MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007761	GCC	2	6	630070	630075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356263
15002	NC_007761	TTC	2	6	630091	630096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356263
15003	NC_007761	AAGG	2	8	630217	630224	50 %	0 %	50 %	0 %	86356263
15004	NC_007761	GCT	2	6	630258	630263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
15005	NC_007761	GAA	2	6	630292	630297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356263
15006	NC_007761	GCC	2	6	630355	630360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356263
15007	NC_007761	CGT	2	6	630381	630386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
15008	NC_007761	GTC	2	6	630427	630432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
15009	NC_007761	ACA	2	6	630440	630445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356263
15010	NC_007761	CCG	2	6	630448	630453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356263
15011	NC_007761	GC	3	6	630506	630511	0 %	0 %	50 %	50 %	86356263
15012	NC_007761	CCG	2	6	630602	630607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356263
15013	NC_007761	AAT	2	6	630617	630622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86356263
15014	NC_007761	GCA	2	6	630758	630763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_007761	GAC	2	6	630764	630769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_007761	CGT	2	6	630811	630816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_007761	CTG	2	6	630908	630913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15018	NC_007761	GGC	2	6	630914	630919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356264
15019	NC_007761	TTTC	2	8	630945	630952	0 %	75 %	0 %	25 %	86356264
15020	NC_007761	ATC	2	6	630966	630971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356264
15021	NC_007761	CGC	2	6	630978	630983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356264
15022	NC_007761	CCA	2	6	631015	631020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356264
15023	NC_007761	TGG	2	6	631095	631100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356264
15024	NC_007761	CG	3	6	631121	631126	0 %	0 %	50 %	50 %	86356264
15025	NC_007761	CTG	2	6	631133	631138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15026	NC_007761	CGA	2	6	631164	631169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15027	NC_007761	GCC	2	6	631179	631184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356264
15028	NC_007761	GCT	2	6	631243	631248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15029	NC_007761	CGA	2	6	631255	631260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15030	NC_007761	GAC	2	6	631336	631341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15031	NC_007761	TA	3	6	631346	631351	50 %	50 %	0 %	0 %	86356264
15032	NC_007761	GAG	2	6	631364	631369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356264
15033	NC_007761	GAC	2	6	631385	631390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15034	NC_007761	TGC	2	6	631398	631403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15035	NC_007761	TCG	2	6	631458	631463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15036	NC_007761	TCG	2	6	631605	631610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15037	NC_007761	GC	3	6	631651	631656	0 %	0 %	50 %	50 %	86356264
15038	NC_007761	CGG	2	6	631681	631686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356264
15039	NC_007761	GCC	2	6	631742	631747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356264
15040	NC_007761	GC	3	6	631806	631811	0 %	0 %	50 %	50 %	86356264
15041	NC_007761	CGG	2	6	631954	631959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356264
15042	NC_007761	CAG	2	6	631964	631969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15043	NC_007761	GGT	2	6	631972	631977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356264
15044	NC_007761	CGC	2	6	632086	632091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356264
15045	NC_007761	TCG	2	6	632109	632114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356264
15046	NC_007761	CAT	2	6	632155	632160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356264
15047	NC_007761	GAG	2	6	632210	632215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356264
15048	NC_007761	AGGC	2	8	632332	632339	25 %	0 %	50 %	25 %	86356265
15049	NC_007761	TCCTGA	2	12	632356	632367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86356265
15050	NC_007761	TTC	2	6	632370	632375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356265
15051	NC_007761	CCTCG	2	10	632450	632459	0 %	20 %	20 %	60 %	86356265
15052	NC_007761	CGG	2	6	632483	632488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356265
15053	NC_007761	TCGG	2	8	632499	632506	0 %	25 %	50 %	25 %	86356265
15054	NC_007761	GCT	2	6	632510	632515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15055	NC_007761	CGA	2	6	632539	632544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15056	NC_007761	TCGC	2	8	632592	632599	0 %	25 %	25 %	50 %	86356265
15057	NC_007761	GC	3	6	632712	632717	0 %	0 %	50 %	50 %	86356265
15058	NC_007761	CCA	2	6	632734	632739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356265
