MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007643	GGC	2	6	588181	588186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591841
15002	NC_007643	GAC	2	6	588261	588266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15003	NC_007643	TGA	2	6	588304	588309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591841
15004	NC_007643	TAA	2	6	588362	588367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83591841
15005	NC_007643	GAG	2	6	588432	588437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591841
15006	NC_007643	TCT	2	6	588563	588568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15007	NC_007643	CGCAG	2	10	588578	588587	20 %	0 %	40 %	40 %	83591841
15008	NC_007643	TCT	2	6	588671	588676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15009	NC_007643	CCG	2	6	588761	588766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591841
15010	NC_007643	ATC	2	6	588831	588836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591841
15011	NC_007643	CTG	2	6	588876	588881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15012	NC_007643	TCA	2	6	588932	588937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591841
15013	NC_007643	ATG	2	6	588939	588944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591841
15014	NC_007643	GCC	2	6	588970	588975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591841
15015	NC_007643	CGATC	2	10	589175	589184	20 %	20 %	20 %	40 %	83591841
15016	NC_007643	ACTTCC	2	12	589193	589204	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	83591841
15017	NC_007643	CGC	2	6	589257	589262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591841
15018	NC_007643	CAC	2	6	589296	589301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591841
15019	NC_007643	CTT	2	6	589425	589430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15020	NC_007643	GCTC	2	8	589495	589502	0 %	25 %	25 %	50 %	83591841
15021	NC_007643	TGC	2	6	589553	589558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15022	NC_007643	TCG	2	6	589619	589624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15023	NC_007643	ATC	2	6	589629	589634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591841
15024	NC_007643	GC	3	6	589690	589695	0 %	0 %	50 %	50 %	83591841
15025	NC_007643	TTC	2	6	589951	589956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15026	NC_007643	GCG	2	6	590135	590140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591841
15027	NC_007643	GCC	2	6	590173	590178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591841
15028	NC_007643	CTT	2	6	590210	590215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15029	NC_007643	GAC	2	6	590259	590264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15030	NC_007643	AAG	2	6	590298	590303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591841
15031	NC_007643	TCG	2	6	590305	590310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15032	NC_007643	GTC	2	6	590481	590486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15033	NC_007643	T	6	6	590589	590594	0 %	100 %	0 %	0 %	83591841
15034	NC_007643	GA	4	8	590652	590659	50 %	0 %	50 %	0 %	83591841
15035	NC_007643	CCA	2	6	590699	590704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591841
15036	NC_007643	TCG	2	6	590732	590737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15037	NC_007643	TCT	2	6	590753	590758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591841
15038	NC_007643	TCG	3	9	590764	590772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591841
15039	NC_007643	CAA	2	6	590854	590859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591841
15040	NC_007643	GA	3	6	590871	590876	50 %	0 %	50 %	0 %	83591841
15041	NC_007643	TGCC	2	8	590882	590889	0 %	25 %	25 %	50 %	83591841
15042	NC_007643	AAGCTC	2	12	590925	590936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83591841
15043	NC_007643	CCT	2	6	590956	590961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591841
15044	NC_007643	TGGC	2	8	591044	591051	0 %	25 %	50 %	25 %	83591841
15045	NC_007643	TGT	2	6	591158	591163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591841
15046	NC_007643	CAC	2	6	591255	591260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591841
15047	NC_007643	TCA	2	6	591314	591319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591841
15048	NC_007643	T	6	6	591354	591359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_007643	TCG	2	6	591381	591386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15050	NC_007643	GCA	2	6	591411	591416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_007643	GA	3	6	591461	591466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_007643	CGT	2	6	591508	591513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_007643	CGA	2	6	591546	591551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_007643	CCTC	2	8	591566	591573	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15055	NC_007643	TCA	2	6	591659	591664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_007643	CCGG	2	8	591789	591796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15057	NC_007643	CGC	2	6	591844	591849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_007643	CG	3	6	591853	591858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15059	NC_007643	GGCC	2	8	591875	591882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15060	NC_007643	GAT	2	6	591936	591941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591842
15061	NC_007643	CCGC	2	8	591952	591959	0 %	0 %	25 %	75 %	83591842
15062	NC_007643	TCC	3	9	591982	591990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591842
15063	NC_007643	AGG	2	6	592004	592009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591842
15064	NC_007643	CG	4	8	592010	592017	0 %	0 %	50 %	50 %	83591842
15065	NC_007643	TGTTC	2	10	592062	592071	0 %	60 %	20 %	20 %	83591842
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15067	NC_007643	CCGGC	2	10	592177	592186	0 %	0 %	40 %	60 %	83591842
