %	86356299
16004	NC_007761	CGC	2	6	670390	670395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356299
16005	NC_007761	GCC	3	9	670399	670407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356299
16006	NC_007761	TCGGC	2	10	670520	670529	0 %	20 %	40 %	40 %	86356299
16007	NC_007761	CGGCT	2	10	670582	670591	0 %	20 %	40 %	40 %	86356299
16008	NC_007761	GTGC	2	8	670662	670669	0 %	25 %	50 %	25 %	86356300
16009	NC_007761	TCG	2	6	670727	670732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356300
16010	NC_007761	GGA	2	6	670738	670743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356300
16011	NC_007761	GCC	2	6	670864	670869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356300
16012	NC_007761	GAAA	2	8	670920	670927	75 %	0 %	25 %	0 %	86356300
16013	NC_007761	CCG	3	9	670932	670940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356300
16014	NC_007761	CGA	2	6	670944	670949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356300
16015	NC_007761	GCA	2	6	670980	670985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356300
16016	NC_007761	T	6	6	671083	671088	0 %	100 %	0 %	0 %	86356300
16017	NC_007761	GCG	2	6	671125	671130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356301
16018	NC_007761	AGA	2	6	671165	671170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356301
16019	NC_007761	GC	3	6	671214	671219	0 %	0 %	50 %	50 %	86356301
16020	NC_007761	GCG	2	6	671222	671227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356301
16021	NC_007761	ACC	2	6	671308	671313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356301
16022	NC_007761	CGT	2	6	671318	671323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356301
16023	NC_007761	CGG	2	6	671413	671418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356301
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16025	NC_007761	TTC	2	6	671484	671489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356301
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16027	NC_007761	TCGA	2	8	671656	671663	25 %	25 %	25 %	25 %	86356301
16028	NC_007761	CTC	2	6	671677	671682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356301
16029	NC_007761	CGA	4	12	671705	671716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356301
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16031	NC_007761	GGA	2	6	671850	671855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356301
16032	NC_007761	GGCG	2	8	671886	671893	0 %	0 %	75 %	25 %	86356301
16033	NC_007761	CAG	2	6	671895	671900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356301
16034	NC_007761	CGC	2	6	671901	671906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356301
16035	NC_007761	AGCCT	2	10	671915	671924	20 %	20 %	20 %	40 %	86356301
16036	NC_007761	AAAG	2	8	671932	671939	75 %	0 %	25 %	0 %	86356301
16037	NC_007761	GCT	2	6	671975	671980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356301
16038	NC_007761	GAA	2	6	672030	672035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356301
16039	NC_007761	AGAT	2	8	672040	672047	50 %	25 %	25 %	0 %	86356301
16040	NC_007761	CG	3	6	672083	672088	0 %	0 %	50 %	50 %	86356301
16041	NC_007761	ATGC	2	8	672213	672220	25 %	25 %	25 %	25 %	86356301
16042	NC_007761	TGA	2	6	672242	672247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_007761	CAAAA	2	10	672258	672267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16044	NC_007761	A	6	6	672264	672269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_007761	GTC	2	6	672337	672342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_007761	GCC	2	6	672362	672367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_007761	GGC	2	6	672373	672378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_007761	CCTT	2	8	672426	672433	0 %	50 %	0 %	50 %	86356302
16049	NC_007761	CG	3	6	672511	672516	0 %	0 %	50 %	50 %	86356302
16050	NC_007761	CGC	2	6	672523	672528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356302
16051	NC_007761	GCG	2	6	672560	672565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356302
16052	NC_007761	GA	3	6	672585	672590	50 %	0 %	50 %	0 %	86356302
16053	NC_007761	CGGC	2	8	672607	672614	0 %	0 %	50 %	50 %	86356302
16054	NC_007761	GTCG	2	8	672641	672648	0 %	25 %	50 %	25 %	86356302
16055	NC_007761	AGC	2	6	672660	672665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356302
16056	NC_007761	TTG	2	6	672729	672734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356302
16057	NC_007761	CGAG	2	8	672757	672764	25 %	0 %	50 %	25 %	86356302
16058	NC_007761	AGC	2	6	672768	672773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356302
16059	NC_007761	AGC	2	6	672861	672866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356302
16060	NC_007761	TCA	2	6	672868	672873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356302
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16062	NC_007761	GCC	2	6	672894	672899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356302
16063	NC_007761	CGGCG	2	10	672943	672952	0 %	0 %	60 %	40 %	86356302
16064	NC_007761	GCA	3	9	672967	672975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356302
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16073	NC_007761	GC	3	6	673414	673419	0 %	0 %	50 %	50 %	86356302
16074	NC_007761	CAT	2	6	673439	673444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356302
