MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007761	GCG	2	6	549467	549472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_007761	AGC	2	6	549538	549543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_007761	CGT	2	6	549590	549595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_007761	TCG	2	6	549610	549615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_007761	TCCG	2	8	549652	549659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_007761	CGG	2	6	549745	549750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_007761	AGTC	2	8	549768	549775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_007761	CGG	2	6	549850	549855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356184
13009	NC_007761	TTC	2	6	549858	549863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356184
13010	NC_007761	CTGAAG	2	12	549879	549890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86356184
13011	NC_007761	GCA	2	6	549898	549903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356184
13012	NC_007761	GAT	2	6	549927	549932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356184
13013	NC_007761	CCG	2	6	549979	549984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356184
13014	NC_007761	GCC	2	6	550000	550005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356184
13015	NC_007761	TTG	2	6	550069	550074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356184
13016	NC_007761	CTG	2	6	550075	550080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356184
13017	NC_007761	CCG	2	6	550098	550103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356184
13018	NC_007761	GCC	2	6	550104	550109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356184
13019	NC_007761	GCG	2	6	550114	550119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356184
13020	NC_007761	GCTG	2	8	550120	550127	0 %	25 %	50 %	25 %	86356184
13021	NC_007761	TCG	2	6	550156	550161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356184
13022	NC_007761	AGGT	2	8	550162	550169	25 %	25 %	50 %	0 %	86356184
13023	NC_007761	GGC	2	6	550171	550176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356184
13024	NC_007761	TGC	2	6	550204	550209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_007761	TGC	2	6	550367	550372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13026	NC_007761	CGC	2	6	550373	550378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13027	NC_007761	GC	4	8	550408	550415	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13028	NC_007761	CGGG	2	8	550428	550435	0 %	0 %	75 %	25 %	86356185
13029	NC_007761	GC	3	6	550482	550487	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13030	NC_007761	GCG	4	12	550531	550542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356185
13031	NC_007761	TTG	2	6	550582	550587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356185
13032	NC_007761	TGGC	2	8	550615	550622	0 %	25 %	50 %	25 %	86356185
13033	NC_007761	CGC	2	6	550644	550649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13034	NC_007761	CTG	2	6	550653	550658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13035	NC_007761	CG	3	6	550718	550723	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13036	NC_007761	AC	3	6	550814	550819	50 %	0 %	0 %	50 %	86356185
13037	NC_007761	GCC	2	6	550870	550875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13038	NC_007761	CCA	2	6	550913	550918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356185
13039	NC_007761	CGC	2	6	550950	550955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13040	NC_007761	CAG	2	6	550977	550982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13041	NC_007761	GTC	2	6	551001	551006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13042	NC_007761	GAT	2	6	551016	551021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356185
13043	NC_007761	CTG	2	6	551052	551057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13044	NC_007761	CCT	2	6	551135	551140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356185
13045	NC_007761	GGC	2	6	551151	551156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356185
13046	NC_007761	TTC	2	6	551178	551183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356185
13047	NC_007761	TTC	2	6	551199	551204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356185
13048	NC_007761	CTG	2	6	551217	551222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13049	NC_007761	TCCG	2	8	551224	551231	0 %	25 %	25 %	50 %	86356185
13050	NC_007761	GGCGCC	2	12	551268	551279	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13051	NC_007761	CGA	2	6	551372	551377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13052	NC_007761	GCGAG	2	10	551393	551402	20 %	0 %	60 %	20 %	86356185
13053	NC_007761	CGG	2	6	551408	551413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356185
13054	NC_007761	GGC	2	6	551417	551422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356185
13055	NC_007761	CG	3	6	551448	551453	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13056	NC_007761	CG	3	6	551471	551476	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13057	NC_007761	GC	4	8	551533	551540	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13058	NC_007761	CGC	2	6	551612	551617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13059	NC_007761	CGA	2	6	551627	551632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13060	NC_007761	GC	3	6	551661	551666	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13061	NC_007761	CCG	2	6	551812	551817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13062	NC_007761	AGC	2	6	551824	551829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13063	NC_007761	CAT	2	6	551832	551837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356185
13064	NC_007761	GTT	2	6	551844	551849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356185
13065	NC_007761	ATC	2	6	551854	551859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356185
13066	NC_007761	GC	3	6	551909	551914	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13067	NC_007761	TGCTC	2	10	551933	551942	0 %	40 %	20 %	40 %	86356185
13068	NC_007761	GAT	2	6	551943	551948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356185
13069	NC_007761	TTG	2	6	551950	551955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356185
13070	NC_007761	ATC	2	6	551970	551975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356185
13071	NC_007761	TCG	2	6	551992	551997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13072	NC_007761	GCC	2	6	552001	552006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
13073	NC_007761	CAG	2	6	552120	552125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13074	NC_007761	GCA	2	6	552134	552139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13075	NC_007761	CCA	2	6	552146	552151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356185
13076	NC_007761	GC	5	10	552163	552172	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
