MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_007761	TCG	2	6	650199	650204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15502	NC_007761	CGC	2	6	650224	650229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356281
15503	NC_007761	CGT	2	6	650255	650260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15504	NC_007761	CTG	2	6	650398	650403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15505	NC_007761	GCG	3	9	650416	650424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356281
15506	NC_007761	GGAGG	2	10	650501	650510	20 %	0 %	80 %	0 %	86356281
15507	NC_007761	T	6	6	650569	650574	0 %	100 %	0 %	0 %	86356281
15508	NC_007761	GCG	2	6	650614	650619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356281
15509	NC_007761	TCA	2	6	650635	650640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356281
15510	NC_007761	ATC	2	6	650682	650687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356281
15511	NC_007761	TCG	3	9	650706	650714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15512	NC_007761	TCG	2	6	650730	650735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15513	NC_007761	AGC	3	9	650736	650744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15514	NC_007761	GCG	2	6	650770	650775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356281
15515	NC_007761	CTC	2	6	650819	650824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356281
15516	NC_007761	TCG	2	6	650857	650862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356281
15517	NC_007761	CTG	2	6	650895	650900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_007761	CG	3	6	650924	650929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15519	NC_007761	TTG	2	6	650952	650957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_007761	CAA	2	6	650981	650986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_007761	AAC	2	6	651037	651042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_007761	GAT	2	6	651089	651094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356282
15523	NC_007761	GCC	2	6	651099	651104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15524	NC_007761	TGGCG	2	10	651127	651136	0 %	20 %	60 %	20 %	86356282
15525	NC_007761	GCG	3	9	651134	651142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15526	NC_007761	GCG	2	6	651171	651176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15527	NC_007761	CGA	2	6	651185	651190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15528	NC_007761	CCA	2	6	651199	651204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356282
15529	NC_007761	GCC	2	6	651248	651253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15530	NC_007761	GAT	2	6	651338	651343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356282
15531	NC_007761	GAC	3	9	651398	651406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15532	NC_007761	CGA	2	6	651427	651432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15533	NC_007761	GGC	2	6	651443	651448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15534	NC_007761	GAA	2	6	651485	651490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356282
15535	NC_007761	CGAC	2	8	651598	651605	25 %	0 %	25 %	50 %	86356282
15536	NC_007761	GCCG	2	8	651611	651618	0 %	0 %	50 %	50 %	86356282
15537	NC_007761	CGC	2	6	651628	651633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15538	NC_007761	GATC	2	8	651679	651686	25 %	25 %	25 %	25 %	86356282
15539	NC_007761	CGC	2	6	651736	651741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15540	NC_007761	TGT	2	6	651775	651780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356282
15541	NC_007761	GCCGAG	2	12	651806	651817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356282
15542	NC_007761	GCC	2	6	651852	651857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15543	NC_007761	GCC	2	6	651884	651889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15544	NC_007761	GGAT	2	8	651918	651925	25 %	25 %	50 %	0 %	86356282
15545	NC_007761	ACG	2	6	651933	651938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15546	NC_007761	AGC	2	6	651951	651956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15547	NC_007761	GAA	2	6	651974	651979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356282
15548	NC_007761	GC	3	6	651980	651985	0 %	0 %	50 %	50 %	86356282
15549	NC_007761	GCG	3	9	652058	652066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15550	NC_007761	ATC	2	6	652077	652082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356282
15551	NC_007761	CGAA	2	8	652089	652096	50 %	0 %	25 %	25 %	86356282
15552	NC_007761	GAT	2	6	652118	652123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356282
15553	NC_007761	ATA	2	6	652221	652226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86356282
15554	NC_007761	GGC	2	6	652259	652264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15555	NC_007761	GCCCTT	2	12	652271	652282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86356282
15556	NC_007761	ACG	2	6	652350	652355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15557	NC_007761	CAGCGT	2	12	652370	652381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15558	NC_007761	CAG	2	6	652427	652432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15559	NC_007761	CGA	2	6	652486	652491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15560	NC_007761	CGA	2	6	652501	652506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15561	NC_007761	CTC	2	6	652565	652570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356282
15562	NC_007761	GC	3	6	652602	652607	0 %	0 %	50 %	50 %	86356282
15563	NC_007761	GGC	2	6	652613	652618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15564	NC_007761	GTG	2	6	652623	652628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356282
