MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007761	CGC	2	6	527314	527319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356163
12502	NC_007761	CG	3	6	527346	527351	0 %	0 %	50 %	50 %	86356163
12503	NC_007761	GCC	2	6	527375	527380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356163
12504	NC_007761	CGCA	2	8	527515	527522	25 %	0 %	25 %	50 %	86356163
12505	NC_007761	CGC	2	6	527524	527529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356163
12506	NC_007761	CAA	2	6	527530	527535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356163
12507	NC_007761	CGGCGT	2	12	527539	527550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86356163
12508	NC_007761	AAC	2	6	527573	527578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356163
12509	NC_007761	CGTCC	2	10	527614	527623	0 %	20 %	20 %	60 %	86356163
12510	NC_007761	CCCG	2	8	527658	527665	0 %	0 %	25 %	75 %	86356163
12511	NC_007761	TTC	2	6	527669	527674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356163
12512	NC_007761	AAG	2	6	527681	527686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356163
12513	NC_007761	CTT	2	6	527728	527733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356163
12514	NC_007761	GAT	2	6	527746	527751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356163
12515	NC_007761	GCTG	2	8	527767	527774	0 %	25 %	50 %	25 %	86356163
12516	NC_007761	TGA	2	6	527968	527973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_007761	GCC	2	6	527975	527980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_007761	CG	4	8	528077	528084	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12519	NC_007761	TCC	2	6	528114	528119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356164
12520	NC_007761	CGGC	2	8	528132	528139	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12521	NC_007761	GCG	2	6	528156	528161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356164
12522	NC_007761	TTC	2	6	528172	528177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356164
12523	NC_007761	CCG	2	6	528253	528258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12524	NC_007761	AGGCCG	2	12	528265	528276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356164
12525	NC_007761	TGG	2	6	528304	528309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356164
12526	NC_007761	CG	4	8	528317	528324	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12527	NC_007761	CGA	2	6	528344	528349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12528	NC_007761	GCC	2	6	528351	528356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12529	NC_007761	GCC	2	6	528375	528380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12530	NC_007761	GCC	2	6	528447	528452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12531	NC_007761	AAG	2	6	528453	528458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356164
12532	NC_007761	GCC	2	6	528481	528486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12533	NC_007761	GTT	2	6	528501	528506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356164
12534	NC_007761	GC	3	6	528542	528547	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12535	NC_007761	GCT	3	9	528602	528610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12536	NC_007761	CCT	2	6	528613	528618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356164
12537	NC_007761	GAC	2	6	528632	528637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12538	NC_007761	CTT	2	6	528677	528682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356164
12539	NC_007761	CGT	2	6	528686	528691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12540	NC_007761	TCT	2	6	528706	528711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356164
12541	NC_007761	GCCGGC	2	12	528738	528749	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12542	NC_007761	CGC	2	6	528848	528853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12543	NC_007761	CGA	2	6	528931	528936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12544	NC_007761	CTT	2	6	528947	528952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356164
12545	NC_007761	CCG	2	6	529057	529062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12546	NC_007761	CAT	2	6	529076	529081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356164
12547	NC_007761	ATC	2	6	529116	529121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356164
12548	NC_007761	CCG	2	6	529123	529128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12549	NC_007761	AAG	2	6	529188	529193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356164
12550	NC_007761	GTG	2	6	529194	529199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356164
12551	NC_007761	GCCG	2	8	529202	529209	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12552	NC_007761	TCG	2	6	529222	529227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12553	NC_007761	GC	3	6	529228	529233	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12554	NC_007761	TGA	2	6	529237	529242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356164
12555	NC_007761	CG	3	6	529249	529254	0 %	0 %	50 %	50 %	86356164
12556	NC_007761	TCG	2	6	529273	529278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12557	NC_007761	GCC	2	6	529284	529289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12558	NC_007761	CGC	2	6	529295	529300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12559	NC_007761	GAC	2	6	529331	529336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356164
12560	NC_007761	CGC	2	6	529387	529392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356164
12561	NC_007761	CGC	2	6	529579	529584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12562	NC_007761	CGC	2	6	529612	529617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12563	NC_007761	CTG	2	6	529649	529654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12564	NC_007761	CAG	2	6	529688	529693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12565	NC_007761	AAC	2	6	529742	529747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356165
12566	NC_007761	GC	3	6	529750	529755	0 %	0 %	50 %	50 %	86356165
12567	NC_007761	CGC	2	6	529777	529782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12568	NC_007761	CTG	2	6	529796	529801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12569	NC_007761	CGCGA	2	10	529802	529811	20 %	0 %	40 %	40 %	86356165
