MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 111214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007643	GC	3	6	547102	547107	0 %	0 %	50 %	50 %	83591806
14002	NC_007643	GCGG	2	8	547134	547141	0 %	0 %	75 %	25 %	83591806
14003	NC_007643	GCG	2	6	547172	547177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591806
14004	NC_007643	GGTC	2	8	547179	547186	0 %	25 %	50 %	25 %	83591806
14005	NC_007643	CCCT	2	8	547387	547394	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14006	NC_007643	TGGA	2	8	547403	547410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_007643	G	6	6	547451	547456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_007643	G	6	6	547461	547466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_007643	CAG	2	6	547505	547510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14010	NC_007643	GCG	2	6	547581	547586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591807
14011	NC_007643	GCC	2	6	547658	547663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591807
14012	NC_007643	CGC	2	6	547669	547674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591807
14013	NC_007643	CCA	2	6	547737	547742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591807
14014	NC_007643	ATTCC	2	10	547776	547785	20 %	40 %	0 %	40 %	83591807
14015	NC_007643	AGG	2	6	547842	547847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591807
14016	NC_007643	ACC	2	6	547853	547858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591807
14017	NC_007643	CGGC	2	8	547954	547961	0 %	0 %	50 %	50 %	83591807
14018	NC_007643	GGT	2	6	547969	547974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591807
14019	NC_007643	ATC	2	6	548099	548104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591807
14020	NC_007643	GCCAAG	2	12	548105	548116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14021	NC_007643	GCG	4	12	548133	548144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591807
14022	NC_007643	GCCA	2	8	548165	548172	25 %	0 %	25 %	50 %	83591807
14023	NC_007643	ACCCTG	2	12	548213	548224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83591807
14024	NC_007643	GCAT	2	8	548277	548284	25 %	25 %	25 %	25 %	83591807
14025	NC_007643	CATG	2	8	548308	548315	25 %	25 %	25 %	25 %	83591807
14026	NC_007643	TGG	2	6	548328	548333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591807
14027	NC_007643	CGA	2	6	548350	548355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14028	NC_007643	CCGG	2	8	548364	548371	0 %	0 %	50 %	50 %	83591807
14029	NC_007643	CAA	2	6	548431	548436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83591807
14030	NC_007643	TCG	2	6	548460	548465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14031	NC_007643	CGC	2	6	548533	548538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591807
14032	NC_007643	TGG	2	6	548549	548554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591807
14033	NC_007643	CTGC	2	8	548584	548591	0 %	25 %	25 %	50 %	83591807
14034	NC_007643	CGA	2	6	548605	548610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14035	NC_007643	TCA	2	6	548673	548678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591807
14036	NC_007643	GGC	2	6	548707	548712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591807
14037	NC_007643	CGGG	2	8	548754	548761	0 %	0 %	75 %	25 %	83591807
14038	NC_007643	CGG	2	6	548787	548792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591807
14039	NC_007643	GTC	2	6	548828	548833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14040	NC_007643	CGT	2	6	548850	548855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14041	NC_007643	ATG	2	6	548858	548863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591807
14042	NC_007643	GGCG	2	8	548972	548979	0 %	0 %	75 %	25 %	83591807
14043	NC_007643	TGCC	2	8	549002	549009	0 %	25 %	25 %	50 %	83591807
14044	NC_007643	CCG	2	6	549066	549071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591807
14045	NC_007643	TGA	2	6	549076	549081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591807
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14047	NC_007643	GAT	2	6	549160	549165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591807
14048	NC_007643	GC	3	6	549174	549179	0 %	0 %	50 %	50 %	83591807
14049	NC_007643	TGC	2	6	549192	549197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591807
14050	NC_007643	AGG	2	6	549234	549239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591807
14051	NC_007643	GTC	2	6	549281	549286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_007643	C	6	6	549319	549324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14053	NC_007643	CGG	3	9	549338	549346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_007643	CGA	2	6	549539	549544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591808
14055	NC_007643	GAT	2	6	549584	549589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591808
14056	NC_007643	CG	3	6	549673	549678	0 %	0 %	50 %	50 %	83591808
14057	NC_007643	TCGT	2	8	549780	549787	0 %	50 %	25 %	25 %	83591808
14058	NC_007643	TCG	2	6	549796	549801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591808
14059	NC_007643	CG	3	6	549863	549868	0 %	0 %	50 %	50 %	83591808
14060	NC_007643	GCC	2	6	549879	549884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591808
14061	NC_007643	CGG	2	6	549893	549898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591808
14062	NC_007643	GGC	2	6	549988	549993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_007643	TTA	2	6	550046	550051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83591809
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14065	NC_007643	AAG	2	6	550200	550205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83591809
14066	NC_007643	TCG	2	6	550222	550227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591809
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14086	NC_007643	GACAAG	2	12	551040	551051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	83591809
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14088	NC_007643	ACCC	2	8	551156	551163	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14089	NC_007643	G	7	7	551183	551189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_007643	GTT	2	6	551224	551229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_007643	GGC	2	6	551250	551255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_007643	TC	3	6	551261	551266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_007643	CG	3	6	551311	551316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14094	NC_007643	GCA	2	6	551320	551325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_007643	CCTC	2	8	551359	551366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14096	NC_007643	CTC	2	6	551374	551379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14097	NC_007643	CGA	2	6	551457	551462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14099	NC_007643	CGT	2	6	551537	551542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_007643	CGG	2	6	551586	551591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_007643	GGGAA	2	10	551597	551606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_007643	CG	4	8	551641	551648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_007643	A	6	6	551679	551684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_007643	ACG	2	6	551744	551749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_007643	GCGCC	2	10	551758	551767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14106	NC_007643	GCGA	2	8	551813	551820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14107	NC_007643	CAA	2	6	551822	551827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_007643	CGG	2	6	551855	551860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591810
