MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_007761	GCC	2	6	610196	610201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356240
14502	NC_007761	GA	3	6	610281	610286	50 %	0 %	50 %	0 %	86356240
14503	NC_007761	GCA	2	6	610372	610377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_007761	CGCT	2	8	610459	610466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_007761	CGG	2	6	610491	610496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356241
14506	NC_007761	TGC	2	6	610581	610586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356241
14507	NC_007761	CAT	2	6	610618	610623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356241
14508	NC_007761	CGC	2	6	610680	610685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356241
14509	NC_007761	GGC	2	6	610765	610770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356241
14510	NC_007761	CGC	2	6	610785	610790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356241
14511	NC_007761	GATC	2	8	610851	610858	25 %	25 %	25 %	25 %	86356241
14512	NC_007761	CG	3	6	610907	610912	0 %	0 %	50 %	50 %	86356241
14513	NC_007761	GC	3	6	610927	610932	0 %	0 %	50 %	50 %	86356241
14514	NC_007761	CCG	2	6	611006	611011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356241
14515	NC_007761	GTC	2	6	611020	611025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356241
14516	NC_007761	GGC	3	9	611026	611034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356241
14517	NC_007761	GCA	2	6	611085	611090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356241
14518	NC_007761	ATG	2	6	611113	611118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_007761	GGCT	2	8	611120	611127	0 %	25 %	50 %	25 %	86356242
14520	NC_007761	GCC	2	6	611131	611136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356242
14521	NC_007761	GCC	2	6	611176	611181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356242
14522	NC_007761	GAT	2	6	611225	611230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356242
14523	NC_007761	GCT	2	6	611246	611251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356242
14524	NC_007761	GCAG	2	8	611279	611286	25 %	0 %	50 %	25 %	86356242
14525	NC_007761	GT	3	6	611317	611322	0 %	50 %	50 %	0 %	86356242
14526	NC_007761	CAGC	2	8	611370	611377	25 %	0 %	25 %	50 %	86356242
14527	NC_007761	GGC	2	6	611394	611399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356242
14528	NC_007761	TCG	2	6	611401	611406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356242
14529	NC_007761	CATG	2	8	611444	611451	25 %	25 %	25 %	25 %	86356242
14530	NC_007761	TTG	2	6	611455	611460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356242
14531	NC_007761	CAGC	2	8	611466	611473	25 %	0 %	25 %	50 %	86356242
14532	NC_007761	CCG	2	6	611480	611485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356242
14533	NC_007761	GCTG	2	8	611510	611517	0 %	25 %	50 %	25 %	86356242
14534	NC_007761	GAT	2	6	611547	611552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356242
14535	NC_007761	GGTGA	2	10	611607	611616	20 %	20 %	60 %	0 %	86356242
14536	NC_007761	CGC	3	9	611654	611662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356242
14537	NC_007761	GCG	2	6	611698	611703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356242
14538	NC_007761	CGGC	2	8	611771	611778	0 %	0 %	50 %	50 %	86356242
14539	NC_007761	GCT	2	6	611885	611890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356242
14540	NC_007761	GTT	2	6	611927	611932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_007761	TTCG	2	8	611950	611957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_007761	GT	3	6	611965	611970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_007761	GGT	2	6	612025	612030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_007761	CGA	2	6	612126	612131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356243
14545	NC_007761	GAAA	2	8	612135	612142	75 %	0 %	25 %	0 %	86356243
14546	NC_007761	CCCG	2	8	612151	612158	0 %	0 %	25 %	75 %	86356243
14547	NC_007761	GAC	3	9	612163	612171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356243
14548	NC_007761	GGC	2	6	612177	612182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356243
14549	NC_007761	CG	3	6	612222	612227	0 %	0 %	50 %	50 %	86356243
14550	NC_007761	GCC	2	6	612241	612246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356243
14551	NC_007761	CGGC	2	8	612290	612297	0 %	0 %	50 %	50 %	86356243
14552	NC_007761	GAA	2	6	612307	612312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356243
14553	NC_007761	GCCG	2	8	612352	612359	0 %	0 %	50 %	50 %	86356243
14554	NC_007761	GA	3	6	612382	612387	50 %	0 %	50 %	0 %	86356243
14555	NC_007761	CCG	2	6	612389	612394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356243
14556	NC_007761	GGC	2	6	612400	612405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356243
14557	NC_007761	CAT	2	6	612406	612411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356243
14558	NC_007761	TGCC	2	8	612422	612429	0 %	25 %	25 %	50 %	86356243
14559	NC_007761	TCA	2	6	612486	612491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356243
14560	NC_007761	CAT	2	6	612567	612572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_007761	GGC	2	6	612663	612668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356244
14562	NC_007761	CAGG	2	8	612795	612802	25 %	0 %	50 %	25 %	86356244
14563	NC_007761	AG	3	6	612829	612834	50 %	0 %	50 %	0 %	86356244
14564	NC_007761	GAAG	2	8	612861	612868	50 %	0 %	50 %	0 %	86356244
14565	NC_007761	C	6	6	612895	612900	0 %	0 %	0 %	100 %	86356244