12570	NC_007761	AGC	2	6	529818	529823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12571	NC_007761	GCGAC	2	10	529857	529866	20 %	0 %	40 %	40 %	86356165
12572	NC_007761	GTC	2	6	529910	529915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12573	NC_007761	CAA	2	6	529984	529989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356165
12574	NC_007761	GATC	2	8	529996	530003	25 %	25 %	25 %	25 %	86356165
12575	NC_007761	GAA	2	6	530017	530022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356165
12576	NC_007761	GCC	2	6	530219	530224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12577	NC_007761	ATCT	2	8	530228	530235	25 %	50 %	0 %	25 %	86356165
12578	NC_007761	GAG	2	6	530237	530242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356165
12579	NC_007761	GAA	2	6	530251	530256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356165
12580	NC_007761	TCAACA	2	12	530280	530291	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	86356165
12581	NC_007761	CGC	2	6	530296	530301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12582	NC_007761	TCA	2	6	530343	530348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356165
12583	NC_007761	CGG	2	6	530383	530388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356165
12584	NC_007761	TGA	2	6	530403	530408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356165
12585	NC_007761	CGA	2	6	530415	530420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12586	NC_007761	TCA	2	6	530421	530426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356165
12587	NC_007761	GCG	2	6	530438	530443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356165
12588	NC_007761	GC	3	6	530446	530451	0 %	0 %	50 %	50 %	86356165
12589	NC_007761	GCC	2	6	530455	530460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12590	NC_007761	CTCGGC	2	12	530480	530491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356165
12591	NC_007761	CCA	2	6	530515	530520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356165
12592	NC_007761	ATC	2	6	530561	530566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356165
12593	NC_007761	CGC	2	6	530595	530600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356165
12594	NC_007761	TCG	2	6	530625	530630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12595	NC_007761	CAT	2	6	530737	530742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356165
12596	NC_007761	CGT	2	6	530792	530797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356165
12597	NC_007761	AGA	2	6	530876	530881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356166
12598	NC_007761	TAC	2	6	530926	530931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356166
12599	NC_007761	GC	4	8	530940	530947	0 %	0 %	50 %	50 %	86356166
12600	NC_007761	CGA	2	6	531099	531104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12601	NC_007761	CGT	2	6	531126	531131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12602	NC_007761	GC	3	6	531138	531143	0 %	0 %	50 %	50 %	86356166
12603	NC_007761	TCG	2	6	531260	531265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12604	NC_007761	AGC	2	6	531268	531273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12605	NC_007761	GC	3	6	531279	531284	0 %	0 %	50 %	50 %	86356166
12606	NC_007761	CGG	2	6	531339	531344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356166
12607	NC_007761	CAG	3	9	531346	531354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12608	NC_007761	GCCGTC	2	12	531373	531384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356166
12609	NC_007761	ATCGTC	2	12	531487	531498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86356166
12610	NC_007761	GCA	2	6	531510	531515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12611	NC_007761	CG	4	8	531519	531526	0 %	0 %	50 %	50 %	86356166
12612	NC_007761	TCG	2	6	531563	531568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356166
12613	NC_007761	CAT	2	6	531627	531632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356166
12614	NC_007761	ATG	3	9	531721	531729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356167
12615	NC_007761	GGC	2	6	531765	531770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356167
12616	NC_007761	CGA	2	6	531848	531853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356167
12617	NC_007761	CGCC	2	8	531908	531915	0 %	0 %	25 %	75 %	86356167
12618	NC_007761	CGC	2	6	531965	531970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356167
12619	NC_007761	CGC	2	6	532130	532135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356167
12620	NC_007761	ATG	2	6	532218	532223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356167
12621	NC_007761	CCA	2	6	532300	532305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356167
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12964	NC_007761	CTG	2	6	547720	547725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
12965	NC_007761	CGA	2	6	547845	547850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
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12968	NC_007761	CT	3	6	548027	548032	0 %	50 %	0 %	50 %	86356181
12969	NC_007761	GAA	2	6	548061	548066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356181
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12971	NC_007761	CTG	2	6	548154	548159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12972	NC_007761	TGA	2	6	548171	548176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12973	NC_007761	GCAT	2	8	548194	548201	25 %	25 %	25 %	25 %	86356182
12974	NC_007761	GC	3	6	548260	548265	0 %	0 %	50 %	50 %	86356182
12975	NC_007761	CTT	2	6	548266	548271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356182
12976	NC_007761	GC	3	6	548316	548321	0 %	0 %	50 %	50 %	86356182
12977	NC_007761	TTG	2	6	548387	548392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356182
12978	NC_007761	T	6	6	548399	548404	0 %	100 %	0 %	0 %	86356182
12979	NC_007761	CAA	2	6	548433	548438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356182
12980	NC_007761	GCT	2	6	548539	548544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356182
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12982	NC_007761	TCA	3	9	548576	548584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356182
12983	NC_007761	AT	3	6	548629	548634	50 %	50 %	0 %	0 %	86356182
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12985	NC_007761	CGTG	2	8	548700	548707	0 %	25 %	50 %	25 %	86356182
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