MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_007643	GCC	2	6	630231	630236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591874
16002	NC_007643	GA	3	6	630264	630269	50 %	0 %	50 %	0 %	83591874
16003	NC_007643	GC	3	6	630329	630334	0 %	0 %	50 %	50 %	83591874
16004	NC_007643	CG	3	6	630361	630366	0 %	0 %	50 %	50 %	83591874
16005	NC_007643	GC	3	6	630450	630455	0 %	0 %	50 %	50 %	83591874
16006	NC_007643	GCC	2	6	630491	630496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591874
16007	NC_007643	GCC	2	6	630596	630601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591874
16008	NC_007643	CCG	2	6	630613	630618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591874
16009	NC_007643	GGC	2	6	630647	630652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591874
16010	NC_007643	AGA	2	6	630673	630678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591874
16011	NC_007643	CGC	2	6	630812	630817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591874
16012	NC_007643	ACG	2	6	630933	630938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591874
16013	NC_007643	TGG	2	6	630961	630966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591874
16014	NC_007643	G	6	6	630983	630988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_007643	C	6	6	631009	631014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16016	NC_007643	CTTG	2	8	631037	631044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_007643	TTCG	2	8	631093	631100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16018	NC_007643	GAC	2	6	631130	631135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591875
16019	NC_007643	GC	3	6	631187	631192	0 %	0 %	50 %	50 %	83591875
16020	NC_007643	GCC	3	9	631208	631216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591875
16021	NC_007643	CGA	2	6	631228	631233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591875
16022	NC_007643	ACC	2	6	631263	631268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591875
16023	NC_007643	CGC	2	6	631307	631312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591875
16024	NC_007643	GGCG	2	8	631315	631322	0 %	0 %	75 %	25 %	83591875
16025	NC_007643	CCG	2	6	631374	631379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591875
16026	NC_007643	GGTC	2	8	631395	631402	0 %	25 %	50 %	25 %	83591875
16027	NC_007643	CGGTC	2	10	631405	631414	0 %	20 %	40 %	40 %	83591875
16028	NC_007643	CG	3	6	631437	631442	0 %	0 %	50 %	50 %	83591875
16029	NC_007643	GGT	2	6	631459	631464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591875
16030	NC_007643	CCCG	2	8	631484	631491	0 %	0 %	25 %	75 %	83591875
16031	NC_007643	CGGG	2	8	631609	631616	0 %	0 %	75 %	25 %	83591875
16032	NC_007643	GGC	2	6	631633	631638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591875
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16034	NC_007643	CGCC	2	8	631702	631709	0 %	0 %	25 %	75 %	83591875
16035	NC_007643	GC	3	6	631711	631716	0 %	0 %	50 %	50 %	83591875
16036	NC_007643	CGA	2	6	631753	631758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591875
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16038	NC_007643	CGG	2	6	631850	631855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591875
16039	NC_007643	GC	3	6	631861	631866	0 %	0 %	50 %	50 %	83591875
16040	NC_007643	GC	3	6	631879	631884	0 %	0 %	50 %	50 %	83591875
16041	NC_007643	GCCT	2	8	631890	631897	0 %	25 %	25 %	50 %	83591875
16042	NC_007643	GCCA	2	8	631928	631935	25 %	0 %	25 %	50 %	83591875
16043	NC_007643	CCGC	2	8	631947	631954	0 %	0 %	25 %	75 %	83591875
16044	NC_007643	GGT	2	6	632003	632008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591875
16045	NC_007643	AG	4	8	632045	632052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_007643	AGA	2	6	632132	632137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_007643	GCG	2	6	632154	632159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_007643	GGA	2	6	632231	632236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591876
16049	NC_007643	GGC	2	6	632237	632242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591876
16050	NC_007643	GA	3	6	632296	632301	50 %	0 %	50 %	0 %	83591876
16051	NC_007643	TGCTC	2	10	632330	632339	0 %	40 %	20 %	40 %	83591876
16052	NC_007643	TCA	2	6	632371	632376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591876
16053	NC_007643	GCC	2	6	632393	632398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591876
16054	NC_007643	GCG	2	6	632413	632418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591876
16055	NC_007643	CAGG	2	8	632449	632456	25 %	0 %	50 %	25 %	83591876
16056	NC_007643	CTG	2	6	632478	632483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591876
16057	NC_007643	CTG	2	6	632520	632525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591876
16058	NC_007643	GAA	2	6	632532	632537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591876
16059	NC_007643	TCG	2	6	632557	632562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591876