15068	NC_007643	CGA	2	6	592200	592205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591842
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15070	NC_007643	AGG	2	6	592247	592252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591842
15071	NC_007643	CAA	2	6	592329	592334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591842
15072	NC_007643	GC	3	6	592344	592349	0 %	0 %	50 %	50 %	83591842
15073	NC_007643	CTG	2	6	592429	592434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591842
15074	NC_007643	ACG	2	6	592451	592456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591842
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15080	NC_007643	CGG	2	6	592638	592643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591842
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15085	NC_007643	CG	3	6	592958	592963	0 %	0 %	50 %	50 %	83591842
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15088	NC_007643	CGG	2	6	593049	593054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591842
15089	NC_007643	GCC	2	6	593058	593063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591842
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15094	NC_007643	TGC	2	6	593432	593437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591842
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15099	NC_007643	GGCGA	2	10	593649	593658	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15100	NC_007643	GGC	2	6	593660	593665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_007643	CATC	2	8	593669	593676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15102	NC_007643	ACC	2	6	593848	593853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15103	NC_007643	CTG	2	6	593878	593883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591843
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15111	NC_007643	CGA	2	6	594183	594188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591843
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15118	NC_007643	GCC	3	9	594376	594384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
15119	NC_007643	GGT	2	6	594387	594392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591843
15120	NC_007643	GCC	2	6	594393	594398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
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15122	NC_007643	GAT	2	6	594420	594425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591843
15123	NC_007643	GGC	2	6	594426	594431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591843
15124	NC_007643	CCG	2	6	594434	594439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
15125	NC_007643	CCG	3	9	594448	594456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
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15127	NC_007643	GCC	3	9	594475	594483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
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15131	NC_007643	GCC	2	6	594587	594592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591843
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15135	NC_007643	GC	3	6	594727	594732	0 %	0 %	50 %	50 %	83591843
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15153	NC_007643	CCGC	2	8	595439	595446	0 %	0 %	25 %	75 %	83591844
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15240	NC_007643	CCG	2	6	599250	599255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591846
15241	NC_007643	TTCACC	2	12	599303	599314	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	83591846
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15244	NC_007643	GC	3	6	599430	599435	0 %	0 %	50 %	50 %	83591846
15245	NC_007643	GCG	2	6	599451	599456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591846
15246	NC_007643	GCCGGC	2	12	599489	599500	0 %	0 %	50 %	50 %	83591846
15247	NC_007643	ATC	2	6	599510	599515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591846
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15249	NC_007643	GCG	2	6	599589	599594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591846
15250	NC_007643	GGT	2	6	599656	599661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591846
15251	NC_007643	TGG	2	6	599712	599717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591846
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15253	NC_007643	TGA	2	6	599850	599855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591846
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15259	NC_007643	CTT	2	6	600118	600123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591846
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15263	NC_007643	CCG	2	6	600396	600401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591846
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15272	NC_007643	CCG	2	6	600757	600762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591846
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15274	NC_007643	GC	3	6	600881	600886	0 %	0 %	50 %	50 %	83591846
15275	NC_007643	GGA	2	6	600928	600933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591846
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15278	NC_007643	C	6	6	600999	601004	0 %	0 %	0 %	100 %	83591846
15279	NC_007643	GGC	2	6	601012	601017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591846
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15300	NC_007643	TGG	2	6	601824	601829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591846
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15302	NC_007643	ACC	2	6	601934	601939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591846
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15304	NC_007643	TGC	2	6	602052	602057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591846
15305	NC_007643	CGC	2	6	602095	602100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15307	NC_007643	CGT	2	6	602360	602365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591847
