MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_007761	TCA	2	6	233865	233870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355880
5503	NC_007761	GCC	2	6	233924	233929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355880
5504	NC_007761	CCT	2	6	233985	233990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355880
5505	NC_007761	AGT	2	6	233997	234002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355880
5506	NC_007761	GA	3	6	234164	234169	50 %	0 %	50 %	0 %	86355880
5507	NC_007761	GCA	2	6	234171	234176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355880
5508	NC_007761	TCGA	2	8	234200	234207	25 %	25 %	25 %	25 %	86355880
5509	NC_007761	GAA	2	6	234220	234225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355880
5510	NC_007761	CGC	2	6	234252	234257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355880
5511	NC_007761	GGC	4	12	234280	234291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355880
5512	NC_007761	GATC	2	8	234408	234415	25 %	25 %	25 %	25 %	86355880
5513	NC_007761	GCG	2	6	234470	234475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355880
5514	NC_007761	TCG	2	6	234477	234482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355880
5515	NC_007761	GGT	2	6	234523	234528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355880
5516	NC_007761	CCG	2	6	234540	234545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355880
5517	NC_007761	TCA	2	6	234558	234563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355880
5518	NC_007761	GCA	2	6	234581	234586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355880
5519	NC_007761	TGA	2	6	234603	234608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355880
5520	NC_007761	GC	3	6	234610	234615	0 %	0 %	50 %	50 %	86355880
5521	NC_007761	TCA	2	6	234639	234644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355880
5522	NC_007761	TCG	2	6	234678	234683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_007761	TCAA	2	8	234749	234756	50 %	25 %	0 %	25 %	86355881
5524	NC_007761	CGC	2	6	234827	234832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355881
5525	NC_007761	GC	3	6	234831	234836	0 %	0 %	50 %	50 %	86355881
5526	NC_007761	TGG	2	6	234857	234862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355881
5527	NC_007761	GCA	2	6	234962	234967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355881
5528	NC_007761	TCG	2	6	235055	235060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355881
5529	NC_007761	GTC	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355881
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5531	NC_007761	GCC	2	6	235153	235158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355881
5532	NC_007761	CGA	2	6	235208	235213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355881
5533	NC_007761	GCGAT	2	10	235219	235228	20 %	20 %	40 %	20 %	86355881
5534	NC_007761	GCT	2	6	235236	235241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355881
5535	NC_007761	GCCGA	2	10	235252	235261	20 %	0 %	40 %	40 %	86355881
5536	NC_007761	GCCC	2	8	235262	235269	0 %	0 %	25 %	75 %	86355881
5537	NC_007761	GCCGGC	2	12	235296	235307	0 %	0 %	50 %	50 %	86355881
5538	NC_007761	TCG	2	6	235331	235336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355881
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5540	NC_007761	CAG	2	6	235407	235412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355881
5541	NC_007761	CGGC	2	8	235471	235478	0 %	0 %	50 %	50 %	86355881
5542	NC_007761	CGC	2	6	235499	235504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355881
5543	NC_007761	GCC	2	6	235530	235535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355881
5544	NC_007761	GC	3	6	235607	235612	0 %	0 %	50 %	50 %	86355881
5545	NC_007761	CCG	2	6	235637	235642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355881
5546	NC_007761	TCG	2	6	235645	235650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355881
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5548	NC_007761	GA	3	6	235848	235853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_007761	CGG	2	6	235901	235906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355882
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5552	NC_007761	CGAAC	2	10	235945	235954	40 %	0 %	20 %	40 %	86355882
5553	NC_007761	GCT	2	6	235956	235961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355882
5554	NC_007761	TCG	2	6	236012	236017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355882
5555	NC_007761	CTT	2	6	236062	236067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355882
5556	NC_007761	ATAG	2	8	236069	236076	50 %	25 %	25 %	0 %	86355882
5557	NC_007761	CG	3	6	236086	236091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_007761	AGG	2	6	236136	236141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_007761	CGGG	2	8	236164	236171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_007761	CTA	2	6	236320	236325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_007761	TAG	2	6	236329	236334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_007761	CGA	2	6	236385	236390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_007761	A	6	6	236395	236400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_007761	GCA	2	6	236489	236494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_007761	GTCT	2	8	236505	236512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_007761	TCG	2	6	236530	236535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_007761	GAA	2	6	236630	236635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355883
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5571	NC_007761	CGC	2	6	236744	236749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355883
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5591	NC_007761	GCAG	2	8	237490	237497	25 %	0 %	50 %	25 %	86355883
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5602	NC_007761	CG	3	6	237952	237957	0 %	0 %	50 %	50 %	86355883
5603	NC_007761	GCG	2	6	237970	237975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355883
5604	NC_007761	GCC	2	6	238013	238018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355883
5605	NC_007761	CGA	2	6	238022	238027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355883
5606	NC_007761	ACCGA	2	10	238041	238050	40 %	0 %	20 %	40 %	86355883
5607	NC_007761	CGG	2	6	238060	238065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355883
5608	NC_007761	GTC	2	6	238124	238129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355883
5609	NC_007761	CGTCAG	2	12	238130	238141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86355883
5610	NC_007761	CGGC	2	8	238164	238171	0 %	0 %	50 %	50 %	86355883
5611	NC_007761	GCA	2	6	238197	238202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355883
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5618	NC_007761	GCG	2	6	238461	238466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355883
5619	NC_007761	GCCG	2	8	238475	238482	0 %	0 %	50 %	50 %	86355883
5620	NC_007761	TGC	2	6	238561	238566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355883
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5997	NC_007761	ATG	2	6	254688	254693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355898
5998	NC_007761	CT	3	6	254748	254753	0 %	50 %	0 %	50 %	86355898
5999	NC_007761	GCG	2	6	254794	254799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355898
6000	NC_007761	GCGAT	2	10	254900	254909	20 %	20 %	40 %	20 %	86355898

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