MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007761	GCT	2	6	588890	588895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14002	NC_007761	ACC	2	6	588913	588918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356219
14003	NC_007761	GCA	2	6	588938	588943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14004	NC_007761	TGA	2	6	588944	588949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356219
14005	NC_007761	TCT	2	6	589040	589045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356219
14006	NC_007761	GCCG	2	8	589092	589099	0 %	0 %	50 %	50 %	86356219
14007	NC_007761	CGA	2	6	589109	589114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14008	NC_007761	ACC	2	6	589120	589125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356219
14009	NC_007761	ATG	2	6	589195	589200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356219
14010	NC_007761	CGA	2	6	589226	589231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14011	NC_007761	GC	3	6	589401	589406	0 %	0 %	50 %	50 %	86356219
14012	NC_007761	CGA	2	6	589409	589414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14013	NC_007761	GAT	2	6	589455	589460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356219
14014	NC_007761	GCG	2	6	589461	589466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356219
14015	NC_007761	AGC	2	6	589468	589473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14016	NC_007761	GGC	2	6	589539	589544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356219
14017	NC_007761	GAC	2	6	589605	589610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14018	NC_007761	AGC	3	9	589678	589686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356219
14019	NC_007761	CCG	2	6	589738	589743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_007761	GCC	2	6	589751	589756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_007761	GATT	2	8	589871	589878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_007761	AAC	2	6	589906	589911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_007761	TCA	2	6	590012	590017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356220
14024	NC_007761	CGG	2	6	590019	590024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356220
14025	NC_007761	CGA	2	6	590055	590060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14026	NC_007761	TCG	2	6	590075	590080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14027	NC_007761	CGG	2	6	590091	590096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356220
14028	NC_007761	ATT	2	6	590111	590116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86356220
14029	NC_007761	TCG	2	6	590128	590133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14030	NC_007761	GCC	3	9	590155	590163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356220
14031	NC_007761	TCA	2	6	590210	590215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356220
14032	NC_007761	CAG	2	6	590275	590280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14033	NC_007761	GCC	4	12	590316	590327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356220
14034	NC_007761	GCT	2	6	590340	590345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14035	NC_007761	CTG	2	6	590362	590367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356220
14036	NC_007761	CCG	2	6	590378	590383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356220
14037	NC_007761	GTC	2	6	590392	590397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_007761	GCC	2	6	590415	590420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_007761	TCA	2	6	590423	590428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_007761	CG	3	6	590534	590539	0 %	0 %	50 %	50 %	86356221
14041	NC_007761	GCG	2	6	590545	590550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356221
14042	NC_007761	TCG	2	6	590564	590569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356221
14043	NC_007761	GTC	2	6	590572	590577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356221
14044	NC_007761	TCA	2	6	590648	590653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356221
14045	NC_007761	GCG	2	6	590659	590664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356221
14046	NC_007761	TAT	2	6	590743	590748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86356221
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14049	NC_007761	GGC	2	6	590947	590952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356221
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14051	NC_007761	GCC	2	6	590983	590988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356221
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14053	NC_007761	CGA	2	6	591050	591055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356221
14054	NC_007761	CGA	2	6	591066	591071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356221
14055	NC_007761	CG	3	6	591126	591131	0 %	0 %	50 %	50 %	86356221
14056	NC_007761	CGG	2	6	591144	591149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356221
14057	NC_007761	CG	3	6	591151	591156	0 %	0 %	50 %	50 %	86356221
14058	NC_007761	GAC	2	6	591184	591189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356221
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14061	NC_007761	GCG	2	6	591394	591399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356221
14062	NC_007761	CG	3	6	591404	591409	0 %	0 %	50 %	50 %	86356221
14063	NC_007761	ATGCG	2	10	591417	591426	20 %	20 %	40 %	20 %	86356221
14064	NC_007761	GCC	2	6	591517	591522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356221
14065	NC_007761	TCG	2	6	591530	591535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356221
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14067	NC_007761	GC	3	6	591597	591602	0 %	0 %	50 %	50 %	86356221
14068	NC_007761	CGAT	2	8	591723	591730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14069	NC_007761	GAAA	2	8	591823	591830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14071	NC_007761	CGG	2	6	592006	592011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356222
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14080	NC_007761	CAG	3	9	592245	592253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356222
14081	NC_007761	TGA	2	6	592318	592323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356222
14082	NC_007761	TGC	2	6	592333	592338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356222
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14088	NC_007761	GC	3	6	592724	592729	0 %	0 %	50 %	50 %	86356222
14089	NC_007761	CGT	2	6	592745	592750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356222
14090	NC_007761	TCGC	2	8	592761	592768	0 %	25 %	25 %	50 %	86356222
14091	NC_007761	CGA	2	6	592865	592870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356222
14092	NC_007761	GCC	2	6	592896	592901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356222
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14094	NC_007761	CCG	2	6	592931	592936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14095	NC_007761	ATGAC	2	10	592962	592971	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14096	NC_007761	GCTG	2	8	592997	593004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14097	NC_007761	AGA	2	6	593024	593029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_007761	GAA	2	6	593031	593036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_007761	GTC	2	6	593103	593108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_007761	CTG	2	6	593131	593136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_007761	TCA	2	6	593138	593143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_007761	CGT	2	6	593220	593225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_007761	CTG	2	6	593241	593246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_007761	CCG	2	6	593276	593281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14105	NC_007761	TGA	2	6	593297	593302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356223
