MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007761	CGA	2	6	465320	465325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356107
11002	NC_007761	GAGCA	2	10	465351	465360	40 %	0 %	40 %	20 %	86356107
11003	NC_007761	GTCG	2	8	465366	465373	0 %	25 %	50 %	25 %	86356107
11004	NC_007761	GAGAT	2	10	465455	465464	40 %	20 %	40 %	0 %	86356108
11005	NC_007761	GCT	2	6	465481	465486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11006	NC_007761	CGG	2	6	465526	465531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356108
11007	NC_007761	CGC	2	6	465559	465564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356108
11008	NC_007761	CGA	2	6	465598	465603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11009	NC_007761	CCG	2	6	465607	465612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356108
11010	NC_007761	CTG	3	9	465659	465667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11011	NC_007761	CGACGC	2	12	465682	465693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86356108
11012	NC_007761	TCA	2	6	465699	465704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356108
11013	NC_007761	GAC	2	6	465757	465762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11014	NC_007761	CCG	3	9	465825	465833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356108
11015	NC_007761	GGCGAC	2	12	465844	465855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356108
11016	NC_007761	CCT	2	6	465900	465905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356108
11017	NC_007761	CGC	2	6	465936	465941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356108
11018	NC_007761	GGC	2	6	465974	465979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356108
11019	NC_007761	TCT	2	6	465981	465986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356108
11020	NC_007761	TCG	2	6	465993	465998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11021	NC_007761	GCC	2	6	466037	466042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356108
11022	NC_007761	AATC	2	8	466078	466085	50 %	25 %	0 %	25 %	86356108
11023	NC_007761	GTC	2	6	466097	466102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356108
11024	NC_007761	CAC	2	6	466183	466188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356108
11025	NC_007761	GGCCG	2	10	466194	466203	0 %	0 %	60 %	40 %	86356108
11026	NC_007761	ATC	2	6	466304	466309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356108
11027	NC_007761	GCCG	2	8	466352	466359	0 %	0 %	50 %	50 %	86356108
11028	NC_007761	CGG	2	6	466362	466367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356108
11029	NC_007761	CCA	2	6	466374	466379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356108
11030	NC_007761	CGG	2	6	466444	466449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356108
11031	NC_007761	CGG	2	6	466479	466484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356108
11032	NC_007761	CGG	3	9	466548	466556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356109
11033	NC_007761	GCA	2	6	466620	466625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356109
11034	NC_007761	TCG	2	6	466634	466639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356109
11035	NC_007761	TAG	2	6	466661	466666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356109
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11037	NC_007761	CG	3	6	466735	466740	0 %	0 %	50 %	50 %	86356109
11038	NC_007761	GCG	2	6	466745	466750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356109
11039	NC_007761	GC	3	6	466794	466799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_007761	CCG	2	6	466820	466825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_007761	CCG	2	6	466831	466836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_007761	TGC	2	6	466913	466918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356110
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11044	NC_007761	CGC	2	6	466972	466977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356110
11045	NC_007761	GGA	2	6	467055	467060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356110
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11047	NC_007761	TCG	2	6	467171	467176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356110
11048	NC_007761	TTGA	2	8	467280	467287	25 %	50 %	25 %	0 %	86356111
11049	NC_007761	CGC	3	9	467327	467335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356111
11050	NC_007761	GACG	2	8	467372	467379	25 %	0 %	50 %	25 %	86356111
11051	NC_007761	CTGTC	2	10	467381	467390	0 %	40 %	20 %	40 %	86356111
11052	NC_007761	TGC	2	6	467453	467458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356111
11053	NC_007761	CCG	2	6	467506	467511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356111
11054	NC_007761	GCA	2	6	467567	467572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356111
11055	NC_007761	CGG	2	6	467613	467618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356111
11056	NC_007761	GCC	2	6	467633	467638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356111
11057	NC_007761	CGC	2	6	467670	467675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356111
11058	NC_007761	GTT	2	6	467865	467870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_007761	TCG	2	6	467909	467914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_007761	CCG	2	6	468038	468043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_007761	GCC	2	6	468108	468113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356112
11062	NC_007761	CT	3	6	468128	468133	0 %	50 %	0 %	50 %	86356112
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11064	NC_007761	GCT	2	6	468170	468175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356112
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11066	NC_007761	GCA	2	6	468227	468232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356112
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11069	NC_007761	CAG	2	6	468338	468343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356112
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11072	NC_007761	TCGA	2	8	468486	468493	25 %	25 %	25 %	25 %	86356112
11073	NC_007761	TCGGC	2	10	468519	468528	0 %	20 %	40 %	40 %	86356112
11074	NC_007761	CG	3	6	468576	468581	0 %	0 %	50 %	50 %	86356112
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11080	NC_007761	A	6	6	468735	468740	100 %	0 %	0 %	0 %	86356112
11081	NC_007761	CAG	2	6	468860	468865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356112
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11085	NC_007761	CGC	2	6	469201	469206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356112
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11090	NC_007761	ACG	2	6	469461	469466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356112
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11092	NC_007761	GC	3	6	469677	469682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_007761	GAA	2	6	469722	469727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356113
