MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	CGC	2	6	56	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007761	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007761	ATCC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007761	CG	3	6	177	182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007761	GAG	2	6	228	233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007761	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007761	CGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007761	CGC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007761	CAT	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007761	GAAC	2	8	483	490	50 %	0 %	25 %	25 %	86355670
11	NC_007761	GA	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	86355670
12	NC_007761	CCG	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
13	NC_007761	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	86355670
14	NC_007761	CGAT	2	8	642	649	25 %	25 %	25 %	25 %	86355670
15	NC_007761	CGA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
16	NC_007761	ATCT	2	8	776	783	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
17	NC_007761	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
18	NC_007761	TGA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
19	NC_007761	CG	3	6	841	846	0 %	0 %	50 %	50 %	86355670
20	NC_007761	GAC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
21	NC_007761	GAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
22	NC_007761	GTC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355670
23	NC_007761	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355670
24	NC_007761	ATCT	2	8	962	969	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
25	NC_007761	CAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355670
26	NC_007761	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355670
27	NC_007761	GAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
28	NC_007761	GGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355670
29	NC_007761	CGC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
30	NC_007761	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355670
31	NC_007761	TTG	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355670
32	NC_007761	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007761	TCG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355671
34	NC_007761	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355671
35	NC_007761	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355671
36	NC_007761	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355671
37	NC_007761	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355671
38	NC_007761	CGAT	2	8	1912	1919	25 %	25 %	25 %	25 %	86355671
39	NC_007761	GAT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355671
40	NC_007761	CTGG	2	8	2211	2218	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
41	NC_007761	CCT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355672
42	NC_007761	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355672
43	NC_007761	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
44	NC_007761	CGG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
45	NC_007761	CGT	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
46	NC_007761	GC	3	6	2465	2470	0 %	0 %	50 %	50 %	86355672
47	NC_007761	CATG	2	8	2481	2488	25 %	25 %	25 %	25 %	86355672
48	NC_007761	CTCG	2	8	2514	2521	0 %	25 %	25 %	50 %	86355672
49	NC_007761	ATGG	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	86355672
50	NC_007761	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
51	NC_007761	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
52	NC_007761	GTCG	2	8	2646	2653	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
53	NC_007761	TGC	3	9	2669	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
54	NC_007761	CGT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
55	NC_007761	GC	3	6	2739	2744	0 %	0 %	50 %	50 %	86355672
56	NC_007761	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355673
57	NC_007761	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355673
58	NC_007761	GCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
59	NC_007761	GTC	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
60	NC_007761	GC	3	6	3195	3200	0 %	0 %	50 %	50 %	86355673
61	NC_007761	TC	4	8	3233	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	86355673
62	NC_007761	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	86355673
63	NC_007761	ATC	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355673
64	NC_007761	ATC	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
65	NC_007761	ACC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355674
66	NC_007761	ATC	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
67	NC_007761	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
68	NC_007761	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355674
69	NC_007761	CGA	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355674
70	NC_007761	CTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355674
71	NC_007761	GC	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	86355674
72	NC_007761	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	86355674
73	NC_007761	GC	3	6	3830	3835	0 %	0 %	50 %	50 %	86355674
74	NC_007761	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355674
75	NC_007761	CGG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
76	NC_007761	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
77	NC_007761	TTC	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355675
78	NC_007761	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355675
79	NC_007761	GCG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355675
80	NC_007761	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355675
81	NC_007761	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355675
82	NC_007761	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355675
83	NC_007761	TCG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
84	NC_007761	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
85	NC_007761	TGT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355675
86	NC_007761	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007761	TCC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355676
88	NC_007761	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355676
89	NC_007761	GAC	3	9	4883	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
90	NC_007761	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355676
91	NC_007761	AATGAG	2	12	4937	4948	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	86355676
92	NC_007761	GAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355676
93	NC_007761	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
94	NC_007761	CAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
95	NC_007761	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
96	NC_007761	CGA	3	9	5170	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
97	NC_007761	GCA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
98	NC_007761	GCCA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007761	ATC	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007761	CGG	2	6	5356	5361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007761	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355677
102	NC_007761	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355677
103	NC_007761	TGG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355677
104	NC_007761	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
105	NC_007761	TCT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355677
106	NC_007761	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	86355677
107	NC_007761	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355677
108	NC_007761	CGA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355677
109	NC_007761	GCG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
110	NC_007761	TGAA	2	8	5627	5634	50 %	25 %	25 %	0 %	86355677
111	NC_007761	GC	3	6	5640	5645	0 %	0 %	50 %	50 %	86355677
112	NC_007761	TCCT	2	8	5661	5668	0 %	50 %	0 %	50 %	86355677
113	NC_007761	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
114	NC_007761	TCG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355677
115	NC_007761	CAGC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	86355677
116	NC_007761	CG	3	6	6029	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	86355677
117	NC_007761	GAT	3	9	6137	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007761	ATG	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355678
119	NC_007761	CGG	2	6	6179	6184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
120	NC_007761	GGA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355678