14106	NC_007761	CGG	2	6	593343	593348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356223
14107	NC_007761	GCA	2	6	593385	593390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356223
14108	NC_007761	TCT	2	6	593435	593440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356223
14109	NC_007761	GGC	3	9	593460	593468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356223
14110	NC_007761	TCA	2	6	593480	593485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356223
14111	NC_007761	TCG	2	6	593534	593539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356223
14112	NC_007761	CCG	2	6	593543	593548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356223
14113	NC_007761	TCG	2	6	593609	593614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356223
14114	NC_007761	GAAGCA	2	12	593640	593651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86356223
14115	NC_007761	GGA	2	6	593652	593657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356223
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14117	NC_007761	CTT	2	6	593733	593738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356223
14118	NC_007761	GAA	2	6	593749	593754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356223
14119	NC_007761	CGC	2	6	593777	593782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356223
14120	NC_007761	CAT	2	6	593793	593798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356223
14121	NC_007761	ACG	2	6	593825	593830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356223
14122	NC_007761	GCC	2	6	593842	593847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356223
14123	NC_007761	CGG	2	6	593922	593927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356223
14124	NC_007761	CAT	2	6	593940	593945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356223
14125	NC_007761	CCG	2	6	594092	594097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356223
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14145	NC_007761	CGCT	2	8	594942	594949	0 %	25 %	25 %	50 %	86356223
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14147	NC_007761	TCG	2	6	595036	595041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14175	NC_007761	TC	3	6	596337	596342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14231	NC_007761	GCGAA	2	10	598244	598253	40 %	0 %	40 %	20 %	86356226
14232	NC_007761	GGC	2	6	598255	598260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356226
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14236	NC_007761	TCG	2	6	598460	598465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356226
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14240	NC_007761	GGAA	2	8	598671	598678	50 %	0 %	50 %	0 %	86356226
14241	NC_007761	TCG	2	6	598694	598699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14242	NC_007761	CGA	2	6	598701	598706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14243	NC_007761	TCG	2	6	598778	598783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14244	NC_007761	GTC	2	6	598864	598869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14245	NC_007761	CGC	2	6	598942	598947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356226
14246	NC_007761	GCA	2	6	598968	598973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14247	NC_007761	ATGG	2	8	599116	599123	25 %	25 %	50 %	0 %	86356226
14248	NC_007761	CTG	2	6	599146	599151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356226
14249	NC_007761	CG	3	6	599171	599176	0 %	0 %	50 %	50 %	86356226
14250	NC_007761	CGCGC	2	10	599265	599274	0 %	0 %	40 %	60 %	86356226
14251	NC_007761	CGG	2	6	599283	599288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356226
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14265	NC_007761	GTC	2	6	599864	599869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14266	NC_007761	CGG	2	6	599900	599905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14267	NC_007761	GCA	2	6	599922	599927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14269	NC_007761	CTT	2	6	600035	600040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14270	NC_007761	ATC	2	6	600062	600067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14271	NC_007761	ATT	2	6	600114	600119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14272	NC_007761	CG	3	6	600212	600217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14273	NC_007761	ATC	2	6	600230	600235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14274	NC_007761	GCT	2	6	600276	600281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14275	NC_007761	CAT	3	9	600339	600347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14276	NC_007761	GCA	2	6	600515	600520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356228
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14282	NC_007761	CTC	2	6	600761	600766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14284	NC_007761	CAA	2	6	600855	600860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14285	NC_007761	TTG	2	6	600872	600877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14286	NC_007761	TA	3	6	600959	600964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14287	NC_007761	GC	3	6	601064	601069	0 %	0 %	50 %	50 %	86356229
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14304	NC_007761	GGC	2	6	601762	601767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14305	NC_007761	GAC	2	6	601782	601787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14348	NC_007761	GCA	2	6	603483	603488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14349	NC_007761	ATG	2	6	603548	603553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14350	NC_007761	GACC	2	8	603610	603617	25 %	0 %	25 %	50 %	86356232
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14353	NC_007761	GCG	2	6	603714	603719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356232
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14355	NC_007761	CG	3	6	603763	603768	0 %	0 %	50 %	50 %	86356232
14356	NC_007761	GCC	2	6	603789	603794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356232
14357	NC_007761	CCGT	2	8	603825	603832	0 %	25 %	25 %	50 %	86356232
14358	NC_007761	ATCG	2	8	603842	603849	25 %	25 %	25 %	25 %	86356232
14359	NC_007761	GCT	2	6	603874	603879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356232
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14361	NC_007761	CTGG	2	8	604089	604096	0 %	25 %	50 %	25 %	86356233
14362	NC_007761	AGC	2	6	604118	604123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356233
14363	NC_007761	GAC	2	6	604140	604145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356233
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14365	NC_007761	GAT	2	6	604195	604200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356233
14366	NC_007761	CG	3	6	604208	604213	0 %	0 %	50 %	50 %	86356233
14367	NC_007761	CGC	2	6	604263	604268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356233
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14371	NC_007761	CAT	2	6	604372	604377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356233
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