14109	NC_007643	CCGT	2	8	551932	551939	0 %	25 %	25 %	50 %	83591810
14110	NC_007643	TGA	2	6	551988	551993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591810
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14118	NC_007643	GTC	2	6	552304	552309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591810
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14122	NC_007643	CGG	2	6	552384	552389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591810
14123	NC_007643	ATC	2	6	552409	552414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83591810
14124	NC_007643	CTG	2	6	552439	552444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591810
14125	NC_007643	A	6	6	552472	552477	100 %	0 %	0 %	0 %	83591810
14126	NC_007643	TGA	2	6	552545	552550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591810
14127	NC_007643	GCC	2	6	552670	552675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591810
14128	NC_007643	TCG	2	6	552680	552685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591810
14129	NC_007643	CGG	3	9	552705	552713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591810
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14131	NC_007643	GAT	2	6	552778	552783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591810
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14133	NC_007643	CCG	2	6	552965	552970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14134	NC_007643	AGGG	2	8	553000	553007	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_007643	CG	3	6	553042	553047	0 %	0 %	50 %	50 %	83591811
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14153	NC_007643	G	6	6	553896	553901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14154	NC_007643	GC	3	6	553948	553953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14155	NC_007643	GC	3	6	553974	553979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14156	NC_007643	GC	3	6	554000	554005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14157	NC_007643	GC	3	6	554026	554031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14158	NC_007643	CGGCG	2	10	554075	554084	0 %	0 %	60 %	40 %	83591812
14159	NC_007643	TGC	2	6	554181	554186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591812
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14164	NC_007643	TGC	2	6	554370	554375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591812
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14173	NC_007643	TGC	2	6	554672	554677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591813
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14179	NC_007643	TCG	2	6	554819	554824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591813
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14200	NC_007643	ATCG	2	8	555820	555827	25 %	25 %	25 %	25 %	83591813
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14221	NC_007643	C	7	7	556608	556614	0 %	0 %	0 %	100 %	83591813
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14224	NC_007643	TCGC	2	8	556689	556696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14225	NC_007643	CCCG	2	8	556700	556707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14226	NC_007643	CGA	2	6	556723	556728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591814
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14230	NC_007643	CG	4	8	556807	556814	0 %	0 %	50 %	50 %	83591814
14231	NC_007643	GCCA	2	8	556830	556837	25 %	0 %	25 %	50 %	83591814
14232	NC_007643	GAT	2	6	556886	556891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83591814
14233	NC_007643	CCG	2	6	556910	556915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591814
14234	NC_007643	GTCCG	2	10	556958	556967	0 %	20 %	40 %	40 %	83591814
14235	NC_007643	GCA	2	6	557029	557034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591814
14236	NC_007643	GTG	2	6	557126	557131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83591814
14237	NC_007643	CAC	2	6	557185	557190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591814
14238	NC_007643	ACC	2	6	557202	557207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83591814
14239	NC_007643	GAC	2	6	557234	557239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591814
14240	NC_007643	GCC	3	9	557262	557270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591814
14241	NC_007643	ACG	3	9	557271	557279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591814
14242	NC_007643	CCAGGG	2	12	557353	557364	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83591814
14243	NC_007643	GCC	2	6	557504	557509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83591814
14244	NC_007643	AGG	2	6	557545	557550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83591814
14245	NC_007643	GCA	3	9	557605	557613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591814
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14247	NC_007643	GGC	2	6	557749	557754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591815
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14484	NC_007643	GAC	2	6	568169	568174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591824
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14487	NC_007643	CGG	2	6	568330	568335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83591824
14488	NC_007643	CGT	2	6	568381	568386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83591824
14489	NC_007643	AGC	2	6	568416	568421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83591824
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14491	NC_007643	GC	3	6	568522	568527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14492	NC_007643	TGG	2	6	568583	568588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_007643	A	7	7	568635	568641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_007643	GGCG	2	8	568642	568649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14495	NC_007643	TCG	2	6	568682	568687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14496	NC_007643	CG	3	6	568696	568701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14497	NC_007643	TCGG	2	8	568775	568782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14498	NC_007643	CGC	2	6	568844	568849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14499	NC_007643	GCC	2	6	568850	568855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_007643	GATC	2	8	568895	568902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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