15059	NC_007761	TCG	2	6	632761	632766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15060	NC_007761	TCT	2	6	632782	632787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356265
15061	NC_007761	GTC	3	9	632823	632831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15062	NC_007761	TCG	2	6	632833	632838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15063	NC_007761	TGC	2	6	632848	632853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15064	NC_007761	CCG	2	6	632971	632976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356265
15065	NC_007761	GCC	2	6	632982	632987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356265
15066	NC_007761	CTG	2	6	632997	633002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15067	NC_007761	CGC	2	6	633056	633061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356265
15068	NC_007761	TCA	2	6	633064	633069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356265
15069	NC_007761	CGG	2	6	633071	633076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356265
15070	NC_007761	GGC	2	6	633090	633095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356265
15071	NC_007761	TCG	2	6	633106	633111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15072	NC_007761	GCT	2	6	633161	633166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15073	NC_007761	CGA	2	6	633173	633178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356265
15074	NC_007761	TCT	2	6	633304	633309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_007761	AGGC	2	8	633330	633337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15076	NC_007761	GCG	2	6	633469	633474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_007761	GAAA	2	8	633519	633526	75 %	0 %	25 %	0 %	86356266
15078	NC_007761	GGT	2	6	633607	633612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356266
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15080	NC_007761	GTC	2	6	633674	633679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15081	NC_007761	ATCT	2	8	633716	633723	25 %	50 %	0 %	25 %	86356266
15082	NC_007761	AAC	2	6	633752	633757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356266
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15084	NC_007761	CGT	2	6	633838	633843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15085	NC_007761	CGA	2	6	633873	633878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15086	NC_007761	GC	3	6	633894	633899	0 %	0 %	50 %	50 %	86356266
15087	NC_007761	TCG	2	6	633927	633932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15088	NC_007761	CGG	2	6	633946	633951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356266
15089	NC_007761	ATCG	2	8	633970	633977	25 %	25 %	25 %	25 %	86356266
15090	NC_007761	CGA	2	6	633979	633984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15091	NC_007761	GTG	2	6	633989	633994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356266
15092	NC_007761	GCA	2	6	633996	634001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356266
15093	NC_007761	CAT	2	6	634003	634008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356266
15094	NC_007761	AAC	2	6	634103	634108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356266
15095	NC_007761	GACATC	2	12	634163	634174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86356266
15096	NC_007761	TCA	2	6	634185	634190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356266
15097	NC_007761	CTT	2	6	634207	634212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356266
15098	NC_007761	ATGCG	2	10	634256	634265	20 %	20 %	40 %	20 %	86356266
15099	NC_007761	CCG	2	6	634302	634307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356266
15100	NC_007761	CTT	2	6	634342	634347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356266
15101	NC_007761	GCC	2	6	634360	634365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356266
15102	NC_007761	CCAT	2	8	634484	634491	25 %	25 %	0 %	50 %	86356266
15103	NC_007761	ATG	2	6	634578	634583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356266
15104	NC_007761	CGC	2	6	634590	634595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356266
15105	NC_007761	GC	3	6	634594	634599	0 %	0 %	50 %	50 %	86356266
15106	NC_007761	A	7	7	634608	634614	100 %	0 %	0 %	0 %	86356266
15107	NC_007761	TC	3	6	634636	634641	0 %	50 %	0 %	50 %	86356266
15108	NC_007761	CTCG	2	8	634775	634782	0 %	25 %	25 %	50 %	86356267
15109	NC_007761	CGA	2	6	634810	634815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356267
15110	NC_007761	CAA	2	6	634823	634828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356267
15111	NC_007761	CG	3	6	634939	634944	0 %	0 %	50 %	50 %	86356267
15112	NC_007761	TTC	2	6	634960	634965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356267
15113	NC_007761	CGAGGA	2	12	634967	634978	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86356267
15114	NC_007761	CG	3	6	635035	635040	0 %	0 %	50 %	50 %	86356267
15115	NC_007761	TCGA	2	8	635043	635050	25 %	25 %	25 %	25 %	86356267
15116	NC_007761	CGC	2	6	635178	635183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356267
15117	NC_007761	GC	3	6	635186	635191	0 %	0 %	50 %	50 %	86356267