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15312	NC_007643	GC	3	6	602539	602544	0 %	0 %	50 %	50 %	83591847
15313	NC_007643	CCGC	2	8	602546	602553	0 %	0 %	25 %	75 %	83591847
15314	NC_007643	CGGG	2	8	602605	602612	0 %	0 %	75 %	25 %	83591847
15315	NC_007643	GCG	2	6	602613	602618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591847
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15323	NC_007643	GGCCG	2	10	602961	602970	0 %	0 %	60 %	40 %	83591847
15324	NC_007643	ATG	2	6	603042	603047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591847
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15326	NC_007643	CCG	2	6	603137	603142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15327	NC_007643	AG	3	6	603174	603179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15328	NC_007643	CGC	2	6	603221	603226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15330	NC_007643	CCG	2	6	603417	603422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591848
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15334	NC_007643	GA	3	6	603681	603686	50 %	0 %	50 %	0 %	83591849
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15347	NC_007643	ATCA	2	8	604237	604244	50 %	25 %	0 %	25 %	83591850
15348	NC_007643	TCA	2	6	604247	604252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591850
15349	NC_007643	AT	3	6	604301	604306	50 %	50 %	0 %	0 %	83591850
15350	NC_007643	TG	3	6	604511	604516	0 %	50 %	50 %	0 %	83591850
15351	NC_007643	ATG	2	6	604529	604534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591850
15352	NC_007643	TGCT	2	8	604560	604567	0 %	50 %	25 %	25 %	83591850
15353	NC_007643	CGGC	2	8	604572	604579	0 %	0 %	50 %	50 %	83591850
15354	NC_007643	GAG	2	6	604621	604626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591850
15355	NC_007643	TG	3	6	604691	604696	0 %	50 %	50 %	0 %	83591850
15356	NC_007643	CGT	2	6	604737	604742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591850
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15359	NC_007643	GAT	2	6	604993	604998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591850
15360	NC_007643	CG	3	6	605029	605034	0 %	0 %	50 %	50 %	83591850
15361	NC_007643	GCA	2	6	605097	605102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591850
15362	NC_007643	CGC	2	6	605238	605243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591850
15363	NC_007643	CGA	2	6	605247	605252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591850
15364	NC_007643	TCG	2	6	605327	605332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591850
15365	NC_007643	GCA	2	6	605340	605345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591850
15366	NC_007643	GATCA	2	10	605353	605362	40 %	20 %	20 %	20 %	83591850
15367	NC_007643	TTG	2	6	605509	605514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83591850
15368	NC_007643	GGA	2	6	605577	605582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591850
15369	NC_007643	TGA	2	6	605670	605675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591850
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15371	NC_007643	GGA	2	6	605727	605732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591850
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15379	NC_007643	GCT	2	6	606123	606128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591850
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15393	NC_007643	ATGC	2	8	607092	607099	25 %	25 %	25 %	25 %	83591851
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15398	NC_007643	TTAA	2	8	607560	607567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15399	NC_007643	T	6	6	607603	607608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15400	NC_007643	C	6	6	607637	607642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15402	NC_007643	AAC	2	6	607685	607690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591852
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15408	NC_007643	CGA	3	9	608075	608083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15459	NC_007643	GCCG	2	8	610133	610140	0 %	0 %	50 %	50 %	83591854
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15475	NC_007643	TCGC	2	8	610793	610800	0 %	25 %	25 %	50 %	83591855
15476	NC_007643	CTT	2	6	610851	610856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83591855
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15484	NC_007643	GCGCC	2	10	611118	611127	0 %	0 %	40 %	60 %	83591856
15485	NC_007643	TGC	2	6	611221	611226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591856
15486	NC_007643	GAG	2	6	611232	611237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591856
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15488	NC_007643	GCA	2	6	611326	611331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591856
15489	NC_007643	CG	3	6	611384	611389	0 %	0 %	50 %	50 %	83591856
15490	NC_007643	TCA	2	6	611464	611469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591856
15491	NC_007643	CGG	2	6	611511	611516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591856
15492	NC_007643	TGG	2	6	611521	611526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591856
15493	NC_007643	CGC	2	6	611554	611559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591856
15494	NC_007643	CGA	2	6	611566	611571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591856
15495	NC_007643	CGG	2	6	611578	611583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591856
15496	NC_007643	CGG	2	6	611588	611593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591856
15497	NC_007643	CCT	2	6	611629	611634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83591856
15498	NC_007643	CGA	2	6	611656	611661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591856
15499	NC_007643	GGGAG	2	10	611709	611718	20 %	0 %	80 %	0 %	83591856
15500	NC_007643	CGG	2	6	611745	611750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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