14566	NC_007761	GCC	2	6	613034	613039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356244
14567	NC_007761	TCA	2	6	613058	613063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356244
14568	NC_007761	CGC	2	6	613139	613144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356244
14569	NC_007761	CAC	2	6	613156	613161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356244
14570	NC_007761	GCCT	2	8	613162	613169	0 %	25 %	25 %	50 %	86356244
14571	NC_007761	CAG	2	6	613209	613214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356244
14572	NC_007761	GAG	2	6	613222	613227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356244
14573	NC_007761	CGC	2	6	613284	613289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356244
14574	NC_007761	GTC	2	6	613327	613332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356244
14575	NC_007761	CAGG	2	8	613344	613351	25 %	0 %	50 %	25 %	86356244
14576	NC_007761	TCT	2	6	613365	613370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356244
14577	NC_007761	GGCA	2	8	613464	613471	25 %	0 %	50 %	25 %	86356244
14578	NC_007761	TCGGA	2	10	613499	613508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14579	NC_007761	GCG	2	6	613517	613522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_007761	GCA	2	6	613543	613548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_007761	GTCA	2	8	613567	613574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14582	NC_007761	GCG	2	6	613660	613665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_007761	TCC	2	6	613669	613674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_007761	TCG	2	6	613726	613731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_007761	TCG	2	6	613782	613787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_007761	CCAT	2	8	613845	613852	25 %	25 %	0 %	50 %	86356245
14587	NC_007761	CCCTCG	2	12	613870	613881	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	86356245
14588	NC_007761	GCTC	2	8	613885	613892	0 %	25 %	25 %	50 %	86356245
14589	NC_007761	CGC	2	6	613919	613924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356245
14590	NC_007761	CGG	2	6	613933	613938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356245
14591	NC_007761	TGG	2	6	613945	613950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356245
14592	NC_007761	GCC	2	6	613998	614003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356245
14593	NC_007761	CGA	2	6	614032	614037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356245
14594	NC_007761	ACCCG	2	10	614217	614226	20 %	0 %	20 %	60 %	86356246
14595	NC_007761	CTGC	2	8	614232	614239	0 %	25 %	25 %	50 %	86356246
14596	NC_007761	CGGCCT	2	12	614246	614257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356246
14597	NC_007761	CTT	2	6	614306	614311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356246
14598	NC_007761	GCC	2	6	614348	614353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
14599	NC_007761	ATCG	2	8	614414	614421	25 %	25 %	25 %	25 %	86356246
14600	NC_007761	GCGCG	2	10	614422	614431	0 %	0 %	60 %	40 %	86356246
14601	NC_007761	TTG	2	6	614547	614552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356246
14602	NC_007761	GAA	2	6	614568	614573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356246
14603	NC_007761	GC	3	6	614580	614585	0 %	0 %	50 %	50 %	86356246
14604	NC_007761	GTC	2	6	614586	614591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14605	NC_007761	CTG	3	9	614631	614639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14606	NC_007761	CGAT	2	8	614677	614684	25 %	25 %	25 %	25 %	86356246
14607	NC_007761	CGA	2	6	614701	614706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14608	NC_007761	CAA	2	6	614744	614749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356246
14609	NC_007761	CGG	2	6	614761	614766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356246
14610	NC_007761	ACC	2	6	614770	614775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356246
14611	NC_007761	GCC	2	6	614784	614789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
14612	NC_007761	TA	3	6	614793	614798	50 %	50 %	0 %	0 %	86356246
14613	NC_007761	TCG	2	6	614818	614823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14614	NC_007761	ACG	2	6	614845	614850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14615	NC_007761	CCG	2	6	614863	614868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
14616	NC_007761	GCT	2	6	614876	614881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356246
14617	NC_007761	CGG	2	6	614899	614904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356246
14618	NC_007761	GC	3	6	614943	614948	0 %	0 %	50 %	50 %	86356246
14619	NC_007761	AAT	2	6	614982	614987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86356246
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14621	NC_007761	CGC	2	6	615057	615062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
14622	NC_007761	GGCG	2	8	615063	615070	0 %	0 %	75 %	25 %	86356246
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14624	NC_007761	GCC	2	6	615113	615118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
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14745	NC_007761	CG	5	10	620024	620033	0 %	0 %	50 %	50 %	86356254
14746	NC_007761	CTT	2	6	620051	620056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356254
14747	NC_007761	TCG	2	6	620059	620064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356254
14748	NC_007761	GCA	2	6	620308	620313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356254