15118	NC_007761	AAGGCA	2	12	635209	635220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86356267
15119	NC_007761	CGA	2	6	635246	635251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356267
15120	NC_007761	CGA	2	6	635276	635281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356267
15121	NC_007761	CAAGG	2	10	635282	635291	40 %	0 %	40 %	20 %	86356267
15122	NC_007761	TGA	2	6	635314	635319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356267
15123	NC_007761	GAAG	2	8	635330	635337	50 %	0 %	50 %	0 %	86356267
15124	NC_007761	AGC	2	6	635383	635388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356267
15125	NC_007761	GAT	2	6	635396	635401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356267
15126	NC_007761	AGA	2	6	635413	635418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356267
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15128	NC_007761	GGC	2	6	635429	635434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356267
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15233	NC_007761	CGA	2	6	640081	640086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356272
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15239	NC_007761	GCC	2	6	640175	640180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356272
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15241	NC_007761	GCC	2	6	640274	640279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356272
15242	NC_007761	CTCG	2	8	640291	640298	0 %	25 %	25 %	50 %	86356272
15243	NC_007761	CGC	2	6	640337	640342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356272
15244	NC_007761	CG	3	6	640353	640358	0 %	0 %	50 %	50 %	86356272
15245	NC_007761	GCT	2	6	640426	640431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356272
15246	NC_007761	CGC	2	6	640444	640449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356272
15247	NC_007761	GATC	2	8	640492	640499	25 %	25 %	25 %	25 %	86356272
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15250	NC_007761	GCCG	2	8	640646	640653	0 %	0 %	50 %	50 %	86356272
15251	NC_007761	GC	3	6	640685	640690	0 %	0 %	50 %	50 %	86356272
15252	NC_007761	ACG	2	6	640758	640763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356272
15253	NC_007761	CGT	3	9	640765	640773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356272
15254	NC_007761	CAC	2	6	640774	640779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356272
15255	NC_007761	GGC	2	6	640793	640798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356272
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15257	NC_007761	CTT	2	6	641005	641010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356272
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15260	NC_007761	CCG	2	6	641143	641148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15261	NC_007761	GGC	2	6	641235	641240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356273
15262	NC_007761	CGG	2	6	641250	641255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356273
15263	NC_007761	GGC	2	6	641256	641261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356273
15264	NC_007761	CGG	2	6	641265	641270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356273
15265	NC_007761	TTCG	2	8	641281	641288	0 %	50 %	25 %	25 %	86356273
15266	NC_007761	TGGCGC	2	12	641330	641341	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86356273
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15268	NC_007761	CTG	2	6	641416	641421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356273
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15271	NC_007761	GCT	2	6	641502	641507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356273
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15292	NC_007761	GCG	2	6	642100	642105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356274
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15325	NC_007761	GC	3	6	643468	643473	0 %	0 %	50 %	50 %	86356274
15326	NC_007761	TGCC	2	8	643513	643520	0 %	25 %	25 %	50 %	86356274
15327	NC_007761	AGA	2	6	643531	643536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356274
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15329	NC_007761	CGT	2	6	643691	643696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15330	NC_007761	ACC	2	6	643743	643748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15331	NC_007761	CGC	2	6	643783	643788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356275
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15355	NC_007761	CG	3	6	644909	644914	0 %	0 %	50 %	50 %	86356275
15356	NC_007761	CATGC	2	10	644963	644972	20 %	20 %	20 %	40 %	86356275
15357	NC_007761	ATG	2	6	644973	644978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356275
15358	NC_007761	CG	4	8	645037	645044	0 %	0 %	50 %	50 %	86356275
15359	NC_007761	TCA	2	6	645052	645057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356275
15360	NC_007761	CGACGG	2	12	645061	645072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356275
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15362	NC_007761	GCG	2	6	645108	645113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356275
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