16060	NC_007643	CG	3	6	632644	632649	0 %	0 %	50 %	50 %	83591876
16061	NC_007643	CGG	2	6	632652	632657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591876
16062	NC_007643	GAT	2	6	632670	632675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591876
16063	NC_007643	TTC	2	6	632722	632727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591876
16064	NC_007643	CGA	2	6	632755	632760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591876
16065	NC_007643	TCA	3	9	632815	632823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591876
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16067	NC_007643	GCT	2	6	632858	632863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591876
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16069	NC_007643	CGG	2	6	632920	632925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591876
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16071	NC_007643	GCC	2	6	633030	633035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591876
16072	NC_007643	CGC	2	6	633044	633049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591876
16073	NC_007643	GTC	2	6	633057	633062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591876
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16075	NC_007643	GAT	2	6	633098	633103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591876
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16078	NC_007643	GC	3	6	633186	633191	0 %	0 %	50 %	50 %	83591876
16079	NC_007643	GAG	2	6	633204	633209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591876
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16088	NC_007643	GAGG	2	8	633678	633685	25 %	0 %	75 %	0 %	83591877
16089	NC_007643	TGA	2	6	633702	633707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591877
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16091	NC_007643	TCG	2	6	633776	633781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591877
16092	NC_007643	AAG	2	6	633788	633793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591877
16093	NC_007643	GAAA	2	8	633806	633813	75 %	0 %	25 %	0 %	83591877
16094	NC_007643	GATTTT	2	12	633871	633882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	83591877
16095	NC_007643	T	7	7	633879	633885	0 %	100 %	0 %	0 %	83591877
16096	NC_007643	C	7	7	633985	633991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16097	NC_007643	TCG	2	6	634027	634032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16099	NC_007643	GAT	2	6	634153	634158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591878
16100	NC_007643	ATC	2	6	634178	634183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591878
16101	NC_007643	CAG	2	6	634192	634197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16102	NC_007643	CGA	2	6	634248	634253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16103	NC_007643	GGCG	2	8	634401	634408	0 %	0 %	75 %	25 %	83591878
16104	NC_007643	ATC	2	6	634433	634438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591878
16105	NC_007643	ATG	2	6	634439	634444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591878
16106	NC_007643	CAG	2	6	634519	634524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16107	NC_007643	TGGG	2	8	634562	634569	0 %	25 %	75 %	0 %	83591878
16108	NC_007643	TCG	2	6	634610	634615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16109	NC_007643	AGC	2	6	634616	634621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16110	NC_007643	CAC	2	6	634666	634671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591878
16111	NC_007643	GTG	2	6	634685	634690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591878
16112	NC_007643	ACC	2	6	634709	634714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591878
16113	NC_007643	CGG	2	6	634764	634769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591878
16114	NC_007643	TCG	2	6	634817	634822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591878
16115	NC_007643	CG	3	6	634824	634829	0 %	0 %	50 %	50 %	83591878
16116	NC_007643	CCT	2	6	634881	634886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591878
16117	NC_007643	GGC	2	6	634909	634914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591878
16118	NC_007643	TGT	2	6	634923	634928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591878
16119	NC_007643	CGG	2	6	634942	634947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591878
16120	NC_007643	GGTC	2	8	634998	635005	0 %	25 %	50 %	25 %	83591878
16121	NC_007643	CAG	2	6	635038	635043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591878
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16123	NC_007643	TCG	2	6	635150	635155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591878
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16360	NC_007643	CTG	2	6	644941	644946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591885
16361	NC_007643	TCT	2	6	645149	645154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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