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14750	NC_007761	CGT	2	6	620402	620407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356254
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14753	NC_007761	GCC	2	6	620530	620535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356254
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14767	NC_007761	GCG	2	6	621114	621119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356255
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14773	NC_007761	CTG	2	6	621307	621312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356255
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14775	NC_007761	TCG	2	6	621374	621379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356255
14776	NC_007761	CGA	2	6	621381	621386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356255
14777	NC_007761	CCGCTG	2	12	621427	621438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356255
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14780	NC_007761	CT	3	6	621526	621531	0 %	50 %	0 %	50 %	86356255
14781	NC_007761	TGCCG	2	10	621532	621541	0 %	20 %	40 %	40 %	86356255
14782	NC_007761	AT	3	6	621623	621628	50 %	50 %	0 %	0 %	86356255
14783	NC_007761	CGG	2	6	621705	621710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356255
14784	NC_007761	GCA	2	6	621726	621731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356255
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14787	NC_007761	GA	3	6	621875	621880	50 %	0 %	50 %	0 %	86356255
14788	NC_007761	GCTC	2	8	621885	621892	0 %	25 %	25 %	50 %	86356255
14789	NC_007761	TGG	2	6	621925	621930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356256
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14798	NC_007761	CGCGCT	2	12	622268	622279	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356256
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14800	NC_007761	CGT	2	6	622332	622337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356256
14801	NC_007761	TCG	2	6	622342	622347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356256
14802	NC_007761	CAG	2	6	622353	622358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356256
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14830	NC_007761	GAT	2	6	623357	623362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356257
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14833	NC_007761	GCCG	2	8	623543	623550	0 %	0 %	50 %	50 %	86356257
14834	NC_007761	TGA	2	6	623572	623577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356257
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14836	NC_007761	CGA	2	6	623605	623610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356257
14837	NC_007761	TGA	2	6	623629	623634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356257
14838	NC_007761	GAT	2	6	623651	623656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356257
14839	NC_007761	TCG	2	6	623673	623678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356257
14840	NC_007761	CGAGC	2	10	623699	623708	20 %	0 %	40 %	40 %	86356257
14841	NC_007761	ACG	2	6	623802	623807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356257
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14843	NC_007761	CTTT	2	8	623842	623849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14844	NC_007761	GCC	2	6	623940	623945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356258
14845	NC_007761	GCGG	2	8	623991	623998	0 %	0 %	75 %	25 %	86356258
14846	NC_007761	GCC	2	6	624022	624027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356258
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14848	NC_007761	AGGA	2	8	624049	624056	50 %	0 %	50 %	0 %	86356258
14849	NC_007761	TCGA	2	8	624118	624125	25 %	25 %	25 %	25 %	86356258
14850	NC_007761	GGA	3	9	624143	624151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356258
14851	NC_007761	GCCC	2	8	624162	624169	0 %	0 %	25 %	75 %	86356258
14852	NC_007761	GCC	2	6	624181	624186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356258
14853	NC_007761	CAG	2	6	624213	624218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356258
14854	NC_007761	CG	4	8	624220	624227	0 %	0 %	50 %	50 %	86356258
14855	NC_007761	GC	3	6	624234	624239	0 %	0 %	50 %	50 %	86356258
14856	NC_007761	CAG	2	6	624240	624245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356258
14857	NC_007761	AGC	2	6	624256	624261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356258
14858	NC_007761	TGCCGG	2	12	624287	624298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86356258
14859	NC_007761	CAG	2	6	624315	624320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356258
14860	NC_007761	CGG	2	6	624330	624335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356258
14861	NC_007761	CGA	2	6	624353	624358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356258
14862	NC_007761	CGGC	2	8	624385	624392	0 %	0 %	50 %	50 %	86356258
14863	NC_007761	CCA	2	6	624455	624460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356258
14864	NC_007761	GT	3	6	624531	624536	0 %	50 %	50 %	0 %	86356258
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14987	NC_007761	GGA	2	6	629624	629629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14988	NC_007761	GA	3	6	629628	629633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14989	NC_007761	TGA	2	6	629666	629671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356263
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14991	NC_007761	GCG	2	6	629735	629740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356263
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