13077	NC_007761	CGG	2	6	552229	552234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356185
13078	NC_007761	AGC	2	6	552280	552285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356185
13079	NC_007761	GC	3	6	552358	552363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_007761	CG	3	6	552364	552369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_007761	GCT	2	6	552402	552407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_007761	GCAT	2	8	552438	552445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_007761	TGG	2	6	552458	552463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_007761	TCG	2	6	552472	552477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_007761	AGG	2	6	552553	552558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_007761	GGA	2	6	552628	552633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_007761	CCG	2	6	552701	552706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13088	NC_007761	TCG	2	6	552726	552731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_007761	CAG	2	6	552768	552773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_007761	TC	3	6	552914	552919	0 %	50 %	0 %	50 %	86356186
13091	NC_007761	GTCG	2	8	552947	552954	0 %	25 %	50 %	25 %	86356186
13092	NC_007761	GCG	2	6	553030	553035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356186
13093	NC_007761	CGC	2	6	553100	553105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356186
13094	NC_007761	GCC	2	6	553156	553161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356186
13095	NC_007761	TGC	2	6	553189	553194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356186
13096	NC_007761	GC	3	6	553197	553202	0 %	0 %	50 %	50 %	86356186
13097	NC_007761	CGC	2	6	553217	553222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356186
13098	NC_007761	GCT	2	6	553242	553247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356186
13099	NC_007761	CGT	2	6	553271	553276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356186
13100	NC_007761	GCC	2	6	553305	553310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356186
13101	NC_007761	GCC	2	6	553389	553394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356186
13102	NC_007761	TCGC	2	8	553431	553438	0 %	25 %	25 %	50 %	86356186
13103	NC_007761	TGC	2	6	553449	553454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356186
13104	NC_007761	GC	3	6	553453	553458	0 %	0 %	50 %	50 %	86356186
13105	NC_007761	TGC	2	6	553513	553518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356186
13106	NC_007761	ATCT	2	8	553596	553603	25 %	50 %	0 %	25 %	86356186
13107	NC_007761	CGC	2	6	553682	553687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356187
13108	NC_007761	CGAGGC	2	12	553702	553713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356187
13109	NC_007761	GCA	2	6	553720	553725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356187
13110	NC_007761	AGC	2	6	553731	553736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356187
13111	NC_007761	TCC	2	6	553743	553748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356187
13112	NC_007761	GA	3	6	553758	553763	50 %	0 %	50 %	0 %	86356187
13113	NC_007761	CGG	2	6	553765	553770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356187
13114	NC_007761	GCAG	2	8	553815	553822	25 %	0 %	50 %	25 %	86356187
13115	NC_007761	ACG	2	6	553845	553850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356187
13116	NC_007761	CAG	2	6	553871	553876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356187
13117	NC_007761	CGC	2	6	553877	553882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356187
13118	NC_007761	CG	4	8	553888	553895	0 %	0 %	50 %	50 %	86356187
13119	NC_007761	TCA	2	6	553914	553919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356187
13120	NC_007761	CGG	2	6	553996	554001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356187
13121	NC_007761	CCATCA	2	12	554005	554016	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	86356187
13122	NC_007761	CAT	2	6	554029	554034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356187
13123	NC_007761	TTG	2	6	554067	554072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_007761	GGC	3	9	554093	554101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_007761	GCA	2	6	554117	554122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356188
13126	NC_007761	CGG	2	6	554131	554136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356188
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13152	NC_007761	GCCG	2	8	555176	555183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13153	NC_007761	ACCG	2	8	555191	555198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13154	NC_007761	CGCGG	2	10	555199	555208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13155	NC_007761	GTAAAG	2	12	555209	555220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13229	NC_007761	CGC	2	6	558283	558288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356194
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13231	NC_007761	GC	3	6	558348	558353	0 %	0 %	50 %	50 %	86356194
13232	NC_007761	CGGCC	2	10	558357	558366	0 %	0 %	40 %	60 %	86356194
13233	NC_007761	CGG	2	6	558378	558383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356194
13234	NC_007761	ATA	2	6	558403	558408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86356194
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13240	NC_007761	GC	3	6	558642	558647	0 %	0 %	50 %	50 %	86356194
13241	NC_007761	CAG	2	6	558724	558729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356194
13242	NC_007761	GCA	3	9	558756	558764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356194
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13244	NC_007761	CGC	2	6	558910	558915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356194
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13489	NC_007761	TCA	2	6	569171	569176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356205
13490	NC_007761	GAG	2	6	569292	569297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_007761	GCG	2	6	569386	569391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_007761	GAC	2	6	569433	569438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356206
13493	NC_007761	TGA	2	6	569519	569524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356206
13494	NC_007761	TGA	2	6	569549	569554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356206
13495	NC_007761	GC	3	6	569578	569583	0 %	0 %	50 %	50 %	86356206
13496	NC_007761	GCAGGC	2	12	569615	569626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356206
13497	NC_007761	CGC	2	6	569660	569665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356206
13498	NC_007761	GC	3	6	569684	569689	0 %	0 %	50 %	50 %	86356206
13499	NC_007761	CTG	2	6	569694	569699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356206
13500	NC_007761	TGC	2	6	569735	569740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356206

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