15565	NC_007761	CCG	2	6	652668	652673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15566	NC_007761	GTC	2	6	652712	652717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15567	NC_007761	CGTG	2	8	652813	652820	0 %	25 %	50 %	25 %	86356282
15568	NC_007761	CG	3	6	652837	652842	0 %	0 %	50 %	50 %	86356282
15569	NC_007761	CAT	2	6	652913	652918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356282
15570	NC_007761	GTT	2	6	652940	652945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356282
15571	NC_007761	CTG	2	6	653117	653122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15572	NC_007761	GCCG	2	8	653150	653157	0 %	0 %	50 %	50 %	86356282
15573	NC_007761	ACG	2	6	653301	653306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15574	NC_007761	ACG	2	6	653325	653330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15575	NC_007761	CGG	2	6	653364	653369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356282
15576	NC_007761	AGC	2	6	653379	653384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15577	NC_007761	TCG	2	6	653415	653420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356282
15578	NC_007761	GCC	2	6	653441	653446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356282
15579	NC_007761	GGA	2	6	653503	653508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356282
15580	NC_007761	GAT	2	6	653555	653560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356282
15581	NC_007761	GCT	2	6	653667	653672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15583	NC_007761	CG	4	8	653702	653709	0 %	0 %	50 %	50 %	86356283
15584	NC_007761	CGG	2	6	653728	653733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356283
15585	NC_007761	GCG	2	6	653740	653745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356283
15586	NC_007761	CAG	2	6	653761	653766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356283
15587	NC_007761	CCGG	2	8	653777	653784	0 %	0 %	50 %	50 %	86356283
15588	NC_007761	CAT	2	6	653827	653832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356283
15589	NC_007761	CTGC	2	8	653836	653843	0 %	25 %	25 %	50 %	86356283
15590	NC_007761	CGG	2	6	653863	653868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356283
15591	NC_007761	CGC	2	6	653875	653880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356283
15592	NC_007761	CG	4	8	653890	653897	0 %	0 %	50 %	50 %	86356283
15593	NC_007761	TGC	2	6	653904	653909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356283
15594	NC_007761	TTG	2	6	653943	653948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356283
15595	NC_007761	GCC	2	6	653952	653957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356283
15596	NC_007761	GCC	2	6	653978	653983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356283
15597	NC_007761	GCG	2	6	654027	654032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356283
15598	NC_007761	TCC	2	6	654069	654074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356283
15599	NC_007761	GC	3	6	654109	654114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15600	NC_007761	TC	3	6	654118	654123	0 %	50 %	0 %	50 %	86356284
15601	NC_007761	CGG	2	6	654134	654139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356284
15602	NC_007761	CCTG	2	8	654172	654179	0 %	25 %	25 %	50 %	86356284
15603	NC_007761	ATG	2	6	654200	654205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356284
15604	NC_007761	AGCC	2	8	654212	654219	25 %	0 %	25 %	50 %	86356284
15605	NC_007761	ATG	2	6	654255	654260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356284
15606	NC_007761	TCG	2	6	654288	654293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356284
15607	NC_007761	CGA	2	6	654319	654324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356284
15608	NC_007761	GC	3	6	654347	654352	0 %	0 %	50 %	50 %	86356284
15609	NC_007761	GATGGC	2	12	654389	654400	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86356284
15610	NC_007761	GC	3	6	654407	654412	0 %	0 %	50 %	50 %	86356284
15611	NC_007761	CGA	2	6	654559	654564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356284
15612	NC_007761	TCG	2	6	654627	654632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356284
15613	NC_007761	GGC	2	6	654639	654644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356284
15614	NC_007761	GAA	2	6	654746	654751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356284
15615	NC_007761	CAG	2	6	654752	654757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356284
15616	NC_007761	GAT	2	6	654767	654772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356284
15617	NC_007761	GAT	2	6	654776	654781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356284
15618	NC_007761	CTC	2	6	654809	654814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356284
15619	NC_007761	GCG	2	6	654843	654848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356284
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15621	NC_007761	GGC	2	6	654941	654946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356284
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15981	NC_007761	GC	3	6	669247	669252	0 %	0 %	50 %	50 %	86356298
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15986	NC_007761	GCT	2	6	669448	669453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356298
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15988	NC_007761	CGCCT	2	10	669527	669536	0 %	20 %	20 %	60 %	86356298
15989	NC_007761	CTTC	2	8	669619	669626	0 %	50 %	0 %	50 %	86356298
15990	NC_007761	ACTG	2	8	669661	669668	25 %	25 %	25 %	25 %	86356298
15991	NC_007761	CGA	2	6	669715	669720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356298
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