11094	NC_007761	AGC	2	6	469731	469736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356113
11095	NC_007761	TTC	2	6	469749	469754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356113
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11100	NC_007761	CCG	2	6	469943	469948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356113
11101	NC_007761	GAGATC	2	12	469954	469965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86356113
11102	NC_007761	GC	3	6	470155	470160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_007761	T	7	7	470195	470201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_007761	CAT	2	6	470262	470267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356114
11105	NC_007761	CAT	2	6	470271	470276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356114
11106	NC_007761	AAC	2	6	470279	470284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356114
11107	NC_007761	TTG	2	6	470489	470494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86356114
11108	NC_007761	CGC	2	6	470603	470608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356114
11109	NC_007761	GC	3	6	470663	470668	0 %	0 %	50 %	50 %	86356114
11110	NC_007761	GGC	2	6	470833	470838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_007761	CTCC	2	8	470843	470850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11112	NC_007761	ACG	2	6	470878	470883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356115
11113	NC_007761	GCTCT	2	10	470992	471001	0 %	40 %	20 %	40 %	86356115
11114	NC_007761	GAT	2	6	471049	471054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356115
11115	NC_007761	CGAA	2	8	471090	471097	50 %	0 %	25 %	25 %	86356115
11116	NC_007761	CGA	2	6	471099	471104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356115
11117	NC_007761	GATCTT	2	12	471115	471126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	86356115
11118	NC_007761	ATC	2	6	471178	471183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356115
11119	NC_007761	TCG	2	6	471215	471220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356115
11120	NC_007761	TGCG	2	8	471228	471235	0 %	25 %	50 %	25 %	86356115
11121	NC_007761	GAT	2	6	471250	471255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356115
11122	NC_007761	TG	3	6	471285	471290	0 %	50 %	50 %	0 %	86356115
11123	NC_007761	GCG	2	6	471418	471423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356115
11124	NC_007761	CGA	2	6	471444	471449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356115
11125	NC_007761	TCC	2	6	471461	471466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356115
11126	NC_007761	GAAT	2	8	471474	471481	50 %	25 %	25 %	0 %	86356115
11127	NC_007761	CGG	2	6	471487	471492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356115
11128	NC_007761	GC	3	6	471520	471525	0 %	0 %	50 %	50 %	86356115
11129	NC_007761	GAT	2	6	471541	471546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356115
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11135	NC_007761	CGA	2	6	471861	471866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356115
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11148	NC_007761	GC	3	6	472548	472553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11152	NC_007761	TCCTT	2	10	472810	472819	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11153	NC_007761	CGC	2	6	472829	472834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11189	NC_007761	TGA	2	6	474531	474536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11222	NC_007761	T	6	6	475993	475998	0 %	100 %	0 %	0 %	86356118
11223	NC_007761	TCC	2	6	476019	476024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11224	NC_007761	GCT	2	6	476075	476080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11225	NC_007761	TCA	2	6	476103	476108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11226	NC_007761	AGGC	2	8	476134	476141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11227	NC_007761	CGA	2	6	476197	476202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11228	NC_007761	ATC	2	6	476204	476209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11229	NC_007761	CG	3	6	476311	476316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11230	NC_007761	AGGC	2	8	476320	476327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11231	NC_007761	GC	4	8	476326	476333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11232	NC_007761	CGG	2	6	476353	476358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11233	NC_007761	GCC	2	6	476398	476403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356119
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11235	NC_007761	GCG	2	6	476494	476499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356119
11236	NC_007761	CGA	2	6	476525	476530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356119
11237	NC_007761	CAC	2	6	476535	476540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356119
11238	NC_007761	GC	3	6	476561	476566	0 %	0 %	50 %	50 %	86356119
11239	NC_007761	ATC	2	6	476575	476580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356119
11240	NC_007761	TCG	2	6	476653	476658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356119
11241	NC_007761	GCA	2	6	476663	476668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356119
11242	NC_007761	CGG	2	6	476725	476730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356119
11243	NC_007761	TCG	2	6	476773	476778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356119
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11245	NC_007761	GCC	2	6	476911	476916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356120
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11490	NC_007761	CGC	2	6	486518	486523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356130
11491	NC_007761	CTC	2	6	486539	486544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356130
11492	NC_007761	GCT	2	6	486581	486586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356130
11493	NC_007761	CGC	2	6	486623	486628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356130
11494	NC_007761	CTG	2	6	486636	486641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356130
11495	NC_007761	CGG	2	6	486677	486682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356130
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11497	NC_007761	CGC	2	6	486704	486709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356130
11498	NC_007761	GAT	2	6	486737	486742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356130
11499	NC_007761	AGC	2	6	486754	486759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356130
11500	NC_007761	GAC	2	6	486836	486841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356130

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