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16081	NC_007761	GC	3	6	673729	673734	0 %	0 %	50 %	50 %	86356303
16082	NC_007761	CGAA	2	8	673759	673766	50 %	0 %	25 %	25 %	86356303
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16092	NC_007761	TCG	2	6	673962	673967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356303
16093	NC_007761	CTG	2	6	674024	674029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356303
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16102	NC_007761	GCCG	2	8	674546	674553	0 %	0 %	50 %	50 %	86356304
16103	NC_007761	GGGC	2	8	674555	674562	0 %	0 %	75 %	25 %	86356304
16104	NC_007761	CCG	2	6	674616	674621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356304
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16107	NC_007761	CGGC	2	8	674694	674701	0 %	0 %	50 %	50 %	86356304
16108	NC_007761	CGG	2	6	674715	674720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356304
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16110	NC_007761	GCGTC	2	10	674802	674811	0 %	20 %	40 %	40 %	86356304
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16112	NC_007761	GGT	2	6	674847	674852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356304
16113	NC_007761	TGA	2	6	674913	674918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356304
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16243	NC_007761	ACG	2	6	680298	680303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356312
16244	NC_007761	GTT	2	6	680391	680396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356312
16245	NC_007761	CTT	2	6	680513	680518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356312
16246	NC_007761	CAC	2	6	680540	680545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356312
16247	NC_007761	CAA	2	6	680570	680575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356312
16248	NC_007761	CCTG	2	8	680618	680625	0 %	25 %	25 %	50 %	86356312
16249	NC_007761	GTC	2	6	680814	680819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356312
16250	NC_007761	CGA	2	6	680828	680833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356312
16251	NC_007761	CAC	2	6	680951	680956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356312
16252	NC_007761	TGA	2	6	680960	680965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356312
16253	NC_007761	AAGGG	2	10	680999	681008	40 %	0 %	60 %	0 %	86356312
16254	NC_007761	ATG	2	6	681016	681021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356313
16255	NC_007761	GGC	2	6	681054	681059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356313
16256	NC_007761	CGCGGA	2	12	681093	681104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356313
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16262	NC_007761	GCT	2	6	681264	681269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356313
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16264	NC_007761	TCT	2	6	681344	681349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356313
16265	NC_007761	CT	3	6	681348	681353	0 %	50 %	0 %	50 %	86356313
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16271	NC_007761	TTG	2	6	681523	681528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356314
16272	NC_007761	GTC	2	6	681531	681536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356314
16273	NC_007761	GCCT	2	8	681560	681567	0 %	25 %	25 %	50 %	86356314
16274	NC_007761	TCGCT	2	10	681595	681604	0 %	40 %	20 %	40 %	86356314
16275	NC_007761	GGCC	2	8	681608	681615	0 %	0 %	50 %	50 %	86356314
16276	NC_007761	TCG	2	6	681646	681651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356314
16277	NC_007761	GGC	2	6	681744	681749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356314
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16279	NC_007761	GCTC	2	8	681841	681848	0 %	25 %	25 %	50 %	86356314
16280	NC_007761	GGC	2	6	681870	681875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356314
16281	NC_007761	GGC	2	6	681971	681976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356314
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16283	NC_007761	GCCG	2	8	682002	682009	0 %	0 %	50 %	50 %	86356314
16284	NC_007761	CGG	2	6	682016	682021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356314
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16287	NC_007761	CGG	2	6	682154	682159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356314
16288	NC_007761	GTG	2	6	682191	682196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356314
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16294	NC_007761	CCG	2	6	682426	682431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356314
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16299	NC_007761	TGC	2	6	682606	682611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356314
16300	NC_007761	ATG	2	6	682613	682618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356314
16301	NC_007761	TGC	2	6	682644	682649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356315
16302	NC_007761	CTG	2	6	682652	682657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356315
16303	NC_007761	CGC	2	6	682658	682663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356315
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16305	NC_007761	GGAG	2	8	682729	682736	25 %	0 %	75 %	0 %	86356315
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16307	NC_007761	GCG	2	6	682906	682911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356315