121	NC_007761	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
122	NC_007761	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
123	NC_007761	GCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
124	NC_007761	TGCC	2	8	6320	6327	0 %	25 %	25 %	50 %	86355678
125	NC_007761	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	86355678
126	NC_007761	GATC	2	8	6454	6461	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
127	NC_007761	TGGA	2	8	6489	6496	25 %	25 %	50 %	0 %	86355678
128	NC_007761	CGGC	2	8	6508	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
129	NC_007761	GAC	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355678
130	NC_007761	CGC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
131	NC_007761	GATC	2	8	6559	6566	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
132	NC_007761	TCT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
133	NC_007761	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
134	NC_007761	GGCC	2	8	6703	6710	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
135	NC_007761	CTG	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
136	NC_007761	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	86355678
137	NC_007761	CTGG	2	8	6793	6800	0 %	25 %	50 %	25 %	86355678
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255	NC_007761	AATCGA	2	12	11593	11604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	86355683
256	NC_007761	GCT	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355683
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258	NC_007761	CATCT	2	10	11702	11711	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
259	NC_007761	CGT	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_007761	CG	4	8	11810	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
261	NC_007761	TAA	2	6	11829	11834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_007761	GGC	2	6	11926	11931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_007761	CAGG	2	8	11937	11944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
264	NC_007761	GCCG	2	8	12019	12026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
265	NC_007761	GGA	2	6	12099	12104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_007761	TTTCCG	2	12	12110	12121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_007761	TCG	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_007761	CAA	2	6	12297	12302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_007761	CCG	2	6	12308	12313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_007761	CGAT	2	8	12362	12369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
271	NC_007761	AAC	2	6	12433	12438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_007761	CCA	2	6	12461	12466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_007761	GAA	2	6	12481	12486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_007761	TCT	2	6	12500	12505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_007761	GCC	2	6	12613	12618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_007761	GC	3	6	12672	12677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NC_007761	CTA	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_007761	AGG	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_007761	AAT	2	6	12862	12867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007761	CGTT	2	8	12887	12894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_007761	TGA	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_007761	GCCG	2	8	13029	13036	0 %	0 %	50 %	50 %	86355684
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285	NC_007761	GCC	2	6	13159	13164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355684
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392	NC_007761	AAGG	2	8	18445	18452	50 %	0 %	50 %	0 %	86355689
393	NC_007761	CCATT	2	10	18453	18462	20 %	40 %	0 %	40 %	86355689
394	NC_007761	CAT	2	6	18594	18599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355689
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397	NC_007761	ATC	2	6	18670	18675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355689
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399	NC_007761	CGCA	2	8	18756	18763	25 %	0 %	25 %	50 %	86355690
400	NC_007761	GCG	2	6	18827	18832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355690
401	NC_007761	CT	3	6	18849	18854	0 %	50 %	0 %	50 %	86355690
402	NC_007761	CAT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355690
403	NC_007761	CAT	2	6	18891	18896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355690
404	NC_007761	TCCGA	2	10	18916	18925	20 %	20 %	20 %	40 %	86355690
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408	NC_007761	TGA	2	6	19046	19051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355690
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415	NC_007761	CTA	2	6	19275	19280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355690
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432	NC_007761	CGG	2	6	20121	20126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355691
433	NC_007761	GC	3	6	20128	20133	0 %	0 %	50 %	50 %	86355691
434	NC_007761	TC	3	6	20148	20153	0 %	50 %	0 %	50 %	86355691
435	NC_007761	GTC	2	6	20218	20223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355691
436	NC_007761	CGA	2	6	20237	20242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355691
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438	NC_007761	CCT	2	6	20258	20263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355691
439	NC_007761	CTG	2	6	20386	20391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355691
440	NC_007761	ATGGT	2	10	20396	20405	20 %	40 %	40 %	0 %	86355691
441	NC_007761	TGG	2	6	20411	20416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355691
442	NC_007761	ACG	2	6	20492	20497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355691
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445	NC_007761	GCA	2	6	20596	20601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_007761	TC	3	6	20650	20655	0 %	50 %	0 %	50 %	86355692
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450	NC_007761	CGC	2	6	20810	20815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355692
451	NC_007761	GGCG	2	8	20853	20860	0 %	0 %	75 %	25 %	86355692
452	NC_007761	TCG	2	6	20873	20878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355692
453	NC_007761	ATG	2	6	20879	20884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355692
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475	NC_007761	CGC	2	6	21744	21749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355692
476	NC_007761	ATG	2	6	21752	21757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355692
477	NC_007761	CGG	2	6	21827	21832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355692
478	NC_007761	GCC	2	6	21837	21842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355692
479	NC_007761	CGG	2	6	21855	21860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355692
480	NC_007761	CT	4	8	21861	21868	0 %	50 %	0 %	50 %	86355692
481	NC_007761	TCG	2	6	21872	21877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355692
482	NC_007761	A	6	6	21923	21928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_007761	GGC	2	6	21979	21984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355693
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485	NC_007761	CGC	2	6	22047	22052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355693
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487	NC_007761	GACCTT	2	12	22135	22146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86355693
488	NC_007761	ATC	2	6	22187	22192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355693
489	NC_007761	CGA	3	9	22224	22232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355693
490	NC_007761	GCT	2	6	22299	22304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_007761	GAA	2	6	22314	22319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
492	NC_007761	GCG	2	6	22343	22348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_007761	GCG	2	6	22485	22490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
494	NC_007761	CCT	2	6	22542	22547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355694
495	NC_007761	CCGG	2	8	22683	22690	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
496	NC_007761	CGA	2	6	22749	22754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694
497	NC_007761	CGG	2	6	22757	22762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
498	NC_007761	GCCGC	2	10	22782	22791	0 %	0 %	40 %	60 %	86355694
499	NC_007761	CGG	2	6	22831	22836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
500	NC_007761	GCA	2	6	22854	22859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355694

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