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16319	NC_007761	GGCAAG	2	12	683566	683577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86356316
16320	NC_007761	CTT	2	6	683602	683607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356316
16321	NC_007761	CGT	2	6	683616	683621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356316
16322	NC_007761	CGTC	2	8	683715	683722	0 %	25 %	25 %	50 %	86356316
16323	NC_007761	TGG	2	6	683787	683792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356316
16324	NC_007761	GCC	2	6	683798	683803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356316
16325	NC_007761	GCA	2	6	683814	683819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356316
16326	NC_007761	CG	3	6	683825	683830	0 %	0 %	50 %	50 %	86356316
16327	NC_007761	CAG	2	6	683833	683838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356316
16328	NC_007761	CGC	2	6	683855	683860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356316
16329	NC_007761	GAC	2	6	683871	683876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16330	NC_007761	GAA	3	9	683910	683918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356317
16331	NC_007761	TGA	2	6	683930	683935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356317
16332	NC_007761	ATC	2	6	683938	683943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356317
16333	NC_007761	CTC	2	6	683962	683967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356317
16334	NC_007761	CGG	3	9	683973	683981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356317
16335	NC_007761	TCG	2	6	683999	684004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356317
16336	NC_007761	AGG	2	6	684026	684031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356317
16337	NC_007761	AAG	3	9	684058	684066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356317
16338	NC_007761	GC	3	6	684082	684087	0 %	0 %	50 %	50 %	86356317
16339	NC_007761	CAA	2	6	684102	684107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356317
16340	NC_007761	CGT	2	6	684108	684113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356317
16341	NC_007761	GCT	2	6	684180	684185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356317
16342	NC_007761	GCC	2	6	684195	684200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356317
16343	NC_007761	CAG	2	6	684265	684270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356317
16344	NC_007761	CG	3	6	684281	684286	0 %	0 %	50 %	50 %	86356317
16345	NC_007761	TCGC	2	8	684330	684337	0 %	25 %	25 %	50 %	86356317
16346	NC_007761	GCC	2	6	684405	684410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356318
16347	NC_007761	ATG	2	6	684411	684416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356318
16348	NC_007761	CAG	2	6	684441	684446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356318
16349	NC_007761	CCGA	2	8	684450	684457	25 %	0 %	25 %	50 %	86356318
16350	NC_007761	TTG	2	6	684459	684464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356318
16351	NC_007761	CGC	2	6	684488	684493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356318
16352	NC_007761	ATC	2	6	684498	684503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356318
16353	NC_007761	CTG	2	6	684516	684521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356318
16354	NC_007761	CTC	2	6	684617	684622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356318
16355	NC_007761	TCC	2	6	684640	684645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356318
16356	NC_007761	TGTCGC	2	12	684646	684657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356318
16357	NC_007761	GCT	2	6	684722	684727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356318
16358	NC_007761	GGC	2	6	684791	684796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356318
16359	NC_007761	TCG	2	6	684826	684831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356318
16360	NC_007761	CG	3	6	684836	684841	0 %	0 %	50 %	50 %	86356318
16361	NC_007761	GAC	2	6	684863	684868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356318
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16487	NC_007761	ACA	2	6	690103	690108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356322
16488	NC_007761	GCC	2	6	690147	690152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356322
16489	NC_007761	TCA	2	6	690196	690201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356322
16490	NC_007761	AGG	2	6	690262	690267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356322
16491	NC_007761	GCA	3	9	690281	690289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356322
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16493	NC_007761	CGT	2	6	690362	690367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356322
16494	NC_007761	GGCAAT	2	12	690387	690398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86356322
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16497	NC_007761	TCG	2	6	690673	690678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356322
16498	NC_007761	TCGA	2	8	690693	690700	25 %	25 %	25 %	25 %	86356322
16499	NC_007761	GCC	2	6	690712	690717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356322
16500	NC_007761	TCG	2	6	